Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02867
• Subject: NM_001253817.1
• Aligned Length: 1221
• Identities: 1112
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGACAGTGAGGGGGGATGTGCTGGCCCCGGATCCAGCGTCGCCCACGACCGCAGCAGCCTCGCCCAGCGTCTC  74
            ||||||||||||||||..|.|||||||||.||.||||||||.|||||.|||.||.||||.||.||.||||||||
Sbjct    1  ATGACAGTGAGGGGGGCCGCGCTGGCCCCAGACCCAGCGTCACCCACAACCACAACAGCTTCACCTAGCGTCTC  74

Query   75  CGTGATCCCCGAGGGCAGCCCCACTGCCATGGAGCAGCCTGTGTTCCTGATGACAACTGCCGCTCAGGCCATCT  148
            .|..|.||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||||
Sbjct   75  TGCCACCCCCGAGGGCAGCCCCACAGCCATGGAGCACCCTGTGTTCCTGATGACCACTGCCGCCCAGGCCATCT  148

Query  149  CTGGCTTCTTCGTGTGGACGGCCCTGCTCATCACATGCCACCAGATCTACATGCACCTGCGCTGCTACAGCTGC  222
            |.||||||||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.|.
Sbjct  149  CCGGCTTCTTTGTGTGGACAGCTCTGCTCATCACTTGCCACCAGATCTACATGCATCTGCGCTGCTACAGCCGT  222

Query  223  CCCAACGAGCAGCGCTACATCGTGCGCATCCTCTTCATCGTGCCCATCTACGCCTTTGACTCCTGGCTCAGCCT  296
            |||||.|||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||
Sbjct  223  CCCAATGAGCAGCGCCACATCGTGCGCATCCTCTTCATCGTGCCCATCTACGCCTTCGACTCCTGGCTCAGCCT  296

Query  297  CCTCTTCTTCACCAACGACCAGTACTACGTGTACTTCGGCACCGTCCGCGACTGCTATGAGGCCTTGGTCATCT  370
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||
Sbjct  297  CCTCTTCTTCACCAATGACCAGTACTACGTGTACTTCGGCACCGTCCGAGACTGCTATGAGGCCTTTGTCATCT  370

Query  371  ATAATTTCCTGAGCCTGTGCTATGAGTACCTAGGAGGAGAAAGTTCCATCATGTCGGAGATCAGAGGAAAACCC  444
            ||||.|||||||||.||||||||||||||||.||.|||||.|||.||||||||||.|||||||||||.||..||
Sbjct  371  ATAACTTCCTGAGCTTGTGCTATGAGTACCTCGGGGGAGAGAGTGCCATCATGTCTGAGATCAGAGGGAAGGCC  444

Query  445  ATTGAGTCCAGCTGTATGTATGGCACCTGCTGCCTCTGGGGAAAGACTTATTCCATCGGATTTCTGAGGTTCTG  518
            ||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.||.|||||||||||.|||.|||||||
Sbjct  445  ATTGAGTCCAGCTGTATGTACGGCACGTGCTGCCTCTGGGGAAAGACCTACTCCATCGGATTCCTGCGGTTCTG  518

Query  519  CAAACAGGCCACCCTGCAGTTCTGTGTGGTGAAGCCACTCATGGCGGTCAGCACTGTGGTCCTCCAGGCCTTCG  592
            .||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||..|.|||||||||||.|
Sbjct  519  TAAACAGGCCACCCTGCAGTTCTGTGTGGTGAAGCCACTCATGGCCGTCAGCACCGTTATACTCCAGGCCTTTG  592

Query  593  GCAAGTACCGGGATGGGGACTTTGACGTCACCAGTGGCTACCTCTACGTGACCATCATCTACAACATCTCCGTC  666
            |||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GCAAGTACCGGGACGGAGACTTTGATGTCACCAGTGGGTACCTCTACGTGACCATCATCTACAACATCTCCGTC  666

Query  667  AGCCTGGCCCTCTACGCCCTCTTCCTCTTCTACTTCGCCACCCGGGAGCTGCTCAGCCCCTACAGCCCCGTCCT  740
            |||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||..|||||||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  667  AGCCTGGCCCTATATGCGCTCTTCCTCTTCTACTTTGCCACAAGGGAGCTGCTCAGCCCCTACAGCCCTGTCCT  740

Query  741  CAAGTTCTTCATGGTCAAGTCCGTCATCTTTCTTTCCTTCTGGCAAGGCATGCTCCTGGCCATCCTGGAGAAGT  814
            |||||||||||||||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||.|.|||||||
Sbjct  741  CAAGTTCTTCATGGTCAAGTCCGTCATATTCCTCTCCTTCTGGCAAGGCATGCTGCTGGCCATCTTAGAGAAGT  814

Query  815  GTGGGGCCATCCCCAAAATCCACTCGGCCCGCGTGTCGGTGGGCGAGGGCACCGTGGCTGCCGGCTACCAGGAC  888
            |.||||||||||||||.|||.||||.||.||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GCGGGGCCATCCCCAAGATCAACTCAGCGCGAGTGTCAGTGGGTGAGGGCACCGTGGCTGCCGGCTACCAGGAC  888

Query  889  TTCATCATCTGTGTGGAGATGTTCTTTGCAGCCCTGGCCCTGCGGCACGCCTTCACCTACAAGGTCTATGCTGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||.||.|||.|||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||
Sbjct  889  TTCATCATCTGTGTGGAGATGTTCTTCGCGGCCTTGGCCCTGCGGCATGCCTTCACCTACAAGGTCTACGCTGA  962

Query  963  CAAGAGGCTGGACGCACAAGGCCGCTGTGCCCCCATGAAGAGCATCTCCAGCAGCCTCAAGGAGACCATGAACC  1036
            ||||||.||||||||.|||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct  963  CAAGAGACTGGACGCTCAAGGCCGCTGCGCCCCCATGAAGAGCATCTCCAGCAGCCTCAAAGAGACCATGAACC  1036

Query 1037  CGCACGACATCGTGCAGGACGCCATCCACAACTTCTCACCTGCCTACCAGCAGTACACGCAGCAGTCCACCCTG  1110
            |.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1037  CACACGATATTGTGCAGGACGCCATCCACAACTTCTCGCCAGCCTACCAGCAGTACACGCAGCAGTCCACTCTG  1110

Query 1111  GAGCCTGGGCCCACCTGGCGTGGTGGCGCCCACGGCCTCTCCCGCTCCCACAGCCTCAGTGGCGCCCGCGACAA  1184
            |||||.|||||||||||||||||.|||.|.|||.||||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1111  GAGCCCGGGCCCACCTGGCGTGGCGGCACGCACAGCCTTTCCCGCTCCCACAGCCTTAGTGGTGCACGCGACAA  1184

Query 1185  CGAGAAGACTCTCCTGCTCAGCTCTGATGATGAATTC  1221
            .|||||||||||.||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 1185  TGAGAAGACTCTGCTGCTCAGCTCTGATGATGAGTTC  1221