Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02758
• Subject: NM_001359626.1
• Aligned Length: 1896
• Identities: 1866
• Gaps: 30

Alignment

Query    1  ATGCAGCGGGAGGAGGGATTTAACACCAAGATGGCGGACGGCCCGGATGAGTACGATACCGAAGCGGGCTGTGT  74
                                          ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ------------------------------ATGGCGGACGGCCCGGATGAGTACGATACCGAAGCGGGCTGTGT  44

Query   75  GCCCCTTCTCCACCCAGAGGAAATCAAACCCCAAAGCCATTATAACCATGGATATGGTGAACCTCTTGGACGGA  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   45  GCCCCTTCTCCACCCAGAGGAAATCAAACCCCAAAGCCATTATAACCATGGATATGGTGAACCTCTTGGACGGA  118

Query  149  AAACTCATATTGATGATTACAGCACATGGGACATAGTCAAGGCTACACAATATGGAATATATGAACGCTGTCGA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  119  AAACTCATATTGATGATTACAGCACATGGGACATAGTCAAGGCTACACAATATGGAATATATGAACGCTGTCGA  192

Query  223  GAATTGGTGGAAGCAGGTTATGATGTACGGCAACCGGACAAAGAAAATGTTACCCTCCTCCATTGGGCTGCCAT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  193  GAATTGGTGGAAGCAGGTTATGATGTACGGCAACCGGACAAAGAAAATGTTACCCTCCTCCATTGGGCTGCCAT  266

Query  297  CAATAACAGAATAGATTTAGTCAAATACTATATTTCGAAAGGTGCTATTGTGGATCAACTTGGAGGGGACCTGA  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  267  CAATAACAGAATAGATTTAGTCAAATACTATATTTCGAAAGGTGCTATTGTGGATCAACTTGGAGGGGACCTGA  340

Query  371  ATTCAACTCCATTGCACTGGGCCACAAGACAAGGCCATCTATCCATGGTTGTGCAACTAATGAAATATGGTGCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  341  ATTCAACTCCATTGCACTGGGCCACAAGACAAGGCCATCTATCCATGGTTGTGCAACTAATGAAATATGGTGCA  414

Query  445  GATCCTTCATTAATTGATGGAGAAGGATGTAGCTGTATTCATCTGGCTGCTCAGTTCGGACATACCTCAATTGT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  415  GATCCTTCATTAATTGATGGAGAAGGATGTAGCTGTATTCATCTGGCTGCTCAGTTCGGACATACCTCAATTGT  488

Query  519  TGCTTATCTCATAGCAAAAGGACAGGATGTAGATATGATGGATCAGAATGGAATGACGCCTTTAATGTGGGCAG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  489  TGCTTATCTCATAGCAAAAGGACAGGATGTAGATATGATGGATCAGAATGGAATGACGCCTTTAATGTGGGCAG  562

Query  593  CATATAGAACACATAGTGTGGATCCAACTAGATTGCTTTTAACATTCAATGTTTCAGTTAACCTTGGTGACAAG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  563  CATATAGAACACATAGTGTGGATCCAACTAGATTGCTTTTAACATTCAATGTTTCAGTTAACCTTGGTGACAAG  636

Query  667  TATCACAAAAACACTGCTCTGCATTGGGCAGTGCTAGCAGGGAATACCACAGTCATTAGCCTTCTTCTGGAAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  637  TATCACAAAAACACTGCTCTGCATTGGGCAGTGCTAGCAGGGAATACCACAGTCATTAGCCTTCTTCTGGAAGC  710

Query  741  TGGAGCTAATGTTGATGCCCAGAATATCAAGGGCGAATCAGCGCTTGATTTGGCAAAACAGAGAAAAAATGTGT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  711  TGGAGCTAATGTTGATGCCCAGAATATCAAGGGCGAATCAGCGCTTGATTTGGCAAAACAGAGAAAAAATGTGT  784

Query  815  GGATGATCAACCACTTACAAGAGGCAAGGCAAGCAAAAGGATATGACAATCCGTCCTTCCTTAGAAAGCTGAAA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  785  GGATGATCAACCACTTACAAGAGGCAAGGCAAGCAAAAGGATATGACAATCCGTCCTTCCTTAGAAAGCTGAAA  858

Query  889  GCTGATAAGGAATTTCGGCAGAAAGTAATGTTAGGAACTCCTTTCCTAGTTATTTGGCTGGTTGGGTTTATAGC  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  859  GCTGATAAGGAATTTCGGCAGAAAGTAATGTTAGGAACTCCTTTCCTAGTTATTTGGCTGGTTGGGTTTATAGC  932

