Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02936
- Subject:
- XM_005266930.3
- Aligned Length:
- 1863
- Identities:
- 1791
- Gaps:
- 72
Alignment
Query 1 ATGTCACCGGTCTTTCCCATGTTAACAGTTCTGACCATGTTTTATTATATATGCCTTCGGCGCCGAGCCAGGAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCACCGGTCTTTCCCATGTTAACAGTTCTGACCATGTTTTATTATATATGCCTTCGGCGCCGAGCCAGGAC 74
Query 75 AGCTACAAGAGGAGAAATGATGAACACCCATAGAGCTATAGAATCAAACAGCCAGACTTCCCCTCTCAATGCAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGCTACAAGAGGAGAAATGATGAACACCCATAGAGCTATAGAATCAAACAGCCAGACTTCCCCTCTCAATGCAG 148
Query 149 AGGTAGTCCAGTATGCCAAAGAAGTAGTGGATTTCAGTTCCCATTATGGAAGTGAGAATAGTATGTCCTATACT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGTAGTCCAGTATGCCAAAGAAGTAGTGGATTTCAGTTCCCATTATGGAAGTGAGAATAGTATGTCCTATACT 222
Query 223 ATGTGGAATTTGGCTGGTGTACCAAATGTATTCCCAAGTTCTGGTGACTTTACTCAGACAGCTGTGTTTCGAAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGTGGAATTTGGCTGGTGTACCAAATGTATTCCCAAGTTCTGGTGACTTTACTCAGACAGCTGTGTTTCGAAC 296
Query 297 TTATGGGACATGGTGGGATCAGTGTCCTAGTGCTTCCTTGCCATTCAAGAGGACGCCACCTAATTTTCAGAGCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTATGGGACATGGTGGGATCAGTGTCCTAGTGCTTCCTTGCCATTCAAGAGGACGCCACCTAATTTTCAGAGCC 370
Query 371 AGGACTATGTGGAACTTACTTTTGAACAACAGGTGTATCCTACAGCTGTACATGTTCTAGAAACCTATCATCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGACTATGTGGAACTTACTTTTGAACAACAGGTGTATCCTACAGCTGTACATGTTCTAGAAACCTATCATCCC 444
Query 445 GGAGCAGTCATTAGAATTCTCGCTTGTTCTGCAAATCCTTATTCCCCAAATCCACCAGCTGAAGTAAGATGGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGAGCAGTCATTAGAATTCTCGCTTGTTCTGCAAATCCTTATTCCCCAAATCCACCAGCTGAAGTAAGATGGGA 518
Query 519 GATTCTTTGGTCAGAGAGACCTACGAAGGTGAATGCTTCCCAAGCTCGCCAGTTTAAACCTTGTATTAAGCAGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATTCTTTGGTCAGAGAGACCTACGAAGGTGAATGCTTCCCAAGCTCGCCAGTTTAAACCTTGTATTAAGCAGA 592
Query 593 TAAATTTCCCCACAAATCTTATACGACTGGAAGTAAATAGTTCTCTTCTGGAATATTACACTGAATTAGATGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TAAATTTCCCCACAAATCTTATACGACTGGAAGTAAATAGTTCTCTTCTGGAATATTACACTGAATTAGATGCA 666
Query 667 GTTGTGCTACATGGTGTGAAGGACAAGCCAGTGCTTTCTCTCAAGACTTCACTTATTGACATGAATGATATAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTTGTGCTACATGGTGTGAAGGACAAGCCAGTGCTTTCTCTCAAGACTTCACTTATTGACATGAATGATATAGA 740
Query 741 AGATGATGCCTATGCAGAAAAGGATGGTTGTGGAATGGACAGTCTTAACAAAAAGTTTAGCAGTGCTGTCCTCG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGATGATGCCTATGCAGAAAAGGATGGTTGTGGAATGGACAGTCTTAACAAAAAGTTTAGCAGTGCTGTCCTCG 814
Query 815 GGGAAGGGCCAAATAATGGGTATTTTGATAAACTACCTTATGAGCTTATTCAGCTGATTCTGAATCATCTTACA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGAAGGGCCAAATAATGGGTATTTTGATAAACTACCTTATGAGCTTATTCAGCTGATTCTGAATCATCTTACA 888
Query 889 CTACCAGACCTGTGTAGATTAGCACAGACTTGCAAACTACTGAGCCAGCATTGCTGTGATCCTCTGCAATACAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTACCAGACCTGTGTAGATTAGCACAGACTTGCAAACTACTGAGCCAGCATTGCTGTGATCCTCTGCAATACAT 962
