Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03028
• Subject: NM_011252.4
• Aligned Length: 1173
• Identities: 1095
• Gaps: 0

Alignment

Query    1  ATGGTTGAAGCAGATCGCCCAGGAAAGCTCTTCATTGGTGGGCTTAATACGGAAACAAATGAGAAAGCTCTTGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||||||.|||||
Sbjct    1  ATGGTTGAAGCAGATCGCCCAGGAAAGCTCTTTATTGGTGGGCTTAATACAGAGACGAATGAGAAAGCCCTTGA  74

Query   75  AGCAGTATTTGGCAAATATGGACGAATAGTGGAAGTACTCTTGATGAAAGACCGTGAAACCAACAAATCAAGAG  148
            .|||||.|||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||.|||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct   75  GGCAGTGTTTGGCAAATATGGACGAATAGTGGAAGTTCTTTTGATGAAGGACCGAGAAACGAATAAGTCAAGAG  148

Query  149  GATTTGCTTTTGTCACCTTTGAAAGCCCAGCAGACGCTAAGGATGCAGCCAGAGACATGAATGGAAAGTCATTA  222
            ||||.|||||||||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||||||||||||||||||||||.|||
Sbjct  149  GATTCGCTTTTGTCACTTTTGAAAGCCCAGCAGATGCAAAGGATGCTGCCAGAGACATGAATGGAAAGTCCTTA  222

Query  223  GATGGAAAAGCCATCAAGGTGGAACAAGCCACCAAACCATCATTTGAAAGTGGTAGACGTGGACCGCCTCCACC  296
            |||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||..||.|||||
Sbjct  223  GATGGGAAAGCCATCAAGGTGGAGCAAGCCACCAAACCATCATTTGAAAGTGGTAGACGTGGACTACCCCCACC  296

Query  297  TCCAAGAAGTAGAGGCCCTCCAAGAGGTCTTAGAGGTGGAAGAGGAGGAAGTGGAGGAACCAGGGGACCTCCCT  370
            |||||||||.|||||||||||.|||||||||.||||.||||||||||||||||||||||||||.|||||.||||
Sbjct  297  TCCAAGAAGCAGAGGCCCTCCCAGAGGTCTTCGAGGAGGAAGAGGAGGAAGTGGAGGAACCAGAGGACCCCCCT  370

Query  371  CACGGGGAGGACACATGGATGACGGTGGATATTCCATGAATTTTAACATGAGTTCTTCCAGGGGACCACTCCCA  444
            |.||||||||||||||||||||.|||||.||.|||||||||||||.|||||||||||||||.|||||.||.|||
Sbjct  371  CCCGGGGAGGACACATGGATGATGGTGGCTACTCCATGAATTTTACCATGAGTTCTTCCAGAGGACCTCTGCCA  444

Query  445  GTAAAAAGAGGACCACCACCAAGAAGTGGGGGTCCTCCTCCTAAGAGATCTGCACCTTCAGGACCAGTTCGCAG  518
            ||||||.||||||||||||||.|||||||.||||||||||||||.|||||.||||||||.|||||||||||.||
Sbjct  445  GTAAAACGAGGACCACCACCACGAAGTGGAGGTCCTCCTCCTAAAAGATCAGCACCTTCTGGACCAGTTCGTAG  518

Query  519  TAGCAGTGGAATGGGAGGAAGAGCTCCTGTATCACGTGGAAGAGATAGTTATGGAGGTCCACCTCGAAGGGAAC  592
            .|||||||||.|||||||||||||.|||||.||.||||||||||||.||||.|||||.||.||.||||||||.|
Sbjct  519  CAGCAGTGGACTGGGAGGAAGAGCCCCTGTGTCCCGTGGAAGAGATGGTTACGGAGGCCCGCCACGAAGGGAGC  592

Query  593  CGCTGCCCTCTCGTAGAGATGTTTATTTGTCCCCAAGAGATGATGGGTATTCTACTAAAGACAGCTATTCAAGC  666
            |.|||||.|||||.||||||||||||||||||||.|||||||||||.|||||.|||||||||||||||||||||
Sbjct  593  CCCTGCCTTCTCGAAGAGATGTTTATTTGTCCCCGAGAGATGATGGATATTCCACTAAAGACAGCTATTCAAGC  666

Query  667  AGAGATTACCCAAGTTCTCGTGATACTAGAGATTATGCACCACCACCACGAGATTATACTTACCGTGATTATGG  740
            |||||.||.|||||||||||.|||||..||||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||
Sbjct  667  AGAGAATATCCAAGTTCTCGAGATACACGAGATTATGCACCACCACCAAGAGATTATACTTACCGTGATTATGG  740

Query  741  TCATTCCAGTTCACGTGATGACTATCCATCAAGAGGATATAGCGATAGAGATGGATATGGTCGTGATCGTGACT  814
            |||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|||||.|||||||||||.||||||||.|||||.||||
Sbjct  741  TCATTCCAGTTCACGAGATGACTATCCATCAAGAGGCTATAGTGATAGAGATGGCTATGGTCGGGATCGGGACT  814

Query  815  ATTCAGATCATCCAAGTGGAGGTTCCTACAGAGATTCATATGAGAGTTATGGTAACTCACGTAGTGCTCCACCT  888
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  815  ATTCAGATCATCCAAGTGGAGGTTCCTACAGAGATTCGTATGAGAGTTATGGTAACTCACGTAGTGCTCCACCT  888

Query  889  ACACGAGGGCCCCCGCCATCTTATGGTGGAAGCAGTCGCTATGATGATTACAGCAGCTCACGTGACGGATATGG  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  889  ACACGAGGGCCCCCGCCATCTTATGGTGGAAGCAGTCGCTATGATGATTACAGCAGCTCACGTGACGGATATGG  962

Query  963  TGGAAGTCGAGACAGTTACTCAAGCAGCCGAAGTGATCTCTACTCAAGTGGTCGTGATCGGGTTGGCAGACAAG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||.||.||||||||||
Sbjct  963  TGGAAGTCGAGACAGTTACTCAAGCAGCCGAAGTGATCTCTACTCAAGTGGTCGTGATCGCGTGGGCAGACAAG  1036

Query 1037  AAAGAGGGCTTCCCCCTTCTATGGAAAGGGGGTACCCTCCTCCACGTGATTCCTACAGCAGTTCAAGCCGCGGA  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1037  AAAGAGGGCTTCCCCCTTCTATGGAAAGGGGGTACCCTCCTCCACGTGATTCCTACAGCAGTTCAAGCCGCGGA  1110

Query 1111  GCACCAAGAGGTGGTGGCCGTGGAGGAAGCCGATCTGATAGAGGGGGAGGCAGAAGCAGATAC  1173
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1111  GCACCAAGAGGTGGTGGCCGTGGAGGAAGCCGATCTGATAGAGGGGGAGGCAGAAGCAGATAC  1173