Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02962
- Subject:
- XM_011244986.2
- Aligned Length:
- 2663
- Identities:
- 2459
- Gaps:
- 16
Alignment
Query 1 ATGCCCATCTTACTGTTCCTGATAGACACGTCTGCCTCTATGAACCAGCGCAGCCATCTGGGCACCACCTACCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCCATCTTACTGTTCCTGATAGACACGTCTGCCTCTATGAACCAGCGCAGCCATCTGGGCACCACCTACCT 74
Query 75 GGACACGGCCAAAGGCGCGGTAGAGACCTTCATGAAGCTCCGTGCCCGGGACCCTGCCAGCAGAGGAGACAGGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGACACGGCCAAAGGCGCGGTAGAGACCTTCATGAAGCTCCGTGCCCGGGACCCTGCCAGCAGAGGAGACAGGT 148
Query 149 ATATGCTGGTCACTTTCGAAGAGCCGCCCTATGCTATCAAGGCTGGATGGAAAGAAAACCATGCAACGTTTATG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATATGCTGGTCACTTTCGAAGAGCCGCCCTATGCTATCAAGGCTGGATGGAAAGAAAACCATGCAACGTTTATG 222
Query 223 AATGAATTGAAAAACCTTCAGGCTGAAGGACTTACGACTCTTGGCCAATCCCTAAGGACAGCTTTTGATTTATT 296
||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 AATGAACTGAAAAACCTTCAGGCAGAAGGACTTACGACTCTTGGCCAATCCCTAAGGACAGCTTTTGATTTGTT 296
Query 297 AAATTTAAATAGATTAGTAACTGGCATAGACAACTATGGGCAGGGAAGAAACCCTTTTTTCTTGGAGCCAGCAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAATTTAAATAGATTAGTAACTGGCATAGACAACTATGGGCAGGGAAGAAACCCCTTTTTCTTGGAGCCAGCAA 370
Query 371 TAATTATCACAATTACTGATGGGAGCAAGTTGACTACCACCAGTGGAGTCCAGGATGAGCTTCATTTACCTCTT 444
||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 TAATAATTACAATCACTGATGGGAGCAAGTTGACTACTACTAGTGGTGTCCAGGATGAGCTTCATTTACCTCTG 444
Query 445 AATTCTCCTTTGCCTGGAAGTGAATTGACCAAGGAACCTTTTCGTTGGGATCAGAGACTCTTTGCATTAGTGTT 518
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|
Sbjct 445 AATTCGCCGTTGCCTGGAAGTGAATTGACCAAGGAACCTTTTCGTTGGGATCAGAGACTATTTGCTTTAGTGCT 518
Query 519 GCGGTTGCCTGGCACCATGTCAGTAGAATCAGAACAGTTGACAGGTGTGCCTTTAGATGACTCTGCAATCACAC 592
|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 519 GCGGTTGCCTGGCACCATGTCGGTGGAATCAGAACAGTTGACAGGTGTGCCTTTGGATGATTCTGCTATCACAC 592
Query 593 CAATGTGTGAAGTGACAGGCGGCCGTTCATATTCTGTGTGTTCTCCAAGAATGCTTAATCAGTGTCTGGAGTCC 666
|||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 CAATGTGTGAAGTGACAGGAGGCCGGTCATACTCTGTATGTTCTCCAAGAATGCTTAATCAGTGTCTGGAATCC 666
Query 667 TTGGTGCAGAAAGTACAAAGTGGGGTGGTAATAAACTTTGAAAAAGCAGGACCAGATCCTTCCCCTGTAGAAGA 740
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||||||..|||||
Sbjct 667 TTGGTGCAGAAAGTACAAAGTGGGGTGGTAATAAACTTTGAAAAGGCAGGACCAGATCCTCCCCCTGCTGAAGA 740
Query 741 TGGGCAGCCAGATATATCAAGGCCTTTTGGATCTCAGCCTTGGCATAGCTGTCACAAACTCATATATGTCAGAC 814
.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||
Sbjct 741 GGGGCAGCCAGATATATCAAGACCTTTTGGATCTCAGCCTTGGCATAGCTGTCACAAGCTCATATATGTCAGAC 814
Query 815 CAAATCCTAAAACTGGGGTTCCTATAGGTCATTGGCCTGTTCCAGAGTCTTTTTGGCCAGATCAAAATTCGCCA 888
||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||
Sbjct 815 CAAATCCTAAAACTGGGGTTCCTATAGGCCATTGGCCTGTTCCAGAGTCTTTTTGGCCAGATCAGAATTCTCCA 888
Query 889 ACACTACCACCTCGTACATCTCATCCTGTAGTGAAGTTTTCCTGTACAGACTGTGAACCAATGGTTATTGATAA 962
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||
Sbjct 889 ACACTACCACCTCGTACATCTCATCCTGTAGTGAAGTTTTCCTGTACAGACTGTGAGCCAATGGTTATTGACAA 962
Query 963 ACTTCCTTTTGACAAATATGAGTTGGAACCTTCACCACTGACTCAATTTATCCTGGAAAGGAAATCTCCTCAAA 1036
|.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||||||||
Sbjct 963 ATTGCCTTTTGACAAATATGAGTTGGAACCTTCACCACTGACTCAGTTTATTCTAGAAAGGAAATCTCCTCAAA 1036
Query 1037 CATGTTGGCAGGTGTACGTGAGCAATAGTGCAAAATACAGTGAACTTGGTCATCCTTTTGGTTACTTGAAAGCC 1110
|.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|.|||||||||.|||||.|||||||||||||||||.
