Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02742
• Subject: NM_001370229.1
• Aligned Length: 1236
• Identities: 981
• Gaps: 255

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGCGACTGCAGCCAGCCCGGTAGGTGCGCGCGGGGCGGGGCGGGGCGGGCGGCGCGGACACAGGCCCAGGAG  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CCGCCGGGGCCGGGCGCGCGAGGGCGCTCGGAGCCGGGATCGGGAAGCCGCTGGTGGCAAAGTTCTCGCAGCGC  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  GCGGAGCCCCGAGCCCCGGGCGGGTGCAGCGGGAGGCGTGCGGGACGCAGATGCTCCTGCGGGAAGAAGTGTCG  222

Query    1  ---------------------------------ATGAAGGAGATGTTGGCGAAGGACCTGGAGGAGTCGCAGGG  41
                                             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CGGCTCCAGGAGGAAGTTCACCTTCTCCGGCAGATGAAGGAGATGTTGGCGAAGGACCTGGAGGAGTCGCAGGG  296

Query   42  CGGCAAGTCCTCTGAGGTCCTCTCGGCCACCGAGCTCAGGGTCCAGCTGGCCCAGAAGGAGCAGGAGCTAGCCA  115
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CGGCAAGTCCTCTGAGGTCCTCTCGGCCACCGAGCTCAGGGTCCAGCTGGCCCAGAAGGAGCAGGAGCTAGCCA  370

Query  116  GAGCCAAAGAAGCCTTGCAGGCCATGAAAGCTGATCGGAAGCGCTTAAAGGGCGAGAAGACAGACCTGGTGAGC  189
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GAGCCAAAGAAGCCTTGCAGGCCATGAAAGCTGATCGGAAGCGCTTAAAGGGCGAGAAGACAGACCTGGTGAGC  444

Query  190  CAGATGCAGCAGCTGTATGCCACACTGGAGAGCCGCGAGGAGCAGCTCCGAGACTTCATCCGCAACTATGAGCA  263
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CAGATGCAGCAGCTGTATGCCACACTGGAGAGCCGCGAGGAGCAGCTCCGAGACTTCATCCGCAACTATGAGCA  518

Query  264  GCACCGCAAGGAGAGCGAGGATGCGGTCAAAGCGCTGGCCAAGGAGAAGGACCTGCTGGAGCGTGAGAAGTGGG  337
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GCACCGCAAGGAGAGCGAGGATGCGGTCAAAGCGCTGGCCAAGGAGAAGGACCTGCTGGAGCGTGAGAAGTGGG  592

Query  338  AGCTGCGGCGCCAAGCCAAGGAGGCCACAGACCACGCCACGGCACTGCGCTCCCAGCTGGACCTCAAGGACAAC  411
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTGCGGCGCCAAGCCAAGGAGGCCACAGACCACGCCACGGCACTGCGCTCCCAGCTGGACCTCAAGGACAAC  666

Query  412  CGGATGAAGGAGCTGGAGGCCGAGCTGGCCATGGCCAAACAGTCCTTAGCTACGCTGACCAAGGACGTCCCCAA  485
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CGGATGAAGGAGCTGGAGGCCGAGCTGGCCATGGCCAAACAGTCCTTAGCTACGCTGACCAAGGACGTCCCCAA  740

Query  486  GCGGCATTCCCTCGCCATGCCGGGCGAGACGGTGCTCAATGGCAACCAGGAGTGGGTGGTGCAGGCGGACCTCC  559
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GCGGCATTCCCTCGCCATGCCGGGCGAGACGGTGCTCAATGGCAACCAGGAGTGGGTGGTGCAGGCGGACCTCC  814

Query  560  CGCTGACCGCAGCCATCCGGCAGAGTCAACAGACTCTCTACCACTCACACCCCCCTCACCCTGCGGACCGGCAA  633
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CGCTGACCGCAGCCATCCGGCAGAGTCAACAGACTCTCTACCACTCACACCCCCCTCACCCTGCGGACCGGCAA  888

Query  634  GCGGTCAGGGTGAGCCCCTGCCACTCCCGGCAGCCCTCTGTCATCTCCGACGCATCTGCCGCCGAAGGCGACCG  707
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GCGGTCAGGGTGAGCCCCTGCCACTCCCGGCAGCCCTCTGTCATCTCCGACGCATCTGCCGCCGAAGGCGACCG  962

Query  708  GTCGTCCACACCGAGCGACATCAACTCCCCTCGACACCGGACACACTCCCTCTGCAACGGCGACAGTCCCGGCC  781
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GTCGTCCACACCGAGCGACATCAACTCCCCTCGACACCGGACACACTCCCTCTGCAACGGCGACAGTCCCGGCC  1036

Query  782  CAGTTCAGAAGAACCTGCACAACCCTATTGTACAGTCACTAGAGGATCTTGAAGACCAAAAACGGAAAAAGAAG  855
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CAGTTCAGAAGAACCTGCACAACCCTATTGTACAGTCACTAGAGGATCTTGAAGACCAAAAACGGAAAAAGAAG  1110

Query  856  AAAGAGAAGATGGGATTCGGCTCCATCTCCCGCGTCTTCGCCAGAGGGAAGCAGCGGAAGTCCCTCGACCCCGG  929
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  AAAGAGAAGATGGGATTCGGCTCCATCTCCCGCGTCTTCGCCAGAGGGAAGCAGCGGAAGTCCCTCGACCCCGG  1184

Query  930  CCTCTTTGATGGTACCGCCCCTGATTATTACATAGAGGAGGACGCGGACTGG  981
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CCTCTTTGATGGTACCGCCCCTGATTATTACATAGAGGAGGACGCGGACTGG  1236