Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02826
• Subject: XM_006500778.3
• Aligned Length: 1530
• Identities: 1187
• Gaps: 180

Alignment

Query    1  ATGGTCAGAAAGCCTGTTGTGTCCACCATCTCCAAAGGAGGTTACCTGCAGGGAAATGTTAACGGGAGGCTGCC  74
                            .||||..|| ||| ||||           ||     ||||         ||||     
Sbjct    1  ----------------ATGTGCTCA-CAT-TCCA-----------CT-----GAAA---------GAGG-----  26

Query   75  TTCCCTGGG----CAACAAGGA----GCCACCTGGGCAGGAGAAAGTGCAGCTGA--AGAG---GAAAGTCACT  135
             .|||||.|    .||.|||.|    ||          |.||||||       ||  ||||   |||||||.| 
Sbjct   27  -ACCCTGTGATCTAAATAAGAATGATGC----------GAAGAAAG-------GATCAGAGTACGAAAGTCGC-  81

Query  136  TTACTGAGGGGAGTCTCCATTATCATTGGCACCATCATTGGAGCAGGAATCTTCATCTCTCCT---------AA  200
               |.|      |||||                     ||||||     ||     ||.||||         ||
Sbjct   82  ---CAG------GTCTC---------------------TGGAGC-----TC-----CTTTCCTGTCAAAACAAA  115

Query  201  GGGCGTGCTCCAGAACACGGGCAGCGTGGGCATGTCTCTGAC-CATCTGGACGGTGTGTGGGGTCCTGTCACTA  273
              ||.| |||.|||.|||                   |..|| ||.|||||.|                     
Sbjct  116  --GCAT-CTCAAGAGCAC-------------------CCCACACACCTGGAGG---------------------  146

Query  274  TTTGGAGCTTTGTCTTATGCTGAATTGGGAACAACTATAAAGAAATCTGGAGGTCATTACACATATATTTTGGA  347
              .|||||..||||.|||||.|||||.||.||||..||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||
Sbjct  147  --AGGAGCCCTGTCCTATGCAGAATTAGGTACAAGCATAAAGAAATCTGGTGGTCATTACACATACATTCTGGA  218

Query  348  AGTCTTTGGTCCATTACCAGCTTTTGTACGAGTCTGGGTGGAACTCCTCATAATACGCCCTGCAGCTACTGCTG  421
            .|||||||||||.||.|..||||||||.|||||||||||||||||.|||.||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  219  GGTCTTTGGTCCTTTGCTGGCTTTTGTTCGAGTCTGGGTGGAACTGCTCGTAATACGCCCTGGAGCTACTGCTG  292

Query  422  TGATATCCCTGGCATTTGGACGCTACATTCTGGAACCATTTTTTATTCAATGTGAAATCCCTGAACTTGCGATC  495
            ||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct  293  TGATATCCCTGGCATTTGGACGCTACATCCTGGAACCATTTTTTATTCAATGTGAAATTCCTGAACTTGCAATC  366

Query  496  AAGCTCATTACAGCTGTGGGCATAACTGTAGTGATGGTCCTAAATAGCATGAGTGTCAGCTGGAGCGCCCGGAT  569
            ||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||||
Sbjct  367  AAGCTCGTGACAGCTGTGGGCATCACTGTGGTGATGGTCCTAAATAGCACGAGTGTCAGCTGGAGTGCCCGGAT  440

Query  570  CCAGATTTTCTTAACCTTTTGCAAGCTCACAGCAATTCTGATAATTATAGTCCCTGGAGTTATGCAGCTAATTA  643
            ||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct  441  CCAGATTTTCCTAACCTTTTGCAAGCTCACAGCAATTCTGATAATTATAGTCCCTGGAGTTATACAGCTAATTA  514

Query  644  AAGGTCAAACGCAGAACTTTAAAGACGCCTTTTCAGGAAGAGATTCAAGTATTACGCGGTTGCCACTGGCTTTT  717
            ||||.|||||.||..||||||||||.||.||||||||||||||..|||||.|.|.|.|||||||..||||||||
Sbjct  515  AAGGGCAAACACATCACTTTAAAGATGCATTTTCAGGAAGAGACACAAGTCTAATGGGGTTGCCCTTGGCTTTT  588

Query  718  TATTATGGAATGTATGCATATGCTGGCTGGTTTTACCTCAACTTTGTTACTGAAGAAGTAGAAAACCCTGAAAA  791
            ||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.|||||||||||
Sbjct  589  TATTATGGGATGTATGCATATGCTGGCTGGTTTTACCTCAACTTTATTACTGAAGAAGTAGACAACCCTGAAAA  662