Sbjct 1037 CGTGTTGGCAGGTGTATGTGAGCAATAGTGCAAAGTATAATGAACTTGGCCATCCCTTTGGTTACTTGAAAGCT 1110
Query 1111 AGTACAGCACTGAACTGTGTCAACTTATTTGTGATGCCTTACAATTATCCAGTCCTTCTTCCCCTCTTAGATGA 1184
|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.||||||||
Sbjct 1111 AGTACAGCACTGACCTGTGTCAACTTATTTGTGATGCCTTACAATTACCCAGTCCTCCTTCCTCTATTAGATGA 1184
Query 1185 CTTGTTTAAAGTGCATAAAGCAAAACCAACATTGAAGTGGAGACAGTCATTTGAAAGTTATTTGAAGACAATGC 1258
||||||.||||||||.||||||||||||||..||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 CTTGTTCAAAGTGCACAAAGCAAAACCAACTCTGAAATGGAGACAGTCATTTGAAAGTTATTTGAAGACAATGC 1258
Query 1259 CTCCCTACTATCTTGGGCCCTTGAAGAAAGCTGTTAGGATGATGGGAGCACCTAACCTAATAGCAGACAGTATG 1332
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||
Sbjct 1259 CTCCCTACTATCTTGGGCCCCTGAAGAAAGCTGTTAGAATGATGGGTGCACCTAATCTGATAGCAGACAGTATG 1332
Query 1333 GAATATGGACTTAGTTACAGTGTCATTTCATACCTCAAAAAACTGAGTCAACAGGCCAAAATAGAATCTGATCG 1406
||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||.|
Sbjct 1333 GAGTATGGACTCAGTTACAGTGTCATTTCATACCTCAAAAAATTGAGTCAACAGGCCAAAATTGAATCTGATAG 1406
Query 1407 AGTCATTGGATCTGTAGGCAAAAAAGTAGTACAGGAGACTGGAATAAAAGTCCGGAGCCGATCACATGGTTTAT 1480
||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.||.|
Sbjct 1407 AGTCATCGGATCCGTAGGCAAAAAAGTAGTACAGGAAACTGGAATTAAAGTCCGAAGCCGGTCACATGGGTTGT 1480
Query 1481 CAATGGCATATAGGAAAGATTTTCAACAACTCCTCCAGGGAATTTCAGAGGATGTCCCTCACAGACTGCTAGAC 1554
|||||||..|||||||||.|||| |||.|.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..||||||||
Sbjct 1481 CAATGGCGCATAGGAAAGGTTTT---CAAGTGCTGCAGGGTATTTCGGAGGATGTCCCCCACAGGTTGCTAGAC 1551
Query 1555 CTTAATATGAAGGAATACACTGGGTTCCAAGTTGCTTTGCTGAATAAGGATTTGAAGCCACAGACATTTAGAAA 1628
||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||||||||
Sbjct 1552 CTTAATATGAAGGAGTACACTGGGTTCCAGGTTGCTTTACTAAATAAGGATTTGAAGCCTCAGACCTTTAGAAA 1625
Query 1629 TGCTTATGACATACCAAGACGAAATCTTTTGGATCACTTAACAAGAATGAGATCTAATCTTTTGAAGAGCACTC 1702
.||||||||.|||||||||||.||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1626 CGCTTATGATATACCAAGACGGAACCTTCTGGATCATTTAACAAGAATGAGATCGAACCTTTTAAAGAGCACCC 1699
Query 1703 GCAGATTTCTGAAAGGACAGGACGAAGATCAAGTGCACAGTGTTCCTATAGCACAAATGGGGAACTACCAGGAA 1776
|||.||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1700 GCAAATTTCTTAAAGGCCAGGATGAAGATCAAGTGCACAGTGTACCTATAGCACAAATGGGGAATTACCAGGAA 1773
Query 1777 TACCTCAAGCAAGTACCTTCTCCACTAAGAGAACTTGATCCTGATCAGCCACGAAGGTTGCATACATTTGGCAA 1850
||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 TACCTCAAGCAAGTACCTTCTCCATTGAGAGAACTTGATCCTGATCAGCCTCGAAGGTTGCATACATTTGGCAA 1847
Query 1851 CCCCTTTAAGCTGGATAAGAAGGGTATGATGATAGATGAAGCAGATGAATTTGTGGCTGGACCTCAAAATAAAC 1924
