Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02745
- Subject:
- XM_011518420.2
- Aligned Length:
- 3558
- Identities:
- 2611
- Gaps:
- 945
Alignment
Query 1 ATGAGCAAGTTAAAAGTGATACCAGAAAAAAGCCTTACCAATAATTCTAGGATCGTAGGACTCCTGGCTCAACT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGAGAAGATCAATGCTGAGCCTTCAGAATCAGACACTGCCCGATATGTTACATCAAAAATTCTTCATCTGGCTC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAGTCAAGAAAAAACAAGGAGAGAAATGACAGCCAAAGGTTCTACAGGAATGGAAATTCTGCTGTCAACATTA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAGAACACAAAAGATCTTCAAACTACACTTAATATCTTAAGCATTCTTGTTGAGCTGGTGTCAGCTGGTGGAGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TCGAAGAGTGAGTTTCTTAGTCACCAAAGGTGGTTCACAAATATTGTTGCAGTTACTTATGAATGCCAGCAAAG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AATCTCCCCCACATGAGGACTTAATGGTACAGATTCATTCTATTCTTGCAAAGATTGGACCAAAAGATAAAAAA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TTTGGAGTAAAGGCTAGAATTAATGGGGCTCTGAATATAACCCTGAATTTGGTCAAGCAGAATTTGCAGAATCA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TCGCTTGGTTCTACCTTGCCTTCAGCTTTTACGAGTATATTCTGCCAACTCTGTGAATTCAGTATCCTTAGGGA 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 AAAATGGAGTTGTGGAACTGATGTTTAAAATCATTGGACCATTTAGTAAGAAGAATTCCAGTCTTATAAAGGTT 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GCTTTAGACACTCTTGCTGCATTGCTAAAATCAAAAACAAATGCCAGGAGAGCTGTAGACAGAGGATATGTCCA 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 AGTGCTTTTAACAATTTATGTAGATTGGCACCGCCATGATAACCGGCATAGAAACATGCTCATTCGGAAAGGAA 814
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 815 TTTTACAGAGTTTAAAAAGTGTTACAAACATCAAGTTGGGAAGAAAAGCATTTATTGATGCCAATGGGATGAAA 888
.|||||| |||||
Sbjct 1 ------------------------------------------------------ATGATGC--------TGAAA 12
Query 889 ATTCTGTATAATACTTCGCAATTGCCTGTTATTCCTGTGACTGGTCCTGTGGCTCAGCTCTACAGCTTACCTCC 962
| |.|||| ||
Sbjct 13 A---------------CACAAT---CT----------------------------------------------- 21
Query 963 TGAAGTGGATGACGTAGTAGATGAAAGTGATGACAACGATGATATTGATGTAGAAGCTGAAAACGAAACTGAGA 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 22 ----GTGGATGACGTAGTAGATGAAAGTGATGACAACGATGATATTGATGTAGAAGCTGAAAACGAAACTGAGA 91
Query 1037 ATGAAGATGACCTAGATCAAAATTTTAAGAATGATGATATTGAAACAGATATTAACAAACTAAAACCCCAGCAA 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 92 ATGAAGATGACCTAGATCAAAATTTTAAGAATGATGATATTGAAACAGATATTAACAAACTAAAACCCCAGCAA 165
Query 1111 GAACCGGGACGAACAATAGAAGATCTAAAAATGTATGAACACCTTTTCCCTGAGCTTGTTGATGATTTTCAGGA 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 166 GAACCGGGACGAACAATAGAAGATCTAAAAATGTATGAACACCTTTTCCCTGAGCTTGTTGATGATTTTCAGGA 239
Query 1185 CTATGATTTAATCTCCAAAGAACCAAAGCCTTTTGTATTTGAGGGAAAAGTACGTGGTCCTATTGTTGTTCCTA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 240 CTATGATTTAATCTCCAAAGAACCAAAGCCTTTTGTATTTGAGGGAAAAGTACGTGGTCCTATTGTTGTTCCTA 313
Query 1259 CGGCAGGCGAGGAAACATCTGGGAATTCTGGCAATTTAAGAAAAGTTGTAATGAAGGAGAACATATCTTCTAAA 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 314 CGGCAGGCGAGGAAACATCTGGGAATTCTGGCAATTTAAGAAAAGTTGTAATGAAGGAGAACATATCTTCTAAA 387
Query 1333 GGAGATGAAGGTGAAAAGAAGTCTACCTTTATGGATCTAGCAAAAGAAGATATTAAAGATAATGATAGAACATT 1406
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 388 GGAGATGAAGGTGAAAAGAAGTCTACCTTTATGGATCTAGCAAAAGAAGATATTAAAGATAATGATAGAACATT 461
