Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02902
• Subject: NM_001177654.1
• Aligned Length: 1598
• Identities: 1352
• Gaps: 100

Alignment

Query    1  ATGGGCGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTGGCGGCCAAAGTGCGAGC  74
            |||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||..||||
Sbjct    1  ATGGGTGCCGCCGCCTCCAGGAGGAGGGCGCTGAGGAGCGAGGCCATGTCCTCGGTAGCGGCCAAAGTAAGAGC  74

Query   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGCGCAGATCACCTGCTGGCTG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||
Sbjct   75  AGCCCGAGCGTTTGGAGAGTACCTGTCCCAGAGTCACCCTGAGAACCGCAACGGTGCAGACCACCTGCTGGCTG  148

Query  149  ATGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCCGAGATGCAGCCGGCCCCCCAGAACAAGCGCCGCCTGTCCCTCGTC  222
            |.||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  149  ACGCCTACTCTGGCCACGACGGGTCCCCAGAGATGCAACCTGCACCCCAGAACAAGCGCCGCCTCTCCCTCGTC  222

Query  223  TCCAACGGCTGCTACGAGGGCAGCCTCTCAGAGGAGCC---CAGCATTAGGAAGCCCGCAGGC----GAGGGCC  289
            |||||.|||.|.||.|||||||||.|||||||.|||.|   ||||   .|||||||    |||    |||||||
Sbjct  223  TCCAATGGCCGATATGAGGGCAGCATCTCAGATGAGGCAGTCAGC---GGGAAGCC----GGCTATAGAGGGCC  289

Query  290  CTCAGCCTCGAGTGTACACCATCTCTGGGGAGCCTGCCCTGCTGCCCAGCCCTGAGGCGGAGGCCATTGAGCTG  363
            |.|||||.|..|||||||||||||||.|.|||||.||||||||.||..||.||||.||.||.|||||||||||.
Sbjct  290  CCCAGCCCCACGTGTACACCATCTCTAGAGAGCCCGCCCTGCTACCTGGCTCTGAAGCTGAAGCCATTGAGCTA  363

Query  364  GCGGTGGTGAAGGGG------CGGCGGCAGCGGCACCCTCACCATCACAGCCAGCCCCTGCGCGCCAGCCCTGG  431
            ||.|||||.||.|||      |.||||.|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||
Sbjct  364  GCAGTGGTAAAAGGGAGGAGACAGCGGGAACGGCACCCTCACCACCACAGCCAGCCCCTGCGTGCCAGCCCAGG  437

Query  432  TGGCAGCCGGGAGGACGTCAGCAGGCCCTGCCAGAGCTGGGCGGGCAGCCGCCAGGGCTCCAAGGAGTGCCCCG  505
            ..||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||||.|
Sbjct  438  CAGCAGCCGGGAGGACATCAGCAGGCCCTGCCAAAGCTGGGCAGGAAGCCGCCAGGGCTCCAAAGAGTGCCCAG  511

Query  506  GATGTGCCCAGCTGGCTCCTGGCCCCACCCCTCGGGCCTTTGGGCTGGACCAGCCACCTCTGCCTGAGACCTCC  579
            |||||||||||||||..|||||.|||.|..|||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||| .||||
Sbjct  512  GATGTGCCCAGCTGGTCCCTGGTCCCTCTTCTCGGGCCTTTGGGCTGGAGCAGCCACCTCTACCTGAG-GCTCC  584

Query  580  -GGTCGCCGCAAGAAGCTGGAGAGGATGTACAGCGTTGACCGTGTGTCTGACGACATCCCTATTCGTACCTGGT  652
             ||.||||.||||||||||||.||||||||.||||||||..|.||||||||.||..||||.||.||||||||||
Sbjct  585  TGGCCGCCACAAGAAGCTGGAAAGGATGTATAGCGTTGATGGAGTGTCTGATGATGTCCCCATCCGTACCTGGT  658

Query  653  TCCCCAAGGAAAATCTTTTCAGCTTCCAGACAGCAACCACAACTATGCAAGC----------------------  704
            |||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||                      
Sbjct  659  TCCCCAAGGAAAACCTTTTCAGCTTCCAGACGGCAACCACAACTATGCAAGCGGTATTCAGGGGCTACGCGGAG  732

