Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02936
• Subject: NM_172988.4
• Aligned Length: 1863
• Identities: 1648
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGTCACCGGTCTTTCCCATGTTAACAGTTCTGACCATGTTTTATTATATATGCCTTCGGCGCCGAGCCAGGAC  74
            ||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct    1  ATGTCACCAGTCTTTCCCATGTTAACAGTTCTGACCATGTTTTATTATATGTGCCTTCGGCGTCGAGCCAGGAC  74

Query   75  AGCTACAAGAGGAGAAATGATGAACACCCATAGAGCTATAGAATCAAACAGCCAGACTTCCCCTCTCAATGCAG  148
            |||||||||||||||.||||||||||.||||||..||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCTACAAGAGGAGATATGATGAACAGCCATAGGACTATAGTGTCAAACAGCCGGACTTCCCCTCTCAATGCAG  148

Query  149  AGGTAGTCCAGTATGCCAAAGAAGTAGTGGATTTCAGTTCCCATTATGGAAGTGAGAATAGTATGTCCTATACT  222
            ||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct  149  AGGTGGTCCAGTATGCTAAAGAAGTGGTGGATTTCAGTTCCCATTACGGCAGTGAGAACAGTATGTCCTATACC  222

Query  223  ATGTGGAATTTGGCTGGTGTACCAAATGTATTCCCAAGTTCTGGTGACTTTACTCAGACAGCTGTGTTTCGAAC  296
            ||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct  223  ATGTGGAATTTGGCAGGTGTACCAAATGTCTTCCCAAGTTCTGGTGACTTCACGCAGACGGCTGTGTTTCGAAC  296

Query  297  TTATGGGACATGGTGGGATCAGTGTCCTAGTGCTTCCTTGCCATTCAAGAGGACGCCACCTAATTTTCAGAGCC  370
            |||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||..|.|.|||.|||||||
Sbjct  297  TTATGGGACGTGGTGGGATCAGTGTCCTAGTGCTTCCTTGCCATTCAGAAGGACACCGTCCAGTTTCCAGAGCC  370

Query  371  AGGACTATGTGGAACTTACTTTTGAACAACAGGTGTATCCTACAGCTGTACATGTTCTAGAAACCTATCATCCC  444
            ||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.||.|||||.
Sbjct  371  AGGACTATGTGGAACTGACTTTTGAGCAGCAAGTGTACCCCACGGCTGTCCATGTGCTGGAGACTTACCATCCT  444

Query  445  GGAGCAGTCATTAGAATTCTCGCTTGTTCTGCAAATCCTTATTCCCCAAATCCACCAGCTGAAGTAAGATGGGA  518
            |||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GGAGCAGTCATCAGAATTCTGGCCTGCTCAGCAAATCCCTACTCCCCAAATCCTCCAGCTGAAGTAAGATGGGA  518

Query  519  GATTCTTTGGTCAGAGAGACCTACGAAGGTGAATGCTTCCCAAGCTCGCCAGTTTAAACCTTGTATTAAGCAGA  592
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  GATTCTTTGGTCAGAGAGACCTATGAAGGTGAATGCTTCCCAGGCTCGTCAGTTTAAACCTTGTATTAAGCAAA  592

Query  593  TAAATTTCCCCACAAATCTTATACGACTGGAAGTAAATAGTTCTCTTCTGGAATATTACACTGAATTAGATGCA  666
            ||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||
Sbjct  593  TAAATTTCCCTACAAACCTCATACGACTGGAAGTCAATAGTTCTCTTCTGGATTATTACACCGAACTAGATGCA  666

Query  667  GTTGTGCTACATGGTGTGAAGGACAAGCCAGTGCTTTCTCTCAAGACTTCACTTATTGACATGAATGATATAGA  740
            ||||||||.||||||..|||||||||||||.||||.||||||||||||.|.|||.|.||||||||||||.||||
Sbjct  667  GTTGTGCTGCATGGTACGAAGGACAAGCCACTGCTCTCTCTCAAGACTGCTCTTGTAGACATGAATGATCTAGA  740

Query  741  AGATGATGCCTATGCAGAAAAGGATGGTTGTGGAATGGACAGTCTTAACAAAAAGTTTAGCAGTGCTGTCCTCG  814
            ||||||.|.|||||.|||.||||||||.||||..|||||...||||||||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct  741  AGATGACGACTATGAAGAGAAGGATGGCTGTGAGATGGATGCTCTTAACAAAAAGTTTAGCAGTGCTGCCCTTG  814

Query  815  GGGAAGGGCCAAATAATGGGTATTTTGATAAACTACCTTATGAGCTTATTCAGCTGATTCTGAATCATCTTACA  888
            ||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||
Sbjct  815  GGGATGGGCCACATAATGGGTATTTTGACAAACTACCATATGAGCTCATTCAACTGATTCTGAATCATCTTTCA  888

Query  889  CTACCAGACCTGTGTAGATTAGCACAGACTTGCAAACTACTGAGCCAGCATTGCTGTGATCCTCTGCAATACAT  962
            |||||||||||||||||||||||.||||||||||..||.||...|||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct  889  CTACCAGACCTGTGTAGATTAGCCCAGACTTGCAGGCTTCTCCACCAGCATTGCTGTGATCCTCTGCAATATAT  962