Query 1407 ACAACAGCAGCCAGGTGATCAAAATAGAACTATTTCATCAGTCCATGGTTTAAACAATGATATTGTAAAGGCCT 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 462 ACAACAGCAGCCAGGTGATCAAAATAGAACTATTTCATCAGTCCATGGTTTAAACAATGATATTGTAAAGGCCT 535
Query 1481 TGGACCGAATTACATTGCAGAATATTCCTTCTCAAACAGCCCCAGGTTTTACTGCAGAAATGAAGAAGGACTGC 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 536 TGGACCGAATTACATTGCAGAATATTCCTTCTCAAACAGCCCCAGGTTTTACTGCAGAAATGAAGAAGGACTGC 609
Query 1555 AGTCTTCCTCTTACTGTCCTTACCTGTGCTAAAGCATGTCCACACATGGCTACTTGTGGAAATGTTCTGTTTGA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 610 AGTCTTCCTCTTACTGTCCTTACCTGTGCTAAAGCATGTCCACACATGGCTACTTGTGGAAATGTTCTGTTTGA 683
Query 1629 GGGAAGAACAGTTCAGCTAGGGAAGCTTTGCTGCACTGGAGTTGAAACTGAAGATGATGAAGATACTGAGTCAA 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 684 GGGAAGAACAGTTCAGCTAGGGAAGCTTTGCTGCACTGGAGTTGAAACTGAAGATGATGAAGATACTGAGTCAA 757
Query 1703 ATTCATCGGTAGAACAAGCATCGGTTGAAGTACCTGATGGACCAACACTCCATGACCCAGACCTCTATATTGAG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 758 ATTCATCGGTAGAACAAGCATCGGTTGAAGTACCTGATGGACCAACACTCCATGACCCAGACCTCTATATTGAG 831
Query 1777 ATTGTGAAAAATACGAAGTCTGTCCCAGAATATTCAGAGGTGGCTTATCCCGATTATTTTGGTCACATTCCGCC 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 832 ATTGTGAAAAATACGAAGTCTGTCCCAGAATATTCAGAGGTGGCTTATCCCGATTATTTTGGTCACATTCCGCC 905
Query 1851 TCCATTCAAAGAGCCTATTTTAGAAAGGCCTTATGGTGTACAAAGGACAAAAATTGCTCAAGATATTGAAAGGC 1924
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 906 TCCATTCAAAGAGCCTATTTTAGAAAGGCCTTATGGTGTACAAAGGACAAAAATTGCTCAAGATATTGAAAGGC 979
Query 1925 TAATACATCAGAGTGATATCATAGATCGTGTGGTATATGACTTGGATAACCCAAATTACACCATTCCAGAAGAG 1998
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 980 TAATACATCAGAGTGATATCATAGATCGTGTGGTATATGACTTGGATAACCCAAATTACACCATTCCAGAAGAG 1053
Query 1999 GGAGATATTTTGAAATTTAACTCCAAATTTGAGTCTGGGAATCTGCGCAAAGTAATTCAAATTAGAAAAAATGA 2072
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1054 GGAGATATTTTGAAATTTAACTCCAAATTTGAGTCTGGGAATCTGCGCAAAGTAATTCAAATTAGAAAAAATGA 1127
Query 2073 ATATGATCTTATTCTGAACTCAGACATAAACAGCAATCATTATCATCAGTGGTTTTACTTTGAAGTCAGTGGAA 2146
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1128 ATATGATCTTATTCTGAACTCAGACATAAACAGCAATCATTATCATCAGTGGTTTTACTTTGAAGTCAGTGGAA 1201
Query 2147 TGCGACCAGGTGTTGCTTACAGGTTTAACATCATTAACTGTGAAAAGTCCAACAGTCAGTTTAATTATGGTATG 2220
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1202 TGCGACCAGGTGTTGCTTACAGGTTTAACATCATTAACTGTGAAAAGTCCAACAGTCAGTTTAATTATGGTATG 1275
Query 2221 CAACCACTCATGTATTCGGTTCAGGAAGCATTAAATGCCAGACCATGGTGGATTCGTATGGGGACTGACATTTG 2294
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1276 CAACCACTCATGTATTCGGTTCAGGAAGCATTAAATGCCAGACCATGGTGGATTCGTATGGGGACTGACATTTG 1349
Query 2295 TTACTATAAAAATCATTTCTCAAGAAGTTCAGTTGCTGCAGGTGGGCAAAAGGGAAAATCCTACTATACAATTA 2368
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1350 TTACTATAAAAATCATTTCTCAAGAAGTTCAGTTGCTGCAGGTGGGCAAAAGGGAAAATCCTACTATACAATTA 1423
Query 2369 CATTTACTGTCAATTTTCCACATAAAGATGATGTTTGCTACTTTGCTTATCACTATCCATATACGTATTCAACT 2442
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1424 CATTTACTGTCAATTTTCCACATAAAGATGATGTTTGCTACTTTGCTTATCACTATCCATATACGTATTCAACT 1497
Query 2443 TTACAGATGCATCTTCAAAAATTGGAATCAGCACACAATCCTCAGCAAATCTATTTTCGGAAAGATGTGTTATG 2516
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1498 TTACAGATGCATCTTCAAAAATTGGAATCAGCACACAATCCTCAGCAAATCTATTTTCGGAAAGATGTGTTATG 1571
