Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02745
- Subject:
- XM_005251848.2
- Aligned Length:
- 3678
- Identities:
- 3558
- Gaps:
- 120
Alignment
Query 1 ATGAGCAAGTTAAAAGTGATACCAGAAAAAAGCCTTACCAATAATTCTAGGATCGTAGGACTCCTGGCTCAACT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGAGCAAGTTAAAAGTGATACCAGAAAAAAGCCTTACCAATAATTCTAGGATCGTAGGACTCCTGGCTCAACT 74
Query 75 GGAGAAGATCAATGCTGAGCCTTCAGAATCAGACACTGCCCGATATGTTACATCAAAAATTCTTCATCTGGCTC 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGAGAAGATCAATGCTGAGCCTTCAGAATCAGACACTGCCCGATATGTTACATCAAAAATTCTTCATCTGGCTC 148
Query 149 AGAGTCAAGAAAAAACAAGGAGAGAAATGACAGCCAAAGGTTCTACAGGAATGGAAATTCTGCTGTCAACATTA 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGAGTCAAGAAAAAACAAGGAGAGAAATGACAGCCAAAGGTTCTACAGGAATGGAAATTCTGCTGTCAACATTA 222
Query 223 GAGAACACAAAAGATCTTCAAACTACACTTAATATCTTAAGCATTCTTGTTGAGCTGGTGTCAGCTGGTGGAGG 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 GAGAACACAAAAGATCTTCAAACTACACTTAATATCTTAAGCATTCTTGTTGAGCTGGTGTCAGCTGGTGGAGG 296
Query 297 TCGAAGAGTGAGTTTCTTAGTCACCAAAGGTGGTTCACAAATATTGTTGCAGTTACTTATGAATGCCAGCAAAG 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TCGAAGAGTGAGTTTCTTAGTCACCAAAGGTGGTTCACAAATATTGTTGCAGTTACTTATGAATGCCAGCAAAG 370
Query 371 AATCTCCCCCACATGAGGACTTAATGGTACAGATTCATTCTATTCTTGCAAAGATTGGACCAAAAGATAAAAAA 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AATCTCCCCCACATGAGGACTTAATGGTACAGATTCATTCTATTCTTGCAAAGATTGGACCAAAAGATAAAAAA 444
Query 445 TTTGGAGTAAAGGCTAGAATTAATGGGGCTCTGAATATAACCCTGAATTTGGTCAAGCAGAATTTGCAGAATCA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 TTTGGAGTAAAGGCTAGAATTAATGGGGCTCTGAATATAACCCTGAATTTGGTCAAGCAGAATTTGCAGAATCA 518
Query 519 TCGCTTGGTTCTACCTTGCCTTCAGCTTTTACGAGTATATTCTGCCAACTCTGTGAATTCAGTATCCTTAGGGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 TCGCTTGGTTCTACCTTGCCTTCAGCTTTTACGAGTATATTCTGCCAACTCTGTGAATTCAGTATCCTTAGGGA 592
Query 593 AAAATGGAGTTGTGGAACTGATGTTTAAAATCATTGGACCATTTAGTAAGAAGAATTCCAGTCTTATAAAGGTT 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 AAAATGGAGTTGTGGAACTGATGTTTAAAATCATTGGACCATTTAGTAAGAAGAATTCCAGTCTTATAAAGGTT 666
Query 667 GCTTTAGACACTCTTGCTGCATTGCTAAAATCAAAAACAAATGCCAGGAGAGCTGTAGACAGAGGATATGTCCA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GCTTTAGACACTCTTGCTGCATTGCTAAAATCAAAAACAAATGCCAGGAGAGCTGTAGACAGAGGATATGTCCA 740
Query 741 AGTGCTTTTAACAATTTATGTAGATTGGCACCGCCATGATAACCGGCATAGAAACATGCTCATTCGGAAAGGAA 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGTGCTTTTAACAATTTATGTAGATTGGCACCGCCATGATAACCGGCATAGAAACATGCTCATTCGGAAAGGAA 814
Query 815 TTTTACAGAGTTTAAAAAGTGTTACAAACATCAAGTTGGGAAGAAAAGCATTTATTGATGCCAATGGGATGAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 TTTTACAGAGTTTAAAAAGTGTTACAAACATCAAGTTGGGAAGAAAAGCATTTATTGATGCCAATGGGATGAAA 888
Query 889 ATTCTGTATAATACTTCGCAA----------------------------------------------------- 909
|||||||||||||||||||||
Sbjct 889 ATTCTGTATAATACTTCGCAAGAATGTCTGGCAGTCAGGACTCTGGATCCTCTTGTCAATACCTCCAGTCTGAT 962
Query 910 -------------------------------------------------------------------TTGCCTG 916
|||||||
Sbjct 963 AATGAGGAAGTGTTTCCCAAAAAATCGACTGCCACTCCCAACAATTAAAAGTTCTTTTCATTTCCAGTTGCCTG 1036
Query 917 TTATTCCTGTGACTGGTCCTGTGGCTCAGCTCTACAGCTTACCTCCTGAAGTGGATGACGTAGTAGATGAAAGT 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTATTCCTGTGACTGGTCCTGTGGCTCAGCTCTACAGCTTACCTCCTGAAGTGGATGACGTAGTAGATGAAAGT 1110
Query 991 GATGACAACGATGATATTGATGTAGAAGCTGAAAACGAAACTGAGAATGAAGATGACCTAGATCAAAATTTTAA 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 GATGACAACGATGATATTGATGTAGAAGCTGAAAACGAAACTGAGAATGAAGATGACCTAGATCAAAATTTTAA 1184
Query 1065 GAATGATGATATTGAAACAGATATTAACAAACTAAAACCCCAGCAAGAACCGGGACGAACAATAGAAGATCTAA 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 GAATGATGATATTGAAACAGATATTAACAAACTAAAACCCCAGCAAGAACCGGGACGAACAATAGAAGATCTAA 1258
Query 1139 AAATGTATGAACACCTTTTCCCTGAGCTTGTTGATGATTTTCAGGACTATGATTTAATCTCCAAAGAACCAAAG 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 AAATGTATGAACACCTTTTCCCTGAGCTTGTTGATGATTTTCAGGACTATGATTTAATCTCCAAAGAACCAAAG 1332
Query 1213 CCTTTTGTATTTGAGGGAAAAGTACGTGGTCCTATTGTTGTTCCTACGGCAGGCGAGGAAACATCTGGGAATTC 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333 CCTTTTGTATTTGAGGGAAAAGTACGTGGTCCTATTGTTGTTCCTACGGCAGGCGAGGAAACATCTGGGAATTC 1406
Query 1287 TGGCAATTTAAGAAAAGTTGTAATGAAGGAGAACATATCTTCTAAAGGAGATGAAGGTGAAAAGAAGTCTACCT 1360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407 TGGCAATTTAAGAAAAGTTGTAATGAAGGAGAACATATCTTCTAAAGGAGATGAAGGTGAAAAGAAGTCTACCT 1480
Query 1361 TTATGGATCTAGCAAAAGAAGATATTAAAGATAATGATAGAACATTACAACAGCAGCCAGGTGATCAAAATAGA 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481 TTATGGATCTAGCAAAAGAAGATATTAAAGATAATGATAGAACATTACAACAGCAGCCAGGTGATCAAAATAGA 1554
Query 1435 ACTATTTCATCAGTCCATGGTTTAAACAATGATATTGTAAAGGCCTTGGACCGAATTACATTGCAGAATATTCC 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 ACTATTTCATCAGTCCATGGTTTAAACAATGATATTGTAAAGGCCTTGGACCGAATTACATTGCAGAATATTCC 1628
Query 1509 TTCTCAAACAGCCCCAGGTTTTACTGCAGAAATGAAGAAGGACTGCAGTCTTCCTCTTACTGTCCTTACCTGTG 1582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629 TTCTCAAACAGCCCCAGGTTTTACTGCAGAAATGAAGAAGGACTGCAGTCTTCCTCTTACTGTCCTTACCTGTG 1702
Query 1583 CTAAAGCATGTCCACACATGGCTACTTGTGGAAATGTTCTGTTTGAGGGAAGAACAGTTCAGCTAGGGAAGCTT 1656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703 CTAAAGCATGTCCACACATGGCTACTTGTGGAAATGTTCTGTTTGAGGGAAGAACAGTTCAGCTAGGGAAGCTT 1776
Query 1657 TGCTGCACTGGAGTTGAAACTGAAGATGATGAAGATACTGAGTCAAATTCATCGGTAGAACAAGCATCGGTTGA 1730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777 TGCTGCACTGGAGTTGAAACTGAAGATGATGAAGATACTGAGTCAAATTCATCGGTAGAACAAGCATCGGTTGA 1850
Query 1731 AGTACCTGATGGACCAACACTCCATGACCCAGACCTCTATATTGAGATTGTGAAAAATACGAAGTCTGTCCCAG 1804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851 AGTACCTGATGGACCAACACTCCATGACCCAGACCTCTATATTGAGATTGTGAAAAATACGAAGTCTGTCCCAG 1924
Query 1805 AATATTCAGAGGTGGCTTATCCCGATTATTTTGGTCACATTCCGCCTCCATTCAAAGAGCCTATTTTAGAAAGG 1878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925 AATATTCAGAGGTGGCTTATCCCGATTATTTTGGTCACATTCCGCCTCCATTCAAAGAGCCTATTTTAGAAAGG 1998
Query 1879 CCTTATGGTGTACAAAGGACAAAAATTGCTCAAGATATTGAAAGGCTAATACATCAGAGTGATATCATAGATCG 1952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999 CCTTATGGTGTACAAAGGACAAAAATTGCTCAAGATATTGAAAGGCTAATACATCAGAGTGATATCATAGATCG 2072
Query 1953 TGTGGTATATGACTTGGATAACCCAAATTACACCATTCCAGAAGAGGGAGATATTTTGAAATTTAACTCCAAAT 2026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2073 TGTGGTATATGACTTGGATAACCCAAATTACACCATTCCAGAAGAGGGAGATATTTTGAAATTTAACTCCAAAT 2146
Query 2027 TTGAGTCTGGGAATCTGCGCAAAGTAATTCAAATTAGAAAAAATGAATATGATCTTATTCTGAACTCAGACATA 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2147 TTGAGTCTGGGAATCTGCGCAAAGTAATTCAAATTAGAAAAAATGAATATGATCTTATTCTGAACTCAGACATA 2220
Query 2101 AACAGCAATCATTATCATCAGTGGTTTTACTTTGAAGTCAGTGGAATGCGACCAGGTGTTGCTTACAGGTTTAA 2174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2221 AACAGCAATCATTATCATCAGTGGTTTTACTTTGAAGTCAGTGGAATGCGACCAGGTGTTGCTTACAGGTTTAA 2294
Query 2175 CATCATTAACTGTGAAAAGTCCAACAGTCAGTTTAATTATGGTATGCAACCACTCATGTATTCGGTTCAGGAAG 2248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2295 CATCATTAACTGTGAAAAGTCCAACAGTCAGTTTAATTATGGTATGCAACCACTCATGTATTCGGTTCAGGAAG 2368
Query 2249 CATTAAATGCCAGACCATGGTGGATTCGTATGGGGACTGACATTTGTTACTATAAAAATCATTTCTCAAGAAGT 2322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2369 CATTAAATGCCAGACCATGGTGGATTCGTATGGGGACTGACATTTGTTACTATAAAAATCATTTCTCAAGAAGT 2442
Query 2323 TCAGTTGCTGCAGGTGGGCAAAAGGGAAAATCCTACTATACAATTACATTTACTGTCAATTTTCCACATAAAGA 2396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2443 TCAGTTGCTGCAGGTGGGCAAAAGGGAAAATCCTACTATACAATTACATTTACTGTCAATTTTCCACATAAAGA 2516
Query 2397 TGATGTTTGCTACTTTGCTTATCACTATCCATATACGTATTCAACTTTACAGATGCATCTTCAAAAATTGGAAT 2470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2517 TGATGTTTGCTACTTTGCTTATCACTATCCATATACGTATTCAACTTTACAGATGCATCTTCAAAAATTGGAAT 2590
Query 2471 CAGCACACAATCCTCAGCAAATCTATTTTCGGAAAGATGTGTTATGTGAAACCCTGTCTGGAAACAGCTGCCCC 2544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2591 CAGCACACAATCCTCAGCAAATCTATTTTCGGAAAGATGTGTTATGTGAAACCCTGTCTGGAAACAGCTGCCCC 2664
Query 2545 TTGGTGACTATAACAGCAATGCCAGAGTCTAATTATTATGAACATATCTGCCATTTCAGAAATCGCCCTTACGT 2618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2665 TTGGTGACTATAACAGCAATGCCAGAGTCTAATTATTATGAACATATCTGCCATTTCAGAAATCGCCCTTACGT 2738
Query 2619 TTTCTTGTCTGCTCGGGTACATCCTGGAGAAACTAATGCAAGTTGGGTTATGAAAGGAACGTTGGAATATCTCA 2692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2739 TTTCTTGTCTGCTCGGGTACATCCTGGAGAAACTAATGCAAGTTGGGTTATGAAAGGAACGTTGGAATATCTCA 2812
Query 2693 TGAGCAATAACCCCACTGCTCAGAGCTTACGAGAATCTTATATTTTTAAAATTGTCCCTATGTTAAATCCAGAT 2766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2813 TGAGCAATAACCCCACTGCTCAGAGCTTACGAGAATCTTATATTTTTAAAATTGTCCCTATGTTAAATCCAGAT 2886
Query 2767 GGTGTCATCAATGGAAATCATCGCTGTTCTTTAAGTGGAGAGGATTTGAATAGGCAGTGGCAAAGTCCAAGTCC 2840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2887 GGTGTCATCAATGGAAATCATCGCTGTTCTTTAAGTGGAGAGGATTTGAATAGGCAGTGGCAAAGTCCAAGTCC 2960
Query 2841 GGATTTACATCCTACAATTTACCATGCTAAGGGGCTGTTGCAATACTTGGCTGCAGTGAAGCGTTTACCCTTGG 2914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2961 GGATTTACATCCTACAATTTACCATGCTAAGGGGCTGTTGCAATACTTGGCTGCAGTGAAGCGTTTACCCTTGG 3034
Query 2915 TTTATTGTGATTATCATGGCCATTCCCGAAAGAAGAATGTATTTATGTATGGTTGCAGCATCAAAGAGACAGTG 2988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3035 TTTATTGTGATTATCATGGCCATTCCCGAAAGAAGAATGTATTTATGTATGGTTGCAGCATCAAAGAGACAGTG 3108
Query 2989 TGGCATACCAATGATAATGCAACTTCATGTGATGTTGTGGAGGATACGGGATACAGGACATTGCCTAAGATACT 3062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3109 TGGCATACCAATGATAATGCAACTTCATGTGATGTTGTGGAGGATACGGGATACAGGACATTGCCTAAGATACT 3182
Query 3063 GAGCCATATCGCCCCAGCATTTTGCATGAGCAGCTGTAGCTTCGTAGTGGAAAAATCTAAAGAATCCACAGCAC 3136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3183 GAGCCATATCGCCCCAGCATTTTGCATGAGCAGCTGTAGCTTCGTAGTGGAAAAATCTAAAGAATCCACAGCAC 3256
Query 3137 GTGTTGTAGTTTGGAGGGAAATAGGAGTACAAAGAAGTTATACCATGGAGAGTACTTTATGTGGCTGTGATCAG 3210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3257 GTGTTGTAGTTTGGAGGGAAATAGGAGTACAAAGAAGTTATACCATGGAGAGTACTTTATGTGGCTGTGATCAG 3330
Query 3211 GGAAAATACAAGGGTTTACAGATTGGTACCCGAGAACTGGAAGAGATGGGAGCAAAATTTTGTGTTGGTCTTTT 3284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3331 GGAAAATACAAGGGTTTACAGATTGGTACCCGAGAACTGGAAGAGATGGGAGCAAAATTTTGTGTTGGTCTTTT 3404
Query 3285 ACGTTTGAAAAGACTGACCTCTCCATTGGAGTATAATCTGCCTTCCAGCCTGCTTGACTTTGAAAATGATTTAA 3358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3405 ACGTTTGAAAAGACTGACCTCTCCATTGGAGTATAATCTGCCTTCCAGCCTGCTTGACTTTGAAAATGATTTAA 3478
Query 3359 TTGAATCAAGCTGCAAAGTAACTAGCCCTACCACTTATGTCTTGGATGAAGATGAACCTCGATTCCTTGAAGAA 3432
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3479 TTGAATCAAGCTGCAAAGTAACTAGCCCTACCACTTATGTCTTGGATGAAGATGAACCTCGATTCCTTGAAGAA 3552
Query 3433 GTTGATTACAGTGCAGAAAGTAATGATGAGTTAGATATTGAGTTGGCTGAAAATGTAGGAGATTATGAACCTTC 3506
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3553 GTTGATTACAGTGCAGAAAGTAATGATGAGTTAGATATTGAGTTGGCTGAAAATGTAGGAGATTATGAACCTTC 3626
Query 3507 TGCTCAAGAAGAAGTACTTTCTGACTCTGAATTATCAAGAACATACCTACCT 3558
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3627 TGCTCAAGAAGAAGTACTTTCTGACTCTGAATTATCAAGAACATACCTACCT 3678