Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03039
• Subject: XM_024452224.1
• Aligned Length: 2382
• Identities: 2103
• Gaps: 279

Alignment

Query    1  ATGTCAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAGCATATGGCCCCAGGAGATCTT  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGTCAGGAAGCCATACACCTGCCTGTGGCCCTTTCTCAGCCCTGACTCCGAGCATATGGCCCCAGGAGATCTT  74

Query   75  GGCCAAGTACACGCAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATGAGTTTGGTTTCCGTGTGT  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCCAAGTACACGCAGAAGGAAGAGTCAGCAGAGCAACCAGAGTTCTACTACGATGAGTTTGGTTTCCGTGTGT  148

Query  149  ACAAGGAAGAAGGTGATGAGCCTGGCTCCAGTCTGCTGGCGAACTCCCCTCTGATGGAGGATGCTCCACAGAGG  222
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  149  ACAAGGAAGAAGGTGATGAGCCTGGCTCCAGTCTGCTGGCGAACTCCCCTCTGATGGAGGATGCTCCACAGAGG  222

Query  223  CTGCGGTGGCAGGCCCACCTGGAGTTCACCCATAACCACGATGTGGGGGATCTCACCTGGGACAAGATTGCCGT  296
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  223  CTGCGGTGGCAGGCCCACCTGGAGTTCACCCATAACCACGATGTGGGGGATCTCACCTGGGACAAGATTGCCGT  296

Query  297  CTCCCTACCCCGCTCTGAGAAGCTCCGCTCCCTGGTGCTGGCCGGCATCCCACATGGCATGAGGCCACAGCTGT  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  297  CTCCCTACCCCGCTCTGAGAAGCTCCGCTCCCTGGTGCTGGCCGGCATCCCACATGGCATGAGGCCACAGCTGT  370

Query  371  GGATGCGGCTCTCTGGGGCCCTGCAGAAGAAGAGGAACTCTGAGCTGTCCTACCGCGAGATTGTGAAGAACAGC  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  371  GGATGCGGCTCTCTGGGGCCCTGCAGAAGAAGAGGAACTCTGAGCTGTCCTACCGCGAGATTGTGAAGAACAGC  444

Query  445  TCCAACGATGAGACCATCGCTGCCAAGCAGATCGAGAAGGACCTGCTCCGCACCATGCCCAGCAACGCCTGCTT  518
            |||||||||||||||||||||||||||||                                             
Sbjct  445  TCCAACGATGAGACCATCGCTGCCAAGCA---------------------------------------------  473

Query  519  CGCCAGCATGGGTAGCATCGGGGTGCCCCGCCTGCGCAGGGTGCTCCGGGCCCTGGCCTGGCTCTACCCAGAGA  592
                                                                                      
Sbjct  474  --------------------------------------------------------------------------  473

Query  593  TCGGCTACTGCCAGGGCACCGGCATGGTGGCCGCCTGCCTCCTGCTGTTCCTGGAGGAGGAGGACGCCTTCTGG  666
                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  474  -------------------------GGTGGCCGCCTGCCTCCTGCTGTTCCTGGAGGAGGAGGACGCCTTCTGG  522

Query  667  ATGATGTCTGCCATCATCGAGGACCTGCTCCCCGCCTCCTACTTCAGCACCACCCTGCTGGGTGTCCAGACTGA  740
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  523  ATGATGTCTGCCATCATCGAGGACCTGCTCCCCGCCTCCTACTTCAGCACCACCCTGCTGGGTGTCCAGACTGA  596

Query  741  CCAGCGGGTCCTGCGCCACCTCATTGTCCAGTACCTGCCTCGCCTGGACAAGCTGCTCCAGGAGCATGACATTG  814
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  597  CCAGCGGGTCCTGCGCCACCTCATTGTCCAGTACCTGCCTCGCCTGGACAAGCTGCTCCAGGAGCATGACATTG  670

