Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02895
• Subject: NM_001167890.2
• Aligned Length: 1662
• Identities: 1659
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGCCTCTGCCCTGGAGCCTTGCGCTCCCGCTGCTGCTCTCCTGGGTGGCAGGTGGTTTCGGGAACGCGGCCAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGCCTCTGCCCTGGAGCCTTGCGCTCCCGCTGCTGCTCTCCTGGGTGGCAGGTGGTTTCGGGAACGCGGCCAG  74

Query   75  TGCAAGGCATCACGGGTTGTTAGCATCGGCACGTCAGCCTGGGGTCTGTCACTATGGAACTAAACTGGCCTGCT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  TGCAAGGCATCACGGGTTGTTAGCATCGGCACGTCAGCCTGGGGTCTGTCACTATGGAACTAAACTGGCCTGCT  148

Query  149  GCTACGGCTGGAGAAGAAACAGCAAGGGAGTCTGTGAAGCTACATGCGAACCTGGATGTAAGTTTGGTGAGTGC  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GCTACGGCTGGAGAAGAAACAGCAAGGGAGTCTGTGAAGCTACATGCGAACCTGGATGTAAGTTTGGTGAGTGC  222

Query  223  GTGGGACCAAACAAATGCAGATGCTTTCCAGGATACACCGGGAAAACCTGCAGTCAAGATGTGAATGAGTGTGG  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GTGGGACCAAACAAATGCAGATGCTTTCCAGGATACACCGGGAAAACCTGCAGTCAAGATGTGAATGAGTGTGG  296

Query  297  AATGAAACCCCGGCCATGCCAACACAGATGTGTGAATACACACGGAAGCTACAAGTGCTTTTGCCTCAGTGGCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  AATGAAACCCCGGCCATGCCAACACAGATGTGTGAATACACACGGAAGCTACAAGTGCTTTTGCCTCAGTGGCC  370

Query  371  ACATGCTCATGCCAGATGCTACGTGTGTGAACTCTAGGACATGTGCCATGATAAACTGTCAGTACAGCTGTGAA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  ACATGCTCATGCCAGATGCTACGTGTGTGAACTCTAGGACATGTGCCATGATAAACTGTCAGTACAGCTGTGAA  444

Query  445  GACACAGAAGAAGGGCCACAGTGCCTGTGTCCATCCTCAGGACTCCGCCTGGCCCCAAATGGAAGAGACTGTCT  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GACACAGAAGAAGGGCCACAGTGCCTGTGTCCATCCTCAGGACTCCGCCTGGCCCCAAATGGAAGAGACTGTCT  518

Query  519  AGATATTGATGAATGTGCCTCTGGTAAAGTCATCTGTCCCTACAATCGAAGATGTGTGAACACATTTGGAAGCT  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  AGATATTGATGAATGTGCCTCTGGTAAAGTCATCTGTCCCTACAATCGAAGATGTGTGAACACATTTGGAAGCT  592

Query  593  ACTACTGCAAATGTCACATTGGTTTCGAACTGCAATATATCAGTGGACGATATGACTGTATAGATATAAATGAA  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  ACTACTGCAAATGTCACATTGGTTTCGAACTGCAATATATCAGTGGACGATATGACTGTATAGATATAAATGAA  666

Query  667  TGTACTATGGATAGCCATACGTGCAGCCACCATGCCAATTGCTTCAATACCCAAGGGTCCTTCAAGTGTAAATG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  TGTACTATGGATAGCCATACGTGCAGCCACCATGCCAATTGCTTCAATACCCAAGGGTCCTTCAAGTGTAAATG  740

Query  741  CAAGCAGGGATATAAAGGCAATGGACTTCGGTGTTCTGCTATCCCTGAAAATTCTGTGAAGGAAGTCCTCAGAG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  CAAGCAGGGATATAAAGGCAATGGACTTCGGTGTTCTGCTATCCCTGAAAATTCTGTGAAGGAAGTCCTCAGAG  814

