Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02936
- Subject:
- XM_011535748.3
- Aligned Length:
- 1866
- Identities:
- 1135
- Gaps:
- 726
Alignment
Query 1 ATGTCACCGGTCTTTCCCATGTTAACAGTTCTGACCATGTTTTATTATATATGCCTTCGGCGCCGAGCCAGGAC 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGTCACCGGTCTTTCCCATGTTAACAGTTCTGACCATGTTTTATTATATATGCCTTCGGCGCCGAGCCAGGAC 74
Query 75 AGCTACAAGAGGAGAAATGATGAACACCCATAGAGCTATAGAATCAAACAGCCAGACTTCCCCTCTCAATGCAG 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGCTACAAGAGGAGAAATGATGAACACCCATAGAGCTATAGAATCAAACAGCCAGACTTCCCCTCTCAATGCAG 148
Query 149 AGGTAGTCCAGTATGCCAAAGAAGTAGTGGATTTCAGTTCCCATTATGGAAGTGAGAATAGTATGTCCTATACT 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 AGGTAGTCCAGTATGCCAAAGAAGTAGTGGATTTCAGTTCCCATTATGGAAGTGAGAATAGTATGTCCTATACT 222
Query 223 ATGTGGAATTTGGCTGGTGTACCAAATGTATTCCCAAGTTCTGGTGACTTTACTCAGACAGCTGTGTTTCGAAC 296
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 223 ATGTGGAATTTGGCTGGTGTACCAAATGTATTCCCAAGTTCTGGTGACTTTACTCAGACAGCTGTGTTTCGAAC 296
Query 297 TTATGGGACATGGTGGGATCAGTGTCCTAGTGCTTCCTTGCCATTCAAGAGGACGCCACCTAATTTTCAGAGCC 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 297 TTATGGGACATGGTGGGATCAGTGTCCTAGTGCTTCCTTGCCATTCAAGAGGACGCCACCTAATTTTCAGAGCC 370
Query 371 AGGACTATGTGGAACTTACTTTTGAACAACAGGTGTATCCTACAGCTGTACATGTTCTAGAAACCTATCATCCC 444
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 371 AGGACTATGTGGAACTTACTTTTGAACAACAGGTGTATCCTACAGCTGTACATGTTCTAGAAACCTATCATCCC 444
Query 445 GGAGCAGTCATTAGAATTCTCGCTTGTTCTGCAAATCCTTATTCCCCAAATCCACCAGCTGAAGTAAGATGGGA 518
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGAGCAGTCATTAGAATTCTCGCTTGTTCTGCAAATCCTTATTCCCCAAATCCACCAGCTGAAGTAAGATGGGA 518
Query 519 GATTCTTTGGTCAGAGAGACCTACGAAGGTGAATGCTTCCCAAGCTCGCCAGTTTAAACCTTGTATTAAGCAGA 592
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 519 GATTCTTTGGTCAGAGAGACCTACGAAGGTGAATGCTTCCCAAGCTCGCCAGTTTAAACCTTGTATTAAGCAGA 592
Query 593 TAAATTTCCCCACAAATCTTATACGACTGGAAGTAAATAGTTCTCTTCTGGAATATTACACTGAATTAGATGCA 666
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 593 TAAATTTCCCCACAAATCTTATACGACTGGAAGTAAATAGTTCTCTTCTGGAATATTACACTGAATTAGATGCA 666
Query 667 GTTGTGCTACATGGTGTGAAGGACAAGCCAGTGCTTTCTCTCAAGACTTCACTTATTGACATGAATGATATAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 667 GTTGTGCTACATGGTGTGAAGGACAAGCCAGTGCTTTCTCTCAAGACTTCACTTATTGACATGAATGATATAGA 740
Query 741 AGATGATGCCTATGCAGAAAAGGATGGTTGTGGAATGGACAGTCTTAACAAAAAGTTTAGCAGTGCTGTCCTCG 814
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 741 AGATGATGCCTATGCAGAAAAGGATGGTTGTGGAATGGACAGTCTTAACAAAAAGTTTAGCAGTGCTGTCCTCG 814
Query 815 GGGAAGGGCCAAATAATGGGTATTTTGATAAACTACCTTATGAGCTTATTCAGCTGATTCTGAATCATCTTACA 888
