Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_02962
- Subject:
- XM_017315908.1
- Aligned Length:
- 2666
- Identities:
- 2459
- Gaps:
- 19
Alignment
Query 1 ATGCCCATCTTACTGTTCCTGATAGACACGTCTGCCTCTATGAACCAGCGCAGCCATCTGGGCACCACCTACCT 74
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGCCCATCTTACTGTTCCTGATAGACACGTCTGCCTCTATGAACCAGCGCAGCCATCTGGGCACCACCTACCT 74
Query 75 GGACACGGCCAAAGGCGCGGTAGAGACCTTCATGAAGCTCCGTGCCCGGGACCCTGCCAGCAGAGGAGACAGGT 148
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 75 GGACACGGCCAAAGGCGCGGTAGAGACCTTCATGAAGCTCCGTGCCCGGGACCCTGCCAGCAGAGGAGACAGGT 148
Query 149 ATATGCTGGTCACTTTCGAAGAGCCGCCCTATGCTATCAAGGCTGGATGGAAAGAAAACCATGCAACGTTTATG 222
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 149 ATATGCTGGTCACTTTCGAAGAGCCGCCCTATGCTATCAAGGCTGGATGGAAAGAAAACCATGCAACGTTTATG 222
Query 223 AATGAATTGAAAAACCTTCAGGCTGAAGGACTTACGACTCTTGGCCAATCCCTAAGGACAGCTTTTGATTTATT 296
||||||.||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 223 AATGAACTGAAAAACCTTCAGGCAGAAGGACTTACGACTCTTGGCCAATCCCTAAGGACAGCTTTTGATTTGTT 296
Query 297 AAATTTAAATAGATTAGTAACTGGCATAGACAACTATGGGCAGGGAAGAAACCCTTTTTTCTTGGAGCCAGCAA 370
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 297 AAATTTAAATAGATTAGTAACTGGCATAGACAACTATGGGCAGGGAAGAAACCCCTTTTTCTTGGAGCCAGCAA 370
Query 371 TAATTATCACAATTACTGATGGGAGCAAGTTGACTACCACCAGTGGAGTCCAGGATGAGCTTCATTTACCTCTT 444
||||.||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.||||||||||||||||||||||||||.
Sbjct 371 TAATAATTACAATCACTGATGGGAGCAAGTTGACTACTACTAGTGGTGTCCAGGATGAGCTTCATTTACCTCTG 444
Query 445 AATTCTCCTTTGCCTGGAAGTGAATTGACCAAGGAACCTTTTCGTTGGGATCAGAGACTCTTTGCATTAGTGTT 518
|||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||||.|
Sbjct 445 AATTCGCCGTTGCCTGGAAGTGAATTGACCAAGGAACCTTTTCGTTGGGATCAGAGACTATTTGCTTTAGTGCT 518
Query 519 GCGGTTGCCTGGCACCATGTCAGTAGAATCAGAACAGTTGACAGGTGTGCCTTTAGATGACTCTGCAATCACAC 592
|||||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||||
Sbjct 519 GCGGTTGCCTGGCACCATGTCGGTGGAATCAGAACAGTTGACAGGTGTGCCTTTGGATGATTCTGCTATCACAC 592
Query 593 CAATGTGTGAAGTGACAGGCGGCCGTTCATATTCTGTGTGTTCTCCAAGAATGCTTAATCAGTGTCTGGAGTCC 666
|||||||||||||||||||.|||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct 593 CAATGTGTGAAGTGACAGGAGGCCGGTCATACTCTGTATGTTCTCCAAGAATGCTTAATCAGTGTCTGGAATCC 666
Query 667 TTGGTGCAGAAAGTACAAAGTGGGGTGGTAATAAACTTTGAAAAAGCAGGACCAGATCCTTCCC---CTGTAGA 737
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||.||| |||.||.
Sbjct 667 TTGGTGCAGAAAGTACAAAGTGGGGTGGTAATAAACTTTGAAAAGGCAGGACCAGATCCTCCCCCTGCTGAAGC 740
Query 738 AGATGGGCAGCCAGATATATCAAGGCCTTTTGGATCTCAGCCTTGGCATAGCTGTCACAAACTCATATATGTCA 811
|||.||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||
Sbjct 741 AGAGGGGCAGCCAGATATATCAAGACCTTTTGGATCTCAGCCTTGGCATAGCTGTCACAAGCTCATATATGTCA 814
Query 812 GACCAAATCCTAAAACTGGGGTTCCTATAGGTCATTGGCCTGTTCCAGAGTCTTTTTGGCCAGATCAAAATTCG 885
|||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.
