Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_02951
• Subject: NM_017416.2
• Aligned Length: 2058
• Identities: 2058
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGAAGCCACCATTTCTTTTGGCCCTTGTGGTCTGTTCTGTAGTCAGCACAAATCTGAAGATGGTGTCAAAGAG  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGAAGCCACCATTTCTTTTGGCCCTTGTGGTCTGTTCTGTAGTCAGCACAAATCTGAAGATGGTGTCAAAGAG  74

Query   75  AAATTCTGTGGATGGCTGCATTGACTGGTCAGTGGATCTCAAGACATACATGGCTTTGGCAGGTGAACCAGTCC  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AAATTCTGTGGATGGCTGCATTGACTGGTCAGTGGATCTCAAGACATACATGGCTTTGGCAGGTGAACCAGTCC  148

Query  149  GAGTGAAATGTGCCCTTTTCTACAGTTATATTCGTACCAACTATAGCACGGCCCAGAGCACTGGGCTCAGGCTT  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GAGTGAAATGTGCCCTTTTCTACAGTTATATTCGTACCAACTATAGCACGGCCCAGAGCACTGGGCTCAGGCTT  222

Query  223  ATGTGGTACAAAAACAAAGGTGATTTGGAAGAGCCCATCATCTTTTCAGAGGTCAGGATGAGCAAAGAGGAAGA  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  ATGTGGTACAAAAACAAAGGTGATTTGGAAGAGCCCATCATCTTTTCAGAGGTCAGGATGAGCAAAGAGGAAGA  296

Query  297  TTCAATATGGTTTCACTCAGCTGAGGCACAAGACAGTGGATTCTACACTTGTGTTTTAAGAAACTCAACATATT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TTCAATATGGTTTCACTCAGCTGAGGCACAAGACAGTGGATTCTACACTTGTGTTTTAAGAAACTCAACATATT  370

Query  371  GCATGAAGGTGTCAATGTCCTTGACTGTTGCAGAGAATGAATCAGGCCTGTGCTACAACAGCAGGATCCGCTAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GCATGAAGGTGTCAATGTCCTTGACTGTTGCAGAGAATGAATCAGGCCTGTGCTACAACAGCAGGATCCGCTAT  444

Query  445  TTAGAAAAATCTGAAGTCACTAAAAGAAAGGAGATCTCCTGTCCAGACATGGATGACTTTAAAAAGTCCGATCA  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  TTAGAAAAATCTGAAGTCACTAAAAGAAAGGAGATCTCCTGTCCAGACATGGATGACTTTAAAAAGTCCGATCA  518

Query  519  GGAGCCTGATGTTGTGTGGTATAAGGAATGCAAGCCAAAAATGTGGAGAAGCATAATAATACAGAAAGGAAATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  GGAGCCTGATGTTGTGTGGTATAAGGAATGCAAGCCAAAAATGTGGAGAAGCATAATAATACAGAAAGGAAATG  592

Query  593  CTCTTCTGATCCAAGAAGTTCAAGAAGAAGATGGAGGAAATTACACATGTGAACTTAAATATGAAGGAAAACTT  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CTCTTCTGATCCAAGAAGTTCAAGAAGAAGATGGAGGAAATTACACATGTGAACTTAAATATGAAGGAAAACTT  666

Query  667  GTAAGACGAACAACTGAATTGAAAGTTACAGCTTTACTCACAGACAAGCCTCCCAAGCCATTGTTCCCCATGGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  GTAAGACGAACAACTGAATTGAAAGTTACAGCTTTACTCACAGACAAGCCTCCCAAGCCATTGTTCCCCATGGA  740

Query  741  GAATCAGCCAAGTGTTATAGATGTCCAGCTGGGTAAGCCTCTGAACATCCCCTGCAAAGCATTCTTCGGATTCA  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  GAATCAGCCAAGTGTTATAGATGTCCAGCTGGGTAAGCCTCTGAACATCCCCTGCAAAGCATTCTTCGGATTCA  814

Query  815  GTGGAGAGTCTGGGCCAATGATCTACTGGATGAAAGGAGAAAAGTTTATTGAAGAACTGGCAGGTCACATTAGA  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  GTGGAGAGTCTGGGCCAATGATCTACTGGATGAAAGGAGAAAAGTTTATTGAAGAACTGGCAGGTCACATTAGA  888

Query  889  GAAGGTGAAATAAGGCTTCTCAAAGAGCATCTTGGAGAAAAAGAAGTTGAATTGGCACTCATCTTTGACTCAGT  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  GAAGGTGAAATAAGGCTTCTCAAAGAGCATCTTGGAGAAAAAGAAGTTGAATTGGCACTCATCTTTGACTCAGT  962

Query  963  TGTGGAAGCTGACCTGGCGAATTATACCTGCCATGTTGAAAACCGAAATGGACGGAAACATGCCAGTGTTTTGC  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGTGGAAGCTGACCTGGCGAATTATACCTGCCATGTTGAAAACCGAAATGGACGGAAACATGCCAGTGTTTTGC  1036