Query  815  CACCTGGTACCATCAAAGACAGAATCAAGAAGTTGCTTGCTCACAAAAACAGCATGAAAAAGAAGGCAAAAATT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  CACCTGGTACCATCAAAGACAGAATCAAGAAGTTGCTTGCTCACAAAAACAGCATGAAAAAGAAGGCAAAAATT  888

Query  889  AAAAATGTTACCCCAGAACCCACCAGGACTCCTACCCCTAAGGTGAACTTGCAGCCCTTCAACTATGAAGAGAT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  AAAAATGTTACCCCAGAACCCACCAGGACTCCTACCCCTAAGGTGAACTTGCAGCCCTTCAACTATGAAGAGAT  962

Query  963  AGTTTCCAGAGGCGGGAACTCTCATGGAGGTAAAAAAGGGAATGAAGAGAAAATGAAAGAGGGGCTTGAGGATG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  AGTTTCCAGAGGCGGGAACTCTCATGGAGGTAAAAAAGGGAATGAAGAGAAAATGAAAGAGGGGCTTGAGGATG  1036

Query 1037  AGAAAAGAGAAGAGAAAGCCCTGAAGAATGACATAGAGGAGCGAAGCCTGCGAGGAGATGTGTTTTTCCCTAAG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AGAAAAGAGAAGAGAAAGCCCTGAAGAATGACATAGAGGAGCGAAGCCTGCGAGGAGATGTGTTTTTCCCTAAG  1110

Query 1111  GTGAATGAAGCAGGTGAATTCGGCCTGATTCTGGTCCAAAGGAAAGCGCTAACTTCCAAACTGGAACATAA---  1181
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   
Sbjct 1111  GTGAATGAAGCAGGTGAATTCGGCCTGATTCTGGTCCAAAGGAAAGCGCTAACTTCCAAACTGGAACATAAAGC  1184

Query 1182  AGATTTAAATATCTCGGTTGACTGCAGCTTCAATCATGGGATCTGTGACTGGAAACAGGATAGAGAAGATGATT  1255
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  AGATTTAAATATCTCGGTTGACTGCAGCTTCAATCATGGGATCTGTGACTGGAAACAGGATAGAGAAGATGATT  1258

Query 1256  TTGACTGGAATCCTGCTGATCGAGATAATGCTATTGGCTTCTATATGGCAGTTCCGGCCTTGGCAGGTCACAAG  1329
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  TTGACTGGAATCCTGCTGATCGAGATAATGCTATTGGCTTCTATATGGCAGTTCCGGCCTTGGCAGGTCACAAG  1332

Query 1330  AAAGACATTGGCCGATTGAAACTTCTCCTACCTGACCTGCAACCCCAAAGCAACTTCTGTTTGCTCTTTGATTA  1403
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  AAAGACATTGGCCGATTGAAACTTCTCCTACCTGACCTGCAACCCCAAAGCAACTTCTGTTTGCTCTTTGATTA  1406

Query 1404  CCGGCTGGCCGGAGACAAAGTCGGGAAACTTCGAGTGTTTGTGAAAAACAGTAACAATGCCCTGGCATGGGAGA  1477
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  CCGGCTGGCCGGAGACAAAGTCGGGAAACTTCGAGTGTTTGTGAAAAACAGTAACAATGCCCTGGCATGGGAGA  1480

Query 1478  AGACCACGAGTGAGGATGAAAAGTGGAAGACAGGGAAAATTCAGTTGTATCAAGGAACTGATGCTACCAAAAGC  1551
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  AGACCACGAGTGAGGATGAAAAGTGGAAGACAGGGAAAATTCAGTTGTATCAAGGAACTGATGCTACCAAAAGC  1554

Query 1552  ATCATTTTTGAAGCAGAACGTGGCAAGGGCAAAACCGGCGAAATCGCAGTGGATGGCGTCTTGCTTGTTTCAGG  1625
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  ATCATTTTTGAAGCAGAACGTGGCAAGGGCAAAACCGGCGAAATCGCAGTGGATGGCGTCTTGCTTGTTTCAGG  1628

Query 1626  CTTATGTCCAGATAGCCTTTTATCTGTGGATGAC  1659
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  CTTATGTCCAGATAGCCTTTTATCTGTGGATGAC  1662