Query 2517 TGAAACCCTGTCTGGAAACAGCTGCCCCTTGGTGACTATAACAGCAATGCCAGAGTCTAATTATTATGAACATA 2590
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1572 TGAAACCCTGTCTGGAAACAGCTGCCCCTTGGTGACTATAACAGCAATGCCAGAGTCTAATTATTATGAACATA 1645
Query 2591 TCTGCCATTTCAGAAATCGCCCTTACGTTTTCTTGTCTGCTCGGGTACATCCTGGAGAAACTAATGCAAGTTGG 2664
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1646 TCTGCCATTTCAGAAATCGCCCTTACGTTTTCTTGTCTGCTCGGGTACATCCTGGAGAAACTAATGCAAGTTGG 1719
Query 2665 GTTATGAAAGGAACGTTGGAATATCTCATGAGCAATAACCCCACTGCTCAGAGCTTACGAGAATCTTATATTTT 2738
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1720 GTTATGAAAGGAACGTTGGAATATCTCATGAGCAATAACCCCACTGCTCAGAGCTTACGAGAATCTTATATTTT 1793
Query 2739 TAAAATTGTCCCTATGTTAAATCCAGATGGTGTCATCAATGGAAATCATCGCTGTTCTTTAAGTGGAGAGGATT 2812
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1794 TAAAATTGTCCCTATGTTAAATCCAGATGGTGTCATCAATGGAAATCATCGCTGTTCTTTAAGTGGAGAGGATT 1867
Query 2813 TGAATAGGCAGTGGCAAAGTCCAAGTCCGGATTTACATCCTACAATTTACCATGCTAAGGGGCTGTTGCAATAC 2886
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1868 TGAATAGGCAGTGGCAAAGTCCAAGTCCGGATTTACATCCTACAATTTACCATGCTAAGGGGCTGTTGCAATAC 1941
Query 2887 TTGGCTGCAGTGAAGCGTTTACCCTTGGTTTATTGTGATTATCATGGCCATTCCCGAAAGAAGAATGTATTTAT 2960
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1942 TTGGCTGCAGTGAAGCGTTTACCCTTGGTTTATTGTGATTATCATGGCCATTCCCGAAAGAAGAATGTATTTAT 2015
Query 2961 GTATGGTTGCAGCATCAAAGAGACAGTGTGGCATACCAATGATAATGCAACTTCATGTGATGTTGTGGAGGATA 3034
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2016 GTATGGTTGCAGCATCAAAGAGACAGTGTGGCATACCAATGATAATGCAACTTCATGTGATGTTGTGGAGGATA 2089
Query 3035 CGGGATACAGGACATTGCCTAAGATACTGAGCCATATCGCCCCAGCATTTTGCATGAGCAGCTGTAGCTTCGTA 3108
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2090 CGGGATACAGGACATTGCCTAAGATACTGAGCCATATCGCCCCAGCATTTTGCATGAGCAGCTGTAGCTTCGTA 2163
Query 3109 GTGGAAAAATCTAAAGAATCCACAGCACGTGTTGTAGTTTGGAGGGAAATAGGAGTACAAAGAAGTTATACCAT 3182
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2164 GTGGAAAAATCTAAAGAATCCACAGCACGTGTTGTAGTTTGGAGGGAAATAGGAGTACAAAGAAGTTATACCAT 2237
Query 3183 GGAGAGTACTTTATGTGGCTGTGATCAGGGAAAATACAAGGGTTTACAGATTGGTACCCGAGAACTGGAAGAGA 3256
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2238 GGAGAGTACTTTATGTGGCTGTGATCAGGGAAAATACAAGGGTTTACAGATTGGTACCCGAGAACTGGAAGAGA 2311
Query 3257 TGGGAGCAAAATTTTGTGTTGGTCTTTTACGTTTGAAAAGACTGACCTCTCCATTGGAGTATAATCTGCCTTCC 3330
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2312 TGGGAGCAAAATTTTGTGTTGGTCTTTTACGTTTGAAAAGACTGACCTCTCCATTGGAGTATAATCTGCCTTCC 2385
Query 3331 AGCCTGCTTGACTTTGAAAATGATTTAATTGAATCAAGCTGCAAAGTAACTAGCCCTACCACTTATGTCTTGGA 3404
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2386 AGCCTGCTTGACTTTGAAAATGATTTAATTGAATCAAGCTGCAAAGTAACTAGCCCTACCACTTATGTCTTGGA 2459
Query 3405 TGAAGATGAACCTCGATTCCTTGAAGAAGTTGATTACAGTGCAGAAAGTAATGATGAGTTAGATATTGAGTTGG 3478
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2460 TGAAGATGAACCTCGATTCCTTGAAGAAGTTGATTACAGTGCAGAAAGTAATGATGAGTTAGATATTGAGTTGG 2533
Query 3479 CTGAAAATGTAGGAGATTATGAACCTTCTGCTCAAGAAGAAGTACTTTCTGACTCTGAATTATCAAGAACATAC 3552
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2534 CTGAAAATGTAGGAGATTATGAACCTTCTGCTCAAGAAGAAGTACTTTCTGACTCTGAATTATCAAGAACATAC 2607
Query 3553 CTACCT 3558
||||||
Sbjct 2608 CTACCT 2613