Query  963  CCACCTCAATCTGCAACCATACTGGGCAAAACTAGATGACACTTCTCTGGAATTTCTACAGTCTCGCTGCACTC  1036
            |||||||||.|||||.|||||||||||....||.||.|||||.||.|||||.||.||||||.|||||||....|
Sbjct  963  CCACCTCAACCTGCAGCCATACTGGGCCCGGCTGGACGACACGTCACTGGAGTTCCTACAGGCTCGCTGTGTGC  1036

Query 1037  TTGTCCAGTGGCTTAATTTATCTTGGACTGGCAATAGAGGCTTCATCTCTGTTGCAGGATTTAGCAGGTTTCTG  1110
            |||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||.
Sbjct 1037  TTGTCCAGTGGCTTAATCTGTCTTGGACTGGCAACAGAGGGTTCATCTCTGTATCAGGATTTAGCAGGTTTCTA  1110

Query 1111  AAGGTTTGTGGATCCGAATTAGTACGCCTTGAATTGTCTTGCAGCCACTTTCTTAATGAAACTTGCTTAGAAGT  1184
            |||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 1111  AAGGTGTGTGGGTCTGAGTTAGTACGCCTTGAGTTATCCTGCAGCCACTTTCTTAATGACACTTGCTTGGAGGT  1184

Query 1185  TATTTCTGAGATGTGTCCAAATCTACAGGCCTTAAATCTCTCCTCCTGTGATAAGCTACCACCTCAAGCTTTCA  1258
            |||||||||.|||||.|||||||||||.|.||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||..
Sbjct 1185  TATTTCTGAAATGTGCCCAAATCTACAAGACTTAAATCTCTCATCCTGCGATAAACTCCCACCTCAGGCTTTTG  1258

Query 1259  ACCACATTGCCAAGTTATGCAGCCTTAAACGACTTGTTCTCTATCGAACAAAAGTAGAGCAAACAGCACTGCTC  1332
            .|||.||||||||||||||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1259  GCCATATTGCCAAGTTATGCAGCCTCAAGAGGCTTGTTCTCTATCGGACAAAAGTAGAGCAAACAGCACTACTG  1332

Query 1333  AGCATTTTGAACTTCTGTTCAGAGCTTCAGCACCTCAGTTTAGGCAGTTGTGTCATGATTGAAGACTATGATGT  1406
            ||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1333  AGCATTTTGAACTTCTGTGCAGAGCTTCAGCACCTCAGCCTGGGCAGCTGTGTGATGATTGAAGATTATGATGT  1406

Query 1407  GATAGCTAGCATGATAGGAGCCAAGTGTAAAAAACTCCGGACCCTGGATCTGTGGAGATGTAAGAATATTACTG  1480
            ||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||..||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 1407  GATAGCCAGCATGATAGGAGCCAAGTGTAAAAACCTGCGGACTTTGGATCTGTGGAGATGCAAGAATATCACCG  1480

Query 1481  AGAATGGAATAGCAGAACTGGCTTCTGGGTGTCCACTACTGGAGGAGCTTGACCTTGGCTGGTGCCCAACTCTG  1554
            |||||||.||||||||..||||||||||.|||...||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1481  AGAATGGGATAGCAGAGTTGGCTTCTGGCTGTGTTCTTCTTGAGGAACTTGACCTTGGCTGGTGCCCCACCCTT  1554

Query 1555  CAGAGCAGCACCGGGTGCTTCACCAGACTGGCACACCAGCTCCCAAACTTGCAAAAACTCTTTCTTACAGCTAA  1628
            |||||||||||.||||||||...|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGAGCAGCACTGGGTGCTTTGTCAGACTGGCACGCCAGCTCCCAAACTTGCAGAAACTCTTTCTTACAGCTAA  1628

Query 1629  TAGATCTGTGTGTGACACAGACATTGATGAATTGGCATGTAATTGTACCAGGTTACAGCAGCTGGACATATTAG  1702
            .||.||||||||||||||||||||.||.|||.||||||.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1629  CAGGTCTGTGTGTGACACAGACATAGAAGAACTGGCATCTAATTGTACCAGATTACAGCAACTGGACATATTAG  1702

Query 1703  GAACAAGAATGGTAAGTCCGGCATCCTTAAGAAAACTCCTGGAATCTTGTAAAGATCTTTCTTTACTTGATGTG  1776
            |||||||||||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||..|||||||.|||
Sbjct 1703  GAACAAGAATGGTAAGTCCAGCATCCTTGAGAAAACTCCTGGAATCTTGCAAAGATCTTTCCCTACTTGACGTG  1776

Query 1777  TCCTTCTGTTCGCAGATTGATAACAGAGCTGTGCTAGAACTGAATGCAAGCTTTCCAAAAGTGTTCATAAAAAA  1850
            |||||||||||.|||||||||||||..||||||.||||.||.||.||.||||||||.|||||.||||||||.||
Sbjct 1777  TCCTTCTGTTCCCAGATTGATAACAAGGCTGTGTTAGAGCTCAACGCGAGCTTTCCGAAAGTCTTCATAAAGAA  1850

Query 1851  GAGCTTTACTCAG  1863
            ||||||||||||.
Sbjct 1851  GAGCTTTACTCAA  1863