Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02717
- Subject:
- NM_001039200.2
- Aligned Length:
- 2982
- Identities:
- 2632
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGCGGCTGAGTGGGCTTCTCGTTTCTGGCTTTGGGCTAC---GCTGCTGATTCCTGCGGCCGCGGTCTACGA 71
|||||||..|.|..|||.|||.|.||||||.|.||||||.| ||||||..|.||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGTCGCGGTGGCGTCTGGGTTCTGGATCTGGGCTGCTGTGCTGCTCGTCCCTGCGGCCGCGGTCTACGA 74
Query 72 AGACCAAGTGGGCAAGTTTGATTGGAGACAGCAATATGTTGGGAAGGTCAAGTTTGCCTCCTTGGAATTTTCCC 145
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 75 AGACCAAGTGGGCAAGTTTGACTGGAGACAGCAGTATGTTGGGAAGATCAAGTTTGCCTCCTTGGAGTTTTCCC 148
Query 146 CTGGATCCAAGAAGTTGGTTGTAGCCACAGAGAAGAATGTGATTGCAGCATTAAATTCCCGAACTGGGGAGATC 219
||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 149 CTGGATCCAAGAAGTTGGTTGTGGCCACAGAGAAGAATGTGATTGCGGCGTTAAATTCTCGGACTGGAGAGATC 222
Query 220 TTGTGGCGCCATGTTGACAAGGGCACGGCAGAAGGGGCTGTGGATGCCATGCTGCTGCACGGACAGGATGTGAT 293
||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||.|.||.|||||.||||..||
Sbjct 223 TTGTGGCGCCATGTTGACAAAGGCACAGCAGAAGGAGCTGTGGATGCCATGCTGGTCCATGGACAAGATGCAAT 296
Query 294 CACTGTGTCCAATGGAGGCCGAATCATGCGTTCCTGGGAGACTAACATCGGGGGCCTGAACTGGGAGATAACCC 367
||||||.|||||.|||||.||..|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 297 CACTGTATCCAACGGAGGGCGCCTCATGCGTTCCTGGGAGACCAACATCGGGGGCCTGAACTGGGAGATAACTC 370
Query 368 TGGACAGTGGCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTGGTTGGCCTGCAGGAGTCTGTAAGGTACATCGCAGTCCTGAAG 441
||||||.||||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.||.||||||||.|||||.||||||
Sbjct 371 TGGACACTGGCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTAGTGGGCCTTCAGGAGTCAGTGAGGTACATTGCAGTTCTGAAG 444
Query 442 AAGACTACACTTGCCCTCCATCACCTCTCCAGTGGGCACCTCAAGTGGGTGGAACATCTCCCAGAAAGTGACAG 515
|||||.||.||..|||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 445 AAGACGACCCTCACCCTCCACCACCTCTCCAGTGGGCACCTGAAGTGGGTGGAGCATCTGCCAGAAAGTGACAG 518
Query 516 CATCCACTACCAGATGGTGTATTCTTACGGCTCTGGGGTGGTGTGGGCCCTCGGAGTTGTTCCCTTCAGCCATG 589
|||||.||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||..|.||||||||||||||.|
Sbjct 519 CATCCTCTACCAGATGGTGTATTCCTACGGCTCCGGGGTGGTGTGGGCCCTTGGCATCGTTCCCTTCAGCCACG 592
Query 590 TGAACATTGTCAAGTTTAATGTGGAAGATGGAGAGATTGTTCAGCAGGTTAGGGTTTCAACTCCGTGGCTGCAG 663
|||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||..|||||.|||||||||
Sbjct 593 TGAACATCGTCAAGTTTAACGTGGAGGATGGAGAGATTGTTCAGCAGGTCAGGGTTTGGACTCCATGGCTGCAG 666
Query 664 CACCTGTCTGGAGCCTGTGGTGTGGTGGATGAGGCTGTCCTGGTGTGTCCTGACCCGAGCTCACGTTCCCTCCA 737
|||||..||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||.|||||||..||.|||||
