Protein Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02745
- Subject:
- NM_001330701.1
- Aligned Length:
- 1226
- Identities:
- 1186
- Gaps:
- 40
Alignment
Query 1 MSKLKVIPEKSLTNNSRIVGLLAQLEKINAEPSESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRREMTAKGSTGMEILLSTL 74
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Sbjct 1 MSKLKVIPEKSLTNNSRIVGLLAQLEKINAEPSESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRREMTAKGSTGMEILLSTL 74
Query 75 ENTKDLQTTLNILSILVELVSAGGGRRVSFLVTKGGSQILLQLLMNASKESPPHEDLMVQIHSILAKIGPKDKK 148
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Sbjct 75 ENTKDLQTTLNILSILVELVSAGGGRRVSFLVTKGGSQILLQLLMNASKESPPHEDLMVQIHSILAKIGPKDKK 148
Query 149 FGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSSLIKV 222
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Sbjct 149 FGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSSLIKV 222
Query 223 ALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVQVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMK 296
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Sbjct 223 ALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVQVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMK 296
Query 297 ILYNTS----------------------------------------QLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDES 330
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Sbjct 297 ILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDES 370
Query 331 DDNDDIDVEAENETENEDDLDQNFKNDDIETDINKLKPQQEPGRTIEDLKMYEHLFPELVDDFQDYDLISKEPK 404
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Sbjct 371 DDNDDIDVEAENETENEDDLDQNFKNDDIETDINKLKPQQEPGRTIEDLKMYEHLFPELVDDFQDYDLISKEPK 444
Query 405 PFVFEGKVRGPIVVPTAGEETSGNSGNLRKVVMKENISSKGDEGEKKSTFMDLAKEDIKDNDRTLQQQPGDQNR 478
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Sbjct 445 PFVFEGKVRGPIVVPTAGEETSGNSGNLRKVVMKENISSKGDEGEKKSTFMDLAKEDIKDNDRTLQQQPGDQNR 518
Query 479 TISSVHGLNNDIVKALDRITLQNIPSQTAPGFTAEMKKDCSLPLTVLTCAKACPHMATCGNVLFEGRTVQLGKL 552
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Sbjct 519 TISSVHGLNNDIVKALDRITLQNIPSQTAPGFTAEMKKDCSLPLTVLTCAKACPHMATCGNVLFEGRTVQLGKL 592
Query 553 CCTGVETEDDEDTESNSSVEQASVEVPDGPTLHDPDLYIEIVKNTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPILER 626
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Sbjct 593 CCTGVETEDDEDTESNSSVEQASVEVPDGPTLHDPDLYIEIVKNTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPILER 666
Query 627 PYGVQRTKIAQDIERLIHQSDIIDRVVYDLDNPNYTIPEEGDILKFNSKFESGNLRKVIQIRKNEYDLILNSDI 700
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Sbjct 667 PYGVQRTKIAQDIERLIHQSDIIDRVVYDLDNPNYTIPEEGDILKFNSKFESGNLRKVIQIRKNEYDLILNSDI 740
Query 701 NSNHYHQWFYFEVSGMRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFSRS 774
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Sbjct 741 NSNHYHQWFYFEVSGMRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFSRS 814
Query 775 SVAAGGQKGKSYYTITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNSCP 848
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Sbjct 815 SVAAGGQKGKSYYTITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNSCP 888
Query 849 LVTITAMPESNYYEHICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPD 922
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Sbjct 889 LVTITAMPESNYYEHICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPD 962
Query 923 GVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPSPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVYCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKETV 996
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Sbjct 963 GVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPSPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVYCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKETV 1036
Query 997 WHTNDNATSCDVVEDTGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGCDQ 1070
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Sbjct 1037 WHTNDNATSCDVVEDTGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGCDQ 1110
Query 1071 GKYKGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSCKVTSPTTYVLDEDEPRFLEE 1144
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Sbjct 1111 GKYKGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSCKVTSPTTYVLDEDEPRFLEE 1184
Query 1145 VDYSAESNDELDIELAENVGDYEPSAQEEVLSDSELSRTYLP 1186
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Sbjct 1185 VDYSAESNDELDIELAENVGDYEPSAQEEVLSDSELSRTYLP 1226