Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02936
- Subject:
- XM_017320233.1
- Aligned Length:
- 1868
- Identities:
- 1534
- Gaps:
- 127
Alignment
Query 1 ATGTCACCGGTCTTTCCCATGTTAACAGTTCTGACCATGTTTTATTATATATGCCTTCGGCGCCGAGCCAGGAC 74
||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||||||||
Sbjct 1 ATGTCACCAGTCTTTCCCATGTTAACAGTTCTGACCATGTTTTATTATATGTGCCTTCGGCGTCGAGCCAGGAC 74
Query 75 AGCTACAAGAGGAGAAATGATGAACACCCATAGAGCTATAGAATCAAACAGCCAGACTTCCCCTCTCAATGCAG 148
|||||||||||||||.||||||||||.||||||..||||||..||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 75 AGCTACAAGAGGAGATATGATGAACAGCCATAGGACTATAGTGTCAAACAGCCGGACTTCCCCTCTCAATGCAG 148
Query 149 AGGTAGTCCAGTATGCCAAAGAAGTAGTGGATTTCAGTTCCCATTATGGAAGTGAGAATAGTATGTCCTATACT 222
||||.|||||||||||.||||||||.||||||||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||.
Sbjct 149 AGGTGGTCCAGTATGCTAAAGAAGTGGTGGATTTCAGTTCCCATTACGGCAGTGAGAACAGTATGTCCTATACC 222
Query 223 ATGTGGAATTTGGCTGGTGTACCAAATGTATTCCCAAGTTCTGGTGACTTTACTCAGACAGCTGTGTTTCGAAC 296
||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||
Sbjct 223 ATGTGGAATTTGGCAGGTGTACCAAATGTCTTCCCAAGTTCTGGTGACTTCACGCAGACGGCTGTGTTTCGAAC 296
Query 297 TTATGGGACATGGTGGGATCAGTGTCCTAGTGCTTCCTTGCCATTCAAGAGGACGCCACCTAATTTTCAGAGCC 370
|||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||..|.|.|||.|||||||
Sbjct 297 TTATGGGACGTGGTGGGATCAGTGTCCTAGTGCTTCCTTGCCATTCAGAAGGACACCGTCCAGTTTCCAGAGCC 370
Query 371 AGGACTATGTGGAACTTACTTTTGAACAACAGGTGTATCCTACAGCTGTACATGTTCTAGAAACCTATCATCCC 444
||||||||||||||||.||||||||.||.||.|||||.||.||.|||||.|||||.||.||.||.||.|||||.
Sbjct 371 AGGACTATGTGGAACTGACTTTTGAGCAGCAAGTGTACCCCACGGCTGTCCATGTGCTGGAGACTTACCATCCT 444
Query 445 GGAGCAGTCATTAGAATTCTCGCTTGTTCTGCAAATCCTTATTCCCCAAATCCACCAGCTGAAGTAAGATGGGA 518
|||||||||||.||||||||.||.||.||.||||||||.||.|||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 445 GGAGCAGTCATCAGAATTCTGGCCTGCTCAGCAAATCCCTACTCCCCAAATCCTCCAGCTGAAGTAAGATGGGA 518
Query 519 GATTCTTTGGTCAGAGAGACCTACGAAGGTGAATGCTTCCCAAGCTCGCCAGTTTAAACCTTGTATTAAGCAGA 592
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.|
Sbjct 519 GATTCTTTGGTCAGAGAGACCTATGAAGGTGAATGCTTCCCAGGCTCGTCAGTTTAAACCTTGTATTAAGCAAA 592
Query 593 TAAATTTCCCCACAAATCTTATACGACTGGAAGTAAATAGTTCTCTTCTGGAATATTACACTGAATTAGATGCA 666
||||||||||.|||||.||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.|||.||||||||
Sbjct 593 TAAATTTCCCTACAAACCTCATACGACTGGAAGTCAATAGTTCTCTTCTGGATTATTACACCGAACTAGATGCA 666
Query 667 GTTGTGCTACATGGTGTGAAGGACAAGCCAGTGCTTTCTCTCAAGACTTCACTTATTGACATGAATGATATAGA 740
||||||||.||||||..|||||||||||||.||||.||||||||||||.|.|||.|.||||||||||||.||||
Sbjct 667 GTTGTGCTGCATGGTACGAAGGACAAGCCACTGCTCTCTCTCAAGACTGCTCTTGTAGACATGAATGATCTAGA 740
Query 741 AGATGATGCCTATGCAGAAAAGGATGGTTGTGGAATGGACAGTCTTAACAAAAAGTTTAGCAGTGCTGTCCTCG 814
||||||.|.|||||.|||.||||||||.||||..|||||...||||||||||||||||||||||||||.|||.|
Sbjct 741 AGATGACGACTATGAAGAGAAGGATGGCTGTGAGATGGATGCTCTTAACAAAAAGTTTAGCAGTGCTGCCCTTG 814
Query 815 GGGAAGGGCCAAATAATGGGTATTTTGATAAACTACCTTATGAGCTTATTCAGCTGATTCTGAATCATCTTACA 888
||||.||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||||||||||||.||
Sbjct 815 GGGATGGGCCACATAATGGGTATTTTGACAAACTACCATATGAGCTCATTCAACTGATTCTGAATCATCTTTCA 888
Query 889 CTACCAGACCTGTGTAGATTAGCACAGACTTGCAAACTACTGAGCCAGCATTGCTGTGATCCTCTGCAATACAT 962
|||||||||||||||||||||||.||||||||||..||.||...|||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 889 CTACCAGACCTGTGTAGATTAGCCCAGACTTGCAGGCTTCTCCACCAGCATTGCTGTGATCCTCTGCAATATAT 962
Query 963 CCACCTCAATCTGCAACCATACTGGGCAAAACTAGATGACACTTCTCTGGAATTTCTACAGTCTCGCTGCACTC 1036
|||||||||.|||||.|||||||||||....||.||.|||||.||.|||||.||.||||||.|||||||....|
Sbjct 963 CCACCTCAACCTGCAGCCATACTGGGCCCGGCTGGACGACACGTCACTGGAGTTCCTACAGGCTCGCTGTGTGC 1036
Query 1037 TTGTCCAGTGGCTTAATTTATCTTGGACTGGCAATAGAGGCTTCATCTCTGTTGCAGGATTTAGCAGGTTTCTG 1110
|||||||||||||||||.|.||||||||||||||.|||||.|||||||||||..|||||||||||||||||||.
