Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02826
• Subject: XM_011531802.3
• Aligned Length: 1526
• Identities: 1479
• Gaps: 31

Alignment

Query    1  ATGGTCAGAAAGCCTGTTGTGTCCACCATCTCCAAAGGAGGTTACCTGCAGGGAAATGTTAACGGGAGGCTGCC  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTCAGAAAGCCTGTTGTGTCCACCATCTCCAAAGGAGGTTACCTGCAGGGAAATGTTAACGGGAGGCTGCC  74

Query   75  TTCCCTGGGCAACAAGGAGCCACCTGGGCAGGAGAAAGTGCAGCTGAAGAGGAAAGTCACTTTACTGAGGGGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TTCCCTGGGCAACAAGGAGCCACCTGGGCAGGAGAAAGTGCAGCTGAAGAGGAAAGTCACTTTACTGAGGGGAG  148

Query  149  TCTCCATTATCATTGGCACCATCATTGGAGCAGGAATCTTCATCTCTCCTAAGGGCGTGCTCCAGAACACGGGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  TCTCCATTATCATTGGCACCATCATTGGAGCAGGAATCTTCATCTCTCCTAAGGGCGTGCTCCAGAACACGGGC  222

Query  223  AGCGTGGGCATGTCTCTGACCATCTGGACGGTGTGTGGGGTCCTGTCACTATTTGGAGCTTTGTCTTATGCTGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  AGCGTGGGCATGTCTCTGACCATCTGGACGGTGTGTGGGGTCCTGTCACTATTTGGAGCTTTGTCTTATGCTGA  296

Query  297  ATTGGGAACAACTATAAAGAAATCTGGAGGTCATTACACATATATTTTGGAAGTCTTTGGTCCATTACCAGCTT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  ATTGGGAACAACTATAAAGAAATCTGGAGGTCATTACACATATATTTTGGAAGTCTTTGGTCCATTACCAGCTT  370

Query  371  TTGTACGAGTCTGGGTGGAACTCCTCATAATACGCCCTGCAGCTACTGCTGTGATATCCCTGGCATTTGGACGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  TTGTACGAGTCTGGGTGGAACTCCTCATAATACGCCCTGCAGCTACTGCTGTGATATCCCTGGCATTTGGACGC  444

Query  445  TACATTCTGGAACCATTTTTTATTCAATGTGAAATCCCTGAACTTGCGATCAAGCTCATTACAGCTGTGGGCAT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TACATTCTGGAACCATTTTTTATTCAATGTGAAATCCCTGAACTTGCGATCAAGCTCATTACAGCTGTGGGCAT  518

Query  519  AACTGTAGTGATGGTCCTAAATAGCATGAGTGTCAGCTGGAGCGCCCGGATCCAGATTTTCTTAACCTTTTGCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AACTGTAGTGATGGTCCTAAATAGCATGAGTGTCAGCTGGAGCGCCCGGATCCAGATTTTCTTAACCTTTTGCA  592

Query  593  AGCTCACAGCAATTCTGATAATTATAGTCCCTGGAGTTATGCAGCTAATTAAAGGTCAAACGCAGAACTTTAAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  AGCTCACAGCAATTCTGATAATTATAGTCCCTGGAGTTATGCAGCTAATTAAAGGTCAAACGCAGAACTTTAAA  666

Query  667  GACGCCTTTTCAGGAAGAGATTCAAGTATTACGCGGTTGCCACTGGCTTTTTATTATGGAATGTATGCATATGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GACGCCTTTTCAGGAAGAGATTCAAGTATTACGCGGTTGCCACTGGCTTTTTATTATGGAATGTATGCATATGC  740

Query  741  TGGCTGGTTTTACCTCAACTTTGTTACTGAAGAAGTAGAAAACCCTGAAAAAACCATTCCCCTTGCAATATGTA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TGGCTGGTTTTACCTCAACTTTGTTACTGAAGAAGTAGAAAACCCTGAAAAAACCATTCCCCTTGCAATATGTA  814

Query  815  TATCCATGGCCATTGTCACCATTGGCTATGTGCTGACAAATGTGGCCTACTTTACGACCATTAATGCTGAGGAG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  TATCCATGGCCATTGTCACCATTGGCTATGTGCTGACAAATGTGGCCTACTTTACGACCATTAATGCTGAGGAG  888

Query  889  CTGCTGCTTTCAAATGCAGTGGCAGTGACCTTTTCTGAGCGGCTACTGGGAAATTTCTCATTAGCAGTTCCGAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  CTGCTGCTTTCAAATGCAGTGGCAGTGACCTTTTCTGAGCGGCTACTGGGAAATTTCTCATTAGCAGTTCCGAT  962

Query  963  CTTTGTTGCCCTCTCCTGCTTTGGCTCCATGAACGGTGGTGTGTTTGCTGTCTCCAGGTTATTCTATGTTGCGT  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  CTTTGTTGCCCTCTCCTGCTTTGGCTCCATGAACGGTGGTGTGTTTGCTGTCTCCAGGTTATTCTATGTTGCGT  1036

Query 1037  CTCGAGAGGGTCACCTTCCAGAAATCCTCTCCATGATTCATGTCCGCAAGCACACTCCTCTACCAGCTGTTATT  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  CTCGAGAGGGTCACCTTCCAGAAATCCTCTCCATGATTCATGTCCGCAAGCACACTCCTCTACCAGCTGTTATT  1110

Query 1111  GTTTTGCACCCTTTGACAATGATAATGCTCTTCTCTGGAGACCTCGACAGTCTTTTGAATTTCCTCAGTTTTGC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GTTTTGCACCCTTTGACAATGATAATGCTCTTCTCTGGAGACCTCGACAGTCTTTTGAATTTCCTCAGTTTTGC  1184

Query 1185  CAGGTGGCTTTTTATTGGGCTGGCAGTTGCTGGGCTGATTTATCTTCGATACAAATGCCCAGATATGCATCGTC  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  CAGGTGGCTTTTTATTGGGCTGGCAGTTGCTGGGCTGATTTATCTTCGATACAAATGCCCAGATATGCATCGTC  1258

Query 1259  CTTTCAAGGTGCCACTGTTCATCCCAGCTTTGTTTTCCTTCACATGCCTCTTCATGGTTGCCCTTTCCCTCTAT  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  CTTTCAAGGTGCCACTGTTCATCCCAGCTTTGTTTTCCTTCACATGCCTCTTCATGGTTGCCCTTTCCCTCTAT  1332

Query 1333  TCGGACCCATTTAGTACAGGGATTGGCTTCGTCATCACTCTGACTGGAGTCCCTGCGTATTATCTCTTTATTAT  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  TCGGACCCATTTAGTACAGGGATTGGCTTCGTCATCACTCTGACTGGAGTCCCTGCGTATTATCTCTTTATTAT  1406

Query 1407  ATGGGACAAGAAACCCAGGTGGTTTAGAATAATGTC----AGAGAAAATAAC-----CAGA-ACATT-ACAAA-  1468
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||    |..|||||.|.|     |||| .|||| |||.| 
Sbjct 1407  ATGGGACAAGAAACCCAGGTGGTTTAGAATAATGTCGGTTACTGAAAACACCAAATGCAGACTCATTAACACAC  1480

Query 1469  -------TAATACTGGAAGTTGTACCAGAAGAAGATAAGTTA----  1503
                   |||    .|||...|||||    |..|.|...|||    
Sbjct 1481  CTTTATTTAA----AGAAAGAGTACC----GCGGGTTGATTATCCT  1518