Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02740
• Subject: XM_017318474.1
• Aligned Length: 1556
• Identities: 1322
• Gaps: 130

Alignment

Query    1  ATGACGTTGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGATCACGTCACCATGGCCAACCG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGACGTTGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGATCACGTCACCATGGCCAACCG  74

Query   75  GGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGA  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGAGTTGGCATTTAAGGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGA  148

Query  149  TCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGAGGTGGAGGAG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct  149  TCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGGGGTGGAGGAA  222

Query  223  GGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTGTCTGGGGCGGCCACTACAGAA  296
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  223  GGGCCCAGTGATGTGCAGAATGGGCACCTGGACCCCAACTCAGACTGCCTTTGTCTGGGCCGGCCACTACAGAA  296

Query  297  CCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTCACTACATCAAGCACCTCAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  297  CCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATCATGAGCACGGAGCGCCATTACATCAAGCACCTCAAGG  370

Query  371  ATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGTAATC  444
            |.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  371  ACATTTGCGAGGGCTACCTGAAGCAGTGCCGAAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAGCTGAAGGTCATC  444

Query  445  TTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCTGGAGAAACAGTATAACAATGA  518
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  445  TTTGGAAACATTGAAGACATATACAGATTTCAGATGGGCTTCGTGAGAGACCTGGAGAAGCAGTACAACAATGA  518

Query  519  TGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAGTATT  592
            |||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  519  TGATCCCCACCTCAGTGAGATAGGACCCTGCTTCTTAGAGCATCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAATATT  592

Query  593  GTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTTTGAG  666
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  593  GTAACAACCACCTGGATGCCTGCATGGAACTCTCCAAGCTGATGAAGGACAGCCGCTATCAACACTTCTTTGAG  666

Query  667  GCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCAGAAGATCTG  740
            |||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  667  GCCTGCCGCCTCTTGCAGCAGATGATCGACATTGCTATTGATGGTTTTCTTTTGACTCCAGTACAGAAGATCTG  740

Query  741  CAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACAGTGACTACAGGTATGTGGCAG  814
            |||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct  741  CAAATATCCCTTACAATTGGCCGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGATCACAGTGATTACAGATACGTTGCAG  814

Query  815  CTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGACGTTTAGAGAATATTGACAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct  815  CTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAATGAACGCAAGCGACGTCTGGAGAATATTGACAAG  888

Query  889  ATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGGAGGGCGAGGACATCCTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTA  962
            |||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ATTGCGCAATGGCAGGCCTCTGTCCTAGACTGGGAGGGAGAGGACATCTTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTA  962

Query  963  CACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCGGGTCTTCTTCCTGTTTGACCACC  1036
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CACTGGAGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTATGGCCGCAACCAGCAGAGAGTCTTCTTCCTGTTTGACCACC  1036

Query 1037  AGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATGGATAAA  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTATACTACAAGGGGCGCATTGACATGGATAAA  1110

Query 1111  TATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGCTTCA  1184
            |||||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1111  TATGAGGTAATTGACATCGAAGATGGCAGAGATGATGACTTTAATGTCAGCATGAAAAATGCTTTCAAGCTTCA  1184

Query 1185  CAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGGGCTT  1258
            .||||||||.||.||.||..|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1185  TAACAAGGAAACGGAAGAAGTGCATCTGTTCTTTGCCAAGAAACTGGAGGAGAAAATACGTTGGCTTAGAGCTT  1258

Query 1259  TCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAGGCAG  1332
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1259  TCAGAGAAGAGAGAAAAATGGTACAAGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAGATTTCTGAAAATCAGAAGAGACAG  1332

Query 1333  GCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAGG--TGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTCCTCCTTCCTAC  1404
            ||||||||||||||||||||||...||||.||.|||||  |||||   |||     |||             ||
Sbjct 1333  GCTGCAATGACTGTGAGAAAAGCTTCTAAACAGAAAGGTTTGTCA---CTG-----TCA-------------AC  1385

Query 1405  CCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCC----CCG--ACGGCATCGCTCAGTCGCAGGT  1472
            ||| .|.|..|..||    |||         |.|||.|||.||    |||  |.||.|      ||||.     
Sbjct 1386  CCA-AAGCAAAATAC----TAA---------ATTACTTGGGCCTTAACCGTTATGGAA------AGTCC-----  1434

Query 1473  CTTTGAGTTCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTAACCCCCTTCAAAA  1546
                                                                                      
Sbjct 1435  --------------------------------------------------------------------------  1434

Query 1547  AA  1548
              
Sbjct 1435  --  1434