Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02693
- Subject:
- NM_001163348.1
- Aligned Length:
- 1449
- Identities:
- 1194
- Gaps:
- 135
Alignment
Query 1 ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATTCATGCCCTTTGGGTTACGGTGTCCTCAGTGATGCAGCCCTACCCTTT 74
||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||.||||||||||||||||.|||
Sbjct 1 ATGTATTTGTCAAGATTCCTGTCGATCCATGCCCTGTGGGTGACAGTGTCCTCTGTGATGCAGCCCTACCTTTT 74
Query 75 GGTTTGGGGACATTATGATTTGTGTAAGACTCAGATTTACACGGAAGAAGGGAAAGTTTGGGATTACATGGCCT 148
.||.|||||||||||||||.|.|||||||..|.|||||||||.||||||||.||||||||||||||||..||||
Sbjct 75 CGTGTGGGGACATTATGATGTATGTAAGAGCCTGATTTACACAGAAGAAGGCAAAGTTTGGGATTACACAGCCT 148
Query 149 GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACAAAATATCTGAAAGTGAAACTCGATCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC 222
|||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GCCAGCCGGAATCCACGGACATGACCAAGTATCTGAAAGTGAAACTGGACCCTCCGGATATTACCTGTGGAGAC 222
Query 223 CCTCCTGAGACGTTCTGTGCAATGGGCAATCCCTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAGCT 296
|||||.|||.|.|||||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 CCTCCAGAGTCCTTCTGTGCAATGGGCAACCCTTACATGTGCAATAATGAGTGTGATGCGAGTACCCCTGAACT 296
Query 297 GGCACACCCCCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCCACTTGGA 370
|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 297 GGCACACCCTCCTGAGCTGATGTTTGATTTTGAAGGAAGACATCCCTCCACATTTTGGCAGTCTGCTACTTGGA 370
Query 371 AGGAGTATCCCAAGCCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAGCTAACAGACAACATA 444
|||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 371 AGGAGTACCCCAAACCTCTCCAGGTTAACATCACTCTGTCTTGGAGCAAAACCATTGAACTCACAGACAACATA 444
Query 445 GTTATTACCTTTGAATCTGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTGGAGAAGTCTCTCGATTATGGACGAACATGGCA 518
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||.||||||||||||||
Sbjct 445 GTTATTACCTTTGAATCGGGGCGTCCAGACCAAATGATCCTAGAGAAATCTCTCGACTACGGACGAACATGGCA 518
Query 519 GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCTTAGATGCTTTTCACATGGATCCTAAATCCGTGAAGGATTTATCAC 592
||||||||||||||||||||||||||||.|..||||.||.||||||||.||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 GCCCTATCAGTATTATGCCACAGACTGCCTCCATGCATTCCACATGGACCCGAAATCCGTGAAGGATTTATCTC 592
Query 593 AGCATACGGTCTTAGAAATCATTTGCACAGAAGAGTACTCAACAGGGTATACAACAAATAGCAAAATAATCCAC 666
||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.||.|||||..|.||.||||||||||||||||||
Sbjct 593 AGCACACGGTCTTGGAAATCATTTGCACGGAAGAGTACTCCACTGGGTACTCCACGAATAGCAAAATAATCCAC 666
Query 667 TTTGAAATCAAAGACAGGTTCGCGTTTTTTGCTGGACCTCGCCTACGCAATATGGCTTCCCTCTACGGACAGCT 740
||.||.||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 667 TTCGAGATCAAAGACAGGTTTGCGTTTTTCGCTGGACCTCGGCTACGAAATATGGCTTCCCTCTATGGACAGCT 740
Query 741 GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTTACAGTCACAGACCTGAGGATAAGGCTGTTAAGACCAGCCGTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 741 GGATACAACCAAGAAACTCAGAGATTTCTTCACTGTCACAGACCTGAGGATCAGGCTGTTGAGACCCGCCGTTG 814
Query 815 GGGAAATATTTGTAGATGAGCTACACTTGGCACGCTACTTTTACGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG 888
|||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGAAATATTTGTAGATGAACTACATTTGGCACGTTACTTTTATGCGATCTCAGACATAAAGGTGCGAGGAAGG 888
Query 889 TGCAAGTGTAATCTCCATGCCACTGTATGTGTGTATGACAACAGCAAATTGACATGCGAATGTGAGCACAACAC 962
||||||||.||.||.|||||||||...|||.|||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||
Sbjct 889 TGCAAGTGCAACCTGCATGCCACTTCGTGTTTGTATGACAACAGCAAACTGACATGTGAATGTGAGCACAACAC 962
Query 963 TACAGGTCCAGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAATTATCAGGGCCGACCTTGGAGTCCAGGCTCCTATCTCCCCA 1036
|||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||.||.|||||||
Sbjct 963 TACAGGTCCCGACTGTGGGAAATGCAAGAAGAACTACCAGGGCCGACCTTGGAGCCCCGGCTCATACCTCCCCA 1036
Query 1037 TCCCCAAAGGCACTGCAAATACCTGTATCCCCAGTATTTCCAGTATTGGTA----------------------- 1087
|||||||||||||.|||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||
Sbjct 1037 TCCCCAAAGGCACCGCAAACACCTGTATCCCCAGCATTTCCAGTATCGGTAAGTGTTATTGTAACCCTTTGGGC 1110
Query 1088 -------------------------------------------------------------------------- 1087
Sbjct 1111 TCAATCCATGATCGTTGTAATGGCTCAGGATTTTGTGAGTGTAAGACTGGAACAACAGGGCCTAAATGTGATGA 1184
Query 1088 --------------------------------------CGAATGTCTGCGACAACGAGCTCCTGCACTGCCAGA 1123
|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GTGTCTGCCAGGAAATTCCTGGTACTACGGCTGTCAACCTAATGTCTGCGACAATGAGCTCCTGCACTGCCAGA 1258
Query 1124 ACGGAGGGACGTGCCACAACAACGTGCGCTGCCTGTGCCCGGCCGCATACACGGGCATCCTCTGCGAGAAGCTG 1197
|.||||||||.|||||.|||||.|||||||||..||||||.|.|||.|||||.|||||||||||.||||||||.
Sbjct 1259 ATGGAGGGACCTGCCAGAACAATGTGCGCTGCGCGTGCCCAGACGCCTACACCGGCATCCTCTGTGAGAAGCTA 1332
Query 1198 CGGTGCGAGGAGGCTGGCAGCTGCGGCTCCGACTCTGGCCAGGGCGCGCCCCCGCACGGCTCCCCAGCGCTGCT 1271
||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||.||||||||.||.|||||||..|||||||||||.|||||
Sbjct 1333 CGGTGCGAAGAGGCGGGCAGCTGTGGCTCCGAATCCGGCCAGGGAGCACCCCCGCGGGGCTCCCCAGCACTGCT 1406
Query 1272 GCTGCTGACCACGCTGCTGGGAACCGCCAGCCCCCTGGTGTTC 1314
|||||||||||.|||||||||.||.|||.|.||||||||||||
Sbjct 1407 GCTGCTGACCATGCTGCTGGGGACTGCCGGTCCCCTGGTGTTC 1449