Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02948
• Subject: NM_001355507.1
• Aligned Length: 1413
• Identities: 954
• Gaps: 330

Alignment

Query    1  ATGGCGGCCATGGAGACCGAGACGGCGCCGCTGACCCTAGAGTCGCTGCCCACCGATCCCCTGCTCCTCATCTT  74
            |||||.|||.|.|||.|||||||||.||.|||||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||
Sbjct    1  ATGGCTGCCGTAGAGGCCGAGACGGGGCTGCTGACCCTGGAGTCGCTGCCCACCGACCCTCTGCTGCTCATCTT  74

Query   75  ATCCTTTTTGGACTATCGGGATCTAATCAACTGTTGTTATGTCAGTCGAAGACTTAGCCAGCTATCAAGTCATG  148
            ||||||..|||||||..||||.||||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||.|||||
Sbjct   75  ATCCTTCGTGGACTACAGGGACCTAATCAATTGTTGCTATGTTAGTCGAAGACTTAGCCAGCTTTCAACTCATG  148

Query  149  ATCCGCTGTGGAGAAGACATTGCAAAAAATACTGGCTGATATCTGAGGAAGAGAAAACACAGAAGAATCAGTGT  222
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|...|||||.||||||.
Sbjct  149  ATCCACTGTGGAGAAGACATTGCAAAAAATACTGGCTGATATCTGAGGAAGAAAAAGCCGGGAAGAGTCAGTGC  222

Query  223  TGGAAATCTCTCTTCATAGATACTTACTCTGATGTAGGAAGATACATTGACCATTATGCTGCTATTAAAAAGGC  296
            ||||.|||.|||||||||||.||.|||||.||.||.||.||.|||||.||||||||.||.||.|||||||||||
Sbjct  223  TGGAGATCCCTCTTCATAGAGACCTACTCAGACGTGGGGAGGTACATCGACCATTACGCCGCCATTAAAAAGGC  296

Query  297  CTGGGATGATCTCAAGAAATATTTGGAGCCCAGGTGTCCTCGGATGGTTTTATCTCTGAAAGAGGGTGCTCGAG  370
            ||||..|||.||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||.|
Sbjct  297  CTGGCGTGACCTCAAGAAGTACTTGGAGCCCAGGTGTCCTCGGATGGTTTTATCTCTGAAAGAGGGCGCACGTG  370

Query  371  AGGAAGACCTCGATGCTGTGGAAGCGCAGATTGGCTGCAAGCTTCCTGACGATTATCGATGTTCATACCGAATT  444
            ||||||||||.||||||||.|||||.|||||.||.||||||||.||.||.||||||||.|||||||||||.||.
Sbjct  371  AGGAAGACCTGGATGCTGTCGAAGCTCAGATCGGTTGCAAGCTCCCGGATGATTATCGCTGTTCATACCGGATC  444

Query  445  CACAATGGACAGAAGTTAGTGGTTCCTGGGTTATTGGGAAGCATGGCACTGTCTAATCACTATCGTTCTGAAGA  518
            |||||.||.||.|||||||||||.||.|||||..|||||||.|||||||||||.||||||||.||.||||||||
Sbjct  445  CACAACGGGCAAAAGTTAGTGGTGCCGGGGTTGCTGGGAAGTATGGCACTGTCCAATCACTACCGCTCTGAAGA  518

Query  519  TTTGTTAGACGTCGATACAGCTGCCGGAGGATTCCAGCAGAGACAGGGACTGAAATACTGTCTCCCTTTAACTT  592
            |.|..||||.||.|||||.|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  519  TCTACTAGATGTTGATACTGCTGCAGGAGGATTTCAGCAGAGACAGGGACTGAAATACTGTCTCCCTTTAACCT  592

Query  593  TTTGCATACATACTGGTTTGAGTCAGTACATAGCAGTGGAAGCTGCAGAGGGCCGAAACAAAAATGAAGTTTTC  666
            ||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||.||.||.||.|||||.|||
Sbjct  593  TTTGCATACACACCGGCTTGAGTCAGTACATAGCTGTGGAGGCTGCAGAGGGGCGGAATAAGAACGAAGTGTTC  666

Query  667  TACCAATGTCCAGACCAAATGGCTCGAAATCCAGCTGCTATTGACATGTTTATTATAGGTGCTACTTTTACTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||
Sbjct  667  TACCAATGTCCAGACCAAATGGCTCGGAATCCTGCTGCTATTGACATGTTTATCATAGGTGCTACTTTTACCGA  740

Query  741  CTGGTTTACCTCTTATGTCAAAAATGTTGTATCAGGTGGCTTCCCCATCATCAGAGACCAAATTTTCAGATATG  814
            |||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||.
Sbjct  741  CTGGTTTACATCCTATGTCAACAATGTTGTATCAGGTGGTTTCCCCATCATCAGAGACCAGATTTTCAGATATA  814

Query  815  TTCACGATCCAGAATGTGTAGCAACAACTGGGGATATTACTGTGTCAGTTTCCACATCGTTTCTGCCAGAACTT  888
            ||||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.
Sbjct  815  TTCATGATCCAGAATGTGTGGCAACAACTGGAGATATTACAGTTTCAGTGTCCACATCGTTTCTGCCAGAACTC  888

Query  889  AGCTCTGTACATCCACCCCACTATTTCTTCACATACCGAATCAGGATTGAAATGTCAAAAGATGCACTTCCTGA  962
            ||||||||.|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..|||||.||||||||
Sbjct  889  AGCTCTGTGCATCCGCCACACTATTTCTTCACATACCGAATCAGGATTGAAATGTCAAGGGATGCTCTTCCTGA  962

Query  963  GAAGGCCTGTCAGTTGGACAGTCGCTATTGGAGAATAACAAATGCTAAGGGTGACGTGGAAGAAGTTCAAGGAC  1036
            |||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||||||.||.||||
Sbjct  963  GAAGGCCTGTCAGTTGGACAGTCGCTACTGGAGGATAACAAACGCTAAAGGGGATGTGGAAGAAGTCCAGGGAC  1036

Query 1037  CTGGAGTAGTTGGTGAATTTCCAATCATCAGCCCAGGTCGGGTATATGAATACACAAGCTGTACCACATTCTCT  1110
            ||||||||||.||||||||||||||.||.||||||||      |.|||..|.|                     
Sbjct 1037  CTGGAGTAGTCGGTGAATTTCCAATTATTAGCCCAGG------AAATGGGTCC---------------------  1083

Query 1111  ACAACATCAGGATACATGGAAGGATATTATACCTTCCATTTTCTTTACTTTAAAGACAAGATCTTTAATGTTGC  1184
                                                                                      
Sbjct 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083

Query 1185  CATTCCCCGATTCCATATGGCATGTCCAACATTCAGGGTGTCTATAGCCCGATTGGAAATGGGTCCTGATGAAT  1258
                                                                                      
Sbjct 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083

Query 1259  ATGAAGAGATGGAAGAAGAGGAGGAGGAGGAAGAGGAGGAAGACGAGGATGATGATTCAGCAGATATGGATGAA  1332
                                                                                      
Sbjct 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083

Query 1333  TCAGATGAAGATGATGAAGAGGAGAGACGGAGGAGAGTCTTTGATGTTCCCATTCGCAGACGCCGCTGCTCACG  1406
                                                                                      
Sbjct 1084  --------------------------------------------------------------------------  1083

Query 1407  CCTTTTT  1413
                   
Sbjct 1084  -------  1083