Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02865
- Subject:
- XR_379879.2
- Aligned Length:
- 1711
- Identities:
- 1116
- Gaps:
- 442
Alignment
Query 1 -------------------------------------------------------------------------- 0
Sbjct 1 TTGAGGCCGGGGCGGGGCGTCGGGCTGGCGTCACCAGGACAACGGGCGTCGCCGGCGCCGTGTGACTTCAGGCT 74
Query 1 ------------------ATGGTTTTCTCAAACAATGATGAAGGCCTTATTAACAAAAAGTTACCCAAAGAACT 56
||||||||||||||||.||||||.||||||||.|||||.|||.|||||||.||.||
Sbjct 75 GTGGGCGCGCTCGCGGCCATGGTTTTCTCAAACAGTGATGATGGCCTTATCAACAAGAAGCTACCCAAGGAGCT 148
Query 57 TCTGTTAAGAATATTTTCCTTCTTGGATATAGTAACTTTGTGCCGATGTGCACAGATTTCCAAGGCTTGGAACA 130
.||.||.||||||||.|||||||||||.||.||||||.|.|||||||||||||||||.||||||||.|||||||
Sbjct 149 CCTCTTGAGAATATTCTCCTTCTTGGACATCGTAACTCTATGCCGATGTGCACAGATCTCCAAGGCCTGGAACA 222
Query 131 TCTTAGCCCTGGATGGAAGCAACTGGCAAAGAATAGATCTTTTTAACTTTCAAACAGATGTAGAGGGTCGAGTG 204
||||||||||||||||.||||||||||||.|..|.||||||||||||||.||.||||||||||||||.||||||
Sbjct 223 TCTTAGCCCTGGATGGCAGCAACTGGCAACGGGTGGATCTTTTTAACTTCCAGACAGATGTAGAGGGCCGAGTG 296
Query 205 GTGGAAAATATCTCGAAGCGATGCGGTGGATTCCTGAGGAAGCTCAGCTTGCGAGGCTGCATTGGTGTTGGGGA 278
||||||||.|||||.|||.|.||||||||.|||||.||.|||||||||.||||.||||||||.||.||.|||||
Sbjct 297 GTGGAAAACATCTCCAAGAGGTGCGGTGGCTTCCTTAGAAAGCTCAGCCTGCGTGGCTGCATCGGAGTCGGGGA 370
Query 279 TTCCTCCTTGAAGACCTTTGCACAGAACTGCCGAAACATTGAACATTTGAACCTCAATGGATGCACAAAAATCA 352
.|||||.||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||
Sbjct 371 CTCCTCTTTGAAGACCTTTGCACAGAACTGCCGGAACATTGAACATTTAAACCTCAATGGCTGCACGAAAATCA 444
Query 353 CTGACAGCACGTGTTATAGCCTTAGCAGATTCTGTTCCAAGCTGAAACATCTGGATCTGACCTCCTGTGTGTCT 426
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.|||||.||||||
Sbjct 445 CTGACAGCACGTGTTACAGCCTTAGCAGATTCTGTTCCAAGCTGAAACACCTGGATCTCACGTCCTGCGTGTCT 518
Query 427 ATTACAAACAGCTCCTTGAAGGGGATCAGTGAGGGCTGCCGAAACCTGGAGTACCTGAACCTCTCTTGGTGTGA 500
.||||.||||||||.||.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 519 GTTACCAACAGCTCTTTAAAGGGCATCAGCGAGGGCTGCCGGAACCTGGAATATCTGAACCTCTCCTGGTGTGA 592
Query 501 TCAGATCACGAAGGATGGCATCGAGGCACTGGTGCGAGGTTGTCGAGGCCTGAAAGCCCTGCTCCTGAGGGGCT 574
.||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||.||.||.||.||..||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 593 CCAGATCACAAAGGAAGGCATTGAGGCGCTGGTGCGGGGGTGCCGGGGTTTGAAAGCCCTGCTCCTGAGGGGTT 666
Query 575 GCACACAGTTAGAAGATGAAGCTCTGAAACACATTCAGAATTACTGCCATGAGCTTGTGAGCCTCAACTTGCAG 648
|.|||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||..|||||||.|||||.||||||||||||.|||||
Sbjct 667 GTACACAGTTAGAGGACGAAGCTCTGAAACACATTCAGAACCACTGCCACGAGCTGGTGAGCCTCAACCTGCAG 740
Query 649 TCCTGCTCACGTATCACGGATGAAGGTGTGGTGCAGATATGCAGGGGCTGTCACCGGCTACAGGCTCTCTGCCT 722
|||||||||||.|||||.|||||.||.|||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.|||||
