Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02740
• Subject: XM_017318478.1
• Aligned Length: 1561
• Identities: 1221
• Gaps: 245

Alignment

Query    1  ATGACGTTGCTGATCACTGGAGATTCCATCGTTAGTGCTGAGGCAGTATGGGATCACGTCACCATGGCCAACCG  74
                                                                           |||||||||||
Sbjct    1  ---------------------------------------------------------------ATGGCCAACCG  11

Query   75  GGAGTTGGCATTTAAAGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGA  148
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   12  GGAGTTGGCATTTAAGGCTGGCGACGTCATCAAAGTCTTGGATGCTTCCAACAAGGATTGGTGGTGGGGCCAGA  85

Query  149  TCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGAGGTGGAGGAG  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||.
Sbjct   86  TCGACGATGAGGAGGGATGGTTTCCTGCCAGCTTTGTGAGGCTCTGGGTGAACCAGGAGGATGGGGTGGAGGAA  159

Query  223  GGGCCCAGCGATGTGCAGAACGGACACCTGGACCCCAATTCAGACTGCCTCTGTCTGGGGCGGCCACTACAGAA  296
            ||||||||.|||||||||||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  160  GGGCCCAGTGATGTGCAGAATGGGCACCTGGACCCCAACTCAGACTGCCTTTGTCTGGGCCGGCCACTACAGAA  233

Query  297  CCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATAATGAGCACTGAGCGTCACTACATCAAGCACCTCAAGG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct  234  CCGGGACCAGATGCGGGCCAATGTCATCAATGAGATCATGAGCACGGAGCGCCATTACATCAAGCACCTCAAGG  307

Query  371  ATATTTGTGAGGGCTATCTGAAGCAGTGCCGGAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAACTGAAGGTAATC  444
            |.|||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||
Sbjct  308  ACATTTGCGAGGGCTACCTGAAGCAGTGCCGAAAGAGAAGGGACATGTTCAGTGACGAGCAGCTGAAGGTCATC  381

Query  445  TTTGGGAACATTGAAGATATCTACAGATTTCAGATGGGCTTTGTGAGAGACCTGGAGAAACAGTATAACAATGA  518
            |||||.|||||||||||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct  382  TTTGGAAACATTGAAGACATATACAGATTTCAGATGGGCTTCGTGAGAGACCTGGAGAAGCAGTACAACAATGA  455

Query  519  TGACCCCCACCTCAGCGAGATAGGACCCTGCTTCCTAGAGCACCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAGTATT  592
            |||.|||||||||||.||||||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct  456  TGATCCCCACCTCAGTGAGATAGGACCCTGCTTCTTAGAGCATCAAGATGGATTCTGGATATACTCTGAATATT  529

Query  593  GTAACAACCACCTGGATGCTTGCATGGAGCTCTCCAAACTGATGAAGGACAGCCGCTACCAGCACTTCTTTGAG  666
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||||||
Sbjct  530  GTAACAACCACCTGGATGCCTGCATGGAACTCTCCAAGCTGATGAAGGACAGCCGCTATCAACACTTCTTTGAG  603

Query  667  GCCTGTCGCCTCTTGCAGCAGATGATTGACATTGCTATCGATGGTTTCCTTTTGACTCCAGTGCAGAAGATCTG  740
            |||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  604  GCCTGCCGCCTCTTGCAGCAGATGATCGACATTGCTATTGATGGTTTTCTTTTGACTCCAGTACAGAAGATCTG  677

Query  741  CAAGTATCCCTTACAGTTGGCTGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGACCACAGTGACTACAGGTATGTGGCAG  814
            |||.|||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||.||||
Sbjct  678  CAAATATCCCTTACAATTGGCCGAGCTCCTAAAGTATACTGCCCAAGATCACAGTGATTACAGATACGTTGCAG  751

Query  815  CTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAACGAACGCAAGCGACGTTTAGAGAATATTGACAAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.|||||||||||||||
Sbjct  752  CTGCTTTGGCTGTCATGAGAAATGTGACTCAGCAGATCAATGAACGCAAGCGACGTCTGGAGAATATTGACAAG  825

Query  889  ATTGCTCAGTGGCAGGCTTCTGTCCTAGACTGGGAGGGCGAGGACATCCTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTA  962
            |||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  826  ATTGCGCAATGGCAGGCCTCTGTCCTAGACTGGGAGGGAGAGGACATCTTAGACAGGAGCTCGGAGCTGATCTA  899

Query  963  CACTGGGGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTACGGCCGCAACCAGCAGCGGGTCTTCTTCCTGTTTGACCACC  1036
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||
Sbjct  900  CACTGGAGAGATGGCCTGGATCTACCAGCCCTATGGCCGCAACCAGCAGAGAGTCTTCTTCCTGTTTGACCACC  973

Query 1037  AGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTGTACTACAAAGGCCGCATTGACATGGATAAA  1110
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||||||||||||||||||
Sbjct  974  AGATGGTCCTCTGCAAGAAGGACCTAATCCGGAGAGACATCCTATACTACAAGGGGCGCATTGACATGGATAAA  1047

Query 1111  TATGAGGTAGTTGACATTGAGGATGGCAGAGATGATGACTTCAATGTCAGCATGAAGAATGCCTTTAAGCTTCA  1184
            |||||||||.|||||||.||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1048  TATGAGGTAATTGACATCGAAGATGGCAGAGATGATGACTTTAATGTCAGCATGAAAAATGCTTTCAAGCTTCA  1121

Query 1185  CAACAAGGAGACTGAGGAGATACATCTGTTCTTTGCCAAGAAGCTGGAGGAAAAAATACGCTGGCTCAGGGCTT  1258
            .||||||||.||.||.||..|.||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 1122  TAACAAGGAAACGGAAGAAGTGCATCTGTTCTTTGCCAAGAAACTGGAGGAGAAAATACGTTGGCTTAGAGCTT  1195

Query 1259  TCAGAGAAGAGAGGAAAATGGTACAGGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAAATTTCTGAAAACCAGAAGAGGCAG  1332
            |||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.|||
Sbjct 1196  TCAGAGAAGAGAGAAAAATGGTACAAGAAGATGAAAAAATTGGCTTTGAGATTTCTGAAAATCAGAAGAGACAG  1269

Query 1333  GCTGCAATGACTGTGAGAAAAGTCCCTAAGCAAAAAG-------------GTGTCAACTCTGCCCGCTCAGTTC  1393
            ||||||||||||||||||||||...||||.||.||||             .||.| |||.|             
Sbjct 1270  GCTGCAATGACTGTGAGAAAAGCTTCTAAACAGAAAGTAACCCAAAGAAAATGGC-ACTAT-------------  1329

Query 1394  CTCCTTCCTACCCACCACCGCAGGACCCGTTAAACCACGGCCAGTACCTGGTCCCCGACGGCATCGCTCAGTCG  1467
                                                                                      
Sbjct 1330  --------------------------------------------------------------------------  1329

Query 1468  CAGGTCTTTGAGTTCACCGAACCCAAGCGCAGCCAGTCACCATTCTGGCAAAACTTCAGCAGGTTAACCCCCTT  1541
                                                                                      
Sbjct 1330  --------------------------------------------------------------------------  1329

Query 1542  CAAAAAA  1548
                   
Sbjct 1330  -------  1329