Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02724
Subject:
XM_011531318.3
Aligned Length:
1407
Identities:
1286
Gaps:
120

Alignment

Query    1  ATGGCAGCGACCGATATAGCTCGCCAGGTGGGTGAAGGTTGCCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCAGCGACCGATATAGCTCGCCAGGTGGGTGAAGGTTGCCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT  74

Query   75  TGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCCGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCCGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGAG  148

Query  149  AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACCCTCATGGACACCCTGTTCAACACCAAATTCGAAGGGGAGCCAGCCACCCAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACCCTCATGGACACCCTGTTCAACACCAAATTCGAAGGGGAGCCAGCCACCCAC  222

Query  223  ACACAGCCGGGTGTCCAGCTCCAGTCTAATACCTATGACCTCCAAGAGAGCAACGTGAGGCTAAAGCTCACGAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ACACAGCCGGGTGTCCAGCTCCAGTCTAATACCTATGACCTCCAAGAGAGCAACGTGAGGCTAAAGCTCACGAT  296

Query  297  CGTTAGCACAGTTGGCTTTGGGGACCAGATCAACAAAGAGGACAGCTACAAGCCTATCGTGGAATTCATCGATG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGTTAGCACAGTTGGCTTTGGGGACCAGATCAACAAAGAGGACAGCTACAAGCCTATCGTGGAATTCATCGATG  370

Query  371  CACAATTCGAGGCCTACCTGCAGGAAGAGCTAAAGATCCGAAGAGTGCTACACACCTACCATGACTCCCGAATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACAATTCGAGGCCTACCTGCAGGAAGAGCTAAAGATCCGAAGAGTGCTACACACCTACCATGACTCCCGAATC  444

Query  445  CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCCACGGGTCATTCCCTGAAGTCTCTGGACCTAGTGACTATGAAGAAGCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCCACGGGTCATTCCCTGAAGTCTCTGGACCTAGTGACTATGAAGAAGCT  518

Query  519  GGACAGTAAGGTGAACATCATCCCCATCATTGCCAAAGCAGATGCCATTTCGAAGAGTGAGCTAACAAAGTTCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGACAGTAAGGTGAACATCATCCCCATCATTGCCAAAGCAGATGCCATTTCGAAGAGTGAGCTAACAAAGTTCA  592

Query  593  AAATCAAAATCACCAGCGAGCTTGTCAGCAACGGAGTCCAGATCTATCAGTTTCCTACAGATGATGAGTCGGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AAATCAAAATCACCAGCGAGCTTGTCAGCAACGGAGTCCAGATCTATCAGTTTCCTACAGATGATGAGTCGGTG  666

Query  667  GCAGAGATCAATGGAACCATGAACGCCCACCTGCCGTTTGCTGTCATTGGCAGCACAGAAGAACTGAAGATAGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GCAGAGATCAATGGAACCATGAACGCCCACCTGCCGTTTGCTGTCATTGGCAGCACAGAAGAACTGAAGATAGG  740

Query  741  CAACAAGATGATGAGGGCGCGGCAGTATCCTTGGGGCACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCCCACTGCGACTTTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAACAAGATGATGAGGGCGCGGCAGTATCCTTGGGGCACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCCCACTGCGACTTTG  814

Query  815  TGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACACCCGGCACTATGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACACCCGGCACTATGAG  888

Query  889  CTGTATCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCCTTCAGTTTACA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGTATCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCCTTCAGTTTACA  962

Query  963  GGAGACATATGAGGCCAAAAGGAACGAGTTCCTAGGGGAACTCCAGAAAAAAGAAGAGGAGATGAGACAGATGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GGAGACATATGAGGCCAAAAGGAACGAGTTCCTAGGGGAACTCCAGAAAAAAGAAGAGGAGATGAGACAGATGT  1036

Query 1037  TCGTCCAGCGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAAGAGGCAGAGAAAGAGCTGCACGAGAAGTTTGACCGT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCGTCCAGCGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAAGAGGCAGAGAAAGAGCTGCACGAGAAGTTTGACCGT  1110

Query 1111  CTGAAGAAACTGCACCAGGACGAGAAGAAGAAACTGGAGGATAAGAAGAAATCCCTGGATGATGAAGTGAATGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGAAGAAACTGCACCAGGACGAGAAGAAGAAACTGGAGGATAAGAAGAAATCCCTGGATGATGAAGTGAATGC  1184

Query 1185  TTTCAAGCAAAGAAAGACGGCGGCTGAGCTGCTCCAGTCCCAGGGCTCCCAGGCTGGAGGCTCACAGACTCTGA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TTTCAAGCAAAGAAAGACGGCGGCTGAGCTGCTCCAGTCCCAGGGCTCCCAGGCTGGAGGCTCACAGACTCTGA  1258

Query 1259  AGAGAGACAAAGAGAAGAAAAACTTTT----TT-----------------------------------------  1287
            ||||||||||||||||||||||||.||    ||                                         
Sbjct 1259  AGAGAGACAAAGAGAAGAAAAACTCTTACTGTTTTACAGTTAACTCTGCTGTTTGCTGCATGCTGCATGAGACC  1332

Query 1288  --------------------------------------------------------------------------  1287
                                                                                      
Sbjct 1333  CAGGGTCCTGTAATCCATGGCTGTGTACTGAATAGTATTCCCCGCTACAGCTGGACTGGACTCCATTTAGCCTT  1406

Query 1288  -  1287
             
Sbjct 1407  T  1407