Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02826
• Subject: XM_006500777.3
• Aligned Length: 1513
• Identities: 1207
• Gaps: 140

Alignment

Query    1  ATGG----TCAGAAAGCCTGTTGTGTCCACCATCTCCAAAGGAGGTTACCTGCAGGGAAATGTTAACGGGAGGC  70
            ||||    .|||||||||.||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|.|.||||||||
Sbjct    1  ATGGGCCAGCAGAAAGCCAGTTGTGGCCACCATCTCCAAAGGAGGTTACCTGCAGGGCAATATGAGCGGGAGGC  74

Query   71  TGCCTTCCCTGGGCAACAAGGAGCCACCTGGGCAGGAGAAAGTGCAG--CTGAAGAGGAAAGTCACTTTACTGA  142
            ||||.|||.||||..||.|.||||||||||||||||||||.||  ||  |||||.|.|||..|||||||.||||
Sbjct   75  TGCCCTCCATGGGGGACCAAGAGCCACCTGGGCAGGAGAAGGT--AGTTCTGAAAAAGAAGATCACTTTGCTGA  146

Query  143  GGGGAGTCTCCATTATCATTGGCACCATCATTGGAGCAGGAATCTTCATCTCTCCTAAGGGCGTGCTCCAGAAC  216
            ||||.||||||||.|||||.||||||.||||.|||.||||.|||||||||||.||.||||||.|.|||||||||
Sbjct  147  GGGGGGTCTCCATCATCATCGGCACCGTCATCGGATCAGGCATCTTCATCTCCCCCAAGGGCATACTCCAGAAC  220

Query  217  ACGGGCAGCGTGGGCATGTCTCTGACCATCTGGACGGTGTGTGGGGTCCTGTCACTATTTGGAGCTTTGTCTTA  290
            ||||||||||||||||||||.|||....|||||.|.|..|||||.||.||||||||.|||              
Sbjct  221  ACGGGCAGCGTGGGCATGTCCCTGGTTTTCTGGTCTGCCTGTGGAGTACTGTCACTTTTT--------------  280

Query  291  TGCTGAATTGGGAACAACTATAAAGAAATCTGGAGGTCATTACACATATATTTTGGAAGTCTTTGGTCCATTAC  364
                                                                                      
Sbjct  281  --------------------------------------------------------------------------  280

Query  365  CAGCTTTTGTACGAGTCTGGGTGGAACTCCTCATAATACGCCCTGCAGCTACTGCTGTGATATCCCTGGCATTT  438
                                                   ||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  281  ---------------------------------------GCCCTGGAGCTACTGCTGTGATATCCCTGGCATTT  315

Query  439  GGACGCTACATTCTGGAACCATTTTTTATTCAATGTGAAATCCCTGAACTTGCGATCAAGCTCATTACAGCTGT  512
            |||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||.|.||||||||
Sbjct  316  GGACGCTACATCCTGGAACCATTTTTTATTCAATGTGAAATTCCTGAACTTGCAATCAAGCTCGTGACAGCTGT  389

Query  513  GGGCATAACTGTAGTGATGGTCCTAAATAGCATGAGTGTCAGCTGGAGCGCCCGGATCCAGATTTTCTTAACCT  586
            ||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||||||||||||.||||||
Sbjct  390  GGGCATCACTGTGGTGATGGTCCTAAATAGCACGAGTGTCAGCTGGAGTGCCCGGATCCAGATTTTCCTAACCT  463

Query  587  TTTGCAAGCTCACAGCAATTCTGATAATTATAGTCCCTGGAGTTATGCAGCTAATTAAAGGTCAAACGCAGAAC  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.||..||
Sbjct  464  TTTGCAAGCTCACAGCAATTCTGATAATTATAGTCCCTGGAGTTATACAGCTAATTAAAGGGCAAACACATCAC  537

Query  661  TTTAAAGACGCCTTTTCAGGAAGAGATTCAAGTATTACGCGGTTGCCACTGGCTTTTTATTATGGAATGTATGC  734
            ||||||||.||.||||||||||||||..|||||.|.|.|.|||||||..||||||||||||||||.||||||||
Sbjct  538  TTTAAAGATGCATTTTCAGGAAGAGACACAAGTCTAATGGGGTTGCCCTTGGCTTTTTATTATGGGATGTATGC  611

Query  735  ATATGCTGGCTGGTTTTACCTCAACTTTGTTACTGAAGAAGTAGAAAACCCTGAAAAAACCATTCCCCTTGCAA  808
            ||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  612  ATATGCTGGCTGGTTTTACCTCAACTTTATTACTGAAGAAGTAGACAACCCTGAAAAAACCATCCCCCTTGCAA  685

