Protein Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02745
• Subject: NM_001286717.1
• Aligned Length: 1246
• Identities: 1176
• Gaps: 68

Alignment

Query    1  ------------------------------------------------------------MSKLKVIPEKSLTN  14
                                                                        .|.        |||
Sbjct    1  MRTGSAASSAAAAAAAAAASASPATGVCMKTPGGGRRGIRRDPGAEPGAAALRGPRQRPILSR--------LTN  66

Query   15  NSRIVGLLAQLEKINAEPSESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRREMTAKGSTGMEILLSTLENTKDLQTTLNILS  88
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   67  NSRIVGLLAQLEKINAEPSESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRREMTAKGSTGMEILLSTLENTKDLQTTLNILS  140

Query   89  ILVELVSAGGGRRVSFLVTKGGSQILLQLLMNASKESPPHEDLMVQIHSILAKIGPKDKKFGVKARINGALNIT  162
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  141  ILVELVSAGGGRRVSFLVTKGGSQILLQLLMNASKESPPHEDLMVQIHSILAKIGPKDKKFGVKARINGALNIT  214

Query  163  LNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSSLIKVALDTLAALLKSKTN  236
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  215  LNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSSLIKVALDTLAALLKSKTN  288

Query  237  ARRAVDRGYVQVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQLPVIPVT  310
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  289  ARRAVDRGYVQVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMKILYNTSQLPVIPVT  362

Query  311  GPVAQLYSLPPEVDDVVDESDDNDDIDVEAENETENEDDLDQNFKNDDIETDINKLKPQQEPGRTIEDLKMYEH  384
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  363  GPVAQLYSLPPEVDDVVDESDDNDDIDVEAENETENEDDLDQNFKNDDIETDINKLKPQQEPGRTIEDLKMYEH  436

Query  385  LFPELVDDFQDYDLISKEPKPFVFEGKVRGPIVVPTAGEETSGNSGNLRKVVMKENISSKGDEGEKKSTFMDLA  458
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  437  LFPELVDDFQDYDLISKEPKPFVFEGKVRGPIVVPTAGEETSGNSGNLRKVVMKENISSKGDEGEKKSTFMDLA  510

Query  459  KEDIKDNDRTLQQQPGDQNRTISSVHGLNNDIVKALDRITLQNIPSQTAPGFTAEMKKDCSLPLTVLTCAKACP  532
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  511  KEDIKDNDRTLQQQPGDQNRTISSVHGLNNDIVKALDRITLQNIPSQTAPGFTAEMKKDCSLPLTVLTCAKACP  584

Query  533  HMATCGNVLFEGRTVQLGKLCCTGVETEDDEDTESNSSVEQASVEVPDGPTLHDPDLYIEIVKNTKSVPEYSEV  606
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  585  HMATCGNVLFEGRTVQLGKLCCTGVETEDDEDTESNSSVEQASVEVPDGPTLHDPDLYIEIVKNTKSVPEYSEV  658

Query  607  AYPDYFGHIPPPFKEPILERPYGVQRTKIAQDIERLIHQSDIIDRVVYDLDNPNYTIPEEGDILKFNSKFESGN  680
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  659  AYPDYFGHIPPPFKEPILERPYGVQRTKIAQDIERLIHQSDIIDRVVYDLDNPNYTIPEEGDILKFNSKFESGN  732

Query  681  LRKVIQIRKNEYDLILNSDINSNHYHQWFYFEVSGMRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNAR  754
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  LRKVIQIRKNEYDLILNSDINSNHYHQWFYFEVSGMRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNAR  806

Query  755  PWWIRMGTDICYYKNHFSRSSVAAGGQKGKSYYTITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNP  828
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  PWWIRMGTDICYYKNHFSRSSVAAGGQKGKSYYTITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNP  880

Query  829  QQIYFRKDVLCETLSGNSCPLVTITAMPESNYYEHICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNP  902
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  881  QQIYFRKDVLCETLSGNSCPLVTITAMPESNYYEHICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNP  954

Query  903  TAQSLRESYIFKIVPMLNPDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPSPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVYCDY  976
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  955  TAQSLRESYIFKIVPMLNPDGVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPSPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVYCDY  1028

Query  977  HGHSRKKNVFMYGCSIKETVWHTNDNATSCDVVEDTGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVW  1050
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1029  HGHSRKKNVFMYGCSIKETVWHTNDNATSCDVVEDTGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVW  1102

Query 1051  REIGVQRSYTMESTLCGCDQGKYKGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSC  1124
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1103  REIGVQRSYTMESTLCGCDQGKYKGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSC  1176

Query 1125  KVTSPTTYVLDEDEPRFLEEVDYSAESNDELDIELAENVGDYEPSAQEEVLSDSELSRTYLP  1186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1177  KVTSPTTYVLDEDEPRFLEEVDYSAESNDELDIELAENVGDYEPSAQEEVLSDSELSRTYLP  1238