Query 963 CCACCTCAATCTGCAACCATACTGGGCAAAACTAGATGACACTTCTCTGGAATTTCTACAGTCTCGCTGCACTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCACCTCAATCTGCAACCATACTGGGCAAAACTAGATGACACTTCTCTGGAATTTCTACAGTCTCGCTGCACTC 1036
Query 1037 TTGTCCAGTGGCTTAATTTATCTTGGACTGGCAATAGAGGCTTCATCTCTGTTGCAGGATTTAGCAGGTTTCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGTCCAGTGGCTTAATTTATCTTGGACTGGCAATAGAGGCTTCATCTCTGTTGCAGGATTTAGCAGGTTTCTG 1110
Query 1111 AAGGTTTGTGGATCCGAATTAGTACGCCTTGAATTGTCTTGCAGCCACTTTCTTAATGAAACTTGCTTAGAAGT 1184
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111 AAGGTTTGTGGATCCGAATTAGTACGCCTTGAATTGTCTTGCAGCCACTTTCTTAATGAAACTTGCTTAGAAGT 1184
Query 1185 TATTTCTGAGATGTGTCCAAATCTACAGGCCTTAAATCTCTCCTCCTGTGATAAGCTACCACCTCAAGCTTTCA 1258
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TATTTCTGAGATGTGTCCAAATCTACAGGCCTTAAATCTCTCCTCCTGTGATAAGCTACCACCTCAAGCTTTCA 1258
Query 1259 ACCACATTGCCAAGTTATGCAGCCTTAAACGACTTGTTCTCTATCGAACAAAAGTAGAGCAAACAGCACTGCTC 1332
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259 ACCACATTGCCAAGTTATGCAGCCTTAAACGACTTGTTCTCTATCGAACAAAAGTAGA---------------- 1316
Query 1333 AGCATTTTGAACTTCTGTTCAGAGCTTCAGCACCTCAGTTTAGGCAGTTGTGTCATGATTGAAGACTATGATGT 1406
||||||||||||||||||
Sbjct 1317 --------------------------------------------------------GATTGAAGACTATGATGT 1334
Query 1407 GATAGCTAGCATGATAGGAGCCAAGTGTAAAAAACTCCGGACCCTGGATCTGTGGAGATGTAAGAATATTACTG 1480
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1335 GATAGCTAGCATGATAGGAGCCAAGTGTAAAAAACTCCGGACCCTGGATCTGTGGAGATGTAAGAATATTACTG 1408
Query 1481 AGAATGGAATAGCAGAACTGGCTTCTGGGTGTCCACTACTGGAGGAGCTTGACCTTGGCTGGTGCCCAACTCTG 1554
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1409 AGAATGGAATAGCAGAACTGGCTTCTGGGTGTCCACTACTGGAGGAGCTTGACCTTGGCTGGTGCCCAACTCTG 1482
Query 1555 CAGAGCAGCACCGGGTGCTTCACCAGACTGGCACACCAGCTCCCAAACTTGCAAAAACTCTTTCTTACAGCTAA 1628
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1483 CAGAGCAGCACCGGGTGCTTCACCAGACTGGCACACCAGCTCCCAAACTTGCAAAAACTCTTTCTTACAGCTAA 1556
Query 1629 TAGATCTGTGTGTGACACAGACATTGATGAATTGGCATGTAATTGTACCAGGTTACAGCAGCTGGACATATTAG 1702
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1557 TAGATCTGTGTGTGACACAGACATTGATGAATTGGCATGTAATTGTACCAGGTTACAGCAGCTGGACATATTAG 1630
Query 1703 GAACAAGAATGGTAAGTCCGGCATCCTTAAGAAAACTCCTGGAATCTTGTAAAGATCTTTCTTTACTTGATGTG 1776
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1631 GAACAAGAATGGTAAGTCCGGCATCCTTAAGAAAACTCCTGGAATCTTGTAAAGATCTTTCTTTACTTGATGTG 1704
Query 1777 TCCTTCTGTTCGCAGATTGATAACAGAGCTGTGCTAGAACTGAATGCAAGCTTTCCAAAAGTGTTCATAAAAAA 1850
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1705 TCCTTCTGTTCGCAGATTGATAACAGAGCTGTGCTAGAACTGAATGCAAGCTTTCCAAAAGTGTTCATAAAAAA 1778
Query 1851 GAGCTTTACTCAG 1863
|||||||||||||
Sbjct 1779 GAGCTTTACTCAG 1791