Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02745
- Subject:
- XM_017014549.1
- Aligned Length:
- 3689
- Identities:
- 2611
- Gaps:
- 1069
Alignment
Query 1 ATGAGCAAGTTAAAAGTGATACCAGAAAAAAGCCTTACCAATAATTCTAGGATCGTAGGACTCCTGGCTCAACT 74
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 75 GGAGAAGATCAATGCTGAGCCTTCAGAATCAGACACTGCCCGATATGTTACATCAAAAATTCTTCATCTGGCTC 148
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 149 AGAGTCAAGAAAAAACAAGGAGAGAAATGACAGCCAAAGGTTCTACAGGAATGGAAATTCTGCTGTCAACATTA 222
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 223 GAGAACACAAAAGATCTTCAAACTACACTTAATATCTTAAGCATTCTTGTTGAGCTGGTGTCAGCTGGTGGAGG 296
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 297 TCGAAGAGTGAGTTTCTTAGTCACCAAAGGTGGTTCACAAATATTGTTGCAGTTACTTATGAATGCCAGCAAAG 370
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 371 AATCTCCCCCACATGAGGACTTAATGGTACAGATTCATTCTATTCTTGCAAAGATTGGACCAAAAGATAAAAAA 444
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 445 TTTGGAGTAAAGGCTAGAATTAATGGGGCTCTGAATATAACCCTGAATTTGGTCAAGCAGAATTTGCAGAATCA 518
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 519 TCGCTTGGTTCTACCTTGCCTTCAGCTTTTACGAGTATATTCTGCCAACTCTGTGAATTCAGTATCCTTAGGGA 592
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 593 AAAATGGAGTTGTGGAACTGATGTTTAAAATCATTGGACCATTTAGTAAGAAGAATTCCAGTCTTATAAAGGTT 666
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 667 GCTTTAGACACTCTTGCTGCATTGCTAAAATCAAAAACAAATGCCAGGAGAGCTGTAGACAGAGGATATGTCCA 740
Sbjct 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Query 741 AGTGCTTTTAACAATTTATGTAGATTGGCACCGCCATGATAACCGGCATAGAAACATGCTCATTCGGAAAGGAA 814
|||||||||||||||||||
Sbjct 1 -------------------------------------------------------ATGCTCATTCGGAAAGGAA 19
Query 815 TTTTACAGAGTTTAAAAAGTGTTACAAACATCAAGTTGGGAAGAAAAGCATTTATTGATGCCAATGGGATGAAA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 20 TTTTACAGAGTTTAAAAAGTGTTACAAACATCAAGTTGGGAAGAAAAGCATTTATTGATGCCAATGGGATGAAA 93
Query 889 ATTCTGTATAATACTTCGCAA----------------------------------------------------- 909
|||||||||||||||||||||
Sbjct 94 ATTCTGTATAATACTTCGCAAGAATGTCTGGCAGTCAGGACTCTGGATCCTCTTGTCAATACCTCCAGTCTGAT 167
Query 910 -------------------------------------------------------------------TTGCCTG 916
|||||||
Sbjct 168 AATGAGGAAGTGTTTCCCAAAAAATCGACTGCCACTCCCAACAATTAAAAGTTCTTTTCATTTCCAGTTGCCTG 241
Query 917 TTATTCCTGTGACTGGTCCTGTGGCTCAGCTCTACAGCTTACCTCCTGAAGTGGATGACGTAGTAGATGAAAGT 990
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 242 TTATTCCTGTGACTGGTCCTGTGGCTCAGCTCTACAGCTTACCTCCTGAAGTGGATGACGTAGTAGATGAAAGT 315
Query 991 GATGACAACGATGATATTGATGTAGAAGCTGAAAACGAAACTGAGAATGAAGATGACCTAGATCAAAATTTTAA 1064
