Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03048
• Subject: NM_001199484.1
• Aligned Length: 945
• Identities: 691
• Gaps: 150

Alignment

Query   1  ATGGCTTGTGCTGAGTTTTCTTTTCATGTACCAAGTCTTGAAGAGCTTGCTGGAGTTATGCAGAAGGGGTTAAA  74
           ||||||||...|||||||||.|||||..|.||||||||.||.||||||||||.||||.|||||||||||.|||.
Sbjct   1  ATGGCTTGCAGTGAGTTTTCCTTTCACATGCCAAGTCTGGAGGAGCTTGCTGAAGTTTTGCAGAAGGGGCTAAC  74

Query  75  AGATAACTTTGCTGATGTCCAGGTCTCTGTAGTTGATTGCCCTGATTTGACTAAGGAACCCTTTACCTTTCCTG  148
           .||.|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.|||||.||.|||||.||.|||||||||||||
Sbjct  75  TGACAACTTTGCTGATGTCCAGGTCTCAGTGGTTGACTGCCCAGATTTAACAAAGGAGCCATTTACCTTTCCTG  148

Query 149  TAAAAGGCATCTGTGGGAAAACTAGAATTGCAGAAGTTGGAGGTGTGCCTTACTTATTGCCTCTTGTAAACCAA  222
           |||.|||||||||||||.|||||||||||||||||||.|||||||||||||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 149  TAAGAGGCATCTGTGGGCAAACTAGAATTGCAGAAGTAGGAGGTGTGCCTTACTTATTGCCTCTTGTAAACAAA  222

Query 223  AAAAAAGTTTATGATCTGAATAAAATTGCAAAAGAAATCAAGCTGCCTGGAGCCTTTATTCTTGGAGCAGGAGC  296
           ||||||||||||||.||.|||.||||||||||||.|||.||||||||.|||||.|||||.|||||||||||.||
Sbjct 223  AAAAAAGTTTATGACCTAAATGAAATTGCAAAAGTAATAAAGCTGCCCGGAGCTTTTATCCTTGGAGCAGGGGC  296

Query 297  AGGTCCATTTCAGACTCTCGGGTTCAATTCTGAGTTTATGCCAGTTATTCAGACAGAAAGTGAACACAAGCCTC  370
           |||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.||||||.||.||||.||||.||||||||||||.|..|
Sbjct 297  AGGTCCATTTCAGACGCTTGGGTTCAATTCTGAGTTCATGCCAATTGTTCAAACAGCAAGTGAACACAACCAAC  370

Query 371  CTGTAAATGGAAGTTACTTTGCCCATGTGAACCCTGCAGATGGAGGGTGCCTACTGGAGAAATACAGTGAGAAA  444
           ||||.|||||||||||||||||||||...||||||||||||||||.||||||.||||||||||||||..|.|||
Sbjct 371  CTGTGAATGGAAGTTACTTTGCCCATAAAAACCCTGCAGATGGAGCGTGCCTGCTGGAGAAATACAGCCAAAAA  444

Query 445  TGTCATGATTTTCAGTGTGCATTACTGGCTAATCTTTTTGCCAGTGAAGGCCAACCTGGCAA------------  506
           |.||||||||||...||||||.|||||||||||||||||||||||||.||||||||||||||            
Sbjct 445  TATCATGATTTTGGATGTGCACTACTGGCTAATCTTTTTGCCAGTGAGGGCCAACCTGGCAAGGTCATTGAAGT  518

Query 507  --------------------------------------------------------------------------  506
                                                                                     
Sbjct 519  GCAAGCCAAGAGAAGAACAGGAGAACTTAACTTTGTGAGCTGCATGAGACAGACACTGGAGGAGCACTATGGTG  592

Query 507  ----------------------------------------------------------------GCCTGCAGAA  516
                                                                           |||||||||.
Sbjct 593  ACAAGCCTGTGGGGATGGGAGGCACCTTCATTGTGCAGAAGGGGAAAGTGAAAGCCCACATCATGCCTGCAGAG  666

Query 517  TTTTCTTCCTGCCCCTTGAACTCTGATGAAGAAGTGAATAAATGGTTGCATTTTTATGAAATGAAAGCTCCTTT  590
           ||||||||||||||..|||||||.||.||||..||.|||||||||.|.||.||.|||||.|||||.|||||.||
Sbjct 667  TTTTCTTCCTGCCCACTGAACTCGGACGAAGCTGTCAATAAATGGCTACACTTCTATGAGATGAAGGCTCCCTT  740

Query 591  GGTTTGTCTACCAGTTTTTGTCTCCAGAGACCCAGGGTTTGATTTGCGACTGGAGCACACTCATTTTTTTAGTC  664
           |||||||||||||||||||||.||||.||||||.||..||||||||||||||||||||||.|||||.||.||||
Sbjct 741  GGTTTGTCTACCAGTTTTTGTTTCCAAAGACCCTGGACTTGATTTGCGACTGGAGCACACACATTTCTTCAGTC  814

Query 665  GTCATGGAGAAGGTGGACACTACCATTATGACACTACTCCAGATATAGTGGAATATCTTGGATACTTCTTACCT  738
           .||||||||||||||||||||||||.||.||.||.||.|||||.|.||||||.||.|||||||||||||.||||
Sbjct 815  ATCATGGAGAAGGTGGACACTACCACTACGATACGACCCCAGACACAGTGGAGTACCTTGGATACTTCTCACCT  888

Query 739  GCAGAGTTTCTCTATCGCATTGATCAACCAAAAGAGACGCATTCAATTGGGCGAGAT  795
           |||.||||.|||||||||||||||||.||.||||||||.|||.|..|||||.|||||
Sbjct 889  GCACAGTTCCTCTATCGCATTGATCAGCCCAAAGAGACCCATGCCTTTGGGAGAGAT  945