Sbjct 667 CACCTCACTGGGGCCTGTGGTGTGGTAGATGAGGCTGTCCTGGTATGCCCCGACCCCAGCTCACACTCACTCCA 740
Query 738 AACTTTGGCTCTGGAGACGGAATGGGAGTTGAGACAGATCCCACTGCAGTCTCTCGACTTAGAATTTGGAAGTG 811
.||||||||.|||||||||||.|||||..||.||||||||||.||||||||||..|||||||||||||||||||
Sbjct 741 CACTTTGGCCCTGGAGACGGAGTGGGAACTGCGACAGATCCCCCTGCAGTCTCCTGACTTAGAATTTGGAAGTG 814
Query 812 GATTCCAACCCCGGGTCCTGCCTACCCAGCCCAACCCAGTGGACGCTTCCCGGGCCCAGTTCTTCCTGCACTTG 885
|||||||.||||..||.|||||.||.||.||||.||||||||...||||.||.|||||||||||||||||.|||
Sbjct 815 GATTCCAGCCCCAAGTGCTGCCCACACAACCCAGCCCAGTGGCTCCTTCTCGAGCCCAGTTCTTCCTGCAGTTG 888
Query 886 TCCCCAAGCCACTATGCTCTGCTGCAGTACCATTATGGAACGCTGAGTTTGCTTAAAAACTTCCCACAGACTGC 959
||||||||||||||.|||||.|||||.|||||..||||..|..|||.|.|||||||.||||||||.|||.|..|
Sbjct 889 TCCCCAAGCCACTACGCTCTACTGCACTACCACCATGGTGCCGTGACTCTGCTTAAGAACTTCCCCCAGGCCAC 962
Query 960 CCTAGTGAGCTTTGCCACCACTGGGGAGAAGACGGTGGCTGCAGTCATGGCCTGTCGGAATGAAGTGCAGAAAA 1033
.||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||.|||||||.|.|||||||||.|||.
Sbjct 963 GCTCGTCAGCTTCGCCACCACAGGGGAGAAGACAGTGGCTGCAGTCATGACCTGTCGCACTGAAGTGCAAAAAC 1036
Query 1034 GTAGCAGTTCTGAAGATGGGTCAATGGGGAGCTTTTCGGAGAAGTCTAGTTCAAAGGACTCTCTGGCTTGCTTC 1107
.|..||||.|||.|||||||||..|||..||||||.|.||||..|||.||.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 CTGTCAGTGCTGGAGATGGGTCTGTGGCAAGCTTTCCTGAGACATCTGGTGCACAGGACTCTCTGGCTTGCTTC 1110
Query 1108 AATCAGACCTACACCATTAACCTATACCTCGTGGAGACAGGTCGGCGGCTGCTGGACACCACGATAACATTTAG 1181
||.||||||||||||||||||||.|||.|.||||||||||||||||||||.||.|||||..|.||..|.||.||
Sbjct 1111 AACCAGACCTACACCATTAACCTGTACTTAGTGGAGACAGGTCGGCGGCTCCTAGACACTTCCATTTCCTTCAG 1184
Query 1182 CCTGGAACAGAGCGGCACTCGGCCTGAGCGGCTGTATATCCAGGTGTTCTTGAAGAAGGATGACTCAGTGGGCT 1255
||||||.||||..|||||.||.|||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 1185 CCTGGAGCAGAAGGGCACGCGACCTGAGCAGCTGTACATCCAGGTGTTCTTGAAGAAGGACGACTCGGTGGGCT 1258
Query 1256 ACCGGGCTTTGGTGCAGACAGAGGATCATCTGCTACTTTTCCTGCAGCAGTTGGCAGGGAAGGTGGTGCTGTGG 1329
|||||||.||||||||||||.||||.|||||||..||.||||||||||||.|.||.||||||||||||.|||||
Sbjct 1259 ACCGGGCCTTGGTGCAGACACAGGACCATCTGCAGCTGTTCCTGCAGCAGCTTGCTGGGAAGGTGGTGTTGTGG 1332
Query 1330 AGCCGTGAGGAGTCCCTGGCAGAAGTGGTGTGCCTAGAGATGGTGGACCTCCCCCTGACTGGGGCACAGGCCGA 1403
|||||.||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||.||.|||||.||
Sbjct 1333 AGCCGAGAGGAGTCCCTGGCAGAAGTCGTGTGCCTGGAGATGGTGGATCTCCCCCTGACTGGAGCGCAGGCTGA 1406
Query 1404 GCTGGAAGGAGAATTTGGCAAAAAGGCAGATGGCTTGCTGGGGATGTTCCTGAAACGCCTCTCGTCTCAGCTTA 1477
|.|||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|
