Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02715
• Subject: XM_011541058.3
• Aligned Length: 2084
• Identities: 1662
• Gaps: 388

Alignment

Query    1  ATGGCGAAAGTCAACATAACTAGAGACCTCATCCGTAGGCAGATCAAGGAGCGGGGTGCCCTGAGCTTTGAGCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGAAAGTCAACATAACTAGAGACCTCATCCGTAGGCAGATCAAGGAGCGGGGTGCCCTGAGCTTTGAGCG  74

Query   75  GCGCTACCATGTCACTGACCCCTTTATCCGGCGGCTGGGCCTGGAAGCAGAGCTGCAGGGTCACTCAGGATGTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GCGCTACCATGTCACTGACCCCTTTATCCGGCGGCTGGGCCTGGAAGCAGAGCTGCAGGGTCACTCAGGATGTG  148

Query  149  TCAACTGTCTGGAGTGGAATGAGAAAGGAGACTTGCTGGCCTCTGGTTCCGATGACCAGCACACGATTGTGTGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCAACTGTCTGGAGTGGAATGAGAAAGGAGACTTGCTGGCCTCTGGTTCCGATGACCAGCACACGATTGTGTGG  222

Query  223  GACCCGCTGCACCACAAGAAGCTGCTCTCCATGCACACGGGACACACCGCAAATATCTTCTCTGTCAAGTTCCT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GACCCGCTGCACCACAAGAAGCTGCTCTCCATGCACACGGGACACACCGCAAATATCTTCTCTGTCAAGTTCCT  296

Query  297  GCCTCACGCTGGGGACCGCATCTTGATCACGGGGGCAGCCGACTCTAAGGTGCATGTGCACGACCTGACAGTAA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GCCTCACGCTGGGGACCGCATCTTGATCACGGGGGCAGCCGACTCTAAGGTGCATGTGCACGACCTGACAGTAA  370

Query  371  AGGAGACCATCCACATGTTTGGAGACCACACAAACCGGGTGAAGCGCATCGCCACAGCGCCCATGTGGCCCAAC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  AGGAGACCATCCACATGTTTGGAGACCACACAAACCGGGTGAAGCGCATCGCCACAGCGCCCATGTGGCCCAAC  444

Query  445  ACATTCTGGAGTGCTGCTGAGGATGGGCTTATCCGCCAGTATGACCTTCGAGAGAACAGCAAACACTCGGAGGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  ACATTCTGGAGTGCTGCTGAGGATGGGCTTATCCGCCAGTATGACCTTCGAGAGAACAGCAAACACTCGGAGGT  518

Query  519  GCTGATTGACCTGACAGAGTACTGTGGCCAGCTGGTGGAGGCCAAGTGCCTCACTGTCAACCCCCAGGACAACA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCTGATTGACCTGACAGAGTACTGTGGCCAGCTGGTGGAGGCCAAGTGCCTCACTGTCAACCCCCAGGACAACA  592

Query  593  ACTGCCTGGCAGTTGGGGCCAGCGGGCCCTTCGTGAGGCTCTATGACATCCGCATGATCCATAACCACAGAAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTGCCTGGCAGTTGGGGCCAGCGGGCCCTTCGTGAGGCTCTATGACATCCGCATGATCCATAACCACAGAAAG  666

Query  667  AGCATGAAGCAGAGCCCTTCAGCGGGTGTGCACACCTTCTGTGACCGGCAGAAACCCCTTCCGGACGGTGCAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGCATGAAGCAGAGCCCTTCAGCGGGTGTGCACACCTTCTGTGACCGGCAGAAACCCCTTCCGGACGGTGCAGC  740

Query  741  CCAGTATTACGTAGCAGGTCACCTGCCAGTGAAGCTTCCTGACTACAACAACCGTTTGAGAGTGCTGGTTGCCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCAGTATTACGTAGCAGGTCACCTGCCAGTGAAGCTTCCTGACTACAACAACCGTTTGAGAGTGCTGGTTGCCA  814

Query  815  CCTATGTGACCTTCAGCCCCAATGGCACAGAGCTACTAGTCAACATGGGGGGGGAACAGGTCTATTTGTTTGAC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CCTATGTGACCTTCAGCCCCAATGGCACAGAGCTACTAGTCAACATGGGGGGGGAACAGGTCTATTTGTTTGAC  888

Query  889  TTGACTTACAAGCAGCGGCCGTACACCTTCCTCTTGCCTAGAAAATGCCACTCCTCGGGG---GTCCAGAATGG  959
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   |||||||||||
Sbjct  889  TTGACTTACAAGCAGCGGCCGTACACCTTCCTCTTGCCTAGAAAATGCCACTCCTCGGGGGAAGTCCAGAATGG  962

Query  960  CAAGATGTCCACCAACGGTGTGTCCAACGGTGTGTCCAATGGCCTGCACCTTCATAGCAATGGCTTCCGGCTGC  1033
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CAAGATGTCCACCAACGGTGTGTCCAACGGTGTGTCCAATGGCCTGCACCTTCATAGCAATGGCTTCCGGCTGC  1036

Query 1034  CGGAGAGTAGGGGACATGTCAGCCCCCAAGTAGAGCTACCACCATACCTGGAGCGTGTGAAACAGCAAGCCAAT  1107
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CGGAGAGTAGGGGACATGTCAGCCCCCAAGTAGAGCTACCACCATACCTGGAGCGTGTGAAACAGCAAGCCAAT  1110