Query 1037  TGCGTAAAAAGGATTTAATCTATAAAATTGAGCTTGCAGGGGGCCTGGGAGCAATCTTCCTCCTCCTTGTACTG  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  TGCGTAAAAAGGATTTAATCTATAAAATTGAGCTTGCAGGGGGCCTGGGAGCAATCTTCCTCCTCCTTGTACTG  1110

Query 1111  CTGGTGGTCATTTACAAATGCTACAACATTGAATTGATGCTCTTCTACAGGCAGCACTTTGGAGCTGATGAAAC  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  CTGGTGGTCATTTACAAATGCTACAACATTGAATTGATGCTCTTCTACAGGCAGCACTTTGGAGCTGATGAAAC  1184

Query 1185  TAATGATGACAACAAGGAATATGATGCCTATCTCTCTTACACAAAAGTGGACCAAGATACTTTAGACTGTGACA  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185  TAATGATGACAACAAGGAATATGATGCCTATCTCTCTTACACAAAAGTGGACCAAGATACTTTAGACTGTGACA  1258

Query 1259  ATCCTGAAGAAGAGCAGTTTGCTCTTGAAGTACTGCCAGATGTCCTGGAAAAACACTATGGATATAAACTCTTC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1259  ATCCTGAAGAAGAGCAGTTTGCTCTTGAAGTACTGCCAGATGTCCTGGAAAAACACTATGGATATAAACTCTTC  1332

Query 1333  ATCCCAGAAAGAGACCTGATTCCAAGTGGAACATACATGGAAGATCTCACAAGATATGTTGAACAAAGCAGAAG  1406
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1333  ATCCCAGAAAGAGACCTGATTCCAAGTGGAACATACATGGAAGATCTCACAAGATATGTTGAACAAAGCAGAAG  1406

Query 1407  ACTTATTATCGTGCTAACTCCAGACTATATTCTCAGACGGGGATGGAGTATTTTCGAACTGGAAAGCAGACTCC  1480
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1407  ACTTATTATCGTGCTAACTCCAGACTATATTCTCAGACGGGGATGGAGTATTTTCGAACTGGAAAGCAGACTCC  1480

Query 1481  ATAACATGCTAGTCAGTGGAGAAATCAAAGTGATTTTGATTGAGTGTACAGAATTAAAAGGGAAAGTGAATTGC  1554
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1481  ATAACATGCTAGTCAGTGGAGAAATCAAAGTGATTTTGATTGAGTGTACAGAATTAAAAGGGAAAGTGAATTGC  1554

Query 1555  CAGGAAGTGGAATCACTAAAGCGTAGCATCAAACTTCTGTCCCTGATCAAGTGGAAGGGATCCAAAAGCAGCAA  1628
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1555  CAGGAAGTGGAATCACTAAAGCGTAGCATCAAACTTCTGTCCCTGATCAAGTGGAAGGGATCCAAAAGCAGCAA  1628

Query 1629  ATTAAATTCTAAGTTTTGGAAGCACTTAGTATATGAAATGCCCATCAAGAAAAAAGAAATGCTACCTCGGTGCC  1702
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1629  ATTAAATTCTAAGTTTTGGAAGCACTTAGTATATGAAATGCCCATCAAGAAAAAAGAAATGCTACCTCGGTGCC  1702

Query 1703  ATGTTCTGGACTCCGCAGAACAAGGACTTTTTGGAGAACTCCAGCCTATACCCTCTATTGCCATGACCAGTACT  1776
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1703  ATGTTCTGGACTCCGCAGAACAAGGACTTTTTGGAGAACTCCAGCCTATACCCTCTATTGCCATGACCAGTACT  1776

Query 1777  TCAGCCACTCTGGTGTCATCTCAGGCTGATCTCCCTGAATTCCACCCTTCAGATTCAATGCAAATCAGGCACTG  1850
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1777  TCAGCCACTCTGGTGTCATCTCAGGCTGATCTCCCTGAATTCCACCCTTCAGATTCAATGCAAATCAGGCACTG  1850

Query 1851  TTGCAGAGGTTATAAACATGAGATACCAGCCACGACCTTGCCAGTACCTTCCTTAGGCAACCACCATACTTATT  1924
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1851  TTGCAGAGGTTATAAACATGAGATACCAGCCACGACCTTGCCAGTACCTTCCTTAGGCAACCACCATACTTATT  1924

Query 1925  GTAACCTGCCTCTGACGCTACTCAACGGACAGCTACCCCTTAATAACACCCTGAAAGATACCCAGGAATTTCAC  1998
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1925  GTAACCTGCCTCTGACGCTACTCAACGGACAGCTACCCCTTAATAACACCCTGAAAGATACCCAGGAATTTCAC  1998

Query 1999  AGGAACAGTTCTTTGCTGCCTTTATCCTCCAAAGAGCTTAGCTTTACCAGTGATATTTGG  2058
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1999  AGGAACAGTTCTTTGCTGCCTTTATCCTCCAAAGAGCTTAGCTTTACCAGTGATATTTGG  2058