Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02725
- Subject:
- NM_001253706.1
- Aligned Length:
- 1303
- Identities:
- 1170
- Gaps:
- 23
Alignment
Query 1 ATGGCAGCGACCGATATAGCTCGCCAGGTGGGTGAAGGTTGCCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT 74
|||||||||.||||||||||||||||||||||.||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCAGCGGCCGATATAGCTCGCCAGGTGGGCGAAGATTGTCGAACTGTCCCCCTGGCTGGACATGTGGGGTT 74
Query 75 TGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCCGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGAG 148
.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 75 CGACAGCTTGCCTGACCAGCTGGTGAATAAGTCAGTCAGCCAGGGCTTCTGCTTCAACATCCTGTGCGTGGGGG 148
Query 149 AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACCCTCATGGACACCCTGTTCAACACCAAATTCGAAGGGGAGCCAGCCACCCAC 222
||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 149 AGACAGGTTTGGGCAAGTCCACGCTCATGGATACCCTGTTTAACACCAAGTTTGAAGGGGAGCCAGCGACCCAC 222
Query 223 ACACAGCCGGGTGTCCAGCTCCAGTCTAATACCTATGACCTCCAAGAGAGCAACGTGAGGCTAAAGCTCACGAT 296
||||||||.||.||.|||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||.||.|.||.|||||.||
Sbjct 223 ACACAGCCAGGGGTTCAGCTCCAGTCCAATACCTACGACCTCCAGGAGAGCAACGTGGGGTTGAAACTCACAAT 296
Query 297 CGTTAGCACAGTTGGCTTTGGGGACCAGATCAACAAAGAGGACAGCTACAAGCCTATCGTGGAATTCATCGATG 370
.||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||
Sbjct 297 TGTGAGCACTGTAGGCTTTGGGGATCAGATCAACAAGGAGGACAGCTACAAGCCCATCGTGGAATTCATTGATG 370
Query 371 CACAATTCGAGGCCTACCTGCAGGAAGAGCTAAAGATCCGAAGAGTGCTACACACCTACCATGACTCCCGAATC 444
|.||.||.|||||||||||.||.||.|||||.||||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||
Sbjct 371 CTCAGTTTGAGGCCTACCTACAAGAGGAGCTGAAGATCCGAAGAGTACTGCACTCCTACCATGACTCCCGAATC 444
Query 445 CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCCACGGGTCATTCCCTGAAGTCTCTGGACCTAGTGACTATGAAGAAGCT 518
||||||||||||||||||||||||||.||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 445 CATGTCTGCTTGTATTTCATTGCCCCGACAGGACATTCGCTTAAGTCTCTGGACCTAGTGACCATGAAGAAGCT 518
Query 519 GGACAGTAAGGTGAACATCATCCCCATCATTGCCAAAGCAGATGCCATTTCGAAGAGTGAGCTAACAAAGTTCA 592
|||.|||||||||||||||||.|||.|.||||||||..|||||||||||||.|||||||||||..|||||||||
Sbjct 519 GGATAGTAAGGTGAACATCATTCCCGTTATTGCCAAGTCAGATGCCATTTCTAAGAGTGAGCTGGCAAAGTTCA 592
Query 593 AAATCAAAATCACCAGCGAGCTTGTCAGCAACGGAGTCCAGATCTATCAGTTTCCTACAGATGATGAGTCGGTG 666
|.|||||||||||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||
Sbjct 593 AGATCAAAATCACCAGCGAACTTGTGAGCAATGGAGTCCAGATCTATCAGTTCCCCACAGACGATGAGTCGGTG 666
Query 667 -GCAGAGATCAATGGAACCATGAACGCCCACCTGCCGTTTGCTGTCATTGGCAGCACAGAAGAACTGAAGATAG 739
|| ||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||..|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 667 AGC-GAGATCAATGGAACCATGAATGCCCACCTGCCGTTTGCTGTTGTTGGCAGCACAGAAGAAGTGAAGATAG 739
Query 740 GCAACAAGATGATGAGGGCGCGGCAGTATCCTTGGGGCACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCCCACTGCGACTTT 813
||||||||||||||.||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 740 GCAACAAGATGATGCGGGCTCGGCAGTATCCTTGGGGGACTGTGCAGGTTGAAAACGAGGCTCACTGCGACTTT 813
Query 814 GTGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACACCCGGCACTATGA 887
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 814 GTGAAGCTGCGGGAGATGCTGATTCGGGTCAACATGGAGGATCTGCGGGAGCAGACCCACGCCCGGCACTATGA 887
Query 888 GCTGTATCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCCTTCAGTTTAC 961
..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct 888 ATTGTACCGCCGCTGTAAGCTGGAGGAGATGGGCTTCAAGGACACCGACCCTGACAGCAAACCATTCAGTTTGC 961
Query 962 AGGAGACATATGAGGCCAAAAGGAACGAGTTCCTAGGGGAACTCCAGAAAAAAGAAGAGGAGATGAGACAGATG 1035
||||||||||||||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||
Sbjct 962 AGGAGACATATGAGGCAAAGAGAAATGAGTTCCTTGGGGAGCTCCAGAAGAAAGAAGAGGAGATGAGGCAGATG 1035
Query 1036 TTCGTCCAGCGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAAGAGGCAGAGAAAGAGCTGCACGAGAAGTTTGACCG 1109
||.||||||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1036 TTTGTCCAGAGAGTCAAAGAGAAAGAAGCGGAGCTCAAGGAGGCTGAAAAAGAGCTGCATGAGAAATTTGACCG 1109
Query 1110 TCTGAAGAAACTGCACCAGGACGAGAAGAAGAAACTGGAGGATAAGAAGAAATCCCTGGATGATGAAGTGAATG 1183
|||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||..||||||||.|||.||||.|
Sbjct 1110 TCTGAAGAAACTGCACCAGGAAGAGAAGAAGAAGCTGGAGGATAAGAAGAAATGTCTGGATGAGGAAATGAACG 1183
Query 1184 CTTTCAAGCAAAGAAAGACGGCGGCTGAGCTGCTCCAGTCCCAGGGCTCCCAGGCTGGAGGCTCACAGACTCTG 1257
|.||||||||.||||||.||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 1184 CCTTCAAGCAGAGAAAGGCGGCAGCTGAGCTGCTCCAGTCTCAGGGCTCTCAGGCTGGGGGCTCACAGACTCTG 1257
Query 1258 AAGAGAGACAAAGAGAAGAAAAATAATCCATGGCTGTGTACTGAA 1302
||.||.||||||||||||||.|||
Sbjct 1258 AAAAGGGACAAAGAGAAGAAGAAT--------------------- 1281