Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02878
• Subject: XM_011533562.2
• Aligned Length: 1222
• Identities: 898
• Gaps: 323

Alignment

Query    1  ATGGCTGCGCCCTGCGCGGAGGACCCCTCGCTGGAAAGGCATTTTAAGGGCCACCGAGATGCAGTTACCTGTGT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCGCCCTGCGCGGAGGACCCCTCGCTGGAAAGGCATTTTAAGGGCCACCGAGATGCAGTTACCTGTGT  74

Query   75  GGACTTCAGTATCAACACAAAGCAGCTGGCCAGTGGCTCCATGGACTCATGCCTCATGGTCTGGCACATGAAGC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGACTTCAGTATCAACACAAAGCAGCTGGCCAGTGGCTCCATGGACTCATGCCTCATGGTCTGGCACATGAAGC  148

Query  149  CGCAGTCACGCGCCTACCGCTTCACTGGCCACAAGGATGCCGTCACCTGTGTGAACTTCTCTCCTTCGGGACAC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  CGCAGTCACGCGCCTACCGCTTCACTGGCCACAAGGATGCCGTCACCTGTGTGAACTTCTCTCCTTCGGGACAC  222

Query  223  CTGCTTGCTTCCGGCTCCCGAGACAAGACTGTCCGCATCTGGGTACCCAATGTCAAAGGTGAGTCCACTGTGTT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCTTGCTTCCGGCTCCCGAGACAAGACTGTCCGCATCTGGGTACCCAATGTCAAAGGTGAGTCCACTGTGTT  296

Query  297  TCGTGCACACACAGCCACAGTGAGGAGTGTCCACTTCTGCAGTGATGGCCAGTCCTTCGTGACAGCCTCTGACG  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCGTGCACACACAGCCACAGTGAGGAGTGTCCACTTCTGCAGTGATGGCCAGTCCTTCGTGACAGCCTCTGACG  370

Query  371  ACAAGACAGTCAAAGTGTGGGCAACTCATCGCCAGAAATTCCTGTTCTCCCTGAGCCAGCATATCAACTGGGTC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACAAGACAGTCAAAGTGTGGGCAACTCATCGCCAGAAATTCCTGTTCTCCCTGAGCCAGCATATCAACTGGGTC  444

Query  445  CGCTGTGCCAAGTTCTCCCCCGACGGGCGGCTCATCGTGTCTGCCAGTGATGACAAGACTGTTAAGCTGTGGGA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  CGCTGTGCCAAGTTCTCCCCCGACGGGCGGCTCATCGTGTCTGCCAGTGATGACAAGACTGTTAAGCTGTGGGA  518

Query  519  CAAGAGCAGCCGGGAATGTGTCCACTCGTATTGTGAGCATGGCGGCTTTGTCACCTATGTGGACTTCCACCCCA  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAAGAGCAGCCGGGAATGTGTCCACTCGTATTGTGAGCATGGCGGCTTTGTCACCTATGTGGACTTCCACCCCA  592

Query  593  GTGGGACGTGCATTGCCGCTGCCGGCATGGACAACACAGTGAAGGTGTGGGACGTGCGGACTCACCGGCTGCTG  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  GTGGGACGTGCATTGCCGCTGCCGGCATGGACAACACAGTGAAGGTGTGGGACGTGCGGACTCACCGGCTGCTG  666

Query  667  CAGCATTATCAGTTGCACAGTGCAGCAGTGAACGGGCTCTCTTTCCACCCGTCGGGAAACTACCTGATCACAGC  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  CAGCATTATCAGTTGCACAGTGCAGCAGTGAACGGGCTCTCTTTCCACCCGTCGGGAAACTACCTGATCACAGC  740

Query  741  CTCCAGTGACTCAACCCTGAAGATCCTGGACCTGATGGAGGGCCGGCTGCTCTACACACTCCACGGGCATCAGG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CTCCAGTGACTCAACCCTGAAGATCCTGGACCTGATGGAGGGCCGGCTGCTCTACACACTCCACGGGCATCAGG  814

Query  815  GACCAGCCACCACTGTTGCCTTTTCAAGAACGGGGGAGTATTTTGCTTCTGGAGGCTCTGATGAACAAGTGATG  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||| 
Sbjct  815  GACCAGCCACCACTGTTGCCTTTTCAAGAACGGGGGAGTATTTTGCTTCTGGAGGCTCTGATGAACAAGTGAT-  887

Query  889  GTTTGGAAGAGTAACTTTGATATTGTTGATCATGGAGAAGT-CACGAAAGTGCCGAGGCCCCCAGCCACACTGG  961
                                                 |.|| |||||           |||             
Sbjct  888  -------------------------------------ATGTGCACGA-----------CCC-------------  900

Query  962  CCAGCTCCATGGGGAATCTGCCAGAAGTGGACTTCCCTGTCCCCCCAGGCAGAGGCAGGAGTGTGGAGTCTGTG  1035
                                                                                      
Sbjct  901  --------------------------------------------------------------------------  900

Query 1036  CAGAGCCAGCCCCAGGAGCCCGTGAGTGTGCCCCAGACACTGACTAGCACGCTGGAGCACATTGTGGGCCAGCT  1109
                                                                                      
Sbjct  901  --------------------------------------------------------------------------  900

Query 1110  GGATGTCCTCACTCAGACAGTCTCCATTCTGGAGCAGCGGTTGACACTGACAGAAGACAAGCTGAAGCAGTGTC  1183
                                                                                      
Sbjct  901  --------------------------------------------------------------------------  900

Query 1184  TGGAGAACCAGCAGCTAATCATGCAGAGAGCAACACCA  1221
                                                  
Sbjct  901  --------------------------------------  900