Sbjct 741 TCCTGCTCACGCATCACTGATGATGGCGTGGTGCAGATCTGCAGGGGCTGCCACCGGCTACAGGCTCTGTGCCT 814
Query 723 TTCGGGTTGCAGCAACCTCACAGATGCCTCTCTTACAGCCCTGGGTTTGAACTGTCCGCGACTGCAAATTTTGG 796
.||||||||.||||||||.||.|||||.|||||.||||||.||||..|||||||.||..||||.|||.||||||
Sbjct 815 CTCGGGTTGTAGCAACCTTACGGATGCATCTCTCACAGCCTTGGGCCTGAACTGCCCCAGACTACAAGTTTTGG 888
Query 797 AGGCTGCCCGATGCTCCCATTTGACTGACGCAGGTTTTACACTTTTAGCTCGGAATTGCCACGAATTGGAGAAG 870
||||||||||.|||||||||.||||.||||||||.||||||||..||||||||||||||||.||..||||||||
Sbjct 889 AGGCTGCCCGGTGCTCCCATCTGACCGACGCAGGCTTTACACTGCTAGCTCGGAATTGCCATGAGCTGGAGAAG 962
Query 871 ATGGATCTTGAAGAATGCATCCTGATAACCGACAGCACACTCATCCAGCTCTCCATTCACTGTCCTAAACTGCA 944
|||||.|||||||||||..|||||||.|||||||||||.|||.|||||||||||||.||||||||.||.|||||
Sbjct 963 ATGGACCTTGAAGAATGTGTCCTGATTACCGACAGCACCCTCGTCCAGCTCTCCATCCACTGTCCCAAGCTGCA 1036
Query 945 AGCCCTGAGCCTGTCCCACTGTGAACTCATCACAGATGATGGGATCCTGCACCTGAGCAACAGTACCTGTGGCC 1018
||||||||||.|||||||||||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||.||||||||.|
Sbjct 1037 AGCCCTGAGCTTGTCCCACTGTGAGCTCATCACAGATGAGGGGATCCTGCACCTGAGCAGCAGCACCTGTGGGC 1110
Query 1019 ATGAGAGGCTGCGGGTACTGGAGTTGGACAACTGCCTCCTCATCACTGATGTGGCCCTGGAACACCTAGAGAAC 1092
|.|||||.||.|||||.||||||.|||||||||||||.||..||||.||.|...|.|||||.|||||.||||||
Sbjct 1111 ACGAGAGACTCCGGGTGCTGGAGCTGGACAACTGCCTTCTTGTCACGGACGCCTCGCTGGAGCACCTGGAGAAC 1184
Query 1093 TGCCGAGGCCTGGAGCGCCTCGAGCTGTACGACTGCCAGCAGGTTACCCGTGCAGGCATCAAGCGGATGCGGGC 1166
|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1185 TGCCGAGGCCTGGAGCGACTGGAGCTTTACGACTGCCAGCAGGTCACCCGTGCAGGCATCAAGCGCATGCGGGC 1258
Query 1167 TCAGCTCCCTCATGTCAAAGTCCACGCCTACTTTGCTCCCGTCACCCCACCGACAGCAGTGGCAGGAAGTGGAC 1240
||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||..|||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 TCAGCTTCCTCATGTCAAAGTCCATGCCTACTTTGCTCCAGTCACCCCTCCACCAGCAGTGGCAGGAAGTGGAC 1332
Query 1241 AGCGACTGTGCAGGTGCTGTGTCATTCTC--------------------------------------------- 1269
|.|||||||||||.|||||||||||.|||
Sbjct 1333 ATCGACTGTGCAGATGCTGTGTCATACTCTGACAGCAGCTGCTTAGGCCACGGGCCCCATCCTCCAGGTTAGAC 1406
Query 1270 -------------------------------------------------------------------------- 1269
Sbjct 1407 CAGTCTCCTGGCTGTTCCATCGTCACCCTATCTCGACTCTCCATGGTGAAAACATTACAGGTGTTCTTGCCAAG 1480
Query 1270 -------------------------------------------------------------------------- 1269
Sbjct 1481 AATGGTAGTTTCAAGGGTTCCCCTTTATAATCAGCCTGCTCCCATCTGAGAGAAGAAAGACATCACATCCAACC 1554
Query 1270 -------------------------------------------------------------------------- 1269
Sbjct 1555 TAGCACTGGGGTTTCAAGACTCTGCCAAGCAAATGCCAGTTTTATCTGTTTTGTCCATTTTTTATATTTGTCAA 1628
Query 1270 -------------------------------------------------------------------------- 1269
Sbjct 1629 CTATACATTTAAATTTGCATAATTATTTGAATAAACTTGTCCTAATGAGTTTTTCCTTTTAAAATTACATTTAC 1702
Query 1270 --------- 1269
Sbjct 1703 TTACTTACA 1711