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 316 GATGACAACGATGATATTGATGTAGAAGCTGAAAACGAAACTGAGAATGAAGATGACCTAGATCAAAATTTTAA 389
Query 1065 GAATGATGATATTGAAACAGATATTAACAAACTAAAACCCCAGCAAGAACCGGGACGAACAATAGAAGATCTAA 1138
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 390 GAATGATGATATTGAAACAGATATTAACAAACTAAAACCCCAGCAAGAACCGGGACGAACAATAGAAGATCTAA 463
Query 1139 AAATGTATGAACACCTTTTCCCTGAGCTTGTTGATGATTTTCAGGACTATGATTTAATCTCCAAAGAACCAAAG 1212
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 464 AAATGTATGAACACCTTTTCCCTGAGCTTGTTGATGATTTTCAGGACTATGATTTAATCTCCAAAGAACCAAAG 537
Query 1213 CCTTTTGTATTTGAGGGAAAAGTACGTGGTCCTATTGTTGTTCCTACGGCAGGCGAGGAAACATCTGGGAATTC 1286
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 538 CCTTTTGTATTTGAGGGAAAAGTACGTGGTCCTATTGTTGTTCCTACGGCAGGCGAGGAAACATCTGGGAATTC 611
Query 1287 TGGCAATTTAAGAAAAGTTGTAATGAAGGAGAACATATCTTCTAAAGGAGATGAAGGTGAAAAGAAGTCTACCT 1360
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 612 TGGCAATTTAAGAAAAGTTGTAATGAAGGAGAACATATCTTCTAAAGGAGATGAAGGTGAAAAGAAGTCTACCT 685
Query 1361 TTATGGATCTAGCAAAAGAAGATATTAAAGATAATGATAGAACATTACAACAGCAGCCAGGTGATCAAAATAGA 1434
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 686 TTATGGATCTAGCAAAAGAAGATATTAAAGATAATGATAGAACATTACAACAGCAGCCAGGTGATCAAAATAGA 759
Query 1435 ACTATTTCATCAGTCCATGGTTTAAACAATGATATTGTAAAGGCCTTGGACCGAATTACATTGCAGAATATTCC 1508
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 760 ACTATTTCATCAGTCCATGGTTTAAACAATGATATTGTAAAGGCCTTGGACCGAATTACATTGCAGAATATTCC 833
Query 1509 TTCTCAAACAGCCCCAGGTTTTACTGCAGAAATGAAGAAGGACTGCAGTCTTCCTCTTACTGTCCTTACCTGTG 1582
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 834 TTCTCAAACAGCCCCAGGTTTTACTGCAGAAATGAAGAAGGACTGCAGTCTTCCTCTTACTGTCCTTACCTGTG 907
Query 1583 CTAAAGCATGTCCACACATGGCTACTTGTGGAAATGTTCTGTTTGAGGGAAGAACAGTTCAGCTAGGGAAGCTT 1656
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 908 CTAAAGCATGTCCACACATGGCTACTTGTGGAAATGTTCTGTTTGAGGGAAGAACAGTTCAGCTAGGGAAGCTT 981
Query 1657 TGCTGCACTGGAGTTGAAACTGAAGATGATGAAGATACTGAGTCAAATTCATCGGTAGAACAAGCATCGGTTGA 1730
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 982 TGCTGCACTGGAGTTGAAACTGAAGATGATGAAGATACTGAGTCAAATTCATCGGTAGAACAAGCATCGGTTGA 1055
Query 1731 AGTACCTGATGGACCAACACTCCATGACCCAGACCTCTATATTGAGATTGTGAAAAATACGAAGTCTGTCCCAG 1804
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1056 AGTACCTGATGGACCAACACTCCATGACCCAGACCTCTATATTGAGATTGTGAAAAATACGAAGTCTGTCCCAG 1129
Query 1805 AATATTCAGAGGTGGCTTATCCCGATTATTTTGGTCACATTCCGCCTCCATTCAAAGAGCCTATTTTAGAAAGG 1878
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1130 AATATTCAGAGGTGGCTTATCCCGATTATTTTGGTCACATTCCGCCTCCATTCAAAGAGCCTATTTTAGAAAGG 1203