.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||
Sbjct 1848 TCCCTTTAAACTGGATAAAAAGGGTATGATGATAGATGAAGCAGATGAATTTGTGGCTGGACCTCAGAATAAAC 1921
Query 1925 ATAAACGACCCGGAGAACCAAATATGCAAGGGATCCCTAAAAGACGTCGGTGTATGTCTCCACTACTAAGAGGC 1998
|.||.||.||.|||||.||||..||||||||||||||.||||||||.||||||...||||||||..|.||||||
Sbjct 1922 ACAAGCGGCCTGGAGAGCCAAGCATGCAAGGGATCCCAAAAAGACGCCGGTGTGCCTCTCCACTCTTGAGAGGC 1995
Query 1999 AGACAGCAGAATCCTGTTGTAAACAATCATATTGGGGGAAAAGGACCACCTGCACCTACAACTCAAGCACAGCC 2072
.||..|||||..||||.|||.||||.|||.||.||.||.|||||||||||||||||.|..||.|||||||||||
Sbjct 1996 CGAAGGCAGAGCCCTGCTGTGAACAGTCACATCGGAGGGAAAGGACCACCTGCACCCATGACGCAAGCACAGCC 2069
Query 2073 AGATCTTATTAAACCTCTTCCTCTTCATAAAATTTCAGAAACCACTAATGATTCGATAATACATGATGTGGTTG 2146
||.||||||||||||.||||||||.||||| ||||.|||||||||||||.|||.||.||||||||||||
Sbjct 2070 AGGTCTTATTAAACCCCTTCCTCTGCATAA------AGAAGCCACTAATGATTCAATAGTAGATGATGTGGTTG 2137
Query 2147 AAAATCATGTTGCAGACCAACTTTCATCAGACATTACACCAAATGCTATGGATACGGAATTTTCAGCATCTTCT 2220
|||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||.|.
Sbjct 2138 AAAATCATGTTGCTGACCAACTTTCATCAGACATGACACCAAATGCTATGGATACTGAATTTTTAACATCTCCC 2211
Query 2221 CC--AGCCAGTTTACTGGAACGGCCAACCAATCATATGGAGGCTCTTGGTCATGACCATTTAGGAACCAATGAC 2292
|| |.| ||| ||||||...||||||||||||..|||||.|||||||||||.||||||||||.|||||||
Sbjct 2212 CCTAATC---TTT--TGGAACCATCAACCAATCATACAGAGGCCCTTGGTCATGAACATTTAGGAAACAATGAC 2280
Query 2293 CTCACTGTTGGTGGATTTTTAGAAAATCATGAGGAGCCAAGAGATAAAGAACAATGTGCTGAAGAGAACATACC 2366
||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||.||||||||.|||||
Sbjct 2281 CTCACTGTTGGTGGGTTTTTAGAAAATCATGAGGAGCCAAGAAATAAAGAACAAAGTGCCGAAGAGAATATACC 2354
Query 2367 AGCATCTTCACTCAACAAAGGAAAGAAATTGATGCATTGCAGAAGCCATGAAGAGGTCAATACTGAACTAAAAG 2440
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 2355 AGCATCTTCACTCAACAAAGGAAAGAAATTGATGCATTGTAGAAGCCATGAAGAGGTCAACACTGAACTAAAAG 2428
Query 2441 CACAAATAATGAAAGAGATCCGAAAGCCAGGAAGAAAATATGAAAGAATCTTCACTTTACTGAAGCATGTGCAA 2514
||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||
Sbjct 2429 CACAAATAATGAAAGAGATCAGAAAGCCAGGAAGAAAATATGAAAGAATCTTCACCTTACTGAAGCATGTGCAA 2502
Query 2515 GGCAGTTTACAAACAAGACTAATATTTTTACAAAATGTCATTAAAGAAGCATCAAGGTTTAAAAAACGAATGCT 2588
|||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||||||||
Sbjct 2503 GGCAGTTTACAAACAAGGCTAATATTCTTACAAAATGTCATTAAGGAAGCATCCAGGTTTAAGAAACGAATGCT 2576
Query 2589 AATAGAACAACTGGAGAACTTCTTGGATGAAATTCATCGAAGAGCCAATCAGATCAACCATATTAATAGCAAT 2661
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct 2577 AATAGAACAACTGGAGAACTTCTTGGATGAAATTCATCGAAGAGCCAATCAAATCAACCATATTAATAGCAAT 2649