Nucleotide Global Alignment
Description
- Query:
- ccsbBroad304_03057
- Subject:
- NM_026277.3
- Aligned Length:
- 1243
- Identities:
- 1050
- Gaps:
- 41
Alignment
Query 1 ATGGCTCCAGTGGAGCACGTTGTGGCGGATGCTGGGGCTTTCCTGCGGCATGCGGCTCTGCAGGACATCGGGAA 74
|||||.||.|||||||||||||||||.|||||.||.||||||.||.||.|.|||.|||||||||||||||||||
Sbjct 1 ATGGCGCCGGTGGAGCACGTTGTGGCTGATGCCGGAGCTTTCTTGAGGGACGCGCCTCTGCAGGACATCGGGAA 74
Query 75 GAACATTTACACCATCCGGGAGGTGGTCACTGAGATTCGGGACAAGGCCACACGCAGGCGGCTCGCTGTCCTGC 148
||||||.||||||||||||||||||||....||||||||.|||||||||||.|||||||||||.||.||.||||
Sbjct 75 GAACATCTACACCATCCGGGAGGTGGTGCGAGAGATTCGCGACAAGGCCACGCGCAGGCGGCTGGCAGTGCTGC 148
Query 149 CCTACGAGCTGCGGTTCAAGGAGCCCTTACCGGAATACGTGCGGCTGGTGACTGAGTTTTCAAAGAAAACAGGA 222
|||||.||||.||||||||||||||..|.||.||.||||||||||||||.|||||||||||.||||||||.||.
Sbjct 149 CCTACCAGCTTCGGTTCAAGGAGCCTCTCCCAGAGTACGTGCGGCTGGTAACTGAGTTTTCCAAGAAAACTGGG 222
Query 223 GACTACCCCAGCCTCTCTGCCACGGACATCCAAGTGCTTGCACTCACATACCAGTTGGAAGCAGAGTTTGTTGG 296
|||||||||||||||||||||||.||.|||||.|||||.||.||.||.||||||.||||||||||.|||||.||
Sbjct 223 GACTACCCCAGCCTCTCTGCCACAGATATCCAGGTGCTGGCTCTGACTTACCAGCTGGAAGCAGAATTTGTCGG 296
Query 297 GGTGTCTCACCTAAAACAAGAACCACAGAAGGTTAAGGTGAGCTCATCGATTCAGCACCCAGAAACACCTCTGC 370
|||||||||.||||||.||||||||.||||||.|||.||||||||.||.|||||||||||.|||||..||||||
Sbjct 297 GGTGTCTCATCTAAAAAAAGAACCAGAGAAGGCTAAAGTGAGCTCTTCAATTCAGCACCCTGAAACTGCTCTGC 370
Query 371 ACATTTCTGGTTTCCATCTGCCCTACAAGCCTAAACCCCCACAAGAAACAGAAAAAGGA-------CACTCAGC 437
||||||||||.|||||||||||||.||||.||||||||..|||||||.||| .||| |||.||||
Sbjct 371 ACATTTCTGGCTTCCATCTGCCCTCCAAGTCTAAACCCTTACAAGAAGCAG----TGGATCGGGGCCACGCAGC 440
Query 438 TTGTGAGCCTGAGAACCTGGAATTTAGTTCCTTCATGTTCTGGAGAAACCCTTTGCCCAACATCGATCATGAAC 511
|..||.|||.|||||||||||.||.||.|||||||||||||||||.|.|||..||||.|||||.||.|.|||.|
Sbjct 441 TGATGGGCCCGAGAACCTGGAGTTCAGCTCCTTCATGTTCTGGAGGACCCCGCTGCCTAACATTGACCGTGAGC 514
Query 512 TGCAGGAGCTGCTGATTGACAGAGGTGAGGACGTTCCAAGTGAGGAGGAGGAGGAGGAAGAAAACGGGTTTGAA 585
|||||||||||||||||||..||.|.||||| .||.|||||||||||||| ||.||||
Sbjct 515 TGCAGGAGCTGCTGATTGATGGAAGGGAGGA---------GGAAGAGGAGGAGGAGGA---------GTGTGAA 570
Query 586 GACAGAAAAGATGACAGCGATGACGACGGGGGTGGCTGGATAACCCCCAGTAACATCAAGCAGATCCAGCAGGA 659