Query  792  AACCATTCCCCTTGCAATATGTATATCCATGGCCATTGTCACCATTGGCTATGTGCTGACAAATGTGGCCTACT  865
            ||||||.|||||||||||.||.||.||||||||.||..||||..|.|||||.||.||||||||.||||||||.|
Sbjct  663  AACCATCCCCCTTGCAATCTGCATCTCCATGGCTATCATCACAGTGGGCTACGTACTGACAAACGTGGCCTATT  736

Query  866  TTACGACCATTAATGCTGAGGAGCTGCTGCTTTCAAATGCAGTGGCAGTGACCTTTTCTGAGCGGCTACTGGGA  939
            ||||.|||||.|.|||.|||||||||||||..||.|..||.|||||.||||||||.|||||||||||.||||||
Sbjct  737  TTACCACCATCAGTGCGGAGGAGCTGCTGCAGTCCAGCGCCGTGGCGGTGACCTTCTCTGAGCGGCTGCTGGGA  810

Query  940  AATTTCTCATTAGCAGTTCCGATCTTTGTTGCCCTCTCCTGCTTTGGCTCCATGAACGGTGGTGTGTTTGCTGT  1013
            ||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  811  AAATTCTCATTAGCAGTCCCGATCTTTGTTGCCCTCTCCTGCTTCGGCTCCATGAACGGTGGTGTGTTCGCTGT  884

Query 1014  CTCCAGGTTATTCTATGTTGCGTCTCGAGAGGGTCACCTTCCAGAAATCCTCTCCATGATTCATGTCCGCAAGC  1087
            |||||||||||||||.||.||.||||||||.||.||||||||.|||||||||||.|||||||||||||.|||||
Sbjct  885  CTCCAGGTTATTCTACGTCGCATCTCGAGAAGGGCACCTTCCGGAAATCCTCTCTATGATTCATGTCCACAAGC  958

Query 1088  ACACTCCTCTACCAGCTGTTATTGTTTTGCACCCTTTGACAATGATAATGCTCTTCTCTGGAGACCTCGACAGT  1161
            ||||||||||.||||||||||||||||||||.|||.||||.|||.|.|||||||||||.|||||||||.|.|||
Sbjct  959  ACACTCCTCTGCCAGCTGTTATTGTTTTGCATCCTCTGACGATGGTGATGCTCTTCTCCGGAGACCTCTATAGT  1032

Query 1162  CTTTTGAATTTCCTCAGTTTTGCCAGGTGGCTTTTTATTGGGCTGGCAGTTGCTGGGCTGATTTATCTTCGATA  1235
            |||.|.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||
Sbjct 1033  CTTCTAAATTTCCTCAGTTTTGCCAGGTGGCTTTTTATGGGGCTGGCAGTCGCAGGACTGATTTATCTTCGATA  1106

Query 1236  CAAATGCCCAGATATGCATCGTCCTTTCAAGGTGCCACTGTTCATCCCAGCTTTGTTTTCCTTCACATGCCTCT  1309
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.||..|.|||||||||||.|||||||
Sbjct 1107  CAAACGCCCAGATATGCATCGTCCTTTCAAGGTGCCTCTCTTCATCCCGGCACTATTTTCCTTCACCTGCCTCT  1180

Query 1310  TCATGGTTGCCCTTTCCCTCTATTCGGACCCATTTAGTACAGGGATTGGCTTCGTCATCACTCTGACTGGAGTC  1383
            |||||||||.|||.||.||.||.|||||||||||.||.||.|||.|.||.||..|.|||||..|||||||.|||
Sbjct 1181  TCATGGTTGTCCTCTCTCTTTACTCGGACCCATTCAGCACCGGGGTCGGTTTTCTTATCACCTTGACTGGGGTC  1254

Query 1384  CCTGCGTATTATCTCTTTATTATATGGGACAAGAAACCCAGGTGGTTTAGAATAATGTCAGAGAAAATAACCAG  1457
            |||||.|||||||||||.|||.||||||||||||||||||.||||||.|||..|.|.|||||.|.|||||||||
Sbjct 1255  CCTGCATATTATCTCTTCATTGTATGGGACAAGAAACCCAAGTGGTTCAGACGATTATCAGACAGAATAACCAG  1328

Query 1458  AACATTACAAATAATACTGGAAGTTGTACCAGAAGA----AGATAAGTTA  1503
            |||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||    |.|.|| |||
Sbjct 1329  AACATTACAGATTATACTAGAAGTTGTACCAGAAGACTCTAAAGAA-TTA  1377