Query 1108  GAGGCTTTTGCCTGCCAGCAGTGGACCCAAGCCATTCAGCTTTACAGCAAGGCTGTGCAGAGGGCCCCTCACAA  1181
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAGGCTTTTGCCTGCCAGCAGTGGACCCAAGCCATTCAGCTTTACAGCAAGGCTGTGCAGAGGGCCCCTCACAA  1184

Query 1182  TGCCATGCTTTATGGAAACCGAGCAGCAGCCTACATGAAGCGCAAGTGGGATGGTGACCACTATGATGCCCTGA  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCCATGCTTTATGGAAACCGAGCAGCAGCCTACATGAAGCGCAAGTGGGATGGTGACCACTATGATGCCCTGA  1258

Query 1256  GGGACTGCCTCAAGGCCATCTCCCTAAACCCATGCCACCTGAAGGCACACTTTCGCCTGGCCCGCTGCCTCTTT  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  GGGACTGCCTCAAGGCCATCTCCCTAAACCCATGCCACCTGAAGGCACACTTTCGCCTGGCCCGCTGCCTCTTT  1332

Query 1330  GAGCTCAAGTATGTGGCTGAAGCCCTGGAGTGCCTGGACGACTTCAAAGGGAAATTTCCGGAGCAGGCCCACAG  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  GAGCTCAAGTATGTGGCTGAAGCCCTGGAGTGCCTGGACGACTTCAAAGGGAAATTTCCGGAGCAGGCCCACAG  1406

Query 1404  CAGCGCTTGTGATGCATTGGGCCGCGACATCACAGCTGCCCTCTTCTCTAAAAATGATGGTGAGGAGAAGAAGG  1477
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||             
Sbjct 1407  CAGCGCTTGTGATGCATTGGGCCGCGACATCACAGCTGCCCTCTTCTCTAAAAATGATGGT-------------  1467

Query 1478  GACCTGGTGGCGGCGCCCCAGTCCGCCTCCGCAGCACGAGCCGCAAGGACT------CCATCTCAGAGGATGAA  1545
                          ||.|||  ||.|||                   ||||      ||.|       ||.|||
Sbjct 1468  --------------GCTCCA--CCACCT-------------------GACTGTGTGGCCTT-------GAAGAA  1499

Query 1546  ATGGTGCTGCGGGAGCGAAGCTACGACTATCAGTTCCGCTACTGCGGCCACTGCAACACCACCACGGATATCAA  1619
                         |||..|||     ||.||  |.|  ||||        |||||                |||
Sbjct 1500  -------------AGCACAGC-----CTCTC--TAC--CTAC--------CTGCA----------------CAA  1527

Query 1620  AGAGGCCAATTTCTTTGGCAGCAACGCTCAGTATATCGTCAGTGGCTCTGACGATGGCTCCTTCTTCATCTGGG  1693
            |||              |||..||                    ||.|||.|.|  |||||             
Sbjct 1528  AGA--------------GCACGAA--------------------GCCCTGCCCA--GCTCC-------------  1552

Query 1694  AAAAGGAGACCACCAACCTGGTCCGTGTGCTCCAAGG-GGATGAGTCCATTGTCAACTGCCTGCAGCCACACCC  1766
                     ||          ||.|||||||    || |.|||           |||||               
Sbjct 1553  ---------CC----------TCAGTGTGCT----GGAGAATG-----------AACTG---------------  1577

Query 1767  CAGCTACTGCTTCCTGGCCACCAGTGGCATC-GATCCTGTTGTGCGGCTCTGGAACCCCCGACCAGAGAGTGAA  1839
                           |||         |||| ||       |||.|| ||||.||.|            |||||
Sbjct 1578  ---------------GGC---------CATCGGA-------GTGTGG-TCTGTAAAC------------GTGAA  1607

Query 1840  ----GACCTCACAGGCCGAGTCGTGGAAGATATGGAGGGTGCTTCA-------------CAG---GCCAACCAG  1893
                ||.||||.||        |.||.|||.|||||    .|||||             |||   .||||||| 
Sbjct 1608  CGGTGAGCTCATAG--------GAGGCAGACATGGA----TCTTCACCTCTCTCCTTTGCAGTTTACCAACCA-  1668

Query 1894  CGGCG------------------CATGAAT-----GCAGACCCGTTGGAGGTGATGCTGCTCAACATGGGCTAC  1944
               ||                  .||||||     .|||||.|             ||||    ||||.||   
Sbjct 1669  ---CGTGATAAATTAATTTGTTTAATGAATAGTTATCAGACAC-------------CTGC----CATGTGC---  1719

Query 1945  CGGATCACGGGC-CTGAGCAGTGGGGGTGCCGGGGCCTCTGATGAT-GAGGACAGCTCTGAGGGCCAGGTGCAG  2016
                   |.||| ||           ||||.|||.|||..||  || |||       |||              
Sbjct 1720  -------CAGGCACT-----------GTGCTGGGTCCTGGGA--ATAGAG-------CTG--------------  1752

Query 2017  TGCCGGCCCAGC  2028
                        
Sbjct 1753  ------------  1752