Query  815  AGCTGTCCCTGATCACACTGCACTGGTTCCTCACGGCCTTCGCCAGCGTGGTGGACATCAAGCTGCTCCTGCGC  888
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  671  AGCTGTCCCTGATCACACTGCACTGGTTCCTCACGGCCTTCGCCAGCGTGGTGGACATCAAGCTGCTCCTGCGC  744

Query  889  ATCTGGGACCTGTTTTTCTACGAGGGCTCCCGGGTGCTGTTCCAGCTCACGCTGGGCATGCTGCACCTCAAGGA  962
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  745  ATCTGGGACCTGTTTTTCTACGAGGGCTCCCGGGTGCTGTTCCAGCTCACGCTGGGCATGCTGCACCTCAAGGA  818

Query  963  GGAAGAGCTGATCCAGTCAGAGAACTCGGCCTCCATCTTCAACACGCTATCGGATATCCCGTCGCAGATGGAGG  1036
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  819  GGAAGAGCTGATCCAGTCAGAGAACTCGGCCTCCATCTTCAACACGCTATCGGATATCCCGTCGCAGATGGAGG  892

Query 1037  ACGCGGAGCTGCTTCTGGGGGTGGCCATGCGGCTGGCCGGCTCCCTCACCGATGTGGCCGTGGAGACTCAGCGC  1110
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  893  ACGCGGAGCTGCTTCTGGGGGTGGCCATGCGGCTGGCCGGCTCCCTCACCGATGTGGCCGTGGAGACTCAGCGC  966

Query 1111  CGCAAGCACCTGGCCTATCTCATTGCAGACCAGGGCCAGCTCCTGGGGGCCGGCACCCTCACCAACCTCTCTCA  1184
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  967  CGCAAGCACCTGGCCTATCTCATTGCAGACCAGGGCCAGCTCCTGGGGGCCGGCACCCTCACCAACCTCTCTCA  1040

Query 1185  GGTTGTTCGCCGCAGGACCCAGCGGAGGAAGTCCACCATCACTGCTCTGCTCTTCGGGGAGGATGACCTGGAGG  1258
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1041  GGTTGTTCGCCGCAGGACCCAGCGGAGGAAGTCCACCATCACTGCTCTGCTCTTCGGGGAGGATGACCTGGAGG  1114

Query 1259  CACTCAAGGCCAAGAACATCAAGCAGACGGAACTGGTGGCTGACCTCCGGGAAGCCATCCTGCGCGTGGCACGC  1332
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1115  CACTCAAGGCCAAGAACATCAAGCAGACGGAACTGGTGGCTGACCTCCGGGAAGCCATCCTGCGCGTGGCACGC  1188

Query 1333  CACTTCCAGTGCACAGACCCCAAAAACTGCAGCGT---------------------------------------  1367
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||                                       
Sbjct 1189  CACTTCCAGTGCACAGACCCCAAAAACTGCAGCGTGGTGAGTCGCCAGCTCCCTGGGCTGCTACCAAACACGGC  1262

Query 1368  ---------------------------------------------GGAGCTGACTCCAGACTATAGCATGGAGA  1396
                                                         |||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1263  CCTAACTCCTCCAACCCCCTTGGTGGGCCTGTGTTCACTGTGGCAGGAGCTGACTCCAGACTATAGCATGGAGA  1336

Query 1397  GCCACCAGCGGGACCACGAGAACTACGTGGCGTGCTCACGCAGCCACCGGCGCCGAGCCAAGGCCCTGCTGGAC  1470
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1337  GCCACCAGCGGGACCACGAGAACTACGTGGCGTGCTCACGCAGCCACCGGCGCCGAGCCAAGGCCCTGCTGGAC  1410

Query 1471  TTTGAGCGGCACGACGACGACGAGCTGGGCTTCCGCAAGAACGACATCATCACAATCGTGTCTCAGAAGGACGA  1544
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1411  TTTGAGCGGCACGACGACGACGAGCTGGGCTTCCGCAAGAACGACATCATCACAATCGTGTCTCAGAAGGACGA  1484