Sbjct 815 GACCAAATCCTAAAACTGGGGTTCCTATAGGCCATTGGCCTGTTCCAGAGTCTTTTTGGCCAGATCAGAATTCT 888
Query 886 CCAACACTACCACCTCGTACATCTCATCCTGTAGTGAAGTTTTCCTGTACAGACTGTGAACCAATGGTTATTGA 959
|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||
Sbjct 889 CCAACACTACCACCTCGTACATCTCATCCTGTAGTGAAGTTTTCCTGTACAGACTGTGAGCCAATGGTTATTGA 962
Query 960 TAAACTTCCTTTTGACAAATATGAGTTGGAACCTTCACCACTGACTCAATTTATCCTGGAAAGGAAATCTCCTC 1033
.|||.|.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||||||||||||||
Sbjct 963 CAAATTGCCTTTTGACAAATATGAGTTGGAACCTTCACCACTGACTCAGTTTATTCTAGAAAGGAAATCTCCTC 1036
Query 1034 AAACATGTTGGCAGGTGTACGTGAGCAATAGTGCAAAATACAGTGAACTTGGTCATCCTTTTGGTTACTTGAAA 1107
||||.||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.|.|||||||||.|||||.|||||||||||||||
Sbjct 1037 AAACGTGTTGGCAGGTGTATGTGAGCAATAGTGCAAAGTATAATGAACTTGGCCATCCCTTTGGTTACTTGAAA 1110
Query 1108 GCCAGTACAGCACTGAACTGTGTCAACTTATTTGTGATGCCTTACAATTATCCAGTCCTTCTTCCCCTCTTAGA 1181
||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||.|||||.||.|||||
Sbjct 1111 GCTAGTACAGCACTGACCTGTGTCAACTTATTTGTGATGCCTTACAATTACCCAGTCCTCCTTCCTCTATTAGA 1184
Query 1182 TGACTTGTTTAAAGTGCATAAAGCAAAACCAACATTGAAGTGGAGACAGTCATTTGAAAGTTATTTGAAGACAA 1255
|||||||||.||||||||.||||||||||||||..||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1185 TGACTTGTTCAAAGTGCACAAAGCAAAACCAACTCTGAAATGGAGACAGTCATTTGAAAGTTATTTGAAGACAA 1258
Query 1256 TGCCTCCCTACTATCTTGGGCCCTTGAAGAAAGCTGTTAGGATGATGGGAGCACCTAACCTAATAGCAGACAGT 1329
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||.||||||||||||
Sbjct 1259 TGCCTCCCTACTATCTTGGGCCCCTGAAGAAAGCTGTTAGAATGATGGGTGCACCTAATCTGATAGCAGACAGT 1332
Query 1330 ATGGAATATGGACTTAGTTACAGTGTCATTTCATACCTCAAAAAACTGAGTCAACAGGCCAAAATAGAATCTGA 1403
|||||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||.||||||||
Sbjct 1333 ATGGAGTATGGACTCAGTTACAGTGTCATTTCATACCTCAAAAAATTGAGTCAACAGGCCAAAATTGAATCTGA 1406
Query 1404 TCGAGTCATTGGATCTGTAGGCAAAAAAGTAGTACAGGAGACTGGAATAAAAGTCCGGAGCCGATCACATGGTT 1477
|.|||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||.||||||||.||||||||.|||||.||||||||.|
Sbjct 1407 TAGAGTCATCGGATCCGTAGGCAAAAAAGTAGTACAGGAAACTGGAATTAAAGTCCGAAGCCGGTCACATGGGT 1480
Query 1478 TATCAATGGCATATAGGAAAGATTTTCAACAACTCCTCCAGGGAATTTCAGAGGATGTCCCTCACAGACTGCTA 1551
|.||||||||..|||||||||.|||| |||.|.||.|||||.|||||.|||||||||||.|||||..|||||
Sbjct 1481 TGTCAATGGCGCATAGGAAAGGTTTT---CAAGTGCTGCAGGGTATTTCGGAGGATGTCCCCCACAGGTTGCTA 1551
Query 1552 GACCTTAATATGAAGGAATACACTGGGTTCCAAGTTGCTTTGCTGAATAAGGATTTGAAGCCACAGACATTTAG 1625
|||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||.|||||
Sbjct 1552 GACCTTAATATGAAGGAGTACACTGGGTTCCAGGTTGCTTTACTAAATAAGGATTTGAAGCCTCAGACCTTTAG 1625
Query 1626 AAATGCTTATGACATACCAAGACGAAATCTTTTGGATCACTTAACAAGAATGAGATCTAATCTTTTGAAGAGCA 1699
|||.||||||||.|||||||||||.||.|||.|||||||.|||||||||||||||||.||.|||||.|||||||
Sbjct 1626 AAACGCTTATGATATACCAAGACGGAACCTTCTGGATCATTTAACAAGAATGAGATCGAACCTTTTAAAGAGCA 1699
Query 1700 CTCGCAGATTTCTGAAAGGACAGGACGAAGATCAAGTGCACAGTGTTCCTATAGCACAAATGGGGAACTACCAG 1773
|.||||.||||||.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||
