Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03028
• Subject: NM_001162536.3
• Aligned Length: 1173
• Identities: 1138
• Gaps: 3

Alignment

Query    1  ATGGTTGAAGCAGATCGCCCAGGAAAGCTCTTCATTGGTGGGCTTAATACGGAAACAAATGAGAAAGCTCTTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTGAAGCAGATCGCCCAGGAAAGCTCTTCATTGGTGGGCTTAATACGGAAACAAATGAGAAAGCTCTTGA  74

Query   75  AGCAGTATTTGGCAAATATGGACGAATAGTGGAAGTACTCTTGATGAAAGACCGTGAAACCAACAAATCAAGAG  148
            |.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AACAGTATTTGGCAAATATGGACGAATAGTGGAAGTACTCTTGATAAAAGACCGTGAAACCAACAAATCAAGAG  148

Query  149  GATTTGCTTTTGTCACCTTTGAAAGCCCAGCAGACGCTAAGGATGCAGCCAGAGACATGAATGGAAAGTCATTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GATTTGCTTTTGTCACCTTTGAAAGCCCAGCAGACGCTAAGGATGCAGCCAGAGACATGAATGGAAAGTCATTA  222

Query  223  GATGGAAAAGCCATCAAGGTGGAACAAGCCACCAAACCATCATTTGAAAGTGGTAGACGTGGACCGCCTCCACC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||.|||||||||.|||||
Sbjct  223  GATGGAAAAGCCATCAAGGTGGAACAAGCCACCAAACCATCATTTGAAAGAGGTAGACATGGACCGCCCCCACC  296

Query  297  TCCAAGAAGTAGAGGCCCTCCAAGAGGTCTTAGAGGTGGAAGAGGAGGAAGTGGAGGAACCAGGGGACCTCCCT  370
            |||||||||||||||.||||||||||||.||.|||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  297  TCCAAGAAGTAGAGGTCCTCCAAGAGGTTTTGGAGCTGGAAGAGGAGGAAGTGGAGGAACCAGGGGACCTCCTT  370

Query  371  CACGGGGAGGACACATGGATGACGGTGGATATTCCATGAATTTTAACATGAGTTCTTCCAGGGGACCACTCCCA  444
            ||||.|||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACGAGGAGGACACATGGATGATGGTGGATATTCCATGAATTTTAACATGAGTTCTTCCAGGGGACCACTCCCA  444

Query  445  GTAAAAAGAGGACCACCACCAAGAAGTGGGGGTCCTCCTCCTAAGAGATCTGCACCTTCAGGACCAGTTCGCAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct  445  GTAAAAAGAGGACCACCACCAAGAAGTGGGGGTCCTTCTCCTAAGAGATCTGCACCTTCAGGACTAGTTCGCAG  518

Query  519  TAGCAGTGGAATGGGAGGAAGAGCTCCTGTATCACGTGGAAGAGATAGTTATGGAGGTCCACCTCGAAGGGAAC  592
            .|||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  CAGCAGTGGAATGGGAGGAAGAGCTCCTCTATCACGTGGAAGAGATAGTTATGGAGGTCCACCTCGAAGGGAAC  592

Query  593  CGCTGCCCTCTCGTAGAGATGTTTATTTGTCCCCAAGAGATGATGGGTATTCTACTAAAGACAGCTATTCAAGC  666
            ||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGCTCCCCTCTCGTAGAGATGTTTATTTGTCCCCAAGAGATGATGGGTATTCTACTAAAGACAGCTATTCAAGC  666

Query  667  AGAGATTACCCAAGTTCTCGTGATACTAGAGATTATGCACCACCACCACGAGATTATACTTACCGTGATTATGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAGATTACCCAAGTTCTCGTGATACAAGAGATTATGCACCACCACCACGAGATTATACTTACCGTGATTATGG  740

Query  741  TCATTCCAGTTCACGTGATGACTATCCATCAAGAGGATATAGCGATAGAGATGGATATGGTCGTGATCGTGACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|||.|||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCATTCCAGTTCACGTGATGACTATCCATCAAGAGGCTATGGCGATAGAGATGGATATGGTCGTGATCGTGACT  814

Query  815  ATTCAGATCATCCAAGTGGAGGTTCCTACAGAGATTCATATGAGAGTTATGGTAACTCACGTAGTGCTCCACCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.|
Sbjct  815  ATTCAGATCATCCAAGTGGAGGTTCCTACAGAGATTCATATGAGAGTTATGGTAACTCACGTAGTGCTCCACTT  888

Query  889  ACACGAGGGCCCCCGCCATCTTATGGTGGAAGCAGTCGCTATGATGATTACAGCAGCTCACGTGACGGATATGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||.||||||||
Sbjct  889  ACACGAGGGCCCCCGCCATCTTATGGTGGAAGCAGTCGCTATGATGATTATAGCAGCTCACGTGATGGATATGG  962

Query  963  TGGAAGTCGAGACAGTTACTCAAGCAGCCGAAGTGATCTCTACTCAAGTGGTCGTGATCGGGTTGGCAGACAAG  1036
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||   ||.||||..|||||||||||||||
Sbjct  963  TGGAAGTCGAGACAGTTACTCAAGCAGCCGAAGTGATCTCTACTCAA---GTTGTGACAGGGTTGGCAGACAAG  1033

Query 1037  AAAGAGGGCTTCCCCCTTCTATGGAAAGGGGGTACCCTCCTCCACGTGATTCCTACAGCAGTTCAAGCCGCGGA  1110
            ||||||||||||||||||||.|.|||||||||||||||.||.||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1034  AAAGAGGGCTTCCCCCTTCTGTAGAAAGGGGGTACCCTTCTTCACGTGATTCCTACAGCAGTTCAAGCCGCGGA  1107

Query 1111  GCACCAAGAGGTGGTGGCCGTGGAGGAAGCCGATCTGATAGAGGGGGAGGCAGAAGCAGATAC  1173
            |||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1108  GCACCAAGAGGTGCTGGCCCTGGAGGAAGCCGATCTGATAGAGGGGGAGGCAGAAGCAGATAC  1170