Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02740
• Subject: NM_001353922.2
• Aligned Length: 1569
• Identities: 1414
• Gaps: 153

Alignment

Query    1  ATGACGT---------------------TGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGA  53
            |||..||                     ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCAGTGGATAAGGGGCGGATCGGGAATGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGA  74

Query   54  TCACGTCACCATGGCCAACCGGGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACA  127
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TCACGTCACCATGGCCAACCGGGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACA  148

Query  128  AGGATTGGTGGTGGGGCCAGATCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAAC  201
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  AGGATTGGTGGTGGGGCCAGATCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAAC  222

Query  202  CAGGAGGATGAGGTGGAGGAGGGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTG  275
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CAGGAGGATGAGGTGGAGGAGGGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTG  296

Query  276  TCTGGGGCGGCCACTACAGAACCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTC  349
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCTGGGGCGGCCACTACAGAACCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTC  370

Query  350  ACTACATCAAGCACCTCAAGGATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGT  423
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACTACATCAAGCACCTCAAGGATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGT  444

Query  424  GACGAGCAACTGAAGGTAATCTTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCT  497
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACGAGCAACTGAAGGTAATCTTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCT  518

Query  498  GGAGAAACAGTATAACAATGATGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGAT  571
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAGAAACAGTATAACAATGATGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGAT  592

Query  572  TCTGGATATACTCTGAGTATTGTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGC  645
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  TCTGGATATACTCTGAGTATTGTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGC  666

Query  646  CGCTACCAGCACTTCTTTGAGGCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTT  719
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGCTACCAGCACTTCTTTGAGGCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTT  740

Query  720  GACTCCAGTGCAGAAGATCTGCAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACA  793
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GACTCCAGTGCAGAAGATCTGCAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACA  814

Query  794  GTGACTACAGGTATGTGGCAGCTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGA  867
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGACTACAGGTATGTGGCAGCTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGA  888

Query  868  CGTTTAGAGAATATTGACAAGATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGGAGGGCGAGGACATCCTAGA  941
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||                   
Sbjct  889  CGTTTAGAGAATATTGACAAGATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGG-------------------  943

Query  942  CAGGAGCTCGGAGCTGATCTACACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCGGG  1015
                                                                                      
Sbjct  944  --------------------------------------------------------------------------  943

Query 1016  TCTTCTTCCTGTTTGACCACCAGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAA  1089
                                                   |||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  944  ---------------------------------------AGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAA  978

Query 1090  GGCCGCATTGACATGGATAAATATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCAT  1163
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  979  GGCCGCATTGACATGGATAAATATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCAT  1052

Query 1164  GAAGAATGCCTTTAAGCTTCACAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAA  1237
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053  GAAGAATGCCTTTAAGCTTCACAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAA  1126

Query 1238  AAATACGCTGGCTCAGGGCTTTCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATT  1311
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127  AAATACGCTGGCTCAGGGCTTTCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATT  1200

Query 1312  TCTGAAAACCAGAAGAGGCAGGCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGGTGTCAACTCTGCCCG  1385
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201  TCTGAAAACCAGAAGAGGCAGGCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGGTGTCAACTCTGCCCG  1274

Query 1386  CTCAGTTCCTCCTTCCTACCCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCG  1459
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275  CTCAGTTCCTCCTTCCTACCCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCG  1348

Query 1460  CTCAGTCGCAGGTCTTTGAGTTCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTA  1533
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349  CTCAGTCGCAGGTCTTTGAGTTCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTA  1422

Query 1534  ACCCCCTTCAAAAAA  1548
            |||||||||||||||
Sbjct 1423  ACCCCCTTCAAAAAA  1437