Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02740
- Subject:
- XM_011247585.2
- Aligned Length:
- 1561
- Identities:
- 1221
- Gaps:
- 245
Alignment
Query 1 ATGACGTTGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGATCACGTCACCATGGCCAACCG 74
|||||||||||
Sbjct 1 ---------------------------------------------------------------ATGGCCAACCG 11
Query 75 GGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGA 148
|||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 12 GGAGTTGGCATTTAAGGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGA 85
Query 149 TCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGAGGTGGAGGAG 222
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct 86 TCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGGGGTGGAGGAA 159
Query 223 GGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTGTCTGGGGCGGCCACTACAGAA 296
||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct 160 GGGCCCAGTGATGTGCAGAATGGGCACCTGGACCCCAACTCAGACTGCCTTTGTCTGGGCCGGCCACTACAGAA 233
Query 297 CCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTCACTACATCAAGCACCTCAAGG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 234 CCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATCATGAGCACGGAGCGCCATTACATCAAGCACCTCAAGG 307
Query 371 ATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGTAATC 444
|.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 308 ACATTTGCGAGGGCTACCTGAAGCAGTGCCGAAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAGCTGAAGGTCATC 381
Query 445 TTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCTGGAGAAACAGTATAACAATGA 518
|||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 382 TTTGGAAACATTGAAGACATATACAGATTTCAGATGGGCTTCGTGAGAGACCTGGAGAAGCAGTACAACAATGA 455
Query 519 TGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAGTATT 592
|||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 456 TGATCCCCACCTCAGTGAGATAGGACCCTGCTTCTTAGAGCATCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAATATT 529
Query 593 GTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTTTGAG 666
|||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 530 GTAACAACCACCTGGATGCCTGCATGGAACTCTCCAAGCTGATGAAGGACAGCCGCTATCAACACTTCTTTGAG 603
Query 667 GCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCAGAAGATCTG 740
|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct 604 GCCTGCCGCCTCTTGCAGCAGATGATCGACATTGCTATTGATGGTTTTCTTTTGACTCCAGTACAGAAGATCTG 677
Query 741 CAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACAGTGACTACAGGTATGTGGCAG 814
|||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct 678 CAAATATCCCTTACAATTGGCCGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGATCACAGTGATTACAGATACGTTGCAG 751
Query 815 CTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGACGTTTAGAGAATATTGACAAG 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct 752 CTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAATGAACGCAAGCGACGTCTGGAGAATATTGACAAG 825
Query 889 ATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGGAGGGCGAGGACATCCTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTA 962
|||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct 826 ATTGCGCAATGGCAGGCCTCTGTCCTAGACTGGGAGGGAGAGGACATCTTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTA 899
Query 963 CACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCGGGTCTTCTTCCTGTTTGACCACC 1036
||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct 900 CACTGGAGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTATGGCCGCAACCAGCAGAGAGTCTTCTTCCTGTTTGACCACC 973
Query 1037 AGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATGGATAAA 1110
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 974 AGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTATACTACAAGGGGCGCATTGACATGGATAAA 1047
Query 1111 TATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGCTTCA 1184
|||||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1048 TATGAGGTAATTGACATCGAAGATGGCAGAGATGATGACTTTAATGTCAGCATGAAAAATGCTTTCAAGCTTCA 1121
Query 1185 CAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGGGCTT 1258
.||||||||.||.||.||..|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1122 TAACAAGGAAACGGAAGAAGTGCATCTGTTCTTTGCCAAGAAACTGGAGGAGAAAATACGTTGGCTTAGAGCTT 1195
Query 1259 TCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAGGCAG 1332
|||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1196 TCAGAGAAGAGAGAAAAATGGTACAAGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAGATTTCTGAAAATCAGAAGAGACAG 1269
Query 1333 GCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAG-------------GTGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTC 1393
||||||||||||||||||||||...||||.||.|||| .||.| |||.|
Sbjct 1270 GCTGCAATGACTGTGAGAAAAGCTTCTAAACAGAAAGTAACCCAAAGAAAATGGC-ACTAT------------- 1329
Query 1394 CTCCTTCCTACCCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCGCTCAGTCG 1467
Sbjct 1330 -------------------------------------------------------------------------- 1329
Query 1468 CAGGTCTTTGAGTTCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTAACCCCCTT 1541
Sbjct 1330 -------------------------------------------------------------------------- 1329
Query 1542 CAAAAAA 1548
Sbjct 1330 ------- 1329