Sbjct 1407 GTTGGAAGGAGAATTTGGCAAGAAGGCAGATGGCTTGCTGGGGATGTTCCTGAAACGCCTGTCGTCCCAGCTCA 1480
Query 1478 TCCTGCTGCAAGCATGGACTTCCCACCTCTGGAAAATGTTTTATGATGCTCGGAAGCCCCGGAGTCAGATTAAG 1551
|||||||.||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||.|||||||||
Sbjct 1481 TCCTGCTCCAGGCCTGGACTTCCCACCTCTGGAAAATGTTCTACGATGCTCGGAAGCCCCGAAGCCAGATTAAG 1554
Query 1552 AATGAGATCAACATTGACACCCTGGCCAGAGATGAATTCAACCTCCAGAAGATGATGGTGATGGTAACAGCCTC 1625
||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1555 AATGAGATCAACATCGACACACTGGCTAGAGATGAGTTCAACCTGCAGAAAATGATGGTGACGGTAACAGCCTC 1628
Query 1626 AGGCAAGCTTTTTGGCATTGAGAGCAGCTCTGGCACCATCCTGTGGAAACAGTATCTACCCAATGTCAAGCCAG 1699
|||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 1629 AGGCAAGCTCTTTGGCATCGAGAGCAGCTCTGGAACCATTCTGTGGAAGCAGTATCTGCCCAATGTTAAGCCAG 1702
Query 1700 ACTCCTCCTTTAAACTGATGGTCCAGAGAACTACTGCTCATTTCCCCCATCCCCCACAGTGCACCCTGCTGGTG 1773
|||||||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||
Sbjct 1703 ACTCCTCCTTTAAGCTGATGGTGCAGAGGACTACTGCCCATTTCCCCCATCCACCCCAGTGCACGCTGCTGGTG 1776
Query 1774 AAGGACAAGGAGTCGGGAATGAGTTCTCTGTATGTCTTCAATCCCATTTTTGGGAAGTGGAGTCAGGTAGCTCC 1847
||||||||||||.|.||||||||.|||||||.|||||||||.|||||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1777 AAGGACAAGGAGACAGGAATGAGCTCTCTGTTTGTCTTCAACCCCATTTTTGGCAAGTGGAGCCAGGTAGCTCC 1850
Query 1848 CCCAGTGCTGAAGCGCCCCATCTTGCAGTCCTTGCTTCTCCCAGTCATGGATCAAGACTACGCCAAGGTGTTGC 1921
||||||||||||||||||||||||||||||..||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1851 CCCAGTGCTGAAGCGCCCCATCTTGCAGTCACTGCTTCTCCCAGTCATGGATCAAGACTATGCCAAGGTGTTGC 1924
Query 1922 TGTTGATAGATGATGAATACAAGGTCACAGCTTTTCCAGCCACTCGGAATGTCTTGCGACAGCTACATGAGCTT 1995
|||||.|.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||
Sbjct 1925 TGTTGGTGGATGACGAATACAAGGTCACAGCTTTCCCAGCTACGCGGAATGTCTTGCGGCAGCTGCATGAACTT 1998
Query 1996 GCCCCTTCCATCTTCTTCTATTTGGTGGATGCAGAGCAGGGACGGCTGTGTGGATATCGGCTTCGAAAGGATCT 2069
|||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||..||||.||||.|||||||||||||||
Sbjct 1999 GCCCCCTCCATCTTCTTCTACTTGGTGGATGCAGAGCAGGGGCGGCTCAGTGGGTATCAGCTTCGAAAGGATCT 2072
Query 2070 CACCACTGAGCTGAGTTGGGAGCTGACCATTCCCCCAGAAGTACAGCGGATCGTCAAGGTGAAGGGGAAACGCA 2143
|||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||..||||||||||.||||||||.||||
Sbjct 2073 CACTACAGAACTGAGTTGGGAGCTGACCATCCCCCCAGAAGTGCAGCGCGTCGTCAAGGTCAAGGGGAAGCGCA 2146
Query 2144 GCAGTGAGCACGTTCATTCCCAGGGCCGTGTGATGGGGGACCGCAGTGTGCTCTACAAGAGCCTGAACCCCAAC 2217
||||.||||||||.||.|||||||||||.|||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 2147 GCAGCGAGCACGTACACTCCCAGGGCCGGGTGATGGGGGATCGAAGTGTGCTCTACAAGAGTCTGAACCCCAAC 2220