Query 1879 CCTTATGGTGTACAAAGGACAAAAATTGCTCAAGATATTGAAAGGCTAATACATCAGAGTGATATCATAGATCG 1952
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1204 CCTTATGGTGTACAAAGGACAAAAATTGCTCAAGATATTGAAAGGCTAATACATCAGAGTGATATCATAGATCG 1277
Query 1953 TGTGGTATATGACTTGGATAACCCAAATTACACCATTCCAGAAGAGGGAGATATTTTGAAATTTAACTCCAAAT 2026
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1278 TGTGGTATATGACTTGGATAACCCAAATTACACCATTCCAGAAGAGGGAGATATTTTGAAATTTAACTCCAAAT 1351
Query 2027 TTGAGTCTGGGAATCTGCGCAAAGTAATTCAAATTAGAAAAAATGAATATGATCTTATTCTGAACTCAGACATA 2100
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1352 TTGAGTCTGGGAATCTGCGCAAAGTAATTCAAATTAGAAAAAATGAATATGATCTTATTCTGAACTCAGACATA 1425
Query 2101 AACAGCAATCATTATCATCAGTGGTTTTACTTTGAAGTCAGTGGAATGCGACCAGGTGTTGCTTACAGGTTTAA 2174
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1426 AACAGCAATCATTATCATCAGTGGTTTTACTTTGAAGTCAGTGGAATGCGACCAGGTGTTGCTTACAGGTTTAA 1499
Query 2175 CATCATTAACTGTGAAAAGTCCAACAGTCAGTTTAATTATGGTATGCAACCACTCATGTATTCGGTTCAGGAAG 2248
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1500 CATCATTAACTGTGAAAAGTCCAACAGTCAGTTTAATTATGGTATGCAACCACTCATGTATTCGGTTCAGGAAG 1573
Query 2249 CATTAAATGCCAGACCATGGTGGATTCGTATGGGGACTGACATTTGTTACTATAAAAATCATTTCTCAAGAAGT 2322
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1574 CATTAAATGCCAGACCATGGTGGATTCGTATGGGGACTGACATTTGTTACTATAAAAATCATTTCTCAAGAAGT 1647
Query 2323 TCAGTTGCTGCAGGTGGGCAAAAGGGAAAATCCTACTATACAATTACATTTACTGTCAATTTTCCACATAAAGA 2396
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1648 TCAGTTGCTGCAGGTGGGCAAAAGGGAAAATCCTACTATACAATTACATTTACTGTCAATTTTCCACATAAAGA 1721
Query 2397 TGATGTTTGCTACTTTGCTTATCACTATCCATATACGTATTCAACTTTACAGATGCATCTTCAAAAATTGGAAT 2470
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1722 TGATGTTTGCTACTTTGCTTATCACTATCCATATACGTATTCAACTTTACAGATGCATCTTCAAAAATTGGAAT 1795
Query 2471 CAGCACACAATCCTCAGCAAATCTATTTTCGGAAAGATGTGTTATGTGAAACCCTGTCTGGAAACAGCTGCCCC 2544
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1796 CAGCACACAATCCTCAGCAAATCTATTTTCGGAAAGATGTGTTATGTGAAACCCTGTCTGGAAACAGCTGCCCC 1869
Query 2545 TTGGTGACTATAACAGCAATGCCAGAGTCTAATTATTATGAACATATCTGCCATTTCAGAAATCGCCCTTACGT 2618
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1870 TTGGTGACTATAACAGCAATGCCAGAGTCTAATTATTATGAACATATCTGCCATTTCAGAAATCGCCCTTACGT 1943
Query 2619 TTTCTTGTCTGCTCGGGTACATCCTGGAGAAACTAATGCAAGTTGGGTTATGAAAGGAACGTTGGAATATCTCA 2692
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1944 TTTCTTGTCTGCTCGGGTACATCCTGGAGAAACTAATGCAAGTTGGGTTATGAAAGGAACGTTGGAATATCTCA 2017