Sbjct 1700 CCCGCAAATTTCTTAAAGGCCAGGATGAAGATCAAGTGCACAGTGTACCTATAGCACAAATGGGGAATTACCAG 1773
Query 1774 GAATACCTCAAGCAAGTACCTTCTCCACTAAGAGAACTTGATCCTGATCAGCCACGAAGGTTGCATACATTTGG 1847
|||||||||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||
Sbjct 1774 GAATACCTCAAGCAAGTACCTTCTCCATTGAGAGAACTTGATCCTGATCAGCCTCGAAGGTTGCATACATTTGG 1847
Query 1848 CAACCCCTTTAAGCTGGATAAGAAGGGTATGATGATAGATGAAGCAGATGAATTTGTGGCTGGACCTCAAAATA 1921
|||.||||||||.||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||
Sbjct 1848 CAATCCCTTTAAACTGGATAAAAAGGGTATGATGATAGATGAAGCAGATGAATTTGTGGCTGGACCTCAGAATA 1921
Query 1922 AACATAAACGACCCGGAGAACCAAATATGCAAGGGATCCCTAAAAGACGTCGGTGTATGTCTCCACTACTAAGA 1995
||||.||.||.||.|||||.||||..||||||||||||||.||||||||.||||||...||||||||..|.|||
Sbjct 1922 AACACAAGCGGCCTGGAGAGCCAAGCATGCAAGGGATCCCAAAAAGACGCCGGTGTGCCTCTCCACTCTTGAGA 1995
Query 1996 GGCAGACAGCAGAATCCTGTTGTAAACAATCATATTGGGGGAAAAGGACCACCTGCACCTACAACTCAAGCACA 2069
|||.||..|||||..||||.|||.||||.|||.||.||.||.|||||||||||||||||.|..||.||||||||
Sbjct 1996 GGCCGAAGGCAGAGCCCTGCTGTGAACAGTCACATCGGAGGGAAAGGACCACCTGCACCCATGACGCAAGCACA 2069
Query 2070 GCCAGATCTTATTAAACCTCTTCCTCTTCATAAAATTTCAGAAACCACTAATGATTCGATAATACATGATGTGG 2143
|||||.||||||||||||.||||||||.||||| ||||.|||||||||||||.|||.||.|||||||||
Sbjct 2070 GCCAGGTCTTATTAAACCCCTTCCTCTGCATAA------AGAAGCCACTAATGATTCAATAGTAGATGATGTGG 2137
Query 2144 TTGAAAATCATGTTGCAGACCAACTTTCATCAGACATTACACCAAATGCTATGGATACGGAATTTTCAGCATCT 2217
||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||||.|.|||||
Sbjct 2138 TTGAAAATCATGTTGCTGACCAACTTTCATCAGACATGACACCAAATGCTATGGATACTGAATTTTTAACATCT 2211
Query 2218 TCTCC--AGCCAGTTTACTGGAACGGCCAACCAATCATATGGAGGCTCTTGGTCATGACCATTTAGGAACCAAT 2289
.|.|| |.| ||| ||||||...||||||||||||..|||||.|||||||||||.||||||||||.||||
Sbjct 2212 CCCCCTAATC---TTT--TGGAACCATCAACCAATCATACAGAGGCCCTTGGTCATGAACATTTAGGAAACAAT 2280
Query 2290 GACCTCACTGTTGGTGGATTTTTAGAAAATCATGAGGAGCCAAGAGATAAAGAACAATGTGCTGAAGAGAACAT 2363
|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||.||||.||||||||.||
Sbjct 2281 GACCTCACTGTTGGTGGGTTTTTAGAAAATCATGAGGAGCCAAGAAATAAAGAACAAAGTGCCGAAGAGAATAT 2354
Query 2364 ACCAGCATCTTCACTCAACAAAGGAAAGAAATTGATGCATTGCAGAAGCCATGAAGAGGTCAATACTGAACTAA 2437
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.||||||||||
Sbjct 2355 ACCAGCATCTTCACTCAACAAAGGAAAGAAATTGATGCATTGTAGAAGCCATGAAGAGGTCAACACTGAACTAA 2428
Query 2438 AAGCACAAATAATGAAAGAGATCCGAAAGCCAGGAAGAAAATATGAAAGAATCTTCACTTTACTGAAGCATGTG 2511
|||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||
Sbjct 2429 AAGCACAAATAATGAAAGAGATCAGAAAGCCAGGAAGAAAATATGAAAGAATCTTCACCTTACTGAAGCATGTG 2502
Query 2512 CAAGGCAGTTTACAAACAAGACTAATATTTTTACAAAATGTCATTAAAGAAGCATCAAGGTTTAAAAAACGAAT 2585
||||||||||||||||||||.||||||||.|||||||||||||||||.||||||||.||||||||.||||||||
Sbjct 2503 CAAGGCAGTTTACAAACAAGGCTAATATTCTTACAAAATGTCATTAAGGAAGCATCCAGGTTTAAGAAACGAAT 2576
Query 2586 GCTAATAGAACAACTGGAGAACTTCTTGGATGAAATTCATCGAAGAGCCAATCAGATCAACCATATTAATAGCA 2659
||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||
Sbjct 2577 GCTAATAGAACAACTGGAGAACTTCTTGGATGAAATTCATCGAAGAGCCAATCAAATCAACCATATTAATAGCA 2650
Query 2660 AT 2661
||
Sbjct 2651 AT 2652