Query  809  TATGTATATCCATGGCCATTGTCACCATTGGCTATGTGCTGACAAATGTGGCCTACTTTACGACCATTAATGCT  882
            |.||.||.||||||||.||..||||..|.|||||.||.||||||||.||||||||.|||||.|||||.|.|||.
Sbjct  686  TCTGCATCTCCATGGCTATCATCACAGTGGGCTACGTACTGACAAACGTGGCCTATTTTACCACCATCAGTGCG  759

Query  883  GAGGAGCTGCTGCTTTCAAATGCAGTGGCAGTGACCTTTTCTGAGCGGCTACTGGGAAATTTCTCATTAGCAGT  956
            |||||||||||||..||.|..||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||
Sbjct  760  GAGGAGCTGCTGCAGTCCAGCGCCGTGGCGGTGACCTTCTCTGAGCGGCTGCTGGGAAAATTCTCATTAGCAGT  833

Query  957  TCCGATCTTTGTTGCCCTCTCCTGCTTTGGCTCCATGAACGGTGGTGTGTTTGCTGTCTCCAGGTTATTCTATG  1030
            .||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|
Sbjct  834  CCCGATCTTTGTTGCCCTCTCCTGCTTCGGCTCCATGAACGGTGGTGTGTTCGCTGTCTCCAGGTTATTCTACG  907

Query 1031  TTGCGTCTCGAGAGGGTCACCTTCCAGAAATCCTCTCCATGATTCATGTCCGCAAGCACACTCCTCTACCAGCT  1104
            |.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||||||||||||.||||||
Sbjct  908  TCGCATCTCGAGAAGGGCACCTTCCGGAAATCCTCTCTATGATTCATGTCCACAAGCACACTCCTCTGCCAGCT  981

Query 1105  GTTATTGTTTTGCACCCTTTGACAATGATAATGCTCTTCTCTGGAGACCTCGACAGTCTTTTGAATTTCCTCAG  1178
            ||||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||||||||.|||||||||.|.||||||.|.|||||||||||
Sbjct  982  GTTATTGTTTTGCATCCTCTGACGATGGTGATGCTCTTCTCCGGAGACCTCTATAGTCTTCTAAATTTCCTCAG  1055

Query 1179  TTTTGCCAGGTGGCTTTTTATTGGGCTGGCAGTTGCTGGGCTGATTTATCTTCGATACAAATGCCCAGATATGC  1252
            |||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||||||.||||||||||||
Sbjct 1056  TTTTGCCAGGTGGCTTTTTATGGGGCTGGCAGTCGCAGGACTGATTTATCTTCGATACAAACGCCCAGATATGC  1129

Query 1253  ATCGTCCTTTCAAGGTGCCACTGTTCATCCCAGCTTTGTTTTCCTTCACATGCCTCTTCATGGTTGCCCTTTCC  1326
            |||||||||||||||||||.||.||||||||.||..|.|||||||||||.||||||||||||||||.|||.||.
Sbjct 1130  ATCGTCCTTTCAAGGTGCCTCTCTTCATCCCGGCACTATTTTCCTTCACCTGCCTCTTCATGGTTGTCCTCTCT  1203

Query 1327  CTCTATTCGGACCCATTTAGTACAGGGATTGGCTTCGTCATCACTCTGACTGGAGTCCCTGCGTATTATCTCTT  1400
            ||.||.|||||||||||.||.||.|||.|.||.||..|.|||||..|||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 1204  CTTTACTCGGACCCATTCAGCACCGGGGTCGGTTTTCTTATCACCTTGACTGGGGTCCCTGCATATTATCTCTT  1277

Query 1401  TATTATATGGGACAAGAAACCCAGGTGGTTTAGAATAATGTCAGAGAAAATAACCAGAACATTACAAATAATAC  1474
            .|||.||||||||||||||||||.||||||.|||..|.|.|||||.|.||||||||||||||||||.||.||||
Sbjct 1278  CATTGTATGGGACAAGAAACCCAAGTGGTTCAGACGATTATCAGACAGAATAACCAGAACATTACAGATTATAC  1351

Query 1475  TGGAAGTTGTACCAGAAGA----AGATAAGTTA  1503
            |.|||||||||||||||||    |.|.|| |||
Sbjct 1352  TAGAAGTTGTACCAGAAGACTCTAAAGAA-TTA  1383