Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02740
• Subject: NM_001173480.2
• Aligned Length: 1548
• Identities: 1242
• Gaps: 306

Alignment

Query    1  ATGACGTTGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGATCACGTCACCATGGCCAACCG  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGA  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  TCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGAGGTGGAGGAG  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTGTCTGGGGCGGCCACTACAGAA  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  CCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTCACTACATCAAGCACCTCAAGG  370
                      ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------ATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTCACTACATCAAGCACCTCAAGG  64

Query  371  ATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGTAATC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   65  ATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGTAATC  138

Query  445  TTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCTGGAGAAACAGTATAACAATGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  139  TTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCTGGAGAAACAGTATAACAATGA  212

Query  519  TGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAGTATT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  213  TGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAGTATT  286

Query  593  GTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTTTGAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  287  GTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTTTGAG  360

Query  667  GCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCAGAAGATCTG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  361  GCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCAGAAGATCTG  434

Query  741  CAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACAGTGACTACAGGTATGTGGCAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  435  CAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACAGTGACTACAGGTATGTGGCAG  508

Query  815  CTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGACGTTTAGAGAATATTGACAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  509  CTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGACGTTTAGAGAATATTGACAAG  582

Query  889  ATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGGAGGGCGAGGACATCCTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  583  ATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGGAGGGCGAGGACATCCTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTA  656

Query  963  CACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCGGGTCTTCTTCCTGTTTGACCACC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  657  CACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCGGGTCTTCTTCCTGTTTGACCACC  730

Query 1037  AGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATGGATAAA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  731  AGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATGGATAAA  804

Query 1111  TATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGCTTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  805  TATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGCTTCA  878

Query 1185  CAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGGGCTT  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  879  CAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGGGCTT  952

Query 1259  TCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAGGCAG  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  953  TCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAGGCAG  1026

Query 1333  GCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGGTGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTCCTCCTTCCTACCC  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1027  GCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGGTGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTCCTCCTTCCTACCC  1100

Query 1407  ACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCGCTCAGTCGCAGGTCTTTGAGT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1101  ACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCGCTCAGTCGCAGGTCTTTGAGT  1174

Query 1481  TCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTAACCCCCTTCAAAAAA  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1175  TCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTAACCCCCTTCAAAAAA  1242