Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02745
• Subject: XM_005251849.3
• Aligned Length: 3678
• Identities: 3204
• Gaps: 474

Alignment

Query    1  ATGAGCAAGTTAAAAGTGATACCAGAAAAAAGCCTTACCAATAATTCTAGGATCGTAGGACTCCTGGCTCAACT  74
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query   75  GGAGAAGATCAATGCTGAGCCTTCAGAATCAGACACTGCCCGATATGTTACATCAAAAATTCTTCATCTGGCTC  148
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  149  AGAGTCAAGAAAAAACAAGGAGAGAAATGACAGCCAAAGGTTCTACAGGAATGGAAATTCTGCTGTCAACATTA  222
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  223  GAGAACACAAAAGATCTTCAAACTACACTTAATATCTTAAGCATTCTTGTTGAGCTGGTGTCAGCTGGTGGAGG  296
                                                                                      
Sbjct    1  --------------------------------------------------------------------------  0

Query  297  TCGAAGAGTGAGTTTCTTAGTCACCAAAGGTGGTTCACAAATATTGTTGCAGTTACTTATGAATGCCAGCAAAG  370
                                                                      ||||||||||||||||
Sbjct    1  ----------------------------------------------------------ATGAATGCCAGCAAAG  16

Query  371  AATCTCCCCCACATGAGGACTTAATGGTACAGATTCATTCTATTCTTGCAAAGATTGGACCAAAAGATAAAAAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   17  AATCTCCCCCACATGAGGACTTAATGGTACAGATTCATTCTATTCTTGCAAAGATTGGACCAAAAGATAAAAAA  90

Query  445  TTTGGAGTAAAGGCTAGAATTAATGGGGCTCTGAATATAACCCTGAATTTGGTCAAGCAGAATTTGCAGAATCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   91  TTTGGAGTAAAGGCTAGAATTAATGGGGCTCTGAATATAACCCTGAATTTGGTCAAGCAGAATTTGCAGAATCA  164

Query  519  TCGCTTGGTTCTACCTTGCCTTCAGCTTTTACGAGTATATTCTGCCAACTCTGTGAATTCAGTATCCTTAGGGA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  165  TCGCTTGGTTCTACCTTGCCTTCAGCTTTTACGAGTATATTCTGCCAACTCTGTGAATTCAGTATCCTTAGGGA  238

Query  593  AAAATGGAGTTGTGGAACTGATGTTTAAAATCATTGGACCATTTAGTAAGAAGAATTCCAGTCTTATAAAGGTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  239  AAAATGGAGTTGTGGAACTGATGTTTAAAATCATTGGACCATTTAGTAAGAAGAATTCCAGTCTTATAAAGGTT  312

Query  667  GCTTTAGACACTCTTGCTGCATTGCTAAAATCAAAAACAAATGCCAGGAGAGCTGTAGACAGAGGATATGTCCA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  313  GCTTTAGACACTCTTGCTGCATTGCTAAAATCAAAAACAAATGCCAGGAGAGCTGTAGACAGAGGATATGTCCA  386

Query  741  AGTGCTTTTAACAATTTATGTAGATTGGCACCGCCATGATAACCGGCATAGAAACATGCTCATTCGGAAAGGAA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  387  AGTGCTTTTAACAATTTATGTAGATTGGCACCGCCATGATAACCGGCATAGAAACATGCTCATTCGGAAAGGAA  460

Query  815  TTTTACAGAGTTTAAAAAGTGTTACAAACATCAAGTTGGGAAGAAAAGCATTTATTGATGCCAATGGGATGAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  461  TTTTACAGAGTTTAAAAAGTGTTACAAACATCAAGTTGGGAAGAAAAGCATTTATTGATGCCAATGGGATGAAA  534

Query  889  ATTCTGTATAATACTTCGCAA-----------------------------------------------------  909
            |||||||||||||||||||||                                                     
Sbjct  535  ATTCTGTATAATACTTCGCAAGAATGTCTGGCAGTCAGGACTCTGGATCCTCTTGTCAATACCTCCAGTCTGAT  608

Query  910  -------------------------------------------------------------------TTGCCTG  916
                                                                               |||||||
Sbjct  609  AATGAGGAAGTGTTTCCCAAAAAATCGACTGCCACTCCCAACAATTAAAAGTTCTTTTCATTTCCAGTTGCCTG  682

Query  917  TTATTCCTGTGACTGGTCCTGTGGCTCAGCTCTACAGCTTACCTCCTGAAGTGGATGACGTAGTAGATGAAAGT  990
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  683  TTATTCCTGTGACTGGTCCTGTGGCTCAGCTCTACAGCTTACCTCCTGAAGTGGATGACGTAGTAGATGAAAGT  756

Query  991  GATGACAACGATGATATTGATGTAGAAGCTGAAAACGAAACTGAGAATGAAGATGACCTAGATCAAAATTTTAA  1064
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  757  GATGACAACGATGATATTGATGTAGAAGCTGAAAACGAAACTGAGAATGAAGATGACCTAGATCAAAATTTTAA  830

Query 1065  GAATGATGATATTGAAACAGATATTAACAAACTAAAACCCCAGCAAGAACCGGGACGAACAATAGAAGATCTAA  1138
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  831  GAATGATGATATTGAAACAGATATTAACAAACTAAAACCCCAGCAAGAACCGGGACGAACAATAGAAGATCTAA  904

Query 1139  AAATGTATGAACACCTTTTCCCTGAGCTTGTTGATGATTTTCAGGACTATGATTTAATCTCCAAAGAACCAAAG  1212
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  905  AAATGTATGAACACCTTTTCCCTGAGCTTGTTGATGATTTTCAGGACTATGATTTAATCTCCAAAGAACCAAAG  978

Query 1213  CCTTTTGTATTTGAGGGAAAAGTACGTGGTCCTATTGTTGTTCCTACGGCAGGCGAGGAAACATCTGGGAATTC  1286
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  979  CCTTTTGTATTTGAGGGAAAAGTACGTGGTCCTATTGTTGTTCCTACGGCAGGCGAGGAAACATCTGGGAATTC  1052

Query 1287  TGGCAATTTAAGAAAAGTTGTAATGAAGGAGAACATATCTTCTAAAGGAGATGAAGGTGAAAAGAAGTCTACCT  1360
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1053  TGGCAATTTAAGAAAAGTTGTAATGAAGGAGAACATATCTTCTAAAGGAGATGAAGGTGAAAAGAAGTCTACCT  1126

Query 1361  TTATGGATCTAGCAAAAGAAGATATTAAAGATAATGATAGAACATTACAACAGCAGCCAGGTGATCAAAATAGA  1434
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1127  TTATGGATCTAGCAAAAGAAGATATTAAAGATAATGATAGAACATTACAACAGCAGCCAGGTGATCAAAATAGA  1200

Query 1435  ACTATTTCATCAGTCCATGGTTTAAACAATGATATTGTAAAGGCCTTGGACCGAATTACATTGCAGAATATTCC  1508
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1201  ACTATTTCATCAGTCCATGGTTTAAACAATGATATTGTAAAGGCCTTGGACCGAATTACATTGCAGAATATTCC  1274

Query 1509  TTCTCAAACAGCCCCAGGTTTTACTGCAGAAATGAAGAAGGACTGCAGTCTTCCTCTTACTGTCCTTACCTGTG  1582
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1275  TTCTCAAACAGCCCCAGGTTTTACTGCAGAAATGAAGAAGGACTGCAGTCTTCCTCTTACTGTCCTTACCTGTG  1348

Query 1583  CTAAAGCATGTCCACACATGGCTACTTGTGGAAATGTTCTGTTTGAGGGAAGAACAGTTCAGCTAGGGAAGCTT  1656
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1349  CTAAAGCATGTCCACACATGGCTACTTGTGGAAATGTTCTGTTTGAGGGAAGAACAGTTCAGCTAGGGAAGCTT  1422

Query 1657  TGCTGCACTGGAGTTGAAACTGAAGATGATGAAGATACTGAGTCAAATTCATCGGTAGAACAAGCATCGGTTGA  1730
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1423  TGCTGCACTGGAGTTGAAACTGAAGATGATGAAGATACTGAGTCAAATTCATCGGTAGAACAAGCATCGGTTGA  1496

Query 1731  AGTACCTGATGGACCAACACTCCATGACCCAGACCTCTATATTGAGATTGTGAAAAATACGAAGTCTGTCCCAG  1804
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1497  AGTACCTGATGGACCAACACTCCATGACCCAGACCTCTATATTGAGATTGTGAAAAATACGAAGTCTGTCCCAG  1570

Query 1805  AATATTCAGAGGTGGCTTATCCCGATTATTTTGGTCACATTCCGCCTCCATTCAAAGAGCCTATTTTAGAAAGG  1878
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1571  AATATTCAGAGGTGGCTTATCCCGATTATTTTGGTCACATTCCGCCTCCATTCAAAGAGCCTATTTTAGAAAGG  1644

Query 1879  CCTTATGGTGTACAAAGGACAAAAATTGCTCAAGATATTGAAAGGCTAATACATCAGAGTGATATCATAGATCG  1952
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1645  CCTTATGGTGTACAAAGGACAAAAATTGCTCAAGATATTGAAAGGCTAATACATCAGAGTGATATCATAGATCG  1718

Query 1953  TGTGGTATATGACTTGGATAACCCAAATTACACCATTCCAGAAGAGGGAGATATTTTGAAATTTAACTCCAAAT  2026
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1719  TGTGGTATATGACTTGGATAACCCAAATTACACCATTCCAGAAGAGGGAGATATTTTGAAATTTAACTCCAAAT  1792

Query 2027  TTGAGTCTGGGAATCTGCGCAAAGTAATTCAAATTAGAAAAAATGAATATGATCTTATTCTGAACTCAGACATA  2100
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1793  TTGAGTCTGGGAATCTGCGCAAAGTAATTCAAATTAGAAAAAATGAATATGATCTTATTCTGAACTCAGACATA  1866

Query 2101  AACAGCAATCATTATCATCAGTGGTTTTACTTTGAAGTCAGTGGAATGCGACCAGGTGTTGCTTACAGGTTTAA  2174
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1867  AACAGCAATCATTATCATCAGTGGTTTTACTTTGAAGTCAGTGGAATGCGACCAGGTGTTGCTTACAGGTTTAA  1940

Query 2175  CATCATTAACTGTGAAAAGTCCAACAGTCAGTTTAATTATGGTATGCAACCACTCATGTATTCGGTTCAGGAAG  2248
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1941  CATCATTAACTGTGAAAAGTCCAACAGTCAGTTTAATTATGGTATGCAACCACTCATGTATTCGGTTCAGGAAG  2014

Query 2249  CATTAAATGCCAGACCATGGTGGATTCGTATGGGGACTGACATTTGTTACTATAAAAATCATTTCTCAAGAAGT  2322
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2015  CATTAAATGCCAGACCATGGTGGATTCGTATGGGGACTGACATTTGTTACTATAAAAATCATTTCTCAAGAAGT  2088

Query 2323  TCAGTTGCTGCAGGTGGGCAAAAGGGAAAATCCTACTATACAATTACATTTACTGTCAATTTTCCACATAAAGA  2396
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2089  TCAGTTGCTGCAGGTGGGCAAAAGGGAAAATCCTACTATACAATTACATTTACTGTCAATTTTCCACATAAAGA  2162

Query 2397  TGATGTTTGCTACTTTGCTTATCACTATCCATATACGTATTCAACTTTACAGATGCATCTTCAAAAATTGGAAT  2470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2163  TGATGTTTGCTACTTTGCTTATCACTATCCATATACGTATTCAACTTTACAGATGCATCTTCAAAAATTGGAAT  2236

Query 2471  CAGCACACAATCCTCAGCAAATCTATTTTCGGAAAGATGTGTTATGTGAAACCCTGTCTGGAAACAGCTGCCCC  2544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2237  CAGCACACAATCCTCAGCAAATCTATTTTCGGAAAGATGTGTTATGTGAAACCCTGTCTGGAAACAGCTGCCCC  2310

Query 2545  TTGGTGACTATAACAGCAATGCCAGAGTCTAATTATTATGAACATATCTGCCATTTCAGAAATCGCCCTTACGT  2618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2311  TTGGTGACTATAACAGCAATGCCAGAGTCTAATTATTATGAACATATCTGCCATTTCAGAAATCGCCCTTACGT  2384

Query 2619  TTTCTTGTCTGCTCGGGTACATCCTGGAGAAACTAATGCAAGTTGGGTTATGAAAGGAACGTTGGAATATCTCA  2692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2385  TTTCTTGTCTGCTCGGGTACATCCTGGAGAAACTAATGCAAGTTGGGTTATGAAAGGAACGTTGGAATATCTCA  2458