Sbjct 1037 TTGTCCAGTGGCTTAATCTGTCTTGGACTGGCAACAGAGGGTTCATCTCTGTATCAGGATTTAGCAGGTTTCTA 1110
Query 1111 AAGGTTTGTGGATCCGAATTAGTACGCCTTGAATTGTCTTGCAGCCACTTTCTTAATGAAACTTGCTTAGAAGT 1184
|||||.|||||.||.||.||||||||||||||.||.||.||||||||||||||||||||.||||||||.||.||
Sbjct 1111 AAGGTGTGTGGGTCTGAGTTAGTACGCCTTGAGTTATCCTGCAGCCACTTTCTTAATGACACTTGCTTGGAGGT 1184
Query 1185 TATTTCTGAGATGTGTCCAAATCTACAGGCCTTAAATCTCTCCTCCTGTGATAAGCTACCACCTCAAGCTTTCA 1258
|||||||||.|||||.|||||||||||.|.||||||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.|||||..
Sbjct 1185 TATTTCTGAAATGTGCCCAAATCTACAAGACTTAAATCTCTCATCCTGCGATAAACTCCCACCTCAGGCTTTTG 1258
Query 1259 ACCACATTGCCAAGTTATGCAGCCTTAAACGACTTGTTCTCTATCGAACAAAAGTAGAGCAAACAGCACTGCTC 1332
.|||.||||||||||||||||||||.||..|.||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||.||.
Sbjct 1259 GCCATATTGCCAAGTTATGCAGCCTCAAGAGGCTTGTTCTCTATCGGACAAAAGTAGAGCAAACAGCACTACTG 1332
Query 1333 AGCATTTTGAACTTCTGTTCAGAGCTTCAGCACCTCAGTTTAGGCAGTTGTGTCATGATTGAAGACTATGATGT 1406
||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||..|.|||||.|||||.|||||||||||.||||||||
Sbjct 1333 AGCATTTTGAACTTCTGTGCAGAGCTTCAGCACCTCAGCCTGGGCAGCTGTGTGATGATTGAAGATTATGATGT 1406
Query 1407 GATAGCTAGCATGATAGGAGCCAAGTGTAAAAAACTCCGGACCCTGGATCTGTGGAGATGTAAGAATATTACTG 1480
||||||.||||||||||||||||||||||||||.||.|||||..||||||||||||||||.||||||||.||.|
Sbjct 1407 GATAGCCAGCATGATAGGAGCCAAGTGTAAAAACCTGCGGACTTTGGATCTGTGGAGATGCAAGAATATCACCG 1480
Query 1481 AGAATGGAATAGCAGAACTGGCTTCTGGGTGTCCACTACTGGAGGAGCTTGACCTTGGCTGGTGCCCAACTCTG 1554
|||||||.||||||||..||||||||||.|||...||.||.|||||.||||||||||||||||||||.||.||.
Sbjct 1481 AGAATGGGATAGCAGAGTTGGCTTCTGGCTGTGTTCTTCTTGAGGAACTTGACCTTGGCTGGTGCCCCACCCTT 1554
Query 1555 CAGAGCAGCACCGGGTGCTTCACCAGACTGGCACACCAGCTCCCAAACTTGCAAAAACTCTTTCTTACAGCTAA 1628
|||||||||||.||||||||...|||||||||||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1555 CAGAGCAGCACTGGGTGCTTTGTCAGACTGGCACGCCAGCTCCCAAACTTGCAGAAACTCTTTCTTACAGCTAA 1628
Query 1629 TAGATCTGTGTGTGACACAGACATTGATGAATTGGCATGTAATTGTACCAGGTTACAGCAGCTGGACATATTAG 1702
.||.||||||||||||||||||||.||.|||.||||||.||||||||||||.||||||||.|||||||||||||
Sbjct 1629 CAGGTCTGTGTGTGACACAGACATAGAAGAACTGGCATCTAATTGTACCAGATTACAGCAACTGGACATATTAG 1702
Query 1703 G-----AACAAGAATGGTAAGTCCGGCATCCTTAAGAAAACTCCTGGAATCTTGTAAAGATCTTTCTTTACTTG 1771
| ||||.| ||...||||| |||.|.|| ||.|||
Sbjct 1703 GCCTGAAACAGG-------------------TTTTCAAAAC-----------TGTTAGGA--------TAGTTG 1738
Query 1772 ATGTGTCCTTCTGTTCGCAGATTGATAACAGAGCTGTGCTAGAACTGAATGCAAGCTTTCCAAAAGTGTTCATA 1845
.|..|| ||
Sbjct 1739 CTCCGT-----TG------------------------------------------------------------- 1746
Query 1846 AAAAAGAGCTTTACTCAG 1863
Sbjct 1747 ------------------ 1746