Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02731
• Subject: NM_015155.3
• Aligned Length: 2214
• Identities: 2214
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGACTTCTGATCAGGACGCTAAGGTTGTGGCTGAACCGCAGACGCAGAGAGTCCAGGAGGGCAAGGACAGCGC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACTTCTGATCAGGACGCTAAGGTTGTGGCTGAACCGCAGACGCAGAGAGTCCAGGAGGGCAAGGACAGCGC  74

Query   75  TCATCTGATGAATGGTCCTATATCTCAAACCACTTCTCAGACAAGTTCCATCCCACCTTTGAGTCAGGTACCAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCATCTGATGAATGGTCCTATATCTCAAACCACTTCTCAGACAAGTTCCATCCCACCTTTGAGTCAGGTACCAG  148

Query  149  CAACTAAGGTTTCAGAGCTGAACCCTAATGCAGAAGTGTGGGGGGCTCCTGTGTTACATCTGGAAGCAAGCAGT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CAACTAAGGTTTCAGAGCTGAACCCTAATGCAGAAGTGTGGGGGGCTCCTGTGTTACATCTGGAAGCAAGCAGT  222

Query  223  GCTGCTGACGGTGTGAGTGCTGCATGGGAGGAGGTGGCTGGCCACCACGCAGACCGTGGCCCGCAGGGATCGGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GCTGCTGACGGTGTGAGTGCTGCATGGGAGGAGGTGGCTGGCCACCACGCAGACCGTGGCCCGCAGGGATCGGA  296

Query  297  TGCCAATGGTGATGGTGACCAGGGCCATGAGAATGCCGCATTGCCAGACCCGCAGGAGTCGGACCCAGCAGACA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TGCCAATGGTGATGGTGACCAGGGCCATGAGAATGCCGCATTGCCAGACCCGCAGGAGTCGGACCCAGCAGACA  370

Query  371  TGAACGCTCTCGCTCTGGGTCCCTCAGAATATGACTCTCTGCCTGAAAATAGCGAGACAGGAGGAAATGAGTCT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TGAACGCTCTCGCTCTGGGTCCCTCAGAATATGACTCTCTGCCTGAAAATAGCGAGACAGGAGGAAATGAGTCT  444

Query  445  CAACCAGACAGCCAGGAAGACCCCCGAGAAGTACTTAAAAAAACATTGGAATTCTGCTTATCTAGGGAGAACCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAACCAGACAGCCAGGAAGACCCCCGAGAAGTACTTAAAAAAACATTGGAATTCTGCTTATCTAGGGAGAACCT  518

Query  519  TGCTAGTGACATGTATCTTATATCACAGATGGATAGTGACCAGTATGTGCCAATCACAACGGTGGCTAACCTCG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TGCTAGTGACATGTATCTTATATCACAGATGGATAGTGACCAGTATGTGCCAATCACAACGGTGGCTAACCTCG  592

Query  593  ACCACATCAAGAAGCTCAGCACTGATGTGGACTTGATTGTGGAAGTGCTAAGATCTTTACCTTTAGTCCAAGTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCACATCAAGAAGCTCAGCACTGATGTGGACTTGATTGTGGAAGTGCTAAGATCTTTACCTTTAGTCCAAGTG  666

Query  667  GATGAAAAGGGAGAAAAAGTAAGGCCAAATCAAAATCGCTGCATAGTAATATTGCGTGAAATATCTGAATCTAC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GATGAAAAGGGAGAAAAAGTAAGGCCAAATCAAAATCGCTGCATAGTAATATTGCGTGAAATATCTGAATCTAC  740

Query  741  CCCCGTGGAAGAAGTAGAAGCACTATTTAAAGGAGATAATTTACCAAAATTTATAAACTGTGAATTTGCATATA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CCCCGTGGAAGAAGTAGAAGCACTATTTAAAGGAGATAATTTACCAAAATTTATAAACTGTGAATTTGCATATA  814

Query  815  ATGATAATTGGTTTATTACATTTGAAACAGAAGCTGATGCACAACAGGCTTACAAATACCTTCGAGAAGAAGTC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATGATAATTGGTTTATTACATTTGAAACAGAAGCTGATGCACAACAGGCTTACAAATACCTTCGAGAAGAAGTC  888

Query  889  AAAACTTTTCAAGGAAAACCAATTAAGGCACGGATAAAAGCAAAGGCAATAGCTATAAACACATTTTTGCCAAA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAACTTTTCAAGGAAAACCAATTAAGGCACGGATAAAAGCAAAGGCAATAGCTATAAACACATTTTTGCCAAA  962

Query  963  GAATGGATTTAGACCCCTGGACGTGAGCCTGTATGCCCAGCAGCGCTACGCGACGTCGTTCTACTTCCCTCCCA  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GAATGGATTTAGACCCCTGGACGTGAGCCTGTATGCCCAGCAGCGCTACGCGACGTCGTTCTACTTCCCTCCCA  1036

Query 1037  TGTACAGCCCCCAGCAGCAGTTCCCCCTGTACAGCCTGATCACTCCCCAGACGTGGTCAGCAACGCACAGCTAT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGTACAGCCCCCAGCAGCAGTTCCCCCTGTACAGCCTGATCACTCCCCAGACGTGGTCAGCAACGCACAGCTAT  1110

