Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02717
- Subject:
- NM_001271427.2
- Aligned Length:
- 2979
- Identities:
- 2976
- Gaps:
- 3
Alignment
Query 1 ATGGCGGCTGAGTGGGCTTCTCGTTTCTGGCTTTGGGCTACGCTGCTGATTCCTGCGGCCGCGGTCTACGAAGA 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGGCTGAGTGGGCTTCTCGTTTCTGGCTTTGGGCTACGCTGCTGATTCCTGCGGCCGCGGTCTACGAAGA 74
Query 75 CCAAGTGGGCAAGTTTGATTGGAGACAGCAATATGTTGGGAAGGTCAAGTTTGCCTCCTTGGAATTTTCCCCTG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 CCAAGTGGGCAAGTTTGATTGGAGACAGCAATATGTTGGGAAGGTCAAGTTTGCCTCCTTGGAATTTTCCCCTG 148
Query 149 GATCCAAGAAGTTGGTTGTAGCCACAGAGAAGAATGTGATTGCAGCATTAAATTCCCGAACTGGGGAGATCTTG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 GATCCAAGAAGTTGGTTGTAGCCACAGAGAAGAATGTGATTGCAGCATTAAATTCCCGAACTGGGGAGATCTTG 222
Query 223 TGGCGCCATGTTGACAAGGGCACGGCAGAAGGGGCTGTGGATGCCATGCTGCTGCACGGACAGGATGTGATCAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 TGGCGCCATGTTGACAAGGGCACGGCAGAAGGGGCTGTGGATGCCATGCTGCTGCACGGACAGGATGTGATCAC 296
Query 297 TGTGTCCAATGGAGGCCGAATCATGCGTTCCTGGGAGACTAACATCGGGGGCCTGAACTGGGAGATAACCCTGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TGTGTCCAATGGAGGCCGAATCATGCGTTCCTGGGAGACTAACATCGGGGGCCTGAACTGGGAGATAACCCTGG 370
Query 371 ACAGTGGCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTGGTTGGCCTGCAGGAGTCTGTAAGGTACATCGCAGTCCTGAAGAAG 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 ACAGTGGCAGTTTCCAGGCACTTGGGCTGGTTGGCCTGCAGGAGTCTGTAAGGTACATCGCAGTCCTGAAGAAG 444
Query 445 ACTACACTTGCCCTCCATCACCTCTCCAGTGGGCACCTCAAGTGGGTGGAACATCTCCCAGAAAGTGACAGCAT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 ACTACACTTGCCCTCCATCACCTCTCCAGTGGGCACCTCAAGTGGGTGGAACATCTCCCAGAAAGTGACAGCAT 518
Query 519 CCACTACCAGATGGTGTATTCTTACGGCTCTGGGGTGGTGTGGGCCCTCGGAGTTGTTCCCTTCAGCCATGTGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 CCACTACCAGATGGTGTATTCTTACGGCTCTGGGGTGGTGTGGGCCCTCGGAGTTGTTCCCTTCAGCCATGTGA 592
Query 593 ACATTGTCAAGTTTAATGTGGAAGATGGAGAGATTGTTCAGCAGGTTAGGGTTTCAACTCCGTGGCTGCAGCAC 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 ACATTGTCAAGTTTAATGTGGAAGATGGAGAGATTGTTCAGCAGGTTAGGGTTTCAACTCCGTGGCTGCAGCAC 666
Query 667 CTGTCTGGAGCCTGTGGTGTGGTGGATGAGGCTGTCCTGGTGTGTCCTGACCCGAGCTCACGTTCCCTCCAAAC 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 CTGTCTGGAGCCTGTGGTGTGGTGGATGAGGCTGTCCTGGTGTGTCCTGACCCGAGCTCACGTTCCCTCCAAAC 740
Query 741 TTTGGCTCTGGAGACGGAATGGGAGTTGAGACAGATCCCACTGCAGTCTCTCGACTTAGAATTTGGAAGTGGAT 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 TTTGGCTCTGGAGACGGAATGGGAGTTGAGACAGATCCCACTGCAGTCTCTCGACTTAGAATTTGGAAGTGGAT 814
Query 815 TCCAACCCCGGGTCCTGCCTACCCAGCCCAACCCAGTGGACGCTTCCCGGGCCCAGTTCTTCCTGCACTTGTCC 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TCCAACCCCGGGTCCTGCCTACCCAGCCCAACCCAGTGGACGCTTCCCGGGCCCAGTTCTTCCTGCACTTGTCC 888
Query 889 CCAAGCCACTATGCTCTGCTGCAGTACCATTATGGAACGCTGAGTTTGCTTAAAAACTTCCCACAGACTGCCCT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CCAAGCCACTATGCTCTGCTGCAGTACCATTATGGAACGCTGAGTTTGCTTAAAAACTTCCCACAGACTGCCCT 962
