Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02742
• Subject: NM_001370231.1
• Aligned Length: 1260
• Identities: 981
• Gaps: 279

Alignment

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct    1  ATGGTTATAAGGGGTGTGCGGGCGTGGAGTTATTTTAATGGATTTACTCTCCGTGGGGACTCCAGGCTTTCTCT  74

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct   75  CGTCTGCTTTTTGGATGCCTTCAAGAGAGGCCAGTTAGAGGATATCAATTGTGGCAATTCCCCAGAGCCCTCAT  148

Query    1  --------------------------------------------------------------------------  0
                                                                                      
Sbjct  149  CAGATGGCATTAGCCCGTCATGTGCTGCAGTGGCACCCAGTTTGGAGGAAATTCGGAACCAGAAGAGTGTGACA  222

Query    1  ---------------------------------------------------------ATGAAGGAGATGTTGGC  17
                                                                     |||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGCTCCTGCGGGAAGAAGTGTCGCGGCTCCAGGAGGAAGTTCACCTTCTCCGGCAGATGAAGGAGATGTTGGC  296

Query   18  GAAGGACCTGGAGGAGTCGCAGGGCGGCAAGTCCTCTGAGGTCCTCTCGGCCACCGAGCTCAGGGTCCAGCTGG  91
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  GAAGGACCTGGAGGAGTCGCAGGGCGGCAAGTCCTCTGAGGTCCTCTCGGCCACCGAGCTCAGGGTCCAGCTGG  370

Query   92  CCCAGAAGGAGCAGGAGCTAGCCAGAGCCAAAGAAGCCTTGCAGGCCATGAAAGCTGATCGGAAGCGCTTAAAG  165
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CCCAGAAGGAGCAGGAGCTAGCCAGAGCCAAAGAAGCCTTGCAGGCCATGAAAGCTGATCGGAAGCGCTTAAAG  444

Query  166  GGCGAGAAGACAGACCTGGTGAGCCAGATGCAGCAGCTGTATGCCACACTGGAGAGCCGCGAGGAGCAGCTCCG  239
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGCGAGAAGACAGACCTGGTGAGCCAGATGCAGCAGCTGTATGCCACACTGGAGAGCCGCGAGGAGCAGCTCCG  518

Query  240  AGACTTCATCCGCAACTATGAGCAGCACCGCAAGGAGAGCGAGGATGCGGTCAAAGCGCTGGCCAAGGAGAAGG  313
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGACTTCATCCGCAACTATGAGCAGCACCGCAAGGAGAGCGAGGATGCGGTCAAAGCGCTGGCCAAGGAGAAGG  592

Query  314  ACCTGCTGGAGCGTGAGAAGTGGGAGCTGCGGCGCCAAGCCAAGGAGGCCACAGACCACGCCACGGCACTGCGC  387
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACCTGCTGGAGCGTGAGAAGTGGGAGCTGCGGCGCCAAGCCAAGGAGGCCACAGACCACGCCACGGCACTGCGC  666

Query  388  TCCCAGCTGGACCTCAAGGACAACCGGATGAAGGAGCTGGAGGCCGAGCTGGCCATGGCCAAACAGTCCTTAGC  461
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TCCCAGCTGGACCTCAAGGACAACCGGATGAAGGAGCTGGAGGCCGAGCTGGCCATGGCCAAACAGTCCTTAGC  740

Query  462  TACGCTGACCAAGGACGTCCCCAAGCGGCATTCCCTCGCCATGCCGGGCGAGACGGTGCTCAATGGCAACCAGG  535
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TACGCTGACCAAGGACGTCCCCAAGCGGCATTCCCTCGCCATGCCGGGCGAGACGGTGCTCAATGGCAACCAGG  814

Query  536  AGTGGGTGGTGCAGGCGGACCTCCCGCTGACCGCAGCCATCCGGCAGAGTCAACAGACTCTCTACCACTCACAC  609
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  AGTGGGTGGTGCAGGCGGACCTCCCGCTGACCGCAGCCATCCGGCAGAGTCAACAGACTCTCTACCACTCACAC  888

Query  610  CCCCCTCACCCTGCGGACCGGCAAGCGGTCAGGGTGAGCCCCTGCCACTCCCGGCAGCCCTCTGTCATCTCCGA  683
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CCCCCTCACCCTGCGGACCGGCAAGCGGTCAGGGTGAGCCCCTGCCACTCCCGGCAGCCCTCTGTCATCTCCGA  962

Query  684  CGCATCTGCCGCCGAAGGCGACCGGTCGTCCACACCGAGCGACATCAACTCCCCTCGACACCGGACACACTCCC  757
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CGCATCTGCCGCCGAAGGCGACCGGTCGTCCACACCGAGCGACATCAACTCCCCTCGACACCGGACACACTCCC  1036

Query  758  TCTGCAACGGCGACAGTCCCGGCCCAGTTCAGAAGAACCTGCACAACCCTATTGTACAGTCACTAGAGGATCTT  831
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TCTGCAACGGCGACAGTCCCGGCCCAGTTCAGAAGAACCTGCACAACCCTATTGTACAGTCACTAGAGGATCTT  1110

Query  832  GAAGACCAAAAACGGAAAAAGAAGAAAGAGAAGATGGGATTCGGCTCCATCTCCCGCGTCTTCGCCAGAGGGAA  905
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GAAGACCAAAAACGGAAAAAGAAGAAAGAGAAGATGGGATTCGGCTCCATCTCCCGCGTCTTCGCCAGAGGGAA  1184

Query  906  GCAGCGGAAGTCCCTCGACCCCGGCCTCTTTGATGGTACCGCCCCTGATTATTACATAGAGGAGGACGCGGACT  979
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  GCAGCGGAAGTCCCTCGACCCCGGCCTCTTTGATGGTACCGCCCCTGATTATTACATAGAGGAGGACGCGGACT  1258

Query  980  GG  981
            ||
Sbjct 1259  GG  1260