Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02724
- Subject:
- XM_011531317.3
- Aligned Length:
- 1578
- Identities:
- 1286
- Gaps:
- 291
Alignment
Query 1 ATGGCAGCGACCGATATAGCTCGCCAGGTGGGTGAAGGTTGCCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGCGACCGATATAGCTCGCCAGGTGGGTGAAGGTTGCCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT 74
Query 75 TGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCCGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 TGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCCGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGAG 148
Query 149 AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACCCTCATGGACACCCTGTTCAACACCAAATTCGAAGGGGAGCCAGCCACCCAC 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACCCTCATGGACACCCTGTTCAACACCAAATTCGAAGGGGAGCCAGCCACCCAC 222
Query 223 ACACAGCCGGGTGTCCAGCTCCAGTCTAATACCTATGACCTCCAAGAGAGCAACGTGAGGCTAAAGCTCACGAT 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ACACAGCCGGGTGTCCAGCTCCAGTCTAATACCTATGACCTCCAAGAGAGCAACGTGAGGCTAAAGCTCACGAT 296
Query 297 CGTTAGCACAGTTGGCTTTGGGGACCAGATCAACAAAGAGGACAGCTACAAGCCTATCGTGGAATTCATCGATG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 CGTTAGCACAGTTGGCTTTGGGGACCAGATCAACAAAGAGGACAGCTACAAGCCTATCGTGGAATTCATCGATG 370
Query 371 CACAATTCGAGGCCTACCTGCAGGAAGAGCTAAAGATCCGAAGAGTGCTACACACCTACCATGACTCCCGAATC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CACAATTCGAGGCCTACCTGCAGGAAGAGCTAAAGATCCGAAGAGTGCTACACACCTACCATGACTCCCGAATC 444
Query 445 CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCCACGGGTCATTCCCTGAAGTCTCTGGACCTAGTGACTATGAAGAAGCT 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCCACGGGTCATTCCCTGAAGTCTCTGGACCTAGTGACTATGAAGAAGCT 518
Query 519 GGACAGTAAGGTGAACATCATCCCCATCATTGCCAAAGCAGATGCCATTTCGAAGAGTGAGCTAACAAAGTTCA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GGACAGTAAGGTGAACATCATCCCCATCATTGCCAAAGCAGATGCCATTTCGAAGAGTGAGCTAACAAAGTTCA 592
Query 593 AAATCAAAATCACCAGCGAGCTTGTCAGCAACGGAGTCCAGATCTATCAGTTTCCTACAGATGATGAGTCGGTG 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAATCAAAATCACCAGCGAGCTTGTCAGCAACGGAGTCCAGATCTATCAGTTTCCTACAGATGATGAGTCGGTG 666
Query 667 GCAGAGATCAATGGAACCATGAACGCCCACCTGCCGTTTGCTGTCATTGGCAGCACAGAAGAACTGAAGATAGG 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCAGAGATCAATGGAACCATGAACGCCCACCTGCCGTTTGCTGTCATTGGCAGCACAGAAGAACTGAAGATAGG 740
Query 741 CAACAAGATGATGAGGGCGCGGCAGTATCCTTGGGGCACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCCCACTGCGACTTTG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 CAACAAGATGATGAGGGCGCGGCAGTATCCTTGGGGCACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCCCACTGCGACTTTG 814
Query 815 TGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACACCCGGCACTATGAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACACCCGGCACTATGAG 888
Query 889 CTGTATCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCCTTCAGTTTACA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTGTATCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCCTTCAGTTTACA 962
Query 963 GGAGACATATGAGGCCAAAAGGAACGAGTTCCTAGGGGAACTCCAGAAAAAAGAAGAGGAGATGAGACAGATGT 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 GGAGACATATGAGGCCAAAAGGAACGAGTTCCTAGGGGAACTCCAGAAAAAAGAAGAGGAGATGAGACAGATGT 1036
Query 1037 TCGTCCAGCGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAAGAGGCAGAGAAAGAGCTGCACGAGAAGTTTGACCGT 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TCGTCCAGCGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAAGAGGCAGAGAAAGAGCTGCACGAGAAGTTTGACCGT 1110
Query 1111 CTGAAGAAACTGCACCAGGACGAGAAGAAGAAACTGGAGGATAAGAAGAAATCCCTGGATGATGAAGTGAATGC 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 CTGAAGAAACTGCACCAGGACGAGAAGAAGAAACTGGAGGATAAGAAGAAATCCCTGGATGATGAAGTGAATGC 1184
Query 1185 TTTCAAGCAAAGAAAGACGGCGGCTGAGCTGCTCCAGTCCCAGGGCTCCCAGGCTGGAGGCTCACAGACTCTGA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TTTCAAGCAAAGAAAGACGGCGGCTGAGCTGCTCCAGTCCCAGGGCTCCCAGGCTGGAGGCTCACAGACTCTGA 1258
Query 1259 AGAGAGACAAAGAGAAGAAAAACTTTT----TT----------------------------------------- 1287
||||||||||||||||||||||||.|| ||
Sbjct 1259 AGAGAGACAAAGAGAAGAAAAACTCTTACTGTTTTACAGTTAACTCTGCTGTTTGCTGCATGCTGCATGAGACC 1332
Query 1288 -------------------------------------------------------------------------- 1287
Sbjct 1333 CAGGGTCCTGCTTTTTTTAATCTTGTCTTCAGCAGCTGCACTAAGTCTAAAGGAGAAGACTGCCATTATAGAAG 1406
Query 1288 -------------------------------------------------------------------------- 1287
Sbjct 1407 AGTTAGGGTTCCATATTGTCTCAAATCAGAAATCAACCAATTTCCTCTCCCCTCAAACTGCAAGCACACACACA 1480
Query 1288 -------------------------------------------------------------------------- 1287
Sbjct 1481 TACACCACACCACTCAACAAGTGTTCATGTGTCCCTGTGTCCAGGCAAGAAGCTCTCTTCCTGACTCACATGGT 1554
Query 1288 ------------------------ 1287
Sbjct 1555 ATTTTAAATGGAAGTGTCTTGTCC 1578