Query 963 AGTGAGCTTTGCCACCACTGGGGAGAAGACGGTGGCTGCAGTCATGGCCTGTCGGAATGAAGTGCAGAAAAGTA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| ||||||||
Sbjct 963 AGTGAGCTTTGCCACCACTGGGGAGAAGACGGTGGCTGCAGTCATGGCCTGTCGGAATGAAGT---GAAAAGTA 1033
Query 1037 GCAGTTCTGAAGATGGGTCAATGGGGAGCTTTTCGGAGAAGTCTAGTTCAAAGGACTCTCTGGCTTGCTTCAAT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034 GCAGTTCTGAAGATGGGTCAATGGGGAGCTTTTCGGAGAAGTCTAGTTCAAAGGACTCTCTGGCTTGCTTCAAT 1107
Query 1111 CAGACCTACACCATTAACCTATACCTCGTGGAGACAGGTCGGCGGCTGCTGGACACCACGATAACATTTAGCCT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108 CAGACCTACACCATTAACCTATACCTCGTGGAGACAGGTCGGCGGCTGCTGGACACCACGATAACATTTAGCCT 1181
Query 1185 GGAACAGAGCGGCACTCGGCCTGAGCGGCTGTATATCCAGGTGTTCTTGAAGAAGGATGACTCAGTGGGCTACC 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1182 GGAACAGAGCGGCACTCGGCCTGAGCGGCTGTATATCCAGGTGTTCTTGAAGAAGGATGACTCAGTGGGCTACC 1255
Query 1259 GGGCTTTGGTGCAGACAGAGGATCATCTGCTACTTTTCCTGCAGCAGTTGGCAGGGAAGGTGGTGCTGTGGAGC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1256 GGGCTTTGGTGCAGACAGAGGATCATCTGCTACTTTTCCTGCAGCAGTTGGCAGGGAAGGTGGTGCTGTGGAGC 1329
Query 1333 CGTGAGGAGTCCCTGGCAGAAGTGGTGTGCCTAGAGATGGTGGACCTCCCCCTGACTGGGGCACAGGCCGAGCT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1330 CGTGAGGAGTCCCTGGCAGAAGTGGTGTGCCTAGAGATGGTGGACCTCCCCCTGACTGGGGCACAGGCCGAGCT 1403
Query 1407 GGAAGGAGAATTTGGCAAAAAGGCAGATGGCTTGCTGGGGATGTTCCTGAAACGCCTCTCGTCTCAGCTTATCC 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1404 GGAAGGAGAATTTGGCAAAAAGGCAGATGGCTTGCTGGGGATGTTCCTGAAACGCCTCTCGTCTCAGCTTATCC 1477
Query 1481 TGCTGCAAGCATGGACTTCCCACCTCTGGAAAATGTTTTATGATGCTCGGAAGCCCCGGAGTCAGATTAAGAAT 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1478 TGCTGCAAGCATGGACTTCCCACCTCTGGAAAATGTTTTATGATGCTCGGAAGCCCCGGAGTCAGATTAAGAAT 1551
Query 1555 GAGATCAACATTGACACCCTGGCCAGAGATGAATTCAACCTCCAGAAGATGATGGTGATGGTAACAGCCTCAGG 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1552 GAGATCAACATTGACACCCTGGCCAGAGATGAATTCAACCTCCAGAAGATGATGGTGATGGTAACAGCCTCAGG 1625
Query 1629 CAAGCTTTTTGGCATTGAGAGCAGCTCTGGCACCATCCTGTGGAAACAGTATCTACCCAATGTCAAGCCAGACT 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1626 CAAGCTTTTTGGCATTGAGAGCAGCTCTGGCACCATCCTGTGGAAACAGTATCTACCCAATGTCAAGCCAGACT 1699
Query 1703 CCTCCTTTAAACTGATGGTCCAGAGAACTACTGCTCATTTCCCCCATCCCCCACAGTGCACCCTGCTGGTGAAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1700 CCTCCTTTAAACTGATGGTCCAGAGAACTACTGCTCATTTCCCCCATCCCCCACAGTGCACCCTGCTGGTGAAG 1773
Query 1777 GACAAGGAGTCGGGAATGAGTTCTCTGTATGTCTTCAATCCCATTTTTGGGAAGTGGAGTCAGGTAGCTCCCCC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 GACAAGGAGTCGGGAATGAGTTCTCTGTATGTCTTCAATCCCATTTTTGGGAAGTGGAGTCAGGTAGCTCCCCC 1847
Query 1851 AGTGCTGAAGCGCCCCATCTTGCAGTCCTTGCTTCTCCCAGTCATGGATCAAGACTACGCCAAGGTGTTGCTGT 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1848 AGTGCTGAAGCGCCCCATCTTGCAGTCCTTGCTTCTCCCAGTCATGGATCAAGACTACGCCAAGGTGTTGCTGT 1921
Query 1925 TGATAGATGATGAATACAAGGTCACAGCTTTTCCAGCCACTCGGAATGTCTTGCGACAGCTACATGAGCTTGCC 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1922 TGATAGATGATGAATACAAGGTCACAGCTTTTCCAGCCACTCGGAATGTCTTGCGACAGCTACATGAGCTTGCC 1995