Query  963  AGACCTAAATATTGATTCTTGGCTCATTAAAGGGCTAATGTATGGTGGTGTTTGGGCTACAGTACAGTTTCTTT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  933  AGACCTAAATATTGATTCTTGGCTCATTAAAGGGCTAATGTATGGTGGTGTTTGGGCTACAGTACAGTTTCTTT  1006

Query 1037  CAAAATCCTTTTTCGATCATTCAATGCATAGTGCATTGCCCCTTGGGATATATTTGGCAACCAAATTCTGGATG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1007  CAAAATCCTTTTTCGATCATTCAATGCATAGTGCATTGCCCCTTGGGATATATTTGGCAACCAAATTCTGGATG  1080

Query 1111  TATGTGACGTGGTTCTTCTGGTTTTGGAATGATCTCAACTTTTTATTTATCCATCTTCCATTCCTTGCCAATAG  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1081  TATGTGACGTGGTTCTTCTGGTTTTGGAATGATCTCAACTTTTTATTTATCCATCTTCCATTCCTTGCCAATAG  1154

Query 1185  TGTTGCACTTTTCTACAATTTTGGAAAATCTTGGAAATCAGATCCAGGGATTATTAAAGCAACAGAAGAGCAAA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1155  TGTTGCACTTTTCTACAATTTTGGAAAATCTTGGAAATCAGATCCAGGGATTATTAAAGCAACAGAAGAGCAAA  1228

Query 1259  AGAAAAAGACAATAGTTGAACTTGCAGAGACAGGAAGTCTGGACCTCAGTATATTCTGCAGTACCTGTTTGATA  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1229  AGAAAAAGACAATAGTTGAACTTGCAGAGACAGGAAGTCTGGACCTCAGTATATTCTGCAGTACCTGTTTGATA  1302

Query 1333  CGAAAACCGGTGAGGTCCAAACATTGTGGTGTGTGCAACCGCTGTATAGCAAAATTTGATCATCATTGCCCATG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1303  CGAAAACCGGTGAGGTCCAAACATTGTGGTGTGTGCAACCGCTGTATAGCAAAATTTGATCATCATTGCCCATG  1376

Query 1407  GGTGGGTAACTGTGTAGGTGCAGGCAACCATAGATATTTTATGGGCTACCTATTCTTCTTGCTTTTTATGATCT  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1377  GGTGGGTAACTGTGTAGGTGCAGGCAACCATAGATATTTTATGGGCTACCTATTCTTCTTGCTTTTTATGATCT  1450

Query 1481  GCTGGATGATTTATGGTTGTATATCTTACTGGGGACTCCACTGTGAGACCACTTACACCAAGGATGGATTTTGG  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1451  GCTGGATGATTTATGGTTGTATATCTTACTGGGGACTCCACTGTGAGACCACTTACACCAAGGATGGATTTTGG  1524

Query 1555  ACATACATTACTCAGATTGCCACGTGTTCACCTTGGATGTTTTGGATGTTCCTGAACAGTGTTTTCCACTTCAT  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1525  ACATACATTACTCAGATTGCCACGTGTTCACCTTGGATGTTTTGGATGTTCCTGAACAGTGTTTTCCACTTCAT  1598

Query 1629  GTGGGTGGCTGTATTACTCATGTGTCAGATGTACCAGATATCATGTTTAGGTATTACTACAAATGAAAGAATGA  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1599  GTGGGTGGCTGTATTACTCATGTGTCAGATGTACCAGATATCATGTTTAGGTATTACTACAAATGAAAGAATGA  1672

Query 1703  ATGCCAGGAGATACAAGCACTTTAAAGTCACAACAACGTCTATTGAAAGCCCATTCAACCATGGATGTGTAAGA  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1673  ATGCCAGGAGATACAAGCACTTTAAAGTCACAACAACGTCTATTGAAAGCCCATTCAACCATGGATGTGTAAGA  1746

Query 1777  AATATTATAGACTTCTTTGAATTTCGATGCTGTGGCCTCTTTCGTCCTGTTATCGTGGACTGGACCAGGCAGTA  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1747  AATATTATAGACTTCTTTGAATTTCGATGCTGTGGCCTCTTTCGTCCTGTTATCGTGGACTGGACCAGGCAGTA  1820

Query 1851  TACAATAGAATATGACCAAATATCAGGATCTGGGTACCAGCTGGTG  1896
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1821  TACAATAGAATATGACCAAATATCAGGATCTGGGTACCAGCTGGTG  1866