Nucleotide Global Alignment

Description

• Query: ccsbBroad304_03082
• Subject: XM_011524694.2
• Aligned Length: 1005
• Identities: 876
• Gaps: 129

Alignment

Query    1  ATGGCGGGGAAGAAGAATGTTCTGTCGTCTCTCGCAGTTTACGCGGAAGATTCAGAGCCCGAGTCTGATGGCGA  74
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct    1  ATGGCGGGGAAGAAGAATGTTCTGTCGTCTCTCGCAGTTTACGCGGAAGATTCAGAGCCCGAGTCTGATGGCGA  74

Query   75  GGCTGGAATCGAGGCGGTGGGCAGCGCGGCTGAGGAGAAAGGCGGATTGGTATCTGATGCCTATGGGGAGGATG  148
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct   75  GGCTGGAATCGAGGCGGTGGGCAGCGCGGCTGAGGAGAAAGGCGGATTGGTATCTGATGCCTATGGGGAGGATG  148

Query  149  ACTTTTCTCGTCTAGGGGGTGATGAAGATGGTTATGAAGAAGAAGAAGATGAGAACAGTAGACAGTCGGAAGAT  222
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||       
Sbjct  149  ACTTTTCTCGTCTAGGGGGTGATGAAGATGGTTATGAAGAAGAAGAAGATGAGAACAGTAGACAGTC-------  215

Query  223  GACGATTCAGAGACTGAAAAACCTGAGGCTGATGACCCAAAGGATAATACAGAAGCAGAAAAGCGAGACCCCCA  296
                                                     |||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  216  -----------------------------------------GGATAATACAGAAGCAGAAAAGCGAGACCCCCA  248

Query  297  GGAACTCGTGGCCTCCTTTTCTGAAAGAGTTCGGAACATGTCGCCTGATGAAATCAAGATCCCGCCAGAACCCC  370
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  249  GGAACTCGTGGCCTCCTTTTCTGAAAGAGTTCGGAACATGTCGCCTGATGAAATCAAGATCCCGCCAGAACCCC  322

Query  371  CTGGCAGATGTTCAAATCACTTGCAAGACAAGATCCAGAAGCTTTATGAACGAAAGATAAAGGAGGGAATGGAT  444
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  323  CTGGCAGATGTTCAAATCACTTGCAAGACAAGATCCAGAAGCTTTATGAACGAAAGATAAAGGAGGGAATGGAT  396

Query  445  ATGAACTACATTATCCAAAGGAAGAAAGAATTTCGGAACCCTAGCATCTACGAGAAGCTGATCCAGTTCTGTGC  518
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  397  ATGAACTACATTATCCAAAGGAAGAAAGAATTTCGGAACCCTAGCATCTACGAGAAGCTGATCCAGTTCTGTGC  470

Query  519  CATTGACGAGCTTGGCACCAACTACCCAAAGGATATGTTTGATCCCCATGGCTGGTCTGAGGACTCCTACTATG  592
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  471  CATTGACGAGCTTGGCACCAACTACCCAAAGGATATGTTTGATCCCCATGGCTGGTCTGAGGACTCCTACTATG  544

Query  593  AGGCATTAGCCAAGGCCCAGAAAATTGAGATGGACAAATTGGAAAAGGCCAAAAAGGAGCGAACAAAA------  660
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||      
Sbjct  545  AGGCATTAGCCAAGGCCCAGAAAATTGAGATGGACAAATTGGAAAAGGCCAAAAAGGAGCGAACAAAAGCTTGT  618

Query  661  --------------------------------------------------------------------------  660
                                                                                      
Sbjct  619  TGCAGGGACGTGTCTGCAGCGCCTGGGGACCGGAGCTGTCCTTCCCCTGTGCGGGCGGGCACCGCCTCCTCCTG  692

Query  661  -ATTGAGTTTGTGACGGGCACCAAAAAAGGCACCACGACCAACGCCACGTCCACCACCACTACCACTGCCAGCA  733
             |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  693  GATTGAGTTTGTGACGGGCACCAAAAAAGGCACCACGACCAACGCCACGTCCACCACCACTACCACTGCCAGCA  766

Query  734  CAGCTGTTGCAGATGCTCAGAAGAGAAAGAGCAAGTGGGATTCGGCTATCCCAGTGACAACGATAGCCCAGCCC  807
            ||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  767  CAGCTGTTGCAGATGCTCAGAAGAGAAAGAGCAAGTGGGATTCGGCTATCCCAGTGACAACGATAGCCCAGCCC  840

Query  808  ACCATCCTCACCACCACAGCCACCCTGCCAGCTGTTGTCACGGTCACCACCAGCGCCAGCGGCTCCAAGACCAC  881
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Sbjct  841  ACCATCCTCACCACCACAGCCACCCTGCCAGCTGTTGTCACGGTCACCACCAGCGCCAGCGGCTCCAAGACCAC  914

Query  882  CGTCATCTCTGCTGTGGGCACCATTGTGAAGAAGGCCAAGCAG  924
            |||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||||
Sbjct  915  CGTCATCTCTGCTGTGGGCACCATTGTGAAGAAGGCCAAGCAG  957