Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02745
• Subject: NM_001284219.1
• Aligned Length: 1228
• Identities: 832
• Gaps: 317

Alignment

Query    1  MSKLKVIPEKSLTNNSRIVGLLAQLEKINAEPSESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRREMTAKGSTGMEILLSTL  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  ENTKDLQTTLNILSILVELVSAGGGRRVSFLVTKGGSQILLQLLMNASKESPPHEDLMVQIHSILAKIGPKDKK  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  FGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSSLIKV  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  ALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVQVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMK  296
                                                       |||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  -------------------------------------------MLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMK  31

Query  297  ILYNTS----------------------------------------QLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDES  330
            ||||||                                        |||.||||||||||||||||||||||||
Sbjct   32  ILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPIIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDES  105

Query  331  DDNDDIDVEAENETENEDDLDQNFKNDDIETDINKLKPQQEPGRTIEDLKMYEHLFPELVDDFQDYDLISKEPK  404
            |||||||.|.|||.||||||||.|||||||||||||.|||.||||||.||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  106  DDNDDIDLEVENELENEDDLDQSFKNDDIETDINKLRPQQVPGRTIEELKMYEHLFPELVDDFQDYELISKEPK  179

Query  405  PFVFEGKVRGPIVVPTAGEETSGNSGNLRK-VVMKENISSKGDEGEKKSTFMDLAKEDIKDNDRTLQQQPGDQN  477
            |||||||.||||||||||||..||||...| |||||..|.||.|          ||||.|..||||.||.|.|.
Sbjct  180  PFVFEGKARGPIVVPTAGEEVPGNSGSVKKGVVMKERASPKGEE----------AKEDPKGHDRTLPQQLGGQS  243

Query  478  RTISSVHGLNNDIVKALDRITLQNIPSQTAPGFTAEMKKDCSLPLTVLTCAKACPHMATCGNVLFEGRTVQLGK  551
            |...|.|..|||.|||||||||||.|||.|.|..|.|.||..||||||.|.|||||.|.||..|||||||.|||
Sbjct  244  RVAPSAHSFNNDLVKALDRITLQNVPSQVASGLNAGMRKDFGLPLTVLSCTKACPHVAKCGSTLFEGRTVHLGK  317

Query  552  LCCTGVETEDDEDTESNSSVEQA-SVEVPDGPTLHDPDLYIEIVKNTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPIL  624
            ||||||||||||||||.||.||| |||..|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  318  LCCTGVETEDDEDTESHSSTEQAPSVEASDGPTLHDPDLYIEIVKNTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPIL  391

Query  625  ERPYGVQRTKIAQDIERLIHQSDIIDRVVYDLDNPNYTIPEEGDILKFNSKFESGNLRKVIQIRKNEYDLILNS  698
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  392  ERPYGVQRTKIAQDIERLIHQNDIIDRVVYDLDNPTYTTPEEGDTLKFNSKFESGNLRKVIQIRKSEYDLILNS  465

Query  699  DINSNHYHQWFYFEVSGMRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFS  772
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  466  DINSNHYHQWFYFEVSGMRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFS  539

Query  773  RSSVAAGGQKGKSYYTITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNS  846
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct  540  RSSVAAGGQKGKSYYTITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNI  613

Query  847  CPLVTITAMPESNYYEHICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLN  920
            |||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct  614  CPLVTITAMPESNYYEHICQFRTRPYIFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNSPTAQSLRESYIFKIVPMLN  687

Query  921  PDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPSPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVYCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKE  994
            |||||||||||||||||||||||||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  688  PDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPNPELHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVYCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKE  761

Query  995  TVWHTNDNATSCDVVEDTGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGC  1068
            |||||.||..|||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  762  TVWHTHDNSASCDIVEDMGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGC  835

Query 1069  DQGKYKGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSCKVTSPTTYVLDEDEPRFL  1142
            |||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  836  DQGRYKGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSSLEYNLPSNLLDFENDLIESSCKVTSPTTYVLDEDEPRFL  909

Query 1143  EEVDYSAESNDELDIELAENVGDYEPSAQEEVLSDSELSRTYLP  1186
            ||||||||||||||.|||||.||||||||||.|||||.|||.|.
Sbjct  910  EEVDYSAESNDELDVELAENTGDYEPSAQEEALSDSEVSRTHLI  953