|||||.||||||||.||.|||||.||||||||||||||.|||||.|||||||||||||||||
Sbjct 571 ------------GACAGTGATGACGATGGTGGTGGGTGGATAACCCCCAGCAACATAAAGCAGATCCAGCAGGA 632
Query 660 GCTGGAGCAGTGTGACGTCCCCGAGGACGTGCGGGTTGGCTGCCTGACCACAGACTTCGCCATGCAGAATGTTC 733
|.||||||||||||||..|||.||||||||||.|||||||||..|||||||.||||||||||||||||||||||
Sbjct 633 GTTGGAGCAGTGTGACACCCCAGAGGACGTGCAGGTTGGCTGTGTGACCACGGACTTCGCCATGCAGAATGTTC 706
Query 734 TGCTGCAGATGGGGCTGCACGTGCTGGCGGTGAACGGCATGCTGATTCGTGAGGCCCGGAGCTACATCTTGCGC 807
|.||.||||||||||||||||||.||||||||||||||||||||.|.||.||||||||||||||||||.|||||
Sbjct 707 TACTTCAGATGGGGCTGCACGTGTTGGCGGTGAACGGCATGCTGGTCCGAGAGGCCCGGAGCTACATCCTGCGC 780
Query 808 TGCCATGGCTGTTTCAAGACAACGTCTGACATGAGCCGAGTGTTCTGCTCACACTGTGGGAACAAGACCCTGAA 881
||.|||||||||||||||||.||.||.|||||||.||||||||||||...|||.||||||||||||||||||||
Sbjct 781 TGTCATGGCTGTTTCAAGACGACATCGGACATGAACCGAGTGTTCTGTGGACATTGTGGGAACAAGACCCTGAA 854
Query 882 GAAAGTGTCCGTGACCGTCAGCGACGACGGCACCCTGCACATGCACTTCTCCCGCAACCCCAAGGTGCTGAACC 955
|||||||||.|||||..|||..|||||.||.|||.||||||||||.||||||||.|||||.||.||.|||||||
Sbjct 855 GAAAGTGTCTGTGACTATCAATGACGATGGGACCTTGCACATGCATTTCTCCCGAAACCCGAAAGTTCTGAACC 928
Query 956 CCCGCGGCCTCCGGTACTCGCTTCCCACTCCCAAAGGGGGCAAATACGCCATCAACCCCCATCTCACCGAGGAT 1029
|.||.||||||||||||||.||.||||||||.||||||||||||||||||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 929 CACGAGGCCTCCGGTACTCACTACCCACTCCAAAAGGGGGCAAATACGCCATCAACCCCCATCTGACCGAGGAT 1002
Query 1030 CAGCGCTTCCCTCAGCTGCGACTCTCCCAAAAGGCCAGGCAGAAAACCAACGTGTTCGCCCCTGACTACATCGC 1103
|||||||||||.|||||||||||||||||.||||||||||||||.|||.||||||||||||||||||||||.||
Sbjct 1003 CAGCGCTTCCCCCAGCTGCGACTCTCCCAGAAGGCCAGGCAGAAGACCGACGTGTTCGCCCCTGACTACATAGC 1076
Query 1104 CGGGGTGTCACCCTTTGTCGAGAATGACATCTCCAGCCGCTCAGCTACCCTGCAGGTCCGGGACAGCACCTTGG 1177
||||||.||.|||||||..|||||||||||||||||||||||.||.|.||||||.|||||||||.|||..||||
Sbjct 1077 CGGGGTTTCTCCCTTTGCAGAGAATGACATCTCCAGCCGCTCGGCCATCCTGCAAGTCCGGGACGGCATGTTGG 1150
Query 1178 GAGCTGGGCGGAGACGCTTAAATCCCAACGCTTCCAGAAAGAAGTTTGTGAAGAAAAGG 1236
||||.|||.|||||||||||||||||||.||.|||||||||||||||||.|||||||||
Sbjct 1151 GAGCCGGGAGGAGACGCTTAAATCCCAATGCCTCCAGAAAGAAGTTTGTAAAGAAAAGG 1209