Query 1111  CTTGACCCACCCTTGGTAACTCCATTTCCAAATACTGGATTTATAAATGGGTTTACGTCTCCAGCGTTCAAGCC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTTGACCCACCCTTGGTAACTCCATTTCCAAATACTGGATTTATAAATGGGTTTACGTCTCCAGCGTTCAAGCC  1184

Query 1185  TGCGGCGTCTCCTCTGACTTCTCTCAGACAGTATCCTCCTCGAAGCAGGAATCCTAGTAAATCTCATCTGCGGC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TGCGGCGTCTCCTCTGACTTCTCTCAGACAGTATCCTCCTCGAAGCAGGAATCCTAGTAAATCTCATCTGCGGC  1258

Query 1259  ATGCGATTCCTAGTGCAGAGAGGGGACCTGGGTTATTAGAAAGTCCTTCAATATTTAACTTCACTGCAGATCGA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATGCGATTCCTAGTGCAGAGAGGGGACCTGGGTTATTAGAAAGTCCTTCAATATTTAACTTCACTGCAGATCGA  1332

Query 1333  TTAATTAATGGTGTCCGGAGTCCACAAACAAGGCAAGCAGGTCAAACTAGAACACGGATTCAAAACCCTTCAGC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TTAATTAATGGTGTCCGGAGTCCACAAACAAGGCAAGCAGGTCAAACTAGAACACGGATTCAAAACCCTTCAGC  1406

Query 1407  ATATGCCAAGAGAGAGGCTGGGCCTGGGCGTGTGGAGCCAGGCAGTCTCGAATCCTCTCCTGGTTTAGGGAGGG  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ATATGCCAAGAGAGAGGCTGGGCCTGGGCGTGTGGAGCCAGGCAGTCTCGAATCCTCTCCTGGTTTAGGGAGGG  1480

Query 1481  GAAGGAAGAATTCCTTTGGCTACCGGAAGAAAAGGGAGGAGAAGTTTACAAGCAGCCAGACACAGTCTCCAACG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  GAAGGAAGAATTCCTTTGGCTACCGGAAGAAAAGGGAGGAGAAGTTTACAAGCAGCCAGACACAGTCTCCAACG  1554

Query 1555  CCACCAAAGCCTCCGTCGCCAAGCTTCGAGCTGGGGCTGTCCAGCTTCCCTCCATTACCTGGAGCTGCCGGCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CCACCAAAGCCTCCGTCGCCAAGCTTCGAGCTGGGGCTGTCCAGCTTCCCTCCATTACCTGGAGCTGCCGGCAA  1628

Query 1629  TTTGAAGACAGAGGACTTGTTTGAAAACAGGCTATCTAGCTTGATAATAGGACCATCCAAAGAAAGGACCCTCA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  TTTGAAGACAGAGGACTTGTTTGAAAACAGGCTATCTAGCTTGATAATAGGACCATCCAAAGAAAGGACCCTCA  1702

Query 1703  GTGCAGACGCAAGCGTGAACACCCTTCCTGTAGTGGTCTCCAGAGAGCCCTCGGTGCCGGCTTCTTGTGCTGTA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  GTGCAGACGCAAGCGTGAACACCCTTCCTGTAGTGGTCTCCAGAGAGCCCTCGGTGCCGGCTTCTTGTGCTGTA  1776

Query 1777  TCAGCAACGTACGAGCGATCCCCCTCCCCAGCTCATTTACCCGATGATCCCAAGGTGGCGGAGAAACAGAGGGA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCAGCAACGTACGAGCGATCCCCCTCCCCAGCTCATTTACCCGATGATCCCAAGGTGGCGGAGAAACAGAGGGA  1850

Query 1851  AACCCACAGTGTGGACAGACTTCCTTCCGCCCTCACTGCGACCGCGTGTAAATCGGTGCAGGTGAACGGAGCCG  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  AACCCACAGTGTGGACAGACTTCCTTCCGCCCTCACTGCGACCGCGTGTAAATCGGTGCAGGTGAACGGAGCCG  1924

Query 1925  CCACGGAATTGCGAAAGCCCAGCTACGCAGAGATTTGTCAGAGAACGAGTAAAGAGCCTCCTTCTTCCCCATTG  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  CCACGGAATTGCGAAAGCCCAGCTACGCAGAGATTTGTCAGAGAACGAGTAAAGAGCCTCCTTCTTCCCCATTG  1998

Query 1999  CAACCCCAAAAAGAACAAAAGCCAAACACTGTTGGTTGTGGGAAGGAGGAAAAGAAGCTGGCAGAGCCCGCAGA  2072
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  CAACCCCAAAAAGAACAAAAGCCAAACACTGTTGGTTGTGGGAAGGAGGAAAAGAAGCTGGCAGAGCCCGCAGA  2072

Query 2073  GAGATACCGGGAGCCCCCAGCCCTCAAGTCCACACCTGGAGCCCCCAGAGACCAGAGGCGGCCGGCGGGGGGCC  2146
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073  GAGATACCGGGAGCCCCCAGCCCTCAAGTCCACACCTGGAGCCCCCAGAGACCAGAGGCGGCCGGCGGGGGGCC  2146

Query 2147  GGCCCTCGCCCTCGGCCATGGGGAAGCGTCTCAGCCGAGAGCAGAGCACTCCCCCCAAGTCTCCTCAG  2214
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147  GGCCCTCGCCCTCGGCCATGGGGAAGCGTCTCAGCCGAGAGCAGAGCACTCCCCCCAAGTCTCCTCAG  2214