Query  705  -----------------------------------------------GAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGT  731
                                                           |||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  733  AGGAAGCGTCGGAAACGGGAGAATGATTCCGCGTCTGTAATCCAGAGGAACTTCCGCAAACACCTGCGCATGGT  806

Query  732  CGGCAGCCGGAGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGGCGCGAGCGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAGCGACC  805
            .|||||.|||.||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  807  TGGCAGTCGGCGGGTGAAGGCCCAGACGTTCGCTGAGCGTCGCGAACGGAGCTTCAGCCGGTCCTGGAGCGACC  880

Query  806  CCACCCCCATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTGCAGAGCTCCCACTGCACGCTG  879
            |||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||
Sbjct  881  CCACCCCTATGAAAGCCGACACTTCCCACGACTCCCGAGACAGCAGTGACCTACAGAGCTCACACTGCACCCTG  954

Query  880  GACGAGGCCTTCGAGGACCTGGACTGGGACACTGAGAAGGGCCTGGAGGCTGTGGCCTGCGACACCGAAGGCTT  953
            ||.|||||.|..||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||..||||||||.|||||||.|||||
Sbjct  955  GATGAGGCTTGTGAGGACCTGGACTGGGACACAGAGAAAGGTCTGGAGGCCATGGCCTGCAACACCGAGGGCTT  1028

Query  954  CGTGCCACCAAAGGTCATGCTCATTTCCTCCAAGGTGCCCAAGGCTGAGTACATCCCCACTATCATCCGCCGGG  1027
            |.|||||||.||||||||||||||.||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||.|.|
Sbjct 1029  CTTGCCACCCAAGGTCATGCTCATCTCCTCCAAGGTGCCAAAGGCCGAGTATATCCCTACTATCATCCGCAGAG  1102

Query 1028  ATGACCCCTCCATCATCCCCATCCTCTACGACCATGAGCACGCAACCTTCGAGGACATCCTTGAGGAGATAGAG  1101
            |||||||.||||||||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||.||||||
Sbjct 1103  ATGACCCGTCCATCATTCCCATCCTCTACGACCACGAGCATGCAACCTTCGAGGACATCCTGGAGGAAATAGAG  1176

Query 1102  AGGAAGCTGAACGTCTACCACAAGGGAGCCAAGATCTGGAAAATGCTGATTTTCTGCCAGGGAGGTCCTGGACA  1175
            |.|||..|||||.||||.||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||
Sbjct 1177  AAGAAATTGAACATCTATCACAAGGGGGCCAAGATCTGGAAGATGCTGATTTTCTGCCAGGGCGGCCCTGGACA  1250

Query 1176  CCTCTATCTCCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATTCACTTCTGGA  1249
            |||.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 1251  CCTTTATTTGCTCAAGAACAAGGTGGCCACCTTTGCCAAAGTGGAGAAGGAAGAGGACATGATCCACTTCTGGA  1324

Query 1250  AGCGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAAGTGAACCCAGAGCCGAACGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTG  1323
            ||.||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1325  AGAGGCTGAGCCGCCTGATGAGCAAGGTGAACCCCGAGCCGAATGTCATCCACATCATGGGCTGCTACATTCTG  1398

Query 1324  GGGAACCCCAATGGAGAGAAGCTGTTCCAGAACCTCAGGACCCTCATGACTCCTTATAGGGTCACCTTCGAGTC  1397
            ||||||||.||.||.||||         ||||||||||||||||||||||.|||||.|.|||.|||||.|||||
Sbjct 1399  GGGAACCCTAACGGGGAGA---------AGAACCTCAGGACCCTCATGACCCCTTACAAGGTTACCTTTGAGTC  1463

Query 1398  ACCCCTGGAGCTCTCAGCCCAAGGGAAGCAGATGATCGAGACGTACTTTGACTTCCGGTTGTATCGCCTGTGGA  1471
            .||.||.|||||.||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||.||||.||||||||||
Sbjct 1464  GCCTCTCGAGCTGTCTGCCCAAGGGAAGCAGATGATTGAGACCTACTTTGACTTCCGGCTGTACCGCCTGTGGA  1537

Query 1472  AGAGCCGCCAGCACTCGAAGCTGCTGGACTTTGACGACGTCCTG  1515
            ||||||||||||||||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1538  AGAGCCGCCAGCACTCAAAGCTGCTGGACTTTGATGACGTCCTG  1581