Query 2218 CTGCTGGCCGTGGTGACAGAGAGCACAGACGCGCACCATGAGCGCACCTTTATTGGCATCTTCCTCATTGATGG 2291
.|||||||||||||||||||||||||.||.|..|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 TTGCTGGCCGTGGTGACAGAGAGCACGGATGTCCACCACGAGCGCACCTTTATTGGCATCTTCCTCATTGATGG 2294
Query 2292 CGTCACTGGGCGTATCATTCACTCCTCTGTGCAGAAGAAAGCCAAAGGCCCTGTCCATATCGTGCATTCAGAGA 2365
.||||||||.||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||..|||||||||||..|.|||||||||||||
Sbjct 2295 TGTCACTGGCCGCATCATCCACTCCTCCGTGCAGAAGAAGGCCAGGGGCCCTGTCCACCTTGTGCATTCAGAGA 2368
Query 2366 ACTGGGTGGTGTACCAGTACTGGAACACCAAGGCTCGGCGCAACGAGTTTACCGTACTGGAGCTCTATGAGGGC 2439
|||||||||||||||||||||||||..|.||||||||||||||.|||.|.||.|..|||||||||||.||||||
Sbjct 2369 ACTGGGTGGTGTACCAGTACTGGAATTCTAAGGCTCGGCGCAATGAGCTGACGGCCCTGGAGCTCTACGAGGGC 2442
Query 2440 ACTGAGCAATACAACGCCACCGCCTTCAGCTCCCTGGACCGCCCCCAGCTGCCCCAGGTCCTCCAGCAGTCCTA 2513
|||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 ACTGAACAGTACAATGCCACTGCCTTCAGCTCTCTAGACCGACCCCAGCTGCCCCAGGTCCTCCAGCAGTCCTA 2516
Query 2514 TATCTTCCCGTCCTCCATCAGTGCCATGGAGGCCACCATCACCGAACGGGGCATCACCAGCCGACACCTGCTGA 2587
.||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||..||||||||||||||||.|||.||||.|
Sbjct 2517 CATCTTCCCCTCCTCCATCAGTGCCATGGAAGCTACCATCACCGAGAGGGGCATCACCAGCCGGCACTTGCTCA 2590
Query 2588 TTGGACTACCTTCTGGAGCAATTCTTTCCCTTCCTAAGGCTTTGCTGGATCCCCGCCGCCCCGAGATCCCAACA 2661
||||.||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.||||||||||||
Sbjct 2591 TTGGGCTGCCTTCTGGAGCAATCCTTTCCCTCCCCAAGGCCTTGCTGGATCCCCGGCGCCCAGAGATCCCAACA 2664
Query 2662 GAACAAAGCAGAGAGGAGAACTTAATCCCGTATTCTCCAGATGTACAGATACACGCAGAGCGATTCATCAACTA 2735
||.|||||||||||.||||||.|.|||||.||||||||||||||.|||.|.||.||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 GAGCAAAGCAGAGAAGAGAACCTGATCCCATATTCTCCAGATGTTCAGGTCCATGCAGAGCGATTCATCAACTA 2738
Query 2736 TAACCAGACAGTTTCTCGAATGCGAGGTATCTACACAGCTCCCTCGGGTCTGGAGTCCACTTGTTTGGTTGTGG 2809
||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TAACCAGACAGTCTCTCGAATGCGAGGCATCTATACAGCGCCCTCAGGCCTGGAGTCCACTTGTTTGGTTGTGG 2812
Query 2810 CCTATGGTTTGGACATTTACCAAACTCGAGTCTACCCATCCAAGCAGTTTGACGTTCTGAAGGATGACTATGAC 2883
||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|||
Sbjct 2813 CCTACGGTTTGGATATTTACCAAACTCGAGTTTACCCGTCCAAGCAGTTTGATGTCCTGAAAGATGACTACGAC 2886
Query 2884 TACGTGTTAATCAGCAGCGTCCTCTTTGGCCTGGTTTTTGCCACCATGATCACTAAGAGACTGGCACAGGTGAA 2957
||.|||.|.||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 2887 TATGTGCTCATCAGCAGTGTCCTTTTTGGCCTGGTTTTTGCCACCATGATCACAAAGAGGCTGGCACAGGTGAA 2960
Query 2958 GCTCCTGAATCGGGCCTGGCGA 2979
.|||||.|||||.||||||||.
Sbjct 2961 ACTCCTCAATCGAGCCTGGCGG 2982