Query 1545  GCACTGCTGGGTGGGGGAGCTCAACGGCCTGCGAGGCTGGTTTCCAGCCAAGTTCGTGGAAGTCCTGGATGAGC  1618
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1485  GCACTGCTGGGTGGGGGAGCTCAACGGCCTGCGAGGCTGGTTTCCAGCCAAGTTCGTGGAAGTCCTGGATGAGC  1558

Query 1619  GCAGCAAAGAGTACTCCATCGCGGGGGATGACTCGGTGACGGAGGGGGTCACAGACCTCGTGCGAGGGACCCTC  1692
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1559  GCAGCAAAGAGTACTCCATCGCGGGGGATGACTCGGTGACGGAGGGGGTCACAGACCTCGTGCGAGGGACCCTC  1632

Query 1693  TGCCCGGCCCTTAAGGCCCTGTTCGAACATGGACTGAAGAAGCCATCCCTGCTTGGGGGCGCCTGCCACCCCTG  1766
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1633  TGCCCGGCCCTTAAGGCCCTGTTCGAACATGGACTGAAGAAGCCATCCCTGCTTGGGGGCGCCTGCCACCCCTG  1706

Query 1767  GCTGTTTATCGAGGAGGCTGCAGGCCGGGAGGTCGAGAGAGACTTTGCCTCCGTGTATTCCCGTCTGGTGCTCT  1840
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1707  GCTGTTTATCGAGGAGGCTGCAGGCCGGGAGGTCGAGAGAGACTTTGCCTCCGTGTATTCCCGTCTGGTGCTCT  1780

Query 1841  GTAAGACCTTCAGGTTGGATGAAGATGGCAAAGTCCTGACCCCGGAGGAGCTGCTCTACCGGGCTGTGCAGTCT  1914
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1781  GTAAGACCTTCAGGTTGGATGAAGATGGCAAAGTCCTGACCCCGGAGGAGCTGCTCTACCGGGCTGTGCAGTCT  1854

Query 1915  GTGAACGTGACCCACGATGCAGTGCATGCACAAATGGATGTGAAGCTCCGCTCACTGATCTGCGTGGGGCTCAA  1988
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 1855  GTGAACGTGACCCACGATGCAGTGCATGCACAAATGGATGTGAAGCTCCGCTCACTGATCTGCGTGGGGCTCAA  1928

Query 1989  ---------------------------------------------------TGAGCAGGTGCTGCACCTGTGGC  2011
                                                               |||||||||||||||||||||||
Sbjct 1929  CCAGAAGGGCCTGGAGCTGCCCCTGCTCCCCACTCCTGGCCATGTCCCCAGTGAGCAGGTGCTGCACCTGTGGC  2002

Query 2012  TGGAGGTGCTCTGCTCCAGCCTGCCCACCGTGGAGAAGTGGTACCAGCCCTGGTCCTTCCTGCGCAGCCCGGGC  2085
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2003  TGGAGGTGCTCTGCTCCAGCCTGCCCACCGTGGAGAAGTGGTACCAGCCCTGGTCCTTCCTGCGCAGCCCGGGC  2076

Query 2086  TGGGTCCAGATCAAGTGTGAGCTCCGAGTCCTCTGCTGCTTTGCCTTCAGCCTCTCCCAGGACTGGGAGCTCCC  2159
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2077  TGGGTCCAGATCAAGTGTGAGCTCCGAGTCCTCTGCTGCTTTGCCTTCAGCCTCTCCCAGGACTGGGAGCTCCC  2150

Query 2160  TGCGAAGAGAGAGGCGCAGCAGCCCCTGAAGGAGGGCGTCCGGGACATGCTGGTGAAGCACCACCTCTTCAGCT  2233
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct 2151  TGCGAAGAGAGAGGCGCAGCAGCCCCTGAAGGAGGGCGTCCGGGACATGCTGGTGAAGCACCACCTCTTCAGCT  2224

Query 2234  GGGATGTGGACGGG  2247
            ||||||||||||||
Sbjct 2225  GGGATGTGGACGGG  2238