Nucleotide Global Alignment

Description

Query:
ccsbBroad304_03028
Subject:
NM_002139.4
Aligned Length:
1173
Identities:
1173
Gaps:
0

Alignment

Query    1  ATGGTTGAAGCAGATCGCCCAGGAAAGCTCTTCATTGGTGGGCTTAATACGGAAACAAATGAGAAAGCTCTTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGTTGAAGCAGATCGCCCAGGAAAGCTCTTCATTGGTGGGCTTAATACGGAAACAAATGAGAAAGCTCTTGA  74

Query   75  AGCAGTATTTGGCAAATATGGACGAATAGTGGAAGTACTCTTGATGAAAGACCGTGAAACCAACAAATCAAGAG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  AGCAGTATTTGGCAAATATGGACGAATAGTGGAAGTACTCTTGATGAAAGACCGTGAAACCAACAAATCAAGAG  148

Query  149  GATTTGCTTTTGTCACCTTTGAAAGCCCAGCAGACGCTAAGGATGCAGCCAGAGACATGAATGGAAAGTCATTA  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  GATTTGCTTTTGTCACCTTTGAAAGCCCAGCAGACGCTAAGGATGCAGCCAGAGACATGAATGGAAAGTCATTA  222

Query  223  GATGGAAAAGCCATCAAGGTGGAACAAGCCACCAAACCATCATTTGAAAGTGGTAGACGTGGACCGCCTCCACC  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  GATGGAAAAGCCATCAAGGTGGAACAAGCCACCAAACCATCATTTGAAAGTGGTAGACGTGGACCGCCTCCACC  296

Query  297  TCCAAGAAGTAGAGGCCCTCCAAGAGGTCTTAGAGGTGGAAGAGGAGGAAGTGGAGGAACCAGGGGACCTCCCT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  TCCAAGAAGTAGAGGCCCTCCAAGAGGTCTTAGAGGTGGAAGAGGAGGAAGTGGAGGAACCAGGGGACCTCCCT  370

Query  371  CACGGGGAGGACACATGGATGACGGTGGATATTCCATGAATTTTAACATGAGTTCTTCCAGGGGACCACTCCCA  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  CACGGGGAGGACACATGGATGACGGTGGATATTCCATGAATTTTAACATGAGTTCTTCCAGGGGACCACTCCCA  444

Query  445  GTAAAAAGAGGACCACCACCAAGAAGTGGGGGTCCTCCTCCTAAGAGATCTGCACCTTCAGGACCAGTTCGCAG  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  445  GTAAAAAGAGGACCACCACCAAGAAGTGGGGGTCCTCCTCCTAAGAGATCTGCACCTTCAGGACCAGTTCGCAG  518

Query  519  TAGCAGTGGAATGGGAGGAAGAGCTCCTGTATCACGTGGAAGAGATAGTTATGGAGGTCCACCTCGAAGGGAAC  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  519  TAGCAGTGGAATGGGAGGAAGAGCTCCTGTATCACGTGGAAGAGATAGTTATGGAGGTCCACCTCGAAGGGAAC  592

Query  593  CGCTGCCCTCTCGTAGAGATGTTTATTTGTCCCCAAGAGATGATGGGTATTCTACTAAAGACAGCTATTCAAGC  666
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CGCTGCCCTCTCGTAGAGATGTTTATTTGTCCCCAAGAGATGATGGGTATTCTACTAAAGACAGCTATTCAAGC  666

Query  667  AGAGATTACCCAAGTTCTCGTGATACTAGAGATTATGCACCACCACCACGAGATTATACTTACCGTGATTATGG  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAGATTACCCAAGTTCTCGTGATACTAGAGATTATGCACCACCACCACGAGATTATACTTACCGTGATTATGG  740

Query  741  TCATTCCAGTTCACGTGATGACTATCCATCAAGAGGATATAGCGATAGAGATGGATATGGTCGTGATCGTGACT  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  741  TCATTCCAGTTCACGTGATGACTATCCATCAAGAGGATATAGCGATAGAGATGGATATGGTCGTGATCGTGACT  814

Query  815  ATTCAGATCATCCAAGTGGAGGTTCCTACAGAGATTCATATGAGAGTTATGGTAACTCACGTAGTGCTCCACCT  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATTCAGATCATCCAAGTGGAGGTTCCTACAGAGATTCATATGAGAGTTATGGTAACTCACGTAGTGCTCCACCT  888

Query  889  ACACGAGGGCCCCCGCCATCTTATGGTGGAAGCAGTCGCTATGATGATTACAGCAGCTCACGTGACGGATATGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACACGAGGGCCCCCGCCATCTTATGGTGGAAGCAGTCGCTATGATGATTACAGCAGCTCACGTGACGGATATGG  962

Query  963  TGGAAGTCGAGACAGTTACTCAAGCAGCCGAAGTGATCTCTACTCAAGTGGTCGTGATCGGGTTGGCAGACAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  963  TGGAAGTCGAGACAGTTACTCAAGCAGCCGAAGTGATCTCTACTCAAGTGGTCGTGATCGGGTTGGCAGACAAG  1036

Query 1037  AAAGAGGGCTTCCCCCTTCTATGGAAAGGGGGTACCCTCCTCCACGTGATTCCTACAGCAGTTCAAGCCGCGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAAGAGGGCTTCCCCCTTCTATGGAAAGGGGGTACCCTCCTCCACGTGATTCCTACAGCAGTTCAAGCCGCGGA  1110

Query 1111  GCACCAAGAGGTGGTGGCCGTGGAGGAAGCCGATCTGATAGAGGGGGAGGCAGAAGCAGATAC  1173
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCACCAAGAGGTGGTGGCCGTGGAGGAAGCCGATCTGATAGAGGGGGAGGCAGAAGCAGATAC  1173