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 815 GGGAAGGGCCAAATAATGGGTATTTTGATAAACTACCTTATGAGCTTATTCAGCTGATTCTGAATCATCTTACA 888
Query 889 CTACCAGACCTGTGTAGATTAGCACAGACTTGCAAACTACTGAGCCAGCATTGCTGTGATCCTCTGCAATACAT 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 889 CTACCAGACCTGTGTAGATTAGCACAGACTTGCAAACTACTGAGCCAGCATTGCTGTGATCCTCTGCAATACAT 962
Query 963 CCACCTCAATCTGCAACCATACTGGGCAAAACTAGATGACACTTCTCTGGAATTTCTACAGTCTCGCTGCACTC 1036
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 963 CCACCTCAATCTGCAACCATACTGGGCAAAACTAGATGACACTTCTCTGGAATTTCTACAGTCTCGCTGCACTC 1036
Query 1037 TTGTCCAGTGGCTTAATTTATCTTGGACTGGCAATAGAGGCTTCATCTCTGTTGCAGGATTTAGCAGGTTTCTG 1110
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037 TTGTCCAGTGGCTTAATTTATCTTGGACTGGCAATAGAGGCTTCATCTCTGTTGCAGGATTTAGCAGG------ 1104
Query 1111 AAGGTTTGTGGATCC--GAATTAGTACGCCTTGAATTGTCTTGCAGCCACTTTCTTAATGAAACTTG-CTTAGA 1181
.|| ||| ||.|| ||.||| ||||||| | ||..||
Sbjct 1105 ------------ACCAAGAA--AGAAC--------------TGAAGC--------TAATGAA----GTCTGTGA 1138
Query 1182 AGTTATTTCTGAGATGTGTCCAAATCTACAGGCCTTAAATCTCTCCTCCTGTGATAAGCTACCACCTCAAGCTT 1255
| ||||
Sbjct 1139 A--TATT------------------------------------------------------------------- 1143
Query 1256 TCAACCACATTGCCAAGTTATGCAGCCTTAAACGACTTGTTCTCTATCGAACAAAAGTAGAGCAAACAGCACTG 1329
Sbjct 1144 -------------------------------------------------------------------------- 1143
Query 1330 CTCAGCATTTTGAACTTCTGTTCAGAGCTTCAGCACCTCAGTTTAGGCAGTTGTGTCATGATTGAAGACTATGA 1403
Sbjct 1144 -------------------------------------------------------------------------- 1143
Query 1404 TGTGATAGCTAGCATGATAGGAGCCAAGTGTAAAAAACTCCGGACCCTGGATCTGTGGAGATGTAAGAATATTA 1477
Sbjct 1144 -------------------------------------------------------------------------- 1143
Query 1478 CTGAGAATGGAATAGCAGAACTGGCTTCTGGGTGTCCACTACTGGAGGAGCTTGACCTTGGCTGGTGCCCAACT 1551
Sbjct 1144 -------------------------------------------------------------------------- 1143
Query 1552 CTGCAGAGCAGCACCGGGTGCTTCACCAGACTGGCACACCAGCTCCCAAACTTGCAAAAACTCTTTCTTACAGC 1625
Sbjct 1144 -------------------------------------------------------------------------- 1143
Query 1626 TAATAGATCTGTGTGTGACACAGACATTGATGAATTGGCATGTAATTGTACCAGGTTACAGCAGCTGGACATAT 1699
Sbjct 1144 -------------------------------------------------------------------------- 1143
Query 1700 TAGGAACAAGAATGGTAAGTCCGGCATCCTTAAGAAAACTCCTGGAATCTTGTAAAGATCTTTCTTTACTTGAT 1773
Sbjct 1144 -------------------------------------------------------------------------- 1143
Query 1774 GTGTCCTTCTGTTCGCAGATTGATAACAGAGCTGTGCTAGAACTGAATGCAAGCTTTCCAAAAGTGTTCATAAA 1847
Sbjct 1144 -------------------------------------------------------------------------- 1143
Query 1848 AAAGAGCTTTACTCAG 1863
Sbjct 1144 ---------------- 1143
