Protein Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_02745
Subject:
NM_001330701.1
Aligned Length:
1226
Identities:
1186
Gaps:
40

Alignment

Query    1  MSKLKVIPEKSLTNNSRIVGLLAQLEKINAEPSESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRREMTAKGSTGMEILLSTL  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  MSKLKVIPEKSLTNNSRIVGLLAQLEKINAEPSESDTARYVTSKILHLAQSQEKTRREMTAKGSTGMEILLSTL  74

Query   75  ENTKDLQTTLNILSILVELVSAGGGRRVSFLVTKGGSQILLQLLMNASKESPPHEDLMVQIHSILAKIGPKDKK  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  ENTKDLQTTLNILSILVELVSAGGGRRVSFLVTKGGSQILLQLLMNASKESPPHEDLMVQIHSILAKIGPKDKK  148

Query  149  FGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSSLIKV  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  FGVKARINGALNITLNLVKQNLQNHRLVLPCLQLLRVYSANSVNSVSLGKNGVVELMFKIIGPFSKKNSSLIKV  222

Query  223  ALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVQVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMK  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ALDTLAALLKSKTNARRAVDRGYVQVLLTIYVDWHRHDNRHRNMLIRKGILQSLKSVTNIKLGRKAFIDANGMK  296

Query  297  ILYNTS----------------------------------------QLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDES  330
            ||||||                                        ||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ILYNTSQECLAVRTLDPLVNTSSLIMRKCFPKNRLPLPTIKSSFHFQLPVIPVTGPVAQLYSLPPEVDDVVDES  370

Query  331  DDNDDIDVEAENETENEDDLDQNFKNDDIETDINKLKPQQEPGRTIEDLKMYEHLFPELVDDFQDYDLISKEPK  404
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  DDNDDIDVEAENETENEDDLDQNFKNDDIETDINKLKPQQEPGRTIEDLKMYEHLFPELVDDFQDYDLISKEPK  444

Query  405  PFVFEGKVRGPIVVPTAGEETSGNSGNLRKVVMKENISSKGDEGEKKSTFMDLAKEDIKDNDRTLQQQPGDQNR  478
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  PFVFEGKVRGPIVVPTAGEETSGNSGNLRKVVMKENISSKGDEGEKKSTFMDLAKEDIKDNDRTLQQQPGDQNR  518

Query  479  TISSVHGLNNDIVKALDRITLQNIPSQTAPGFTAEMKKDCSLPLTVLTCAKACPHMATCGNVLFEGRTVQLGKL  552
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TISSVHGLNNDIVKALDRITLQNIPSQTAPGFTAEMKKDCSLPLTVLTCAKACPHMATCGNVLFEGRTVQLGKL  592

Query  553  CCTGVETEDDEDTESNSSVEQASVEVPDGPTLHDPDLYIEIVKNTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPILER  626
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCTGVETEDDEDTESNSSVEQASVEVPDGPTLHDPDLYIEIVKNTKSVPEYSEVAYPDYFGHIPPPFKEPILER  666

Query  627  PYGVQRTKIAQDIERLIHQSDIIDRVVYDLDNPNYTIPEEGDILKFNSKFESGNLRKVIQIRKNEYDLILNSDI  700
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  PYGVQRTKIAQDIERLIHQSDIIDRVVYDLDNPNYTIPEEGDILKFNSKFESGNLRKVIQIRKNEYDLILNSDI  740

Query  701  NSNHYHQWFYFEVSGMRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFSRS  774
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  NSNHYHQWFYFEVSGMRPGVAYRFNIINCEKSNSQFNYGMQPLMYSVQEALNARPWWIRMGTDICYYKNHFSRS  814

Query  775  SVAAGGQKGKSYYTITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNSCP  848
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  SVAAGGQKGKSYYTITFTVNFPHKDDVCYFAYHYPYTYSTLQMHLQKLESAHNPQQIYFRKDVLCETLSGNSCP  888

Query  849  LVTITAMPESNYYEHICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPD  922
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  LVTITAMPESNYYEHICHFRNRPYVFLSARVHPGETNASWVMKGTLEYLMSNNPTAQSLRESYIFKIVPMLNPD  962

Query  923  GVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPSPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVYCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKETV  996
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  GVINGNHRCSLSGEDLNRQWQSPSPDLHPTIYHAKGLLQYLAAVKRLPLVYCDYHGHSRKKNVFMYGCSIKETV  1036

Query  997  WHTNDNATSCDVVEDTGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGCDQ  1070
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  WHTNDNATSCDVVEDTGYRTLPKILSHIAPAFCMSSCSFVVEKSKESTARVVVWREIGVQRSYTMESTLCGCDQ  1110

Query 1071  GKYKGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSCKVTSPTTYVLDEDEPRFLEE  1144
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Sbjct 1111  GKYKGLQIGTRELEEMGAKFCVGLLRLKRLTSPLEYNLPSSLLDFENDLIESSCKVTSPTTYVLDEDEPRFLEE  1184

Query 1145  VDYSAESNDELDIELAENVGDYEPSAQEEVLSDSELSRTYLP  1186
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  VDYSAESNDELDIELAENVGDYEPSAQEEVLSDSELSRTYLP  1226