Query 1999 CCTTCCATCTTCTTCTATTTGGTGGATGCAGAGCAGGGACGGCTGTGTGGATATCGGCTTCGAAAGGATCTCAC 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1996 CCTTCCATCTTCTTCTATTTGGTGGATGCAGAGCAGGGACGGCTGTGTGGATATCGGCTTCGAAAGGATCTCAC 2069
Query 2073 CACTGAGCTGAGTTGGGAGCTGACCATTCCCCCAGAAGTACAGCGGATCGTCAAGGTGAAGGGGAAACGCAGCA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2070 CACTGAGCTGAGTTGGGAGCTGACCATTCCCCCAGAAGTACAGCGGATCGTCAAGGTGAAGGGGAAACGCAGCA 2143
Query 2147 GTGAGCACGTTCATTCCCAGGGCCGTGTGATGGGGGACCGCAGTGTGCTCTACAAGAGCCTGAACCCCAACCTG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2144 GTGAGCACGTTCATTCCCAGGGCCGTGTGATGGGGGACCGCAGTGTGCTCTACAAGAGCCTGAACCCCAACCTG 2217
Query 2221 CTGGCCGTGGTGACAGAGAGCACAGACGCGCACCATGAGCGCACCTTTATTGGCATCTTCCTCATTGATGGCGT 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2218 CTGGCCGTGGTGACAGAGAGCACAGACGCGCACCATGAGCGCACCTTTATTGGCATCTTCCTCATTGATGGCGT 2291
Query 2295 CACTGGGCGTATCATTCACTCCTCTGTGCAGAAGAAAGCCAAAGGCCCTGTCCATATCGTGCATTCAGAGAACT 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2292 CACTGGGCGTATCATTCACTCCTCTGTGCAGAAGAAAGCCAAAGGCCCTGTCCATATCGTGCATTCAGAGAACT 2365
Query 2369 GGGTGGTGTACCAGTACTGGAACACCAAGGCTCGGCGCAACGAGTTTACCGTACTGGAGCTCTATGAGGGCACT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2366 GGGTGGTGTACCAGTACTGGAACACCAAGGCTCGGCGCAACGAGTTTACCGTACTGGAGCTCTATGAGGGCACT 2439
Query 2443 GAGCAATACAACGCCACCGCCTTCAGCTCCCTGGACCGCCCCCAGCTGCCCCAGGTCCTCCAGCAGTCCTATAT 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2440 GAGCAATACAACGCCACCGCCTTCAGCTCCCTGGACCGCCCCCAGCTGCCCCAGGTCCTCCAGCAGTCCTATAT 2513
Query 2517 CTTCCCGTCCTCCATCAGTGCCATGGAGGCCACCATCACCGAACGGGGCATCACCAGCCGACACCTGCTGATTG 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2514 CTTCCCGTCCTCCATCAGTGCCATGGAGGCCACCATCACCGAACGGGGCATCACCAGCCGACACCTGCTGATTG 2587
Query 2591 GACTACCTTCTGGAGCAATTCTTTCCCTTCCTAAGGCTTTGCTGGATCCCCGCCGCCCCGAGATCCCAACAGAA 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2588 GACTACCTTCTGGAGCAATTCTTTCCCTTCCTAAGGCTTTGCTGGATCCCCGCCGCCCCGAGATCCCAACAGAA 2661
Query 2665 CAAAGCAGAGAGGAGAACTTAATCCCGTATTCTCCAGATGTACAGATACACGCAGAGCGATTCATCAACTATAA 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2662 CAAAGCAGAGAGGAGAACTTAATCCCGTATTCTCCAGATGTACAGATACACGCAGAGCGATTCATCAACTATAA 2735
Query 2739 CCAGACAGTTTCTCGAATGCGAGGTATCTACACAGCTCCCTCGGGTCTGGAGTCCACTTGTTTGGTTGTGGCCT 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2736 CCAGACAGTTTCTCGAATGCGAGGTATCTACACAGCTCCCTCGGGTCTGGAGTCCACTTGTTTGGTTGTGGCCT 2809
Query 2813 ATGGTTTGGACATTTACCAAACTCGAGTCTACCCATCCAAGCAGTTTGACGTTCTGAAGGATGACTATGACTAC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2810 ATGGTTTGGACATTTACCAAACTCGAGTCTACCCATCCAAGCAGTTTGACGTTCTGAAGGATGACTATGACTAC 2883
Query 2887 GTGTTAATCAGCAGCGTCCTCTTTGGCCTGGTTTTTGCCACCATGATCACTAAGAGACTGGCACAGGTGAAGCT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2884 GTGTTAATCAGCAGCGTCCTCTTTGGCCTGGTTTTTGCCACCATGATCACTAAGAGACTGGCACAGGTGAAGCT 2957
Query 2961 CCTGAATCGGGCCTGGCGA 2979
|||||||||||||||||||
Sbjct 2958 CCTGAATCGGGCCTGGCGA 2976