Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02740
• Subject: NM_001353923.1
• Aligned Length: 1588
• Identities: 1545
• Gaps: 41

Alignment

Query    1  ---------------------------------------ATGACG-TTGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTA  34
                                                   | |.|| |.||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAGTGGCTCTGGCCGCGCCTCACGCAAGCGCCCGCA-GTCGCTCGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTA  73

Query   35  GTGCTGAGGCAGTATGGGATCACGTCACCATGGCCAACCGGGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAA  108
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   74  GTGCTGAGGCAGTATGGGATCACGTCACCATGGCCAACCGGGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAA  147

Query  109  GTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGATCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTT  182
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  148  GTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGATCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTT  221

Query  183  TGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGAGGTGGAGGAGGGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACC  256
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  222  TGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGAGGTGGAGGAGGGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACC  295

Query  257  CCAATTCAGACTGCCTCTGTCTGGGGCGGCCACTACAGAACCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAG  330
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  296  CCAATTCAGACTGCCTCTGTCTGGGGCGGCCACTACAGAACCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAG  369

Query  331  ATAATGAGCACTGAGCGTCACTACATCAAGCACCTCAAGGATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAA  404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  370  ATAATGAGCACTGAGCGTCACTACATCAAGCACCTCAAGGATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAA  443

Query  405  GAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGTAATCTTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGA  478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  444  GAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGTAATCTTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGA  517

Query  479  TGGGCTTTGTGAGAGACCTGGAGAAACAGTATAACAATGATGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTC  552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  518  TGGGCTTTGTGAGAGACCTGGAGAAACAGTATAACAATGATGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTC  591

Query  553  CTAGAGCACCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAGTATTGTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTC  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  592  CTAGAGCACCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAGTATTGTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTC  665

Query  627  CAAACTGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTTTGAGGCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTG  700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  666  CAAACTGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTTTGAGGCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTG  739

Query  701  CTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCAGAAGATCTGCAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAG  774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  740  CTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCAGAAGATCTGCAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAG  813

Query  775  TATACTGCCCAAGACCACAGTGACTACAGGTATGTGGCAGCTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCA  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  814  TATACTGCCCAAGACCACAGTGACTACAGGTATGTGGCAGCTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCA  887

Query  849  GATCAACGAACGCAAGCGACGTTTAGAGAATATTGACAAGATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGG  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  888  GATCAACGAACGCAAGCGACGTTTAGAGAATATTGACAAGATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGG  961

Query  923  AGGGCGAGGACATCCTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTACACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTAC  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  962  AGGGCGAGGACATCCTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTACACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTAC  1035

Query  997  GGCCGCAACCAGCAGCGGGTCTTCTTCCTGTTTGACCACCAGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAG  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1036  GGCCGCAACCAGCAGCGGGTCTTCTTCCTGTTTGACCACCAGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAG  1109

Query 1071  AGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATGGATAAATATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATG  1144
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1110  AGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATGGATAAATATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATG  1183

Query 1145  ATGACTTCAATGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGCTTCACAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTT  1218
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1184  ATGACTTCAATGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGCTTCACAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTT  1257

Query 1219  GCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGGGCTTTCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGA  1292
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1258  GCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGGGCTTTCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGA  1331

Query 1293  AAAAATTGGCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAGGCAGGCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAA  1366
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1332  AAAAATTGGCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAGGCAGGCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAA  1405

Query 1367  AAGGTGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTCCTCCTTCCTACCCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTAC  1440
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1406  AAGGTGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTCCTCCTTCCTACCCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTAC  1479

Query 1441  CTGGTCCCCGACGGCATCGCTCAGTCGCAGGTCTTTGAGTTCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTG  1514
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1480  CTGGTCCCCGACGGCATCGCTCAGTCGCAGGTCTTTGAGTTCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTG  1553

Query 1515  GCAAAACTTCAGCAGGTTAACCCCCTTCAAAAAA  1548
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1554  GCAAAACTTCAGCAGGTTAACCCCCTTCAAAAAA  1587