Query 2693  TGAGCAATAACCCCACTGCTCAGAGCTTACGAGAATCTTATATTTTTAAAATTGTCCCTATGTTAAATCCAGAT  2766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2459  TGAGCAATAACCCCACTGCTCAGAGCTTACGAGAATCTTATATTTTTAAAATTGTCCCTATGTTAAATCCAGAT  2532

Query 2767  GGTGTCATCAATGGAAATCATCGCTGTTCTTTAAGTGGAGAGGATTTGAATAGGCAGTGGCAAAGTCCAAGTCC  2840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2533  GGTGTCATCAATGGAAATCATCGCTGTTCTTTAAGTGGAGAGGATTTGAATAGGCAGTGGCAAAGTCCAAGTCC  2606

Query 2841  GGATTTACATCCTACAATTTACCATGCTAAGGGGCTGTTGCAATACTTGGCTGCAGTGAAGCGTTTACCCTTGG  2914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2607  GGATTTACATCCTACAATTTACCATGCTAAGGGGCTGTTGCAATACTTGGCTGCAGTGAAGCGTTTACCCTTGG  2680

Query 2915  TTTATTGTGATTATCATGGCCATTCCCGAAAGAAGAATGTATTTATGTATGGTTGCAGCATCAAAGAGACAGTG  2988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2681  TTTATTGTGATTATCATGGCCATTCCCGAAAGAAGAATGTATTTATGTATGGTTGCAGCATCAAAGAGACAGTG  2754

Query 2989  TGGCATACCAATGATAATGCAACTTCATGTGATGTTGTGGAGGATACGGGATACAGGACATTGCCTAAGATACT  3062
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2755  TGGCATACCAATGATAATGCAACTTCATGTGATGTTGTGGAGGATACGGGATACAGGACATTGCCTAAGATACT  2828

Query 3063  GAGCCATATCGCCCCAGCATTTTGCATGAGCAGCTGTAGCTTCGTAGTGGAAAAATCTAAAGAATCCACAGCAC  3136
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2829  GAGCCATATCGCCCCAGCATTTTGCATGAGCAGCTGTAGCTTCGTAGTGGAAAAATCTAAAGAATCCACAGCAC  2902

Query 3137  GTGTTGTAGTTTGGAGGGAAATAGGAGTACAAAGAAGTTATACCATGGAGAGTACTTTATGTGGCTGTGATCAG  3210
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2903  GTGTTGTAGTTTGGAGGGAAATAGGAGTACAAAGAAGTTATACCATGGAGAGTACTTTATGTGGCTGTGATCAG  2976

Query 3211  GGAAAATACAAGGGTTTACAGATTGGTACCCGAGAACTGGAAGAGATGGGAGCAAAATTTTGTGTTGGTCTTTT  3284
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2977  GGAAAATACAAGGGTTTACAGATTGGTACCCGAGAACTGGAAGAGATGGGAGCAAAATTTTGTGTTGGTCTTTT  3050

Query 3285  ACGTTTGAAAAGACTGACCTCTCCATTGGAGTATAATCTGCCTTCCAGCCTGCTTGACTTTGAAAATGATTTAA  3358
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3051  ACGTTTGAAAAGACTGACCTCTCCATTGGAGTATAATCTGCCTTCCAGCCTGCTTGACTTTGAAAATGATTTAA  3124

Query 3359  TTGAATCAAGCTGCAAAGTAACTAGCCCTACCACTTATGTCTTGGATGAAGATGAACCTCGATTCCTTGAAGAA  3432
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3125  TTGAATCAAGCTGCAAAGTAACTAGCCCTACCACTTATGTCTTGGATGAAGATGAACCTCGATTCCTTGAAGAA  3198

Query 3433  GTTGATTACAGTGCAGAAAGTAATGATGAGTTAGATATTGAGTTGGCTGAAAATGTAGGAGATTATGAACCTTC  3506
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3199  GTTGATTACAGTGCAGAAAGTAATGATGAGTTAGATATTGAGTTGGCTGAAAATGTAGGAGATTATGAACCTTC  3272

Query 3507  TGCTCAAGAAGAAGTACTTTCTGACTCTGAATTATCAAGAACATACCTACCT  3558
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 3273  TGCTCAAGAAGAAGTACTTTCTGACTCTGAATTATCAAGAACATACCTACCT  3324