Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02693
• Subject: NM_001113228.3
• Aligned Length: 1440
• Identities: 1314
• Gaps: 126

Alignment

Query    1  ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATTCATGCCCTTTGGGTTACGGTGTCCTCAGTGATGCAGCCCTACCCTTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATTCATGCCCTTTGGGTTACGGTGTCCTCAGTGATGCAGCCCTACCCTTT  74

Query   75  GGTTTGGGGACATTATGATTTGTGTAAGACTCAGATTTACACGGAAGAAGGGAAAGTTTGGGATTACATGGCCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGTTTGGGGACATTATGATTTGTGTAAGACTCAGATTTACACGGAAGAAGGGAAAGTTTGGGATTACATGGCCT  148

Query  149  GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACAAAATATCTGAAAGTGAAACTCGATCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACAAAATATCTGAAAGTGAAACTCGATCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC  222

Query  223  CCTCCTGAGACGTTCTGTGCAATGGGCAATCCCTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAGCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CCTCCTGAGACGTTCTGTGCAATGGGCAATCCCTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAGCT  296

Query  297  GGCACACCCCCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCCACTTGGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GGCACACCCCCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCCACTTGGA  370

Query  371  AGGAGTATCCCAAGCCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAGCTAACAGACAACATA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGTATCCCAAGCCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAGCTAACAGACAACATA  444

Query  445  GTTATTACCTTTGAATCTGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTGGAGAAGTCTCTCGATTATGGACGAACATGGCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTTATTACCTTTGAATCTGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTGGAGAAGTCTCTCGATTATGGACGAACATGGCA  518

Query  519  GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCTTAGATGCTTTTCACATGGATCCTAAATCCGTGAAGGATTTATCAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCTTAGATGCTTTTCACATGGATCCTAAATCCGTGAAGGATTTATCAC  592

Query  593  AGCATACGGTCTTAGAAATCATTTGCACAGAAGAGTACTCAACAGGGTATACAACAAATAGCAAAATAATCCAC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCATACGGTCTTAGAAATCATTTGCACAGAAGAGTACTCAACAGGGTATACAACAAATAGCAAAATAATCCAC  666

Query  667  TTTGAAATCAAAGACAGGTTCGCGTTTTTTGCTGGACCTCGCCTACGCAATATGGCTTCCCTCTACGGACAGCT  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TTTGAAATCAAAGACAGGTTCGCGTTTTTTGCTGGACCTCGCCTACGCAATATGGCTTCCCTCTACGGACAGCT  740

Query  741  GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTTACAGTCACAGACCTGAGGATAAGGCTGTTAAGACCAGCCGTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTTACAGTCACAGACCTGAGGATAAGGCTGTTAAGACCAGCCGTTG  814

Query  815  GGGAAATATTTGTAGATGAGCTACACTTGGCACGCTACTTTTACGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GGGAAATATTTGTAGATGAGCTACACTTGGCACGCTACTTTTACGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG  888

Query  889  TGCAAGTGTAATCTCCATGCCACTGTATGTGTGTATGACAACAGCAAATTGACATGCGAATGTGAGCACAACAC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  TGCAAGTGTAATCTCCATGCCACTGTATGTGTGTATGACAACAGCAAATTGACATGCGAATGTGAGCACAACAC  962

Query  963  TACAGGTCCAGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAATTATCAGGGCCGACCTTGGAGTCCAGGCTCCTATCTCCCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TACAGGTCCAGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAATTATCAGGGCCGACCTTGGAGTCCAGGCTCCTATCTCCCCA  1036

Query 1037  TCCCCAAAGGCACTGCAAATACCTGTATCCCCAGTATTTCCAGTATTGGTA-----------------------  1087
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                       
Sbjct 1037  TCCCCAAAGGCACTGCAAATACCTGTATCCCCAGTATTTCCAGTATTGGTAATCCTCCAAAGTTTAATAGGATA  1110

Query 1088  --------------------------------------------------------------------------  1087
                                                                                      
Sbjct 1111  TGGCCGAATATTTCTTCCCTTGAGGTTTCTAACCCAAAACAAGTTGCTCCCAAATTAGCTTTGTCAACAGTTTC  1184

Query 1088  -----------------------------CGAATGTCTGCGACAACGAGCTCCTGCACTGCCAGAACGGAGGGA  1132
                                         |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTCTGTTCAAGTTGCAAACCACAAGAGAGCGAATGTCTGCGACAACGAGCTCCTGCACTGCCAGAACGGAGGGA  1258

Query 1133  CGTGCCACAACAACGTGCGCTGCCTGTGCCCGGCCGCATACACGGGCATCCTCTGCGAGAAGCTGCGGTGCGAG  1206
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CGTGCCACAACAACGTGCGCTGCCTGTGCCCGGCCGCATACACGGGCATCCTCTGCGAGAAGCTGCGGTGCGAG  1332

Query 1207  GAGGCTGGCAGCTGCGGCTCCGACTCTGGCCAGGGCGCGCCCCCGCACGGCTCCCCAGCGCTGCTGCTGCTGAC  1280
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGGCTGGCAGCTGCGGCTCCGACTCTGGCCAGGGCGCGCCCCCGCACGGCTCCCCAGCGCTGCTGCTGCTGAC  1406

Query 1281  CACGCTGCTGGGAACCGCCAGCCCCCTGGTGTTC  1314
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CACGCTGCTGGGAACCGCCAGCCCCCTGGTGTTC  1440