Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02725
- Subject:
- NM_001177323.2
- Aligned Length:
- 1303
- Identities:
- 1170
- Gaps:
- 20
Alignment
Query 1 ATGGCAGCGACCGATATAGCTCGCCAGGTGGGTGAAGGTTGCCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT 74
|||||||||.|||||||||||||||| |||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGCGGCCGATATAGCTCGCCA---GGGCGAAGATTGTCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT 71
Query 75 TGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCCGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGAG 148
.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 72 CGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCAGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGGG 145
Query 149 AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACCCTCATGGACACCCTGTTCAACACCAAATTCGAAGGGGAGCCAGCCACCCAC 222
||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 146 AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACGCTCATGGATACCCTGTTTAACACCAAGTTTGAAGGGGAGCCAGCGACCCAC 219
Query 223 ACACAGCCGGGTGTCCAGCTCCAGTCTAATACCTATGACCTCCAAGAGAGCAACGTGAGGCTAAAGCTCACGAT 296
||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.||.|.||.|||||.||
Sbjct 220 ACACAGCCAGGGGTTCAGCTCCAGTCCAATACCTACGACCTCCAGGAGAGCAACGTGGGGTTGAAACTCACAAT 293
Query 297 CGTTAGCACAGTTGGCTTTGGGGACCAGATCAACAAAGAGGACAGCTACAAGCCTATCGTGGAATTCATCGATG 370
.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 294 TGTGAGCACTGTAGGCTTTGGGGATCAGATCAACAAGGAGGACAGCTACAAGCCCATCGTGGAATTCATTGATG 367
Query 371 CACAATTCGAGGCCTACCTGCAGGAAGAGCTAAAGATCCGAAGAGTGCTACACACCTACCATGACTCCCGAATC 444
|.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct 368 CTCAGTTTGAGGCCTACCTACAAGAGGAGCTGAAGATCCGAAGAGTACTGCACTCCTACCATGACTCCCGAATC 441
Query 445 CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCCACGGGTCATTCCCTGAAGTCTCTGGACCTAGTGACTATGAAGAAGCT 518
||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 442 CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCGACAGGACATTCGCTTAAGTCTCTGGACCTAGTGACCATGAAGAAGCT 515
Query 519 GGACAGTAAGGTGAACATCATCCCCATCATTGCCAAAGCAGATGCCATTTCGAAGAGTGAGCTAACAAAGTTCA 592
|||.|||||||||||||||||.|||.|.||||||||..|||||||||||||.|||||||||||..|||||||||
Sbjct 516 GGATAGTAAGGTGAACATCATTCCCGTTATTGCCAAGTCAGATGCCATTTCTAAGAGTGAGCTGGCAAAGTTCA 589
Query 593 AAATCAAAATCACCAGCGAGCTTGTCAGCAACGGAGTCCAGATCTATCAGTTTCCTACAGATGATGAGTCGGTG 666
|.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 590 AGATCAAAATCACCAGCGAACTTGTGAGCAATGGAGTCCAGATCTATCAGTTCCCCACAGACGATGAGTCGGTG 663
Query 667 -GCAGAGATCAATGGAACCATGAACGCCCACCTGCCGTTTGCTGTCATTGGCAGCACAGAAGAACTGAAGATAG 739
|| ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 664 AGC-GAGATCAATGGAACCATGAATGCCCACCTGCCGTTTGCTGTTGTTGGCAGCACAGAAGAAGTGAAGATAG 736
Query 740 GCAACAAGATGATGAGGGCGCGGCAGTATCCTTGGGGCACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCCCACTGCGACTTT 813
||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 737 GCAACAAGATGATGCGGGCTCGGCAGTATCCTTGGGGGACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCTCACTGCGACTTT 810
Query 814 GTGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACACCCGGCACTATGA 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 811 GTGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACGCCCGGCACTATGA 884
Query 888 GCTGTATCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCCTTCAGTTTAC 961
..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 885 ATTGTACCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCATTCAGTTTGC 958
Query 962 AGGAGACATATGAGGCCAAAAGGAACGAGTTCCTAGGGGAACTCCAGAAAAAAGAAGAGGAGATGAGACAGATG 1035
||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 959 AGGAGACATATGAGGCAAAGAGAAATGAGTTCCTTGGGGAGCTCCAGAAGAAAGAAGAGGAGATGAGGCAGATG 1032
Query 1036 TTCGTCCAGCGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAAGAGGCAGAGAAAGAGCTGCACGAGAAGTTTGACCG 1109
||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1033 TTTGTCCAGAGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAGGAGGCTGAAAAAGAGCTGCATGAGAAATTTGACCG 1106
Query 1110 TCTGAAGAAACTGCACCAGGACGAGAAGAAGAAACTGGAGGATAAGAAGAAATCCCTGGATGATGAAGTGAATG 1183
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||.|||.||||.|
Sbjct 1107 TCTGAAGAAACTGCACCAGGAAGAGAAGAAGAAGCTGGAGGATAAGAAGAAATGTCTGGATGAGGAAATGAACG 1180
Query 1184 CTTTCAAGCAAAGAAAGACGGCGGCTGAGCTGCTCCAGTCCCAGGGCTCCCAGGCTGGAGGCTCACAGACTCTG 1257
|.||||||||.||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1181 CCTTCAAGCAGAGAAAGGCGGCAGCTGAGCTGCTCCAGTCTCAGGGCTCTCAGGCTGGGGGCTCACAGACTCTG 1254
Query 1258 AAGAGAGACAAAGAGAAGAAAAATAATCCATGGCTGTGTACTGAA 1302
||.||.||||||||||||||.|| ||.|.|.
Sbjct 1255 AAAAGGGACAAAGAGAAGAAGAA----------CTTTTTT----- 1284