Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02745
• Subject: NM_001286715.1
• Aligned Length: 1286
• Identities: 1176
• Gaps: 108

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------MSKLKVIPEKSLTN  14
                                                                        .|.        |||
Sbjct    1  MRTGSAASSAAAAAAAAAASASPATGVCMKTPGGGRRGIRRDPGAEPGAAALRGPRQRPILSR--------LTN  66

Query   15  NSRIVGLLAQLEKINAEPSESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRREMTAKGSTGMEILLSTLENTKDLQTTLNILS  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  NSRIVGLLAQLEKINAEPSESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRREMTAKGSTGMEILLSTLENTKDLQTTLNILS  140

Query   89  ILVELVSAGGGRRVSFLVTKGGSQILLQLLMNASKESPPHEDLMVQIHSILAKIGPKDKKFGVKARINGALNIT  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  ILVELVSAGGGRRVSFLVTKGGSQILLQLLMNASKESPPHEDLMVQIHSILAKIGPKDKKFGVKARINGALNIT  214

Query  163  LNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSSLIKVALDTLAALLKSKTN  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  LNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSSLIKVALDTLAALLKSKTN  288

Query  237  ARRAVDRGYVQVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTS--------  302
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||        
Sbjct  289  ARRAVDRGYVQVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQECLAVRT  362

Query  303  --------------------------------QLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDESDDNDDIDVEAENET  344
                                            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  LDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDESDDNDDIDVEAENET  436

Query  345  ENEDDLDQNFKNDDIETDINKLKPQQEPGRTIEDLKMYEHLFPELVDDFQDYDLISKEPKPFVFEGKVRGPIVV  418
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  ENEDDLDQNFKNDDIETDINKLKPQQEPGRTIEDLKMYEHLFPELVDDFQDYDLISKEPKPFVFEGKVRGPIVV  510

Query  419  PTAGEETSGNSGNLRKVVMKENISSKGDEGEKKSTFMDLAKEDIKDNDRTLQQQPGDQNRTISSVHGLNNDIVK  492
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  PTAGEETSGNSGNLRKVVMKENISSKGDEGEKKSTFMDLAKEDIKDNDRTLQQQPGDQNRTISSVHGLNNDIVK  584

Query  493  ALDRITLQNIPSQTAPGFTAEMKKDCSLPLTVLTCAKACPHMATCGNVLFEGRTVQLGKLCCTGVETEDDEDTE  566
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  ALDRITLQNIPSQTAPGFTAEMKKDCSLPLTVLTCAKACPHMATCGNVLFEGRTVQLGKLCCTGVETEDDEDTE  658

Query  567  SNSSVEQASVEVPDGPTLHDPDLYIEIVKNTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPILERPYGVQRTKIAQDIE  640
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  SNSSVEQASVEVPDGPTLHDPDLYIEIVKNTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPILERPYGVQRTKIAQDIE  732

Query  641  RLIHQSDIIDRVVYDLDNPNYTIPEEGDILKFNSKFESGNLRKVIQIRKNEYDLILNSDINSNHYHQWFYFEVS  714
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  RLIHQSDIIDRVVYDLDNPNYTIPEEGDILKFNSKFESGNLRKVIQIRKNEYDLILNSDINSNHYHQWFYFEVS  806

Query  715  GMRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFSRSSVAAGGQKGKSYYT  788
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  GMRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFSRSSVAAGGQKGKSYYT  880

Query  789  ITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNSCPLVTITAMPESNYYE  862
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  ITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNSCPLVTITAMPESNYYE  954

Query  863  HICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPDGVINGNHRCSLSGE  936
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  HICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPDGVINGNHRCSLSGE  1028

Query  937  DLNRQWQSPSPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVYCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKETVWHTNDNATSCDVVE  1010
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  DLNRQWQSPSPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVYCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKETVWHTNDNATSCDVVE  1102

Query 1011  DTGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGCDQGKYKGLQIGTRELE  1084
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103  DTGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGCDQGKYKGLQIGTRELE  1176

Query 1085  EMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSCKVTSPTTYVLDEDEPRFLEEVDYSAESNDELDIE  1158
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177  EMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSCKVTSPTTYVLDEDEPRFLEEVDYSAESNDELDIE  1250

Query 1159  LAENVGDYEPSAQEEVLSDSELSRTYLP  1186
            ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1251  LAENVGDYEPSAQEEVLSDSELSRTYLP  1278