Query 2693 TGAGCAATAACCCCACTGCTCAGAGCTTACGAGAATCTTATATTTTTAAAATTGTCCCTATGTTAAATCCAGAT 2766
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2018 TGAGCAATAACCCCACTGCTCAGAGCTTACGAGAATCTTATATTTTTAAAATTGTCCCTATGTTAAATCCAGAT 2091
Query 2767 GGTGTCATCAATGGAAATCATCGCTGTTCTTTAAGTGGAGAGGATTTGAATAGGCAGTGGCAAAGTCCAAGTCC 2840
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2092 GGTGTCATCAATGGAAATCATCGCTGTTCTTTAAGTGGAGAGGATTTGAATAGGCAGTGGCAAAGTCCAAGTCC 2165
Query 2841 GGATTTACATCCTACAATTTACCATGCTAAGGGGCTGTTGCAATACTTGGCTGCAGTGAAGCGTTTACCCTTGG 2914
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2166 GGATTTACATCCTACAATTTACCATGCTAAGGGGCTGTTGCAATACTTGGCTGCAGTGAAGCGTTTACCCTTGG 2239
Query 2915 TTTATTGTGATTATCATGGCCATTCCCGAAAGAAGAATGTATTTATGTATGGTTGCAGCATCAAAGAGACAGTG 2988
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2240 TTTATTGTGATTATCATGGCCATTCCCGAAAGAAGAATGTATTTATGTATGGTTGCAGCATCAAAGAGACAGTG 2313
Query 2989 TGGCATACCAATGATAATGCAACTTCATGTGATGTTGTGGAGGATACGGGATACAGGACATTGCCTAAGATACT 3062
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2314 TGGCATACCAATGATAATGCAACTTCATGTGATGTTGTGGAGGATACGGGATACAGGACATTGCCTAAGATACT 2387
Query 3063 GAGCCATATCGCCCCAGCATTTTGCATGAGCAGCTGTAGCTTCGTAGTGGAAAAATCTAAAGAATCCACAGCAC 3136
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2388 GAGCCATATCGCCCCAGCATTTTGCATGAGCAGCTGTAGCTTCGTAGTGGAAAAATCTAAAGAATCCACAGCAC 2461
Query 3137 GTGTTGTAGTTTGGAGGGAAATAGGAGTACAAAGAAGTTATACCATGGAGAGTACTTTATGTGGCTGTGATCAG 3210
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2462 GTGTTGTAGTTTGGAGGGAAATAGGAGTACAAAGAAGTTATACCATGGAGAGTACTTTATGTGGCTGTGATCAG 2535
Query 3211 GGAAAATACAAGGGTTTACAGATTGGTACCCGAGAACTGGAAGAGATGGGAGCAAAATTTTGTGTTGGTCTTTT 3284
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2536 GGAAAATACAAGGGTTTACAGATTGGTACCCGAGAACTGGAAGAGATGGGAGCAAAATTTTGTGTTGGTCTTTT 2609
Query 3285 ACGTTTGAAAAGACTGACCTCTCCATTGGAGTATAATCTGCCTTCCAGCCTGCTTGACTTTGAAAATGATTTAA 3358
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2610 ACGTTTGAAAAGACTGACCTCTCCATTGGAGTATAATCTGCCTTCCAGCCTGCTTGACTTTGAAAATGATTTAA 2683
Query 3359 TTGAATCAAGCTGCAAAGTAACTAG---CCCTACC--------ACTTATGTCTTGGATGAAGATGAACCTCGAT 3421
||||||||||||||||||||||||| ||.|..| ||||..||.||.| ||||.|.
Sbjct 2684 TTGAATCAAGCTGCAAAGTAACTAGGAACCTTGGCAGCTCTGAACTTCAGTTTTTG-----------CCTCCAA 2746
Query 3422 TCCTTGAAGAAGTTGATTACAGTGCAGAAAGTAATGATGAGTTAGATATTGAGTTGGCTGAAAATGTAGGAGAT 3495
|||||
Sbjct 2747 TCCTT--------------------------------------------------------------------- 2751
Query 3496 TATGAACCTTCTGCTCAAGAAGAAGTACTTTCTGACTCTGAATTATCAAGAACATACCTACCT 3558
Sbjct 